Heatmap: Cluster_341 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
-1.2 -0.7 -0.67 -0.0 0.54 -0.05 0.93 -0.01
-0.55 -0.0 -0.54 0.08 0.29 -0.12 0.34 0.23
Nbi_g00767 (AR401)
-0.69 0.12 -0.71 0.19 0.34 -0.16 0.29 0.22
-0.51 -0.06 -0.26 -0.07 0.33 -0.1 0.46 -0.03
-1.13 0.09 -0.59 0.21 -0.08 0.09 0.42 0.38
Nbi_g01095 (PUX2)
-0.64 0.12 -0.54 0.3 -0.04 -0.18 0.25 0.38
Nbi_g01258 (CENP-C)
-2.99 -0.05 -1.55 0.22 0.67 -0.06 0.64 0.36
-1.61 0.14 -1.64 0.07 0.08 0.03 0.69 0.6
-0.75 0.04 -0.31 0.13 -0.02 -0.15 0.33 0.42
Nbi_g01885 (AOX1A)
-1.2 -0.19 -1.56 0.21 -0.26 0.2 0.63 0.73
-1.34 0.22 -2.07 0.07 0.21 -0.07 0.49 0.72
Nbi_g02069 (SOS2)
-0.62 0.25 -0.26 0.08 0.11 -0.23 0.23 0.21
-1.12 0.24 -0.69 0.05 -0.18 0.1 0.52 0.4
Nbi_g02859 (ARPC1)
-0.31 0.2 -0.31 0.03 0.17 -0.22 0.23 0.08
-2.34 -0.03 -3.23 0.26 -0.59 -0.44 1.3 0.73
-0.7 0.17 -0.32 0.25 0.21 -0.28 0.18 0.21
-4.05 -0.43 -2.65 0.31 0.89 0.03 0.52 0.56
-1.89 0.04 -2.73 0.62 0.6 -0.56 0.47 0.52
Nbi_g03673 (IAA8)
-2.1 -0.07 -3.27 0.44 0.6 -0.0 0.53 0.47
-1.61 0.17 -1.81 0.2 -0.17 0.36 0.44 0.67
Nbi_g04098 (RABA1f)
-0.93 0.2 -0.58 0.13 0.12 -0.05 0.21 0.43
-1.95 0.2 -1.75 0.02 0.11 0.14 0.63 0.63
-0.44 -0.18 -0.53 0.16 0.32 0.02 0.25 0.15
Nbi_g05194 (AKINBETA1)
-0.9 0.02 -0.48 0.18 0.03 0.15 0.38 0.22
-0.47 0.04 -0.2 0.15 0.05 -0.07 0.17 0.2
-0.61 0.02 -0.22 0.03 0.17 0.01 0.33 0.08
-0.58 0.23 -0.38 0.11 -0.19 0.01 0.26 0.29
-0.37 0.04 -0.02 0.12 0.19 -0.42 0.3 0.02
Nbi_g07222 (TET1)
-1.28 0.55 -1.54 0.02 -0.3 -0.08 0.66 0.52
-0.75 0.05 -0.66 -0.07 0.12 0.16 0.39 0.36
Nbi_g07264 (TPR8)
-0.56 0.05 -0.3 0.1 0.06 -0.12 0.32 0.25
Nbi_g07273 (CPK17)
-1.02 -0.03 -1.16 0.3 -0.06 0.17 0.47 0.47
-1.57 -0.04 -1.13 0.16 0.18 0.2 0.65 0.34
-2.3 0.05 -2.52 0.47 0.48 -0.08 0.48 0.56
-0.61 0.13 -0.2 0.04 0.0 -0.04 0.22 0.26
-1.68 0.08 -1.27 -0.43 0.17 0.27 0.7 0.6
-0.37 0.01 -0.25 0.09 0.1 -0.14 0.21 0.23
-1.6 -0.14 -0.69 0.27 -0.41 0.07 0.59 0.7
-0.56 0.13 -0.24 0.09 0.05 -0.34 0.45 0.16
-0.44 -0.14 -0.53 0.21 0.01 -0.04 0.37 0.3
Nbi_g08057 (PDI8)
-0.44 0.15 -0.33 0.17 0.28 -0.41 0.25 0.12
-0.83 -0.25 -0.19 -0.0 -0.2 -0.06 0.61 0.45
-2.69 0.38 -4.8 -0.17 0.55 -0.16 0.83 0.56
Nbi_g08959 (NIG)
-0.7 0.11 -0.2 0.27 -0.13 -0.17 0.23 0.34
-0.84 0.11 -0.59 0.12 0.11 -0.09 0.32 0.42
Nbi_g09645 (RTE1)
-0.95 0.18 -0.71 0.39 -0.13 0.06 0.21 0.4
-0.36 0.11 -0.39 0.06 0.2 -0.17 0.16 0.24
