Heatmap: Cluster_239 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.87 1.0 0.45 0.51 0.43 0.5 0.38 0.56 0.69 0.58 0.1 0.35 0.15 0.27 0.16 0.11 0.15 0.12 0.09 0.11 0.1 0.34 0.27 0.1 0.27 0.29 0.3 0.42 0.48 0.49 0.45 0.37 0.57
0.81 1.0 0.77 0.67 0.52 0.56 0.44 0.5 0.48 0.46 0.33 0.35 0.53 0.28 0.41 0.26 0.17 0.33 0.35 0.24 0.31 0.43 0.62 0.81 0.41 0.36 0.34 0.53 0.66 0.51 0.58 0.35 0.49
0.68 1.0 0.48 0.47 0.21 0.23 0.42 0.55 0.36 0.54 0.13 0.28 0.31 0.19 0.09 0.13 0.18 0.12 0.1 0.09 0.08 0.32 0.26 0.36 0.22 0.2 0.19 0.32 0.66 0.61 0.31 0.25 0.62
0.77 0.77 0.6 0.53 0.57 0.74 0.57 1.0 0.92 0.83 0.48 0.5 0.49 0.49 0.43 0.41 0.38 0.35 0.36 0.39 0.39 0.55 0.67 0.65 0.43 0.48 0.45 0.45 0.56 0.54 0.44 0.39 0.55
0.72 1.0 0.3 0.25 0.33 0.38 0.31 0.36 0.5 0.35 0.04 0.29 0.03 0.29 0.0 0.0 0.05 0.04 0.01 0.01 0.0 0.15 0.07 0.08 0.2 0.13 0.14 0.23 0.48 0.61 0.23 0.22 0.43
0.87 1.0 0.54 0.43 0.49 0.57 0.31 0.92 0.77 0.59 0.27 0.33 0.39 0.29 0.3 0.2 0.21 0.21 0.22 0.22 0.22 0.43 0.44 0.37 0.3 0.42 0.37 0.41 0.5 0.55 0.44 0.34 0.53
0.84 1.0 0.57 0.46 0.54 0.73 0.53 0.78 0.75 0.8 0.3 0.45 0.46 0.46 0.42 0.31 0.29 0.28 0.3 0.3 0.32 0.6 0.68 0.47 0.38 0.46 0.44 0.41 0.52 0.48 0.43 0.33 0.51
0.84 0.86 0.53 0.44 0.57 0.66 0.49 0.83 1.0 0.6 0.36 0.43 0.42 0.51 0.39 0.26 0.24 0.31 0.25 0.26 0.25 0.59 0.85 0.53 0.35 0.56 0.5 0.46 0.61 0.59 0.46 0.33 0.58
0.74 1.0 0.41 0.4 0.37 0.53 0.31 0.68 0.63 0.62 0.13 0.25 0.24 0.32 0.23 0.1 0.17 0.13 0.14 0.12 0.14 0.33 0.5 0.4 0.17 0.37 0.35 0.62 0.78 0.8 0.64 0.43 0.76
0.84 0.84 0.53 0.45 0.4 0.53 0.46 1.0 0.81 0.62 0.19 0.4 0.37 0.36 0.27 0.17 0.28 0.17 0.19 0.19 0.16 0.47 0.66 0.43 0.41 0.45 0.43 0.27 0.38 0.43 0.28 0.28 0.48
0.91 1.0 0.52 0.48 0.47 0.59 0.48 0.79 0.61 0.6 0.36 0.32 0.39 0.46 0.3 0.25 0.19 0.35 0.31 0.28 0.25 0.6 0.66 0.4 0.5 0.4 0.42 0.15 0.16 0.15 0.16 0.11 0.18
0.76 1.0 0.47 0.46 0.42 0.39 0.32 0.7 0.71 0.6 0.18 0.25 0.28 0.27 0.21 0.12 0.21 0.15 0.17 0.16 0.16 0.4 0.5 0.3 0.28 0.4 0.34 0.35 0.43 0.44 0.35 0.27 0.44
