Heatmap: Cluster_267 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00032990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.16)
0.02 1.0 0.7 0.01 0.39 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.69 0.63 0.29 0.11 0.15 0.15 0.69 0.24 0.18 0.14 0.1 0.3
AMTR_s00001p00102800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.69)
0.44 0.71 1.0 0.18 0.57 0.12 0.08 0.08 0.06 0.08 0.7 0.69 0.42 0.17 0.24 0.45 0.88 0.46 0.46 0.37 0.15 0.46
AMTR_s00001p00260690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.374)
0.0 1.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.96 0.66 0.18 0.16 0.12 0.2 0.71 0.46 0.34 0.28 0.36 0.28
AMTR_s00007p00078630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.43)
0.49 0.82 0.81 0.05 0.29 0.04 0.22 0.0 0.2 0.19 0.75 0.67 0.51 0.31 0.17 0.44 1.0 0.5 0.44 0.31 0.24 0.38
AMTR_s00007p00254340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.296)
0.31 1.0 0.88 0.02 0.14 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.58 0.44 0.46 0.16 0.1 0.67 0.8 0.61 0.61 0.36 0.44 0.59
AMTR_s00009p00171900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.101)
0.35 1.0 0.61 0.12 0.22 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.42 0.42 0.27 0.12 0.2 0.65 0.4 0.28 0.4 0.28 0.39 0.27
AMTR_s00010p00116710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.69)
0.13 0.82 1.0 0.0 0.29 0.0 0.07 0.0 0.06 0.07 0.62 0.2 0.4 0.17 0.29 0.16 0.88 0.25 0.36 0.2 0.34 0.29
AMTR_s00010p00244300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.320)
0.4 0.47 1.0 0.09 0.42 0.06 0.06 0.1 0.13 0.12 0.6 0.58 0.44 0.22 0.32 0.27 0.76 0.31 0.35 0.32 0.25 0.38
AMTR_s00012p00142410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.81)
0.83 1.0 0.91 0.03 0.36 0.1 0.16 0.09 0.16 0.18 0.56 0.68 0.31 0.34 0.28 0.67 0.77 0.4 0.44 0.38 0.21 0.42
AMTR_s00012p00230440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.185)
0.33 0.93 0.97 0.1 0.29 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 1.0 1.0 0.36 0.2 0.23 0.26 0.88 0.31 0.26 0.3 0.19 0.26
AMTR_s00017p00219910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.168)
0.0 1.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.03 0.0 0.04 0.02 0.71 0.75 0.23 0.08 0.13 0.3 0.9 0.31 0.19 0.09 0.18 0.41
AMTR_s00019p00126240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.105)
0.01 0.77 0.77 0.09 0.21 0.03 0.03 0.0 0.04 0.04 0.54 0.8 0.17 0.09 0.08 0.23 1.0 0.16 0.15 0.11 0.22 0.17
AMTR_s00022p00246320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.365)
0.22 0.86 0.04 0.0 0.27 0.01 0.14 0.01 0.16 0.13 0.87 1.0 0.42 0.26 0.31 0.33 0.62 0.4 0.36 0.08 0.11 0.49
AMTR_s00022p00250340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.383)
0.39 1.0 0.58 0.2 0.25 0.03 0.19 0.1 0.18 0.18 0.53 0.51 0.37 0.31 0.38 0.71 0.54 0.34 0.43 0.5 0.47 0.33
AMTR_s00024p00244020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.298)
0.82 0.7 1.0 0.08 0.51 0.01 0.07 0.0 0.17 0.14 0.88 0.89 0.77 0.64 0.26 0.66 0.68 0.83 0.6 0.29 0.53 0.52
AMTR_s00029p00105510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.106)
0.39 0.51 1.0 0.1 0.34 0.04 0.02 0.0 0.04 0.03 0.32 0.19 0.18 0.08 0.22 0.11 0.49 0.1 0.11 0.15 0.13 0.21
AMTR_s00029p00189980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.255)
0.27 0.59 0.74 0.22 0.16 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.56 0.69 0.3 0.21 0.25 0.77 0.51 0.4 0.59 0.44 0.82
AMTR_s00030p00028080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.8)
0.0 1.0 0.33 0.01 0.3 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.7 0.64 0.13 0.08 0.11 0.16 0.66 0.31 0.21 0.26 0.16 0.14
AMTR_s00033p00114960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.55)
0.05 0.57 0.58 0.4 0.17 0.02 0.05 0.0 0.1 0.08 0.79 0.66 0.22 0.08 0.08 0.02 1.0 0.36 0.24 0.05 0.01 0.53
AMTR_s00033p00127000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.66)
0.3 0.31 0.64 0.11 0.05 0.01 0.06 0.0 0.07 0.06 1.0 0.65 0.19 0.18 0.06 0.18 0.52 0.31 0.3 0.15 0.23 0.16
AMTR_s00040p00043760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.20)
0.0 0.32 0.73 0.04 0.08 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 1.0 0.46 0.32 0.08 0.13 0.39 0.68 0.26 0.38 0.27 0.3 0.23
AMTR_s00040p00044580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.21)
0.02 0.69 1.0 0.03 0.07 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.89 0.57 0.22 0.09 0.16 0.62 0.94 0.39 0.37 0.27 0.54 0.28
AMTR_s00046p00010710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00046.1)
0.0 1.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.46 0.56 0.1 0.01 0.04 0.11 0.89 0.21 0.11 0.12 0.21 0.15
AMTR_s00048p00227650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.220)
