Heatmap: Cluster_105 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-0.79 -0.44 -1.21 -2.3 -1.1 0.76 0.93 0.08 -0.04 -0.14 0.4 -0.81 0.19 -0.57 0.29 -3.59 -2.54 -1.49 1.39 1.54
0.24 0.6 0.25 -0.37 0.39 0.65 0.43 -0.23 -0.53 -0.5 -0.04 -0.7 -1.12 -1.27 0.03 -1.03 -0.79 0.31 0.78 0.44
0.33 0.15 0.09 0.36 0.14 1.0 -0.18 -0.31 -0.97 -0.9 -0.28 -0.88 -0.78 -1.04 -0.16 -0.91 -1.11 0.52 1.06 0.68
0.37 0.55 -0.1 0.05 0.02 0.36 0.18 0.05 -0.36 -0.4 0.32 -0.35 -0.74 -0.92 0.22 -0.25 -0.74 -0.15 0.35 0.43
0.33 0.12 -0.09 0.16 0.34 0.46 0.67 0.11 -0.63 -0.6 -0.04 -0.87 0.19 0.05 -0.01 -0.64 -0.76 -0.23 0.46 -0.25
0.47 0.54 0.29 0.37 0.27 0.44 0.73 -0.09 -0.62 -0.53 -0.55 -1.04 -0.27 -0.4 -0.33 -0.58 -0.89 -0.11 0.71 -0.28
0.4 0.39 0.38 0.52 0.53 0.55 -0.21 -0.24 -0.85 -0.83 -0.12 -1.04 -0.56 -0.62 -0.26 -1.42 -1.04 0.52 0.89 0.22
0.35 -0.08 0.39 -0.1 0.69 0.69 -0.27 -0.08 -1.07 -1.09 -0.35 -0.98 -0.7 -0.66 -0.03 -0.94 -0.53 0.72 0.67 0.69
0.3 -0.08 -0.42 -0.41 0.06 -0.99 0.75 -0.28 -0.52 -0.63 0.07 -0.31 0.07 -0.05 0.24 -1.11 -1.09 -0.0 0.34 1.42
0.28 -0.1 0.17 0.36 0.17 0.47 1.06 -0.43 -0.3 -0.37 -0.06 -0.84 -0.9 -1.03 0.06 -0.21 -0.45 0.15 0.3 0.0
0.33 0.03 -0.11 0.28 0.3 -0.17 1.03 0.29 -0.6 -0.61 -0.14 -0.27 0.45 0.18 -0.06 -0.81 -1.07 -0.25 -0.23 -0.08
0.79 -0.43 0.39 0.31 0.2 0.48 0.77 -0.11 -0.79 -0.77 -0.3 -0.8 -1.14 -1.45 -0.3 -1.11 -0.66 0.16 0.78 0.74
1.08 0.33 0.18 0.61 0.64 0.41 1.03 -1.14 -1.43 -1.54 -0.73 -1.66 -2.01 -1.99 -0.68 -0.77 -1.47 -0.35 1.22 0.83
0.67 0.36 0.22 0.54 0.89 0.95 0.37 -0.21 -0.67 -0.7 -0.15 -1.38 -0.98 -1.11 0.04 -1.51 -1.31 0.02 0.26 0.08
0.72 -0.05 0.39 0.59 0.33 -0.17 0.27 0.02 -0.63 -0.54 -0.31 -0.67 0.01 -0.23 -0.43 -0.83 -0.69 0.07 0.48 0.27
0.81 -0.4 0.67 0.45 0.26 0.63 0.88 -0.5 -0.71 -0.98 -0.58 -1.2 -1.21 -1.23 -0.77 -0.69 -0.49 0.09 0.66 0.67
0.18 -0.2 -0.07 -0.41 0.45 0.57 -0.16 -0.08 -0.46 -0.46 -0.09 -0.57 0.12 0.05 0.04 -0.77 -0.69 0.38 0.89 0.04
1.01 -0.01 0.55 0.89 0.73 -0.36 0.83 -0.96 -1.33 -1.38 -0.28 -1.57 -0.73 -1.49 -0.29 -0.74 -1.85 -0.16 0.67 0.9
0.65 -0.08 0.34 0.21 0.35 0.29 -0.05 -0.04 -0.39 -0.57 -0.38 -0.39 -0.52 -0.75 -0.38 -0.57 -0.15 0.23 0.7 0.27
0.45 -0.47 0.05 -0.26 0.1 0.84 -0.44 0.48 -0.34 -0.41 0.1 -0.15 0.15 -0.11 -0.05 -0.84 -0.39 0.23 0.23 -0.2