0.6 1.0 0.36 0.45 0.29 0.36 0.43 0.27 0.29 0.34 0.24 0.29 0.23 0.22 0.15 0.27 0.18 0.14 0.28 0.29 0.25 0.23 0.49 0.41 0.3 0.31 0.31 0.35 0.53 0.49 0.34 0.35 0.57
0.87 1.0 0.56 0.53 0.58 0.74 0.48 0.93 0.97 0.75 0.3 0.39 0.26 0.43 0.35 0.25 0.28 0.26 0.22 0.24 0.25 0.43 0.56 0.33 0.32 0.48 0.46 0.33 0.44 0.45 0.33 0.26 0.46
0.71 1.0 0.48 0.65 0.38 0.52 0.28 0.42 0.34 0.67 0.26 0.32 0.32 0.28 0.21 0.2 0.21 0.26 0.25 0.23 0.25 0.29 0.4 0.37 0.24 0.38 0.38 0.59 0.7 0.67 0.62 0.46 0.77
0.65 1.0 0.39 0.45 0.28 0.33 0.29 0.39 0.38 0.48 0.18 0.27 0.3 0.24 0.23 0.11 0.24 0.13 0.14 0.14 0.15 0.37 0.47 0.28 0.26 0.28 0.27 0.33 0.4 0.41 0.3 0.25 0.4
0.91 0.95 0.79 0.69 0.64 1.0 0.67 0.92 0.94 0.94 0.19 0.41 0.11 0.29 0.21 0.15 0.06 0.2 0.21 0.2 0.26 0.42 0.31 0.46 0.36 0.57 0.44 0.5 0.64 0.59 0.49 0.42 0.57
0.94 1.0 0.69 0.48 0.54 0.58 0.63 0.93 0.81 0.6 0.36 0.42 0.75 0.46 0.4 0.26 0.36 0.3 0.26 0.28 0.28 0.57 0.72 0.88 0.44 0.49 0.49 0.38 0.47 0.49 0.33 0.28 0.58
0.83 1.0 0.6 0.51 0.53 0.59 0.54 0.72 0.73 0.55 0.25 0.5 0.68 0.48 0.3 0.27 0.28 0.22 0.23 0.21 0.25 0.69 0.89 0.57 0.42 0.41 0.39 0.36 0.44 0.45 0.34 0.26 0.47
0.75 1.0 0.39 0.35 0.3 0.34 0.19 0.45 0.43 0.31 0.13 0.14 0.14 0.16 0.17 0.08 0.2 0.11 0.12 0.09 0.12 0.14 0.17 0.15 0.14 0.27 0.3 0.56 0.71 0.63 0.58 0.43 0.5
0.86 1.0 0.54 0.44 0.37 0.62 0.35 0.61 0.52 0.57 0.19 0.26 0.19 0.29 0.28 0.11 0.28 0.17 0.14 0.12 0.1 0.3 0.31 0.24 0.21 0.34 0.31 0.3 0.49 0.55 0.39 0.36 0.4
0.68 1.0 0.57 0.52 0.34 0.37 0.32 0.61 0.48 0.63 0.27 0.34 0.26 0.37 0.26 0.16 0.14 0.23 0.2 0.2 0.24 0.41 0.41 0.23 0.2 0.32 0.3 0.37 0.58 0.44 0.36 0.25 0.45
0.77 1.0 0.49 0.59 0.38 0.45 0.38 0.49 0.49 0.71 0.25 0.35 0.24 0.33 0.28 0.18 0.18 0.17 0.19 0.2 0.21 0.35 0.42 0.39 0.23 0.41 0.4 0.5 0.65 0.68 0.53 0.36 0.61
0.63 1.0 0.37 0.37 0.31 0.36 0.46 0.45 0.54 0.47 0.29 0.4 0.81 0.48 0.2 0.25 0.2 0.25 0.28 0.25 0.28 0.58 0.73 0.8 0.31 0.36 0.35 0.28 0.41 0.43 0.28 0.19 0.42
0.58 1.0 0.23 0.27 0.11 0.08 0.21 0.0 0.2 0.02 0.02 0.37 0.02 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.73 0.03 0.0 0.07 0.17 0.17 0.06 0.07 0.24 0.08 0.06 0.54
