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Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.27 -0.81 -0.08 0.36 0.52 0.09 -0.34 0.37 -0.32 -0.62 -0.3 -0.47 0.02 0.12 -0.4 0.32 0.25 0.12 -0.12 0.17
1.45 -1.3 0.45 0.38 1.04 -1.34 0.36 -0.66 -0.46 -0.62 0.16 -0.64 -1.01 -1.29 -0.21 -0.26 -0.11 -0.34 0.04 0.41
0.81 -0.68 0.1 0.41 0.86 -0.84 -0.98 -0.35 0.14 -0.23 0.05 -0.99 0.14 -0.14 -0.41 0.98 0.13 -0.17 -0.33 -0.86
0.94 0.3 0.26 0.6 0.87 -0.86 -0.82 -0.23 -0.11 -0.47 -0.17 -1.05 -0.3 -0.77 -0.28 0.56 -0.38 0.11 0.57 -1.81
0.54 -0.01 -0.09 0.47 0.31 -1.05 -0.48 0.03 0.27 0.07 0.17 -0.74 -0.3 -0.37 0.0 0.46 -0.45 0.09 0.06 -0.04
0.61 0.49 0.12 0.53 0.3 -0.59 -0.61 -0.01 0.24 0.1 -0.23 -0.6 -1.08 -1.41 -0.02 0.34 -0.56 0.07 0.38 0.13
1.36 0.64 0.69 0.82 1.23 -1.04 -1.29 -0.34 -0.99 -0.85 -0.63 -1.71 -0.81 -1.09 -0.57 -0.38 -0.99 0.77 0.04 -0.43
0.46 0.42 0.12 0.63 0.09 -0.86 -1.08 0.06 0.21 0.21 0.87 -0.84 -1.22 -1.04 0.39 0.31 -0.36 -0.14 -0.69 0.07
0.38 -0.24 -0.15 0.71 0.37 -1.07 -0.42 -0.12 0.26 0.06 0.26 -0.74 -0.33 -0.21 0.37 0.66 -0.78 -0.28 -0.78 0.39
0.12 0.4 0.3 0.49 0.23 0.54 -0.94 0.14 -0.38 -0.64 -0.29 -0.62 -0.53 -0.72 -0.51 0.09 -0.12 0.64 -0.05 0.4
0.95 -0.65 -0.35 0.6 0.54 -0.14 -0.74 -0.2 -0.33 -0.39 0.46 -0.91 -0.56 -0.52 0.36 0.07 -0.07 0.08 -0.69 0.58
0.21 -0.45 -0.96 0.04 0.23 -1.21 0.34 -0.16 -0.17 -0.24 0.5 -0.39 0.32 0.02 0.57 -0.04 0.33 -0.28 -0.96 0.66
0.43 -0.06 -0.13 -0.2 0.64 -0.55 -0.24 -0.07 0.01 0.1 0.26 -1.16 0.19 -0.38 -0.01 -0.17 -0.22 0.32 -0.56 0.66
0.38 0.1 -0.12 0.24 0.43 -0.02 -0.79 0.04 -0.15 -0.24 -0.01 -0.11 -0.31 -0.67 -0.26 0.13 0.22 0.29 -0.24 0.41
0.27 -0.12 -0.42 0.12 0.41 -0.33 -0.67 0.07 0.04 -0.09 0.17 -0.25 -0.16 -0.07 0.1 0.01 0.13 0.35 -0.77 0.51
0.65 -0.06 -0.23 0.3 0.8 -0.79 -0.67 0.07 0.14 -0.25 0.27 -1.15 -0.35 -0.62 0.33 0.15 -0.78 0.05 -0.68 0.8
0.75 -0.48 0.12 0.13 0.77 -0.84 -0.3 -0.29 -0.04 -0.29 -0.03 -0.67 -0.03 0.09 -0.38 0.53 -0.13 0.09 -0.75 0.36
0.84 -0.15 0.34 0.4 0.72 -0.55 -0.15 -0.2 -0.23 -0.55 0.34 -0.63 -2.05 -2.08 0.19 0.24 -0.54 0.16 0.24 0.47
