Heatmap: Cluster_346 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-0.15 -0.04 -0.04 -0.6 -0.53 -0.02 -1.62 0.16 0.15 0.08 0.82 -0.4 0.34 0.26 0.65 -0.17 -0.54 -1.51 0.41 0.48
0.43 0.56 0.47 -0.03 -0.71 -1.81 0.68 0.42 0.38 0.04 0.0 0.13 -0.18 -0.11 -0.39 0.61 0.56 -1.85 -3.29 -0.73
0.17 0.62 0.49 -0.07 0.35 -2.81 -1.36 0.21 0.55 0.45 0.62 -0.54 0.6 0.17 0.33 0.16 -0.33 -0.88 -2.02 -1.47
-0.41 -0.03 -0.36 -0.5 -0.38 -0.17 -1.33 0.23 0.37 0.34 0.74 0.23 0.32 0.12 0.68 0.06 0.23 -0.49 -0.83 -0.44
0.08 0.75 -0.17 -0.57 0.16 -1.86 -0.43 0.22 0.25 0.17 0.38 -0.82 0.15 -0.06 0.44 0.5 -0.25 -0.07 -0.56 -0.15
-0.56 -0.7 -2.0 -0.58 -1.32 -1.0 0.32 1.12 0.61 0.43 0.7 0.15 1.17 0.75 0.82 -1.19 -0.91 -0.66 -2.01 -1.76
-1.42 -0.29 -2.4 -0.38 -1.42 -0.64 -0.71 0.7 0.5 0.13 1.43 0.56 0.75 0.78 1.25 0.29 -0.39 -4.33 -10.73 -3.55
0.0 -0.1 -0.48 -0.12 0.18 0.07 -0.19 0.29 -0.38 -0.42 0.34 0.01 0.37 0.12 0.46 -0.54 -0.45 0.2 -1.16 0.67
0.17 0.38 -0.09 0.02 0.33 0.05 -0.29 0.41 -0.46 -0.53 0.18 -0.02 0.05 -0.1 0.32 -0.38 -0.5 0.2 -0.59 0.17
-0.77 -0.03 -0.96 -0.42 -0.61 -2.31 0.37 0.54 0.51 0.11 0.1 0.43 1.08 0.94 -0.03 0.62 0.36 -1.42 -2.79 -1.82
-0.08 -0.36 -0.15 -0.52 -1.1 -3.54 0.25 0.11 0.09 0.18 0.79 -0.25 0.62 0.54 0.35 1.07 1.04 -1.56 -1.92 -3.89
-0.84 -0.21 -1.08 -0.57 -0.02 0.52 -0.71 0.48 0.0 -0.06 1.26 0.16 0.64 -0.1 1.29 -0.58 -0.4 -1.42 -2.46 -0.68
0.1 1.1 0.54 0.11 0.18 -1.78 -2.15 0.65 0.54 0.42 0.05 -0.82 0.79 -0.15 -0.2 -1.03 -0.09 -0.07 -2.42 -0.8
-0.13 -0.1 -0.56 -0.17 -0.04 0.2 -0.71 0.58 0.08 -0.12 1.18 -0.01 -0.76 -0.93 1.02 0.05 0.27 -0.5 -0.65 -1.38
-1.75 -1.87 -2.21 -0.89 -0.88 0.04 0.96 0.73 0.11 0.09 0.27 0.75 0.62 0.6 -0.05 -0.66 0.09 -0.5 0.48 -0.59
0.67 -0.14 0.12 0.89 -0.06 -1.81 0.45 0.6 -0.32 0.08 0.6 0.42 -0.63 -1.21 1.05 -2.49 -1.34 -0.15 -2.96 -0.07
-1.73 -0.24 -2.05 -2.27 -0.25 0.14 -0.77 0.67 0.5 0.34 0.46 0.51 0.13 -0.18 0.48 -0.29 -0.3 0.26 -0.19 0.79