0.78 1.0 0.61 0.62 0.44 0.54 0.32 0.43 0.47 0.47 0.13 0.25 0.23 0.32 0.2 0.13 0.25 0.2 0.14 0.13 0.18 0.33 0.43 0.37 0.32 0.28 0.3 0.61 0.78 0.66 0.6 0.41 0.58
0.78 1.0 0.57 0.64 0.39 0.47 0.21 0.62 0.59 0.65 0.18 0.22 0.21 0.17 0.23 0.16 0.28 0.16 0.16 0.17 0.17 0.24 0.37 0.24 0.19 0.46 0.41 0.55 0.67 0.67 0.54 0.54 0.72
0.63 0.83 0.55 0.44 0.58 0.85 0.56 0.91 1.0 0.72 0.43 0.57 0.65 0.7 0.3 0.34 0.33 0.41 0.35 0.3 0.35 0.66 0.77 0.56 0.52 0.41 0.42 0.4 0.57 0.61 0.42 0.32 0.57
0.64 1.0 0.44 0.51 0.47 0.42 0.54 0.56 0.4 0.59 0.23 0.34 0.34 0.27 0.26 0.16 0.23 0.23 0.23 0.17 0.26 0.37 0.32 0.45 0.49 0.33 0.37 0.16 0.26 0.27 0.16 0.13 0.23
0.71 1.0 0.63 0.75 0.46 0.59 0.53 0.59 0.46 0.87 0.37 0.44 0.38 0.46 0.33 0.28 0.48 0.43 0.37 0.4 0.4 0.79 0.74 0.33 0.59 0.38 0.39 0.58 0.74 0.69 0.54 0.49 0.69
0.67 1.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.03 0.39 0.06 0.13 0.06 0.06
0.72 1.0 0.42 0.4 0.39 0.49 0.43 0.51 0.64 0.46 0.32 0.44 0.58 0.46 0.26 0.28 0.32 0.26 0.27 0.27 0.29 0.56 0.7 0.51 0.41 0.45 0.43 0.33 0.43 0.43 0.31 0.26 0.44
0.87 0.95 0.64 0.52 0.56 0.7 0.7 0.71 0.65 0.57 0.51 0.7 0.78 0.89 0.44 0.53 0.24 0.41 0.41 0.37 0.41 0.89 1.0 0.81 0.56 0.46 0.45 0.33 0.51 0.56 0.35 0.29 0.52
0.75 1.0 0.55 0.47 0.34 0.28 0.3 0.61 0.48 0.44 0.34 0.18 0.23 0.31 0.21 0.28 0.23 0.4 0.31 0.28 0.46 0.32 0.3 0.31 0.23 0.3 0.26 0.68 0.81 0.58 0.57 0.44 0.48
0.91 0.99 0.66 0.48 0.46 0.51 0.65 0.74 0.75 0.7 0.41 0.51 0.77 0.53 0.42 0.37 0.34 0.35 0.35 0.35 0.36 0.71 1.0 0.96 0.45 0.43 0.41 0.39 0.5 0.52 0.42 0.32 0.56
0.59 1.0 0.54 0.69 0.39 0.32 0.42 0.4 0.47 0.78 0.14 0.24 0.12 0.29 0.12 0.12 0.17 0.14 0.11 0.14 0.14 0.24 0.36 0.28 0.22 0.35 0.33 0.23 0.33 0.4 0.22 0.24 0.35
0.74 0.9 0.52 0.48 0.42 0.44 0.19 0.8 0.7 1.0 0.17 0.19 0.14 0.22 0.2 0.11 0.21 0.12 0.11 0.11 0.11 0.21 0.27 0.15 0.14 0.41 0.38 0.43 0.51 0.54 0.45 0.36 0.55
0.77 1.0 0.47 0.54 0.48 0.65 0.13 0.48 0.4 0.54 0.09 0.09 0.06 0.12 0.15 0.06 0.18 0.08 0.09 0.06 0.1 0.12 0.11 0.08 0.12 0.26 0.25 0.5 0.54 0.52 0.5 0.47 0.41