-0.28 -0.36 -0.49 0.09 0.42 0.79 0.31 -0.14 -0.46 -0.47 0.6 -0.51 -0.49 -0.61 0.56 -0.44 -0.16 -0.07 0.2 0.21
0.2 0.08 -0.55 -0.19 0.13 0.43 -0.03 0.13 -0.21 -0.25 0.06 -0.72 0.28 0.09 0.16 -0.41 -0.54 0.18 0.45 0.02
-0.18 0.06 -0.58 0.25 0.84 0.44 0.06 0.22 -0.62 -0.61 -0.85 -0.38 0.57 0.03 -0.62 -0.73 -1.32 0.34 1.12 -0.66
0.63 0.34 0.31 0.52 0.39 0.14 0.03 -0.1 -0.67 -0.56 0.13 -0.98 -0.52 -0.9 0.01 -1.09 -0.78 0.12 0.72 0.29
0.58 0.1 -0.55 -0.17 0.29 0.77 0.38 0.17 -0.46 -0.53 -0.11 -0.5 -0.52 -0.64 -0.15 -0.31 -0.44 0.26 0.42 0.18
0.36 0.22 0.29 0.72 0.59 0.55 0.18 0.09 -0.85 -0.96 -0.98 -0.98 0.31 -0.05 -0.71 -0.97 -0.83 0.43 0.53 -0.43
0.2 0.33 -0.0 0.06 0.54 0.23 -0.13 -0.01 -0.45 -0.59 0.17 -0.39 -0.41 -0.5 0.21 -0.62 -0.34 0.26 0.51 0.09
-0.11 -1.45 -1.29 -0.71 -0.68 0.8 0.29 0.31 -0.14 -0.19 0.57 -0.31 0.06 -0.14 0.49 -0.75 -0.47 -0.65 0.49 1.05
0.54 -0.53 0.01 0.18 0.21 0.57 0.09 0.02 -0.51 -0.81 -0.09 -0.66 -0.41 -0.53 -0.2 -0.5 0.18 0.34 0.65 0.23
-2.3 -1.78 -2.69 -2.26 -0.98 0.43 0.34 0.01 0.32 0.12 1.05 -0.51 0.55 0.33 1.08 0.04 0.06 -0.74 -0.76 0.85
-1.8 -1.56 -2.53 -1.69 -0.74 0.49 0.34 0.16 0.2 -0.04 1.42 -0.62 -0.42 -1.02 1.57 -0.3 0.04 -0.64 -0.15 0.54
0.58 1.38 0.27 0.44 0.1 0.64 1.18 -0.37 -1.75 -2.26 -1.14 -1.43 -1.55 -1.79 -1.1 -2.32 -1.29 -0.59 1.77 -0.79
0.46 -0.21 -0.46 -0.01 0.39 0.32 0.49 -0.09 -0.56 -0.59 -0.01 -0.87 -0.75 -0.88 0.05 -0.49 -0.63 0.39 0.7 0.84
0.59 -0.12 0.28 0.59 0.51 -0.55 -0.4 -0.19 -0.45 -0.49 0.21 -1.29 0.05 -0.33 -0.16 -1.28 -1.14 0.0 1.41 -0.24
0.15 -0.12 -0.19 0.35 0.93 0.7 0.3 0.27 -0.77 -1.06 -0.95 -0.35 -0.12 -0.06 -0.88 -1.44 -1.64 0.61 0.95 -0.13
-0.23 -0.02 -0.87 0.08 -0.12 1.08 0.06 0.06 -0.53 -0.6 0.27 -0.89 0.09 -0.09 0.36 -0.05 -0.56 -0.18 0.5 0.16
1.35 0.53 0.78 1.21 0.83 -1.29 -0.44 -0.73 -1.3 -1.08 -1.1 -2.39 -0.68 -1.21 -0.44 -3.04 -2.08 -0.43 1.67 -0.25
1.36 0.32 0.54 0.14 0.35 -0.62 -0.25 -0.61 -1.02 -0.98 -0.66 -2.5 -0.71 -1.53 -0.44 -1.29 -2.11 0.12 1.7 0.79
0.43 0.6 -0.01 0.04 0.56 0.93 0.39 -0.44 -0.65 -0.54 -0.08 -1.17 -0.43 -0.82 -0.12 -0.56 -0.76 -0.02 0.4 0.23
-0.55 -0.44 -0.51 -0.43 -0.05 0.49 0.19 0.05 -0.14 -0.26 0.59 -0.44 0.03 0.01 0.43 0.03 -0.06 -0.16 0.26 0.22
0.04 0.35 -0.4 -0.24 0.33 0.18 0.86 -0.05 -0.58 -0.76 0.73 -0.84 -0.46 -0.77 0.79 -0.84 -0.69 -0.36 0.56 -0.07