0.09 -0.94 -0.62 0.2 0.31 -0.07 0.44 0.59 -0.13 -0.19 0.09 -0.11 -0.28 -0.4 -0.16 -0.12 -0.06 0.35 -0.2 0.36
0.37 0.65 0.21 0.52 -0.33 0.01 0.1 -0.87 -1.06 -0.34 0.73 -0.97 -3.94 -3.06 0.41 -0.23 -0.02 0.83 0.64 -0.0
0.62 -0.31 0.15 -0.16 -0.01 -0.09 -0.24 -0.51 -0.91 -0.81 1.04 -1.58 -1.91 -1.75 0.74 0.22 0.14 0.62 0.32 0.47
0.31 -0.26 0.02 0.88 0.51 -1.1 0.72 0.02 -0.69 -0.64 0.41 -0.37 -0.02 -0.18 0.39 0.03 -0.11 -0.31 -1.39 -0.24
0.38 -0.83 -0.88 -0.18 0.04 -0.24 -0.7 0.36 -0.14 -0.11 1.03 -0.57 -1.03 -1.36 0.93 0.06 0.28 -0.11 0.22 0.34
0.35 -0.47 -0.24 0.12 -0.0 0.75 -0.51 -0.35 -0.64 -0.47 0.73 -0.92 -0.41 -0.75 0.55 -0.37 -0.41 0.34 -0.44 1.01
-0.15 -0.27 -0.12 -0.33 -0.26 -1.52 -0.48 0.21 0.24 0.23 0.82 0.01 0.57 0.14 0.64 -0.5 -0.06 -0.17 -1.03 0.23
0.03 0.09 -0.05 -0.21 -0.54 -0.35 -0.95 0.34 0.34 0.18 0.35 -0.31 -0.08 -0.21 0.31 0.21 0.38 -0.04 -1.14 0.49
0.77 -1.06 -0.49 -0.08 -0.16 -0.17 -0.89 -0.12 -0.72 -0.73 0.48 -0.48 -0.49 -0.67 0.34 0.63 0.14 0.31 0.46 0.78
-0.07 0.5 -0.53 -0.11 -0.06 -0.31 -0.61 0.49 -0.48 -0.45 0.85 -0.3 0.81 0.31 0.74 -0.78 -0.73 -0.38 -0.11 -0.77
-0.01 0.68 0.2 0.03 0.05 -0.46 -0.4 -0.02 -0.33 -0.23 0.49 -0.07 -0.13 -0.26 0.16 0.29 0.13 0.02 -2.02 0.35
-1.13 -1.47 -0.28 -0.69 -1.65 -0.76 0.65 0.67 0.53 0.29 0.2 -0.89 0.4 -0.07 0.42 0.16 -0.01 0.14 -0.15 0.67
0.38 0.96 1.23 0.24 0.1 0.68 -1.13 0.73 -0.13 -0.27 -0.28 -0.52 0.12 -0.08 -0.27 -0.75 -0.82 -1.66 -3.45 -0.4
-0.64 -0.36 -0.19 -0.79 -0.29 -0.04 1.02 0.44 0.25 0.49 0.1 0.09 0.17 0.04 0.07 -0.75 0.19 -0.54 -0.68 -0.06
-1.54 -1.36 -1.62 0.64 -1.68 1.06 0.88 0.72 0.28 0.22 -0.12 0.79 -0.74 0.15 0.14 -1.84 -1.12 -1.05 -0.42 0.75
-0.22 -0.54 -0.78 -0.61 -0.23 0.14 -0.98 0.78 0.23 -0.04 0.94 0.26 0.55 0.48 0.85 -0.62 0.21 -0.67 -1.45 -1.67
-1.33 -0.41 -2.15 -1.2 -0.76 -0.76 -0.33 0.52 0.84 0.63 0.67 -0.16 0.74 0.2 1.02 0.92 0.05 -1.24 -1.07 -1.73