-0.12 -0.12 -0.34 0.75 0.28 -0.1 -1.26 0.29 -0.12 -0.07 0.14 -0.89 -0.15 -0.08 0.05 0.27 0.21 0.61 -0.3 -0.32
1.38 -0.67 -0.16 1.24 0.47 -1.37 -1.65 -0.41 -0.16 -0.79 0.1 -1.06 -1.39 -1.43 0.31 0.74 0.12 0.34 -0.79 0.07
1.35 -1.48 -0.03 0.91 0.47 -1.55 -1.41 -0.36 -0.3 -0.66 0.56 -1.23 -0.85 -0.53 0.43 0.99 0.15 0.11 -1.39 -0.2
0.82 -0.2 0.32 0.33 0.14 -0.33 -0.01 -0.01 -0.24 -0.43 0.18 -0.44 0.04 -0.02 0.04 -0.23 -0.58 0.27 -0.26 -0.12
1.2 -0.26 0.31 0.07 0.5 -0.18 -0.12 -0.15 -0.3 -0.29 0.3 -0.78 -0.06 -0.13 0.36 -0.22 -0.26 -0.19 -0.94 -0.37
0.99 -0.46 -0.59 0.72 0.35 0.77 -2.08 -0.18 -0.56 -0.68 0.44 -0.82 0.29 -0.01 0.32 0.14 -0.33 0.18 -0.45 -1.22
1.67 -0.68 0.03 0.19 1.16 -1.11 -0.34 -0.16 -0.34 -0.64 -0.42 -0.46 -0.58 -0.24 -0.5 -0.37 -0.61 -0.03 -0.1 0.25
-0.11 -1.34 -0.82 0.52 0.89 1.16 -1.52 0.35 -0.51 -0.65 0.53 -0.87 -0.18 -0.37 0.42 -1.17 0.4 0.03 -0.2 -0.02
0.56 -1.16 -0.48 0.61 0.57 0.57 -0.58 0.27 -0.38 -0.54 0.66 -0.49 -0.5 -0.69 0.55 -0.08 0.11 -0.27 -0.71 -0.01
0.37 0.46 -0.04 0.53 0.46 0.24 -0.91 0.09 -0.33 -0.4 -0.19 -0.02 -0.78 -0.92 -0.09 -0.1 -0.21 0.36 0.3 -0.01
0.8 0.71 0.52 0.81 0.46 1.01 -0.88 -0.26 -0.81 -1.03 -0.41 -1.21 -0.41 -1.21 -0.12 -0.47 -0.44 -0.3 0.38 -0.41
0.89 0.38 0.04 0.43 0.86 -0.33 -0.77 -0.5 -0.08 -0.47 -0.16 -1.17 -0.4 -0.18 -0.19 0.05 -0.68 0.28 -0.37 0.49
0.47 0.71 0.25 0.02 0.69 0.78 -1.07 -0.12 -0.89 -0.75 -0.33 -0.68 0.14 0.08 -0.53 -0.54 -0.82 0.54 -0.26 0.13
1.36 -0.65 0.04 0.75 0.29 -0.8 -1.08 -0.2 -0.52 -0.32 0.25 -0.63 -0.13 -0.46 0.2 0.25 -0.31 -0.05 -0.38 0.11
1.3 -0.31 0.81 0.82 1.27 -1.0 -0.21 -0.97 -1.32 -1.5 -0.94 -1.55 -1.16 -1.51 -0.64 -0.17 -0.58 0.79 -0.1 0.72
1.22 -1.49 -0.07 1.37 1.01 -0.68 -0.46 -0.88 -0.78 -1.15 -0.72 -1.39 -1.31 -1.26 -1.31 0.22 -0.17 0.83 -0.57 1.07
1.36 -1.55 0.3 1.18 1.42 -0.72 -0.54 -0.86 -1.26 -1.33 -0.98 -1.23 -0.78 -0.44 -1.33 0.29 -0.77 0.43 0.0 0.55
1.27 -0.76 0.36 0.95 1.09 -0.94 -0.29 -0.99 -0.36 -0.95 -0.76 -1.19 -0.46 -0.17 -0.63 0.07 -0.59 0.45 -0.48 0.53