0.71 1.0 0.52 0.49 0.39 0.48 0.35 0.4 0.42 0.58 0.17 0.27 0.24 0.27 0.3 0.16 0.29 0.17 0.22 0.21 0.16 0.3 0.38 0.11 0.36 0.26 0.23 0.31 0.35 0.36 0.34 0.2 0.32
0.79 0.96 0.55 0.51 0.67 0.65 0.48 0.95 1.0 0.84 0.24 0.3 0.16 0.2 0.34 0.24 0.08 0.23 0.17 0.18 0.18 0.19 0.1 0.12 0.35 0.53 0.49 0.33 0.43 0.51 0.36 0.36 0.49
0.91 1.0 0.61 0.59 0.74 0.88 0.49 0.96 0.91 0.82 0.44 0.53 0.32 0.61 0.51 0.32 0.35 0.4 0.31 0.35 0.35 0.67 0.96 0.37 0.49 0.57 0.63 0.32 0.48 0.49 0.3 0.24 0.43
1.0 0.91 0.49 0.39 0.39 0.44 0.94 0.28 0.31 0.15 0.07 0.27 0.19 0.13 0.16 0.08 0.15 0.06 0.07 0.07 0.08 0.14 0.57 0.29 0.15 0.29 0.26 0.48 0.78 0.75 0.41 0.36 0.68
0.74 1.0 0.36 0.27 0.3 0.58 0.48 0.26 0.37 0.37 0.02 0.51 0.06 0.41 0.01 0.02 0.08 0.03 0.01 0.02 0.02 0.21 0.11 0.07 0.25 0.29 0.28 0.47 0.75 0.91 0.46 0.38 0.73
0.76 1.0 0.53 0.53 0.53 0.67 0.27 0.61 0.67 0.76 0.07 0.21 0.09 0.28 0.06 0.05 0.25 0.07 0.04 0.05 0.05 0.19 0.24 0.11 0.17 0.33 0.33 0.44 0.63 0.65 0.43 0.3 0.57
0.49 1.0 0.32 0.41 0.27 0.34 0.28 0.24 0.2 0.65 0.06 0.09 0.12 0.13 0.04 0.05 0.11 0.06 0.03 0.05 0.03 0.17 0.18 0.1 0.07 0.17 0.22 0.16 0.46 0.44 0.17 0.14 0.37
0.66 0.79 0.43 0.41 0.44 0.75 0.41 1.0 0.64 0.67 0.06 0.48 0.52 0.39 0.03 0.07 0.22 0.08 0.04 0.03 0.03 0.83 0.48 0.81 0.33 0.38 0.33 0.31 0.39 0.57 0.31 0.32 0.45
0.78 0.85 0.52 0.56 0.54 0.67 0.58 0.92 1.0 0.73 0.54 0.71 0.67 0.67 0.84 0.55 0.35 0.48 0.58 0.41 0.52 0.75 0.61 0.8 0.58 0.55 0.52 0.46 0.55 0.63 0.47 0.34 0.59
0.83 1.0 0.46 0.41 0.32 0.45 0.4 0.3 0.41 0.65 0.19 0.12 0.06 0.1 0.16 0.09 0.17 0.15 0.16 0.15 0.21 0.09 0.02 0.33 0.08 0.33 0.28 0.29 0.32 0.34 0.26 0.23 0.5
0.84 1.0 0.75 0.84 0.59 0.59 0.57 0.72 0.63 0.65 0.49 0.5 0.46 0.62 0.34 0.56 0.47 0.62 0.53 0.41 0.51 0.72 0.8 0.51 0.57 0.47 0.48 0.58 0.8 0.82 0.65 0.5 0.82
0.64 0.67 0.42 0.43 0.54 0.8 0.32 0.83 1.0 0.7 0.31 0.41 0.44 0.46 0.31 0.33 0.3 0.24 0.26 0.26 0.24 0.51 0.71 0.42 0.5 0.4 0.39 0.52 0.41 0.47 0.4 0.35 0.51
1.0 0.85 0.38 0.33 0.35 0.27 0.59 0.42 0.53 0.42 0.05 0.1 0.2 0.06 0.0 0.02 0.04 0.1 0.0 0.03 0.01 0.04 0.0 0.13 0.11 0.14 0.13 0.33 0.73 0.66 0.28 0.26 0.87