0.34 0.12 0.2 0.12 -0.01 0.21 1.0 0.0 -0.43 -0.53 0.06 -0.79 -0.36 -0.63 0.0 -0.56 -0.13 -0.01 0.29 -0.05
0.0 0.3 0.12 0.4 0.5 0.24 0.18 0.06 -0.37 -0.49 -0.12 -0.44 -0.22 -0.44 -0.28 -0.7 -0.99 0.27 0.64 0.2
0.28 -0.33 -0.37 0.01 -0.31 0.6 1.21 0.39 -0.42 -0.67 0.42 -0.44 -0.47 -0.89 0.28 -0.85 -0.42 -0.38 0.42 -0.09
0.06 0.27 0.01 0.24 0.56 0.52 0.37 0.04 -0.96 -0.84 -0.68 -0.84 -0.11 -0.21 -0.51 -0.91 -0.82 0.57 0.9 0.18
0.25 0.37 0.03 0.23 0.36 0.77 0.4 -0.08 -0.61 -0.65 -0.13 -0.72 -0.57 -0.74 -0.19 -1.04 -0.93 0.26 0.71 0.37
-0.39 0.16 -0.58 -0.32 0.82 0.39 0.58 -0.02 -0.46 -0.67 -0.11 -0.71 -1.06 -1.07 -0.02 -0.45 -0.57 0.62 0.52 0.91
-0.18 -0.65 -0.53 -0.33 0.13 0.47 -0.05 0.06 -0.18 -0.22 0.46 -0.64 0.23 0.2 0.45 -0.21 0.07 0.17 0.2 -0.2
0.15 0.89 -0.31 0.6 0.32 0.23 0.07 0.17 -0.3 -0.34 0.25 -1.44 -0.47 -1.06 0.16 -0.39 -0.42 0.04 0.71 -1.12
0.31 -0.94 0.61 -0.4 0.66 -1.55 2.12 -1.3 -0.41 -0.07 0.23 -1.92 -1.75 -2.28 0.69 -0.97 -0.96 -1.41 0.32 0.45
-0.3 -0.33 -0.41 -0.24 0.21 0.95 0.42 0.15 -0.63 -0.86 -0.13 -0.06 -0.1 -0.18 -0.01 -0.8 0.23 0.24 0.2 0.39
0.09 -0.43 -0.09 0.36 0.16 0.02 0.54 -0.02 -0.12 -0.03 0.17 -0.46 -0.33 -0.59 0.17 -0.68 -0.68 0.22 0.69 0.05
0.23 -0.45 -0.54 -0.03 0.59 1.06 0.58 -0.05 -0.87 -0.78 0.18 -0.92 -0.63 -0.54 0.22 -0.95 -0.87 -0.08 1.06 -0.01
0.95 0.21 0.27 0.33 0.0 0.15 -0.08 -0.49 -0.6 -1.25 -0.5 -1.33 -0.9 -1.05 -0.49 -0.5 -1.55 0.07 1.56 0.77
0.03 -0.26 -0.42 -0.22 -0.16 0.61 0.17 -0.11 -0.31 -0.14 0.54 -0.83 -0.55 -0.89 0.49 -0.24 0.12 0.14 0.06 0.7
0.93 0.21 -0.08 0.34 0.59 -0.84 -0.39 -0.51 -0.47 -0.77 -0.2 -1.21 -0.56 -0.83 -0.2 -0.12 -0.78 -0.13 1.53 0.25
1.39 0.71 0.61 0.73 1.17 -0.82 -0.1 -0.78 -1.09 -1.22 -1.59 -2.96 -0.64 -0.88 -1.28 -2.05 -2.89 -0.0 1.44 0.25
-0.34 0.53 -0.66 -0.14 0.24 0.61 -0.19 0.11 -0.11 -0.12 -0.02 -0.59 0.65 0.28 0.04 -0.97 -1.24 0.02 0.69 -0.51
-1.37 -3.41 -2.66 -1.06 -0.96 0.73 1.43 -0.2 -0.15 -0.31 1.1 -0.72 1.02 1.04 1.13 -1.21 -0.67 -0.75 -1.85 -1.02
-0.16 0.17 -0.22 0.03 0.63 0.45 0.26 0.16 -0.78 -0.8 0.25 -0.64 -0.19 -0.24 0.3 -1.16 -0.64 -0.13 0.85 0.19
-2.12 -3.91 -3.21 -3.37 -3.65 0.3 1.25 -0.22 0.08 0.1 1.09 -1.43 -0.13 -0.63 0.93 -3.31 -2.15 -1.99 0.99 2.1
0.66 0.15 0.06 0.47 0.39 0.53 0.06 -0.13 -0.61 -0.62 -0.47 -1.09 0.03 -0.23 -0.39 -1.39 -1.05 0.08 1.22 -0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.