0.23 -1.55 -0.91 0.21 0.7 -0.73 -1.22 0.07 0.11 -0.21 0.5 -0.87 -0.19 -0.26 0.55 0.98 0.39 0.17 -1.16 0.21
0.55 -1.09 0.38 -0.01 0.48 -0.07 -0.28 0.14 -0.15 -0.29 0.37 -0.37 -0.03 -0.45 0.31 -0.29 -0.04 0.08 -0.43 0.24
0.26 -1.41 -0.92 -0.11 0.25 -0.54 -0.12 -0.12 0.08 0.0 1.08 -0.34 -0.26 -0.54 1.05 0.48 -0.07 -0.0 -0.46 -0.63
0.02 0.57 0.2 0.21 0.45 0.35 -0.28 0.01 -0.77 -0.87 -0.11 -0.24 0.33 0.4 -0.22 -0.22 -0.51 0.4 -0.46 -0.39
1.26 -1.27 -0.83 0.46 0.38 -0.43 0.22 -0.46 -0.3 -0.44 0.24 -1.12 -0.4 0.01 0.16 0.78 0.25 -0.09 -1.15 -0.09
0.51 -0.73 -0.35 -0.19 0.36 -0.94 -0.38 -0.05 0.16 0.14 0.35 -0.5 -0.01 -0.31 0.35 0.5 0.46 0.09 -1.58 0.4
0.44 -0.14 -0.18 0.18 0.52 0.16 -0.56 -0.13 -0.37 -0.52 0.12 -0.5 0.15 0.28 0.11 -0.11 -0.62 0.64 -0.56 0.13
1.62 0.25 1.55 1.09 0.27 -4.45 -1.62 -0.74 -0.8 -0.93 -0.35 -2.23 -1.66 -1.66 -0.39 0.08 -0.91 0.79 -0.16 -0.35
0.77 0.06 0.2 0.47 0.65 -0.87 -0.68 -0.03 -0.23 -0.4 0.41 -0.59 -0.68 -0.99 0.43 -0.21 -0.47 0.08 0.54 -0.29
1.53 -1.71 0.39 1.12 1.41 -1.44 -0.51 -0.48 -0.78 -0.81 -0.86 -1.11 -1.2 -1.85 -0.8 -0.47 -0.43 0.34 -0.32 0.91
0.71 -1.11 -0.7 -0.9 0.37 -2.37 -0.04 -0.24 0.17 0.16 0.94 -0.67 0.03 -0.22 0.66 0.68 0.06 -0.7 -0.96 0.5
0.49 0.61 0.06 0.75 0.64 0.8 -1.17 0.06 -0.57 -0.83 -0.64 -0.43 0.01 0.14 -0.61 -0.64 -0.51 0.26 -0.13 -0.44
1.44 0.2 0.89 0.62 0.79 -0.59 0.09 -0.44 -1.07 -1.18 -0.44 -1.71 -1.19 -1.01 -0.55 -1.06 -1.26 0.55 0.41 0.36
1.5 0.07 0.76 1.11 0.9 -0.84 0.12 -0.68 -0.78 -0.89 -0.29 -1.73 -0.87 -1.07 -0.67 -0.83 -1.2 0.29 -0.04 0.08
0.66 0.18 0.16 0.68 0.81 -0.13 -0.77 0.23 -0.56 -0.42 -0.38 -0.71 0.12 0.08 -0.15 -0.25 -0.29 0.6 -0.87 -0.8
0.8 0.03 0.35 0.18 0.9 -0.31 -0.41 -0.23 -0.04 -0.51 -0.32 -0.55 -0.2 -0.34 -0.89 -0.19 -0.57 0.7 -0.53 0.4
0.85 -0.19 0.3 0.02 0.84 -0.44 -0.42 -0.25 -0.21 -0.28 -0.01 -0.14 -1.89 -2.21 0.07 -0.25 -0.41 0.8 0.04 0.56
0.71 -1.05 -0.4 0.67 0.56 -0.27 -0.67 -0.04 -0.08 -0.5 0.85 -0.73 -1.07 -1.03 0.74 0.59 0.15 -0.55 -0.62 -0.0
0.93 -0.55 -0.27 0.82 0.79 -0.23 -0.65 -0.33 -0.31 -0.45 -0.08 -0.64 0.02 -0.08 0.14 0.27 -0.31 -0.38 -0.21 -0.04