0.69 1.0 0.35 0.35 0.27 0.35 0.3 0.49 0.45 0.43 0.14 0.24 0.49 0.4 0.17 0.16 0.22 0.15 0.15 0.14 0.15 0.38 0.56 0.67 0.28 0.36 0.35 0.2 0.26 0.27 0.2 0.15 0.24
0.68 1.0 0.51 0.51 0.33 0.39 0.47 0.47 0.37 0.47 0.21 0.29 0.4 0.19 0.19 0.25 0.22 0.22 0.21 0.15 0.17 0.28 0.26 0.23 0.38 0.31 0.3 0.28 0.39 0.37 0.25 0.24 0.56
0.59 1.0 0.18 0.13 0.15 0.28 0.33 0.16 0.26 0.17 0.02 0.27 0.01 0.25 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.09 0.08 0.02 0.15 0.17 0.23 0.14 0.55 0.66 0.21 0.17 0.46
0.64 0.96 0.32 0.44 0.49 0.61 0.49 0.77 1.0 0.69 0.19 0.4 0.4 0.3 0.18 0.14 0.1 0.18 0.14 0.23 0.19 0.43 0.45 0.59 0.31 0.37 0.4 0.35 0.5 0.48 0.34 0.3 0.5
0.64 1.0 0.51 0.59 0.33 0.46 0.13 0.46 0.45 0.47 0.08 0.1 0.08 0.17 0.08 0.05 0.15 0.06 0.07 0.05 0.07 0.1 0.13 0.15 0.1 0.24 0.22 0.29 0.46 0.43 0.32 0.22 0.43
0.64 1.0 0.37 0.45 0.32 0.39 0.3 0.3 0.28 0.59 0.17 0.22 0.22 0.12 0.14 0.08 0.19 0.16 0.13 0.13 0.14 0.22 0.28 0.24 0.11 0.4 0.4 0.47 0.89 0.75 0.52 0.39 0.64
0.73 0.67 0.43 0.37 0.43 0.29 0.49 0.56 0.47 0.38 0.24 0.42 0.51 0.35 0.4 0.28 0.15 0.28 0.28 0.28 0.26 0.46 0.88 1.0 0.39 0.2 0.22 0.34 0.45 0.45 0.37 0.3 0.52
0.77 1.0 0.62 0.52 0.44 0.53 0.35 0.5 0.41 0.66 0.38 0.36 0.25 0.51 0.47 0.36 0.2 0.41 0.46 0.39 0.35 0.4 0.43 0.2 0.28 0.4 0.39 0.56 0.66 0.56 0.56 0.48 0.54
0.9 1.0 0.33 0.3 0.25 0.32 0.45 0.42 0.43 0.5 0.02 0.14 0.01 0.04 0.04 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.11 0.1 0.72 0.35 0.26 0.41 0.5 0.91
0.62 1.0 0.51 0.65 0.39 0.49 0.46 0.5 0.45 0.71 0.22 0.29 0.24 0.23 0.24 0.16 0.2 0.17 0.13 0.18 0.18 0.27 0.19 0.17 0.25 0.27 0.27 0.36 0.33 0.37 0.34 0.37 0.38
0.61 1.0 0.35 0.41 0.26 0.31 0.26 0.47 0.44 0.51 0.11 0.21 0.41 0.26 0.09 0.1 0.11 0.1 0.09 0.06 0.09 0.24 0.32 0.51 0.15 0.21 0.21 0.14 0.24 0.25 0.14 0.1 0.24
0.82 1.0 0.5 0.37 0.45 0.49 0.49 0.59 0.63 0.47 0.23 0.38 0.53 0.42 0.2 0.22 0.17 0.22 0.22 0.2 0.19 0.54 0.69 0.67 0.32 0.37 0.36 0.38 0.55 0.56 0.43 0.29 0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)