0.66 -0.98 -0.84 0.34 -0.67 -3.08 -1.86 0.23 0.06 0.02 1.39 0.32 0.11 -0.02 1.26 0.39 0.94 -3.09 - -2.74
-0.25 1.18 0.15 -0.17 0.11 -1.54 0.72 0.59 -0.15 0.45 0.13 0.57 0.15 -0.42 -0.05 -1.41 -1.0 -0.16 -1.92 -0.75
-0.54 -0.27 -0.94 -0.31 -0.91 -1.22 0.01 0.77 -0.29 -0.04 1.28 0.22 1.14 0.52 1.1 -1.54 -1.34 -2.71 -1.95 0.23
0.19 -2.77 -0.36 -1.59 0.1 -0.56 -1.16 0.25 0.11 0.11 0.84 -0.63 0.88 0.84 1.09 -0.74 -0.05 -0.66 -7.07 0.75
-0.08 -1.05 -1.34 -0.45 -0.31 -0.48 0.85 0.36 0.04 -0.06 0.76 -0.47 -0.15 -0.23 0.47 -0.19 0.14 -0.17 -0.29 0.67
0.82 0.19 0.12 0.24 -0.99 -1.86 0.02 0.09 -0.72 -0.62 0.82 0.35 -1.66 -1.32 0.68 1.04 1.03 -1.29 -1.05 -1.44
0.27 -0.72 0.26 -0.62 -0.54 -0.51 0.65 0.36 0.12 -0.19 0.47 -0.28 -0.31 -0.67 0.33 0.68 0.35 -1.07 0.35 -0.75
-0.76 0.44 -0.3 -0.28 -0.05 -0.44 -0.6 0.27 0.51 0.26 0.5 -0.3 -0.07 -0.02 0.54 0.68 -0.04 -0.06 -0.49 -1.46
-0.55 0.48 -0.71 -0.28 -0.68 -0.17 -0.35 0.33 0.39 0.12 0.9 -0.58 0.08 -0.05 1.1 0.25 -0.56 0.09 -1.28 -1.07
-2.01 -2.28 -2.42 -2.56 -2.57 0.73 -1.82 0.44 0.65 0.8 0.87 -0.17 0.41 0.19 0.77 0.08 0.47 0.24 -0.6 0.32
-10.94 -12.26 -13.01 -8.14 -12.91 -2.52 0.27 1.26 1.44 1.59 0.26 -0.53 1.48 1.6 0.23 -0.66 -0.03 -7.95 -7.84 -6.01
0.05 -0.03 -1.09 0.83 0.01 -1.72 0.76 0.24 -0.38 -0.55 0.64 -0.2 0.3 0.11 0.65 0.46 0.23 -0.59 -2.26 -1.48
-4.13 - -3.16 - - -0.28 -2.53 1.26 1.01 1.22 0.88 -0.17 1.22 0.87 1.67 -2.29 0.8 - -4.64 -4.42
-0.54 -0.55 -1.06 -0.69 -1.0 -0.15 -0.23 0.4 0.78 0.71 0.64 0.03 -0.07 -0.1 0.5 0.87 0.23 -0.92 -0.23 -1.48
0.29 -0.68 -1.05 -0.64 -0.42 -0.26 -0.44 0.37 -0.15 -0.22 1.06 -0.26 0.27 -0.26 1.02 -0.69 -0.67 -0.36 0.13 0.64
-0.98 -2.43 -0.66 -1.68 -2.55 -0.08 -3.28 0.54 0.89 0.97 1.24 0.66 0.24 0.28 0.85 -0.17 1.36 -3.26 -4.65 -2.9
-0.9 -0.92 -1.45 -0.71 -1.0 -0.53 0.17 0.55 0.59 0.41 1.11 -0.17 0.57 0.14 1.06 -0.23 -0.43 -1.04 -0.71 -0.09