1.0 -0.77 -0.08 0.37 0.38 0.41 -0.71 -0.02 -0.15 -0.53 0.4 -0.75 -0.87 -0.97 0.34 0.59 0.1 -0.27 -0.4 -0.1
0.78 -0.09 -0.05 0.7 0.53 0.39 -0.99 -0.18 -0.13 -0.55 -0.01 -1.08 -0.05 -0.37 0.61 0.07 -0.34 -0.34 -0.29 -0.27
0.99 -0.42 0.1 0.45 0.69 0.45 -0.86 -0.24 -0.23 -0.68 -0.11 -0.75 -0.11 -0.17 -0.04 0.48 -0.26 -0.24 -0.48 -0.19
0.88 -0.09 0.1 0.87 0.59 0.5 -0.88 -0.04 -0.35 -0.57 0.41 -0.7 -1.1 -1.35 0.24 0.04 -0.21 -0.35 0.16 -0.6
0.96 0.09 0.09 0.73 0.53 1.07 -0.71 -0.15 -0.47 -0.65 0.2 -0.99 -1.25 -1.71 0.05 -0.1 -0.43 -0.04 0.13 -0.51
0.36 0.39 0.07 0.28 0.73 -0.72 -1.22 -0.1 -0.16 -0.2 0.65 -0.5 -1.02 -1.29 0.47 -0.28 -0.61 -0.06 0.49 0.44
1.51 0.04 0.85 0.9 1.07 -0.98 -0.4 -0.61 -0.55 -0.84 -0.64 -1.7 -2.31 -2.85 -0.72 -0.68 -0.52 0.83 -0.23 0.43
1.27 -0.03 0.15 1.3 1.24 -0.15 -0.7 -0.82 -1.3 -1.6 -0.53 -1.59 -0.98 -0.53 -0.09 -0.73 -0.84 0.45 -0.88 0.69
0.74 -0.64 0.43 0.94 0.52 -0.0 -0.28 -0.2 -0.66 -0.61 0.21 -0.96 -0.11 -0.2 0.16 -0.66 -0.56 0.19 -0.07 0.0
0.31 -1.34 -0.75 0.47 0.37 -0.19 -1.35 0.3 0.06 0.03 0.31 -0.48 0.4 0.3 0.21 -0.16 0.21 0.13 0.11 -0.67
1.68 -0.27 0.92 0.86 1.04 -2.27 -0.91 -0.23 -1.16 -1.26 -0.75 -0.72 -1.04 -0.92 -0.51 -0.62 -0.8 0.48 -0.37 0.51
0.75 -0.11 0.17 0.81 0.71 -2.7 -0.63 -0.44 -0.02 -0.42 -0.04 -0.79 -0.75 -0.63 0.03 1.04 -0.28 -0.06 -0.4 0.24
1.0 -0.17 -0.29 0.94 0.76 -1.69 -0.39 -0.26 -0.21 -0.5 0.5 -0.82 -0.46 -0.38 -0.04 0.17 -0.37 -0.16 0.14 -0.21
0.79 0.12 0.1 1.08 0.7 -2.16 -0.59 -0.3 -0.42 -0.62 0.42 -0.9 -1.34 -1.25 0.25 0.34 -0.42 0.27 -0.04 0.26
0.03 0.16 0.4 0.55 0.45 0.7 -0.83 0.1 -0.81 -0.84 -0.1 -0.85 0.01 -0.29 0.02 -0.98 -0.63 0.39 0.55 0.08
1.54 -0.07 0.74 0.72 1.05 -0.68 0.02 -0.6 -0.57 -0.91 0.22 -1.48 -1.54 -1.23 -0.23 0.02 -0.91 -0.05 -0.45 -0.2
0.63 -0.31 0.16 0.49 0.42 0.23 -0.09 -0.12 -0.63 -0.55 0.08 -0.33 -0.27 -0.31 0.12 -0.26 0.25 0.18 -0.01 -0.51
0.7 -0.31 -0.27 0.11 0.76 0.82 -0.85 0.09 -0.91 -0.77 -0.41 -0.87 0.27 -0.3 -0.3 -0.66 -0.76 0.74 0.49 0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.