0.57 0.89 0.85 0.39 0.32 0.0 0.07 0.03 0.08 0.11 0.75 0.58 0.67 0.23 0.15 0.41 1.0 0.56 0.44 0.4 0.22 0.38
AMTR_s00049p00094540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.64)
0.0 0.76 0.85 0.07 0.26 0.0 0.07 0.09 0.08 0.09 1.0 0.62 0.56 0.37 0.2 0.33 0.7 0.62 0.59 0.43 0.41 0.4
AMTR_s00053p00020430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.7)
0.37 1.0 0.34 0.16 0.21 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.41 0.39 0.41 0.16 0.19 0.89 0.76 0.26 0.32 0.39 0.5 0.21
AMTR_s00057p00030490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.12)
0.0 0.59 0.24 0.01 0.05 0.0 0.05 0.02 0.11 0.08 0.38 0.64 0.12 0.02 0.04 0.03 1.0 0.1 0.05 0.02 0.03 0.18
AMTR_s00061p00029690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.4)
0.2 1.0 0.86 0.18 0.17 0.02 0.09 0.0 0.18 0.21 0.69 0.65 0.61 0.44 0.18 0.35 0.84 0.41 0.44 0.57 0.3 0.79
AMTR_s00064p00153650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.63)
0.62 0.93 1.0 0.11 0.47 0.03 0.19 0.0 0.25 0.21 0.85 0.74 0.66 0.42 0.3 0.52 0.84 0.52 0.5 0.34 0.51 0.5
AMTR_s00065p00142450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.97)
0.0 0.86 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.42 0.7 0.1 0.01 0.02 0.11 1.0 0.05 0.17 0.14 0.09 0.11
AMTR_s00066p00170330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.198)
0.0 0.4 1.0 0.15 0.33 0.02 0.02 0.0 0.05 0.04 0.66 0.46 0.46 0.35 0.42 0.44 0.91 0.29 0.27 0.31 0.4 0.34
AMTR_s00067p00134010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.117)
0.23 1.0 0.93 0.08 0.41 0.01 0.09 0.06 0.1 0.1 0.57 0.56 0.37 0.28 0.24 0.37 0.59 0.44 0.36 0.35 0.21 0.37
AMTR_s00067p00180030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.188)
0.15 1.0 0.06 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.46 0.69 0.08 0.01 0.02 0.0 0.89 0.05 0.03 0.01 0.01 0.15
AMTR_s00069p00150990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.120)
0.0 0.76 0.13 0.26 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.53 0.34 0.1 0.02 0.02 0.04 1.0 0.21 0.15 0.04 0.03 0.09
AMTR_s00069p00153410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.121)
0.0 0.89 0.0 0.11 0.15 0.0 0.02 0.0 0.05 0.06 0.78 0.62 0.36 0.04 0.03 0.1 1.0 0.38 0.21 0.08 0.05 0.24
AMTR_s00070p00039040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00070.18)
0.0 0.02 0.88 0.04 0.28 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 1.0 0.61 0.13 0.06 0.06 0.19 0.85 0.22 0.71 0.16 0.41 0.39
AMTR_s00077p00151100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.154)
0.17 1.0 0.35 0.01 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.6 0.12 0.02 0.07 0.05 0.87 0.09 0.05 0.12 0.02 0.24
AMTR_s00078p00108880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.80)
0.34 0.7 1.0 0.02 0.31 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.17 0.14 0.06 0.13 0.13 0.48 0.12 0.14 0.14 0.07 0.15
AMTR_s00088p00121830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.88)
0.08 0.86 0.91 0.05 0.19 0.0 0.08 0.0 0.13 0.11 0.73 0.59 0.48 0.13 0.14 0.28 1.0 0.32 0.41 0.24 0.5 0.39
AMTR_s00110p00142760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.117)
0.23 1.0 0.37 0.07 0.29 0.01 0.02 0.04 0.05 0.04 0.57 0.62 0.51 0.28 0.28 0.42 0.69 0.58 0.39 0.34 0.73 0.38
AMTR_s00119p00048520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.27)
0.0 0.87 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.48 0.14 0.11 0.09 0.12 0.93 0.24 0.26 0.27 0.09 0.3
AMTR_s00119p00130720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.104)
0.66 1.0 0.79 0.07 0.17 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.59 0.54 0.39 0.14 0.18 0.61 0.84 0.36 0.35 0.19 0.24 0.28
AMTR_s00122p00129500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.66)
0.0 0.62 0.53 0.15 0.12 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.97 0.63 1.0 0.35 0.35 0.28 0.65 0.73 0.68 0.53 0.74 0.39
AMTR_s00153p00079910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00153.44)
0.47 1.0 0.73 0.02 0.22 0.0 0.05 0.0 0.07 0.08 0.58 0.71 0.46 0.23 0.12 0.55 0.83 0.66 0.5 0.26 0.27 0.35
AMTR_s00182p00050050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00182.30)
0.3 1.0 0.66 0.09 0.29 0.03 0.04 0.12 0.05 0.06 0.86 0.82 0.66 0.4 0.32 0.73 0.91 0.63 0.45 0.3 0.42 0.45
AMTR_s00186p00039470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00186.14)
0.39 0.98 0.82 0.2 0.28 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.72 0.62 0.73 0.41 0.34 0.47 1.0 0.47 0.33 0.32 0.24 0.66
AMTR_s00211p00024510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00211.2)
0.39 1.0 0.41 0.01 0.02 0.03 0.08 0.0 0.06 0.07 0.55 0.34 0.54 0.14 0.13 0.37 0.79 0.52 0.39 0.34 0.63 0.77

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)