-1.13 -3.07 -3.8 -1.2 -0.81 -0.88 -0.3 0.87 0.9 0.93 -0.49 -0.65 0.94 0.81 -0.47 0.41 1.03 -4.54 -10.53 1.16
0.23 -0.06 -0.16 0.04 -0.31 -2.51 0.02 0.44 0.25 0.2 0.55 -0.0 0.72 0.2 0.65 0.28 0.07 -0.15 -8.77 -2.02
0.59 -1.27 -0.93 -0.22 -0.07 -0.45 0.61 -0.08 -0.3 -0.12 0.38 -1.14 -0.1 -0.48 0.19 -0.44 -0.02 0.13 0.21 1.19
-0.85 -0.17 -0.89 -1.08 -0.94 -1.2 0.03 0.54 1.29 0.96 1.04 0.14 -0.61 -1.16 0.68 0.3 -0.12 -0.22 -0.77 -1.89
-0.27 -1.53 -1.56 -0.65 -0.98 -0.95 0.73 0.1 0.26 0.22 1.5 -0.31 -0.63 -1.05 1.55 0.02 -0.27 -0.57 -2.0 0.33
-0.71 -1.38 -1.62 -0.66 -0.23 -0.7 -2.43 0.93 -0.14 0.13 1.76 0.13 0.25 -0.65 1.82 -0.39 -0.28 -1.21 -3.09 -1.0
-1.92 -0.35 -1.19 -1.73 -1.79 -0.85 0.7 0.29 1.24 0.47 0.89 0.63 0.81 0.66 0.85 -0.62 -0.85 -1.6 -3.67 -0.69
-0.96 0.05 -1.14 -0.7 -0.31 -0.03 -0.82 0.21 0.77 0.6 0.69 -0.25 0.18 -0.15 0.78 0.5 -0.39 -0.17 -0.92 -0.23
0.43 0.36 -0.04 0.07 -0.16 0.59 0.3 0.49 0.11 -0.39 0.38 -0.38 -0.31 -0.33 0.37 -0.39 -0.94 -0.78 -2.29 0.52
-1.89 -0.28 -1.17 -2.87 -1.86 -7.82 1.14 0.97 0.75 0.56 -0.04 0.48 1.37 0.93 -0.04 -1.46 -0.99 -3.39 -0.61 0.38
0.13 -0.57 -0.18 -0.57 -0.69 -1.05 0.65 0.57 -0.6 -0.84 0.88 -0.29 0.56 0.09 0.41 0.8 -0.5 -0.17 -0.49 -0.49
-0.47 -1.96 -1.6 -0.75 -1.69 -2.24 -0.33 0.76 1.07 0.69 0.37 -1.08 1.56 1.06 0.43 0.59 -0.26 -0.25 -7.55 -5.4
-0.71 -1.22 -1.43 -0.72 -0.63 -0.04 -0.62 0.66 -0.29 -0.34 1.4 0.66 0.48 0.0 1.33 -0.94 -0.5 -0.58 -0.99 -0.01
-4.28 -3.97 -4.89 -6.71 -3.53 0.72 -0.9 0.64 0.78 0.5 1.45 -0.49 1.22 0.84 1.32 0.17 -0.07 -5.72 -4.91 -0.5
-1.84 0.14 -2.04 -1.34 -1.1 0.79 0.89 0.32 -0.3 -0.24 0.9 -0.51 -0.3 -1.08 0.8 -0.43 -1.1 -0.72 0.44 1.18
-0.93 0.32 -0.82 -0.38 0.01 0.96 0.01 0.65 0.59 0.2 0.02 -0.25 0.72 0.47 -0.07 0.05 -0.5 -1.55 -0.81 -2.31
1.0 -0.83 -0.06 0.3 -0.17 -1.88 -0.24 0.12 -0.28 -0.25 0.69 -0.58 -0.35 -0.62 0.83 0.73 0.66 -1.0 -0.12 -1.5

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.