-0.85 0.05 -0.63 -0.01 0.06 -0.05 0.44 0.49
Nbi_g10547 (RPT5A)
-0.32 0.01 0.04 0.04 0.25 -0.42 0.32 -0.06
Nbi_g10709 (MGT4)
-1.01 0.19 -0.71 0.09 0.13 0.13 0.35 0.3
Nbi_g10941 (CID12)
-1.09 -0.2 -1.07 0.23 0.06 0.26 0.61 0.31
-1.12 0.11 -0.76 -0.04 0.17 0.05 0.48 0.42
-0.85 0.16 -0.48 0.19 0.09 -0.18 0.48 0.19
-0.33 0.06 -0.08 0.06 0.19 -0.38 0.3 0.05
-1.47 0.15 -1.14 0.01 -0.05 0.24 0.56 0.54
-0.86 -0.04 -0.62 0.22 0.23 0.01 0.38 0.25
-0.71 -0.0 -0.52 0.08 0.08 0.04 0.53 0.14
Nbi_g13401 (RFC1)
-0.63 0.04 -0.19 0.0 0.21 -0.09 0.26 0.21
Nbi_g13669 (FRA3)
-0.77 0.12 -0.83 -0.1 0.06 0.27 0.42 0.32
-4.7 0.08 -3.62 0.33 0.22 -0.26 0.81 0.86
Nbi_g15122 (CM3)
-0.88 -0.06 -1.0 0.26 0.09 0.14 0.56 0.22
-0.96 0.18 -0.89 0.09 0.1 -0.46 0.53 0.58
-0.62 0.07 -0.38 -0.05 0.18 -0.05 0.42 0.17
-1.63 -0.33 -1.41 -0.05 -0.05 0.16 0.81 0.77
-2.21 0.08 -2.22 0.73 0.56 -0.47 0.28 0.52
-0.83 -0.25 -0.25 -0.05 0.42 -0.39 0.49 0.36
-1.41 0.14 -0.43 0.08 0.16 0.03 0.46 0.27
-4.16 -0.4 -0.46 0.13 0.56 -0.03 0.98 -0.09
-1.24 -0.13 -0.5 0.11 -0.18 -0.16 0.68 0.58
-0.74 0.08 -1.29 -0.06 0.58 -0.07 0.54 0.09
Nbi_g20326 (TUF)
-0.76 -0.15 -1.58 0.17 0.01 -0.03 0.43 0.77
Nbi_g21136 (MOD1)
-1.16 -0.23 -0.72 0.35 -0.06 0.01 0.45 0.57
Nbi_g21556 (TBP2)
-0.44 -0.09 -0.18 0.14 0.06 -0.06 0.28 0.16
Nbi_g24966 (AS11)
-0.76 -0.13 -0.73 0.2 -0.12 0.0 0.39 0.59
Nbi_g25160 (PBC1)
-0.6 -0.04 -0.16 0.02 0.35 -0.06 0.37 -0.11
-1.02 0.12 -0.99 0.01 -0.39 -0.09 0.49 0.85
Nbi_g25709 (PRP40A)
-0.34 0.07 -0.17 0.05 0.08 -0.06 0.16 0.13
-1.94 -0.75 -0.39 -0.42 0.44 0.08 0.59 0.78
-1.53 -0.36 -0.56 0.19 -0.55 0.12 0.8 0.62
-1.34 0.09 -1.05 0.07 0.11 0.01 0.52 0.57
-1.03 0.3 -0.72 0.01 -0.08 0.06 0.45 0.39
-0.4 0.08 -0.2 -0.12 0.05 -0.04 0.27 0.24
-0.7 -0.03 -0.48 0.21 -0.06 0.01 0.36 0.36
-1.36 0.27 -1.55 0.24 -0.29 -0.03 0.58 0.67
-1.89 -0.07 -2.9 0.31 -0.32 -0.3 1.23 0.53
-1.02 -0.18 -0.55 0.37 -0.15 0.16 0.43 0.35
- -1.24 - 0.01 -0.7 0.05 1.35 1.25
-0.75 -0.03 -0.65 -0.35 -0.03 -0.03 0.66 0.55
-1.04 0.19 -0.51 0.08 0.09 -0.17 0.49 0.33
-2.52 -0.43 -0.11 -0.19 0.67 -0.52 1.01 -0.03
-0.93 0.18 -0.69 -0.36 0.31 -0.34 0.47 0.62
-0.83 0.05 -1.06 -0.12 0.54 -0.22 0.64 0.17
-0.74 0.09 -0.45 -0.2 0.46 -0.29 0.59 0.04
-1.29 0.02 -0.45 0.05 -0.25 0.26 0.48 0.45
-1.76 0.17 -1.8 -0.3 0.2 -1.78 1.43 0.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.