1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_256 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.05 0.21 0.09 0.09 0.06 1.0 0.01 0.08 0.17 0.15 0.03 0.03 0.32 0.18 0.03 0.04 0.05 0.05 0.0 0.06
Gb_01128 (RNS1)
 0.09 0.17 0.1 0.24 0.31 1.0 0.06 0.22 0.05 0.05 0.11 0.14 0.09 0.12 0.13 0.07 0.12 0.15 0.06 0.09
0.28 0.01 0.05 0.06 0.05 1.0 0.0 0.21 0.16 0.15 0.03 0.11 0.1 0.06 0.03 0.03 0.13 0.04 0.02 0.05
0.37 0.36 0.19 0.12 0.17 1.0 0.01 0.19 0.06 0.06 0.03 0.04 0.07 0.04 0.02 0.06 0.08 0.21 0.12 0.08
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_01493 (ARA5)
 0.28 0.18 0.23 0.22 0.23 1.0 0.12 0.39 0.13 0.14 0.17 0.22 0.23 0.18 0.17 0.13 0.2 0.39 0.21 0.4
0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 1.0 0.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.04 0.1
Gb_02849 (NAC2)
 0.07 0.05 0.03 0.01 0.05 1.0 0.02 0.14 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
Gb_03236 (PIP3B)
 0.03 0.14 0.07 0.1 0.09 1.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.19 0.04 0.15 0.15 0.13 1.0 0.02 0.11 0.03 0.03 0.03 0.05 0.06 0.06 0.03 0.05 0.05 0.09 0.03 0.2
Gb_04243 (SSL5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_05533 (PHR1)
 0.26 0.47 0.26 0.2 0.28 1.0 0.4 0.42 0.27 0.22 0.5 0.22 0.29 0.25 0.48 0.34 0.3 0.07 0.05 0.56
0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.0 0.07 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
Gb_07454 (NLM2)
 0.01 0.04 0.04 0.01 0.02 1.0 0.02 0.1 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.29
0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 1.0 0.01 0.21 0.06 0.06 0.03 0.22 0.11 0.15 0.01 0.03 0.1 0.01 0.0 0.06
Gb_07810 (WRKY6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.04 0.16 0.27 0.17 1.0 0.0 0.11 0.01 0.01 0.0 0.16 0.0 0.01 0.0 0.01 0.14 0.07 0.04 0.14
Gb_08840 (MC5)
 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 1.0 0.02 0.06 0.02 0.02 0.07 0.01 0.01 0.01 0.14 0.03 0.06 0.05 0.01 0.47
Gb_08963 (SLY1)
 0.27 0.14 0.05 0.02 0.03 1.0 0.37 0.06 0.01 0.01 0.0 0.24 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.88
Gb_10432 (ATB2)
 0.2 0.56 0.18 0.15 0.16 1.0 0.01 0.19 0.14 0.1 0.21 0.13 0.06 0.06 0.19 0.22 0.1 0.06 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.09 0.03 0.03 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.06 0.02 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.23 0.03 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.05 0.12 0.03 0.01 0.13
0.02 0.02 0.04 0.05 0.02 1.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.06 0.07
0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.64 0.23 0.18 0.23 0.21 0.06 0.0 0.02 0.15 0.18 0.28 0.0 0.0 0.65
Gb_13280 (ACX3)
 0.2 0.13 0.16 0.15 0.16 1.0 0.09 0.22 0.09 0.1 0.1 0.1 0.07 0.04 0.12 0.1 0.12 0.12 0.08 0.23
Gb_14581 (CYP76G1)
 0.34 0.4 0.07 0.08 0.04 1.0 0.1 0.21 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.31 0.31 0.28 0.33 0.33 1.0 0.15 0.29 0.19 0.16 0.24 0.16 0.21 0.2 0.2 0.24 0.18 0.23 0.26 0.21
Gb_16345 (PAH2)
 0.09 0.15 0.08 0.1 0.23 1.0 0.08 0.27 0.12 0.14 0.29 0.15 0.08 0.07 0.36 0.12 0.06 0.19 0.06 0.38
0.09 0.12 0.1 0.12 0.23 1.0 0.14 0.3 0.17 0.18 0.24 0.16 0.27 0.27 0.26 0.17 0.26 0.22 0.12 0.22
0.08 0.06 0.11 0.01 0.08 1.0 0.12 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.18
0.3 0.66 0.39 0.52 0.11 1.0 0.0 0.29 0.36 0.3 0.09 0.09 0.01 0.01 0.02 0.68 0.32 0.06 0.0 0.07
0.15 0.23 0.15 0.28 0.1 1.0 0.0 0.23 0.22 0.15 0.07 0.07 0.01 0.01 0.03 0.39 0.13 0.05 0.0 0.22
Gb_20481 (HHP4)
 0.05 0.0 0.04 0.05 0.04 1.0 0.03 0.16 0.02 0.04 0.16 0.05 0.16 0.11 0.08 0.02 0.08 0.03 0.04 0.03
0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.14 0.29 0.05 0.09 0.17 0.11 0.06 0.04 0.12 0.03 0.03 0.02 0.01 0.21
Gb_22577 (emb1187)
 0.35 0.22 0.36 0.37 0.3 1.0 0.08 0.37 0.14 0.11 0.32 0.19 0.05 0.05 0.31 0.24 0.2 0.31 0.25 0.24
0.28 0.67 0.23 0.6 0.75 1.0 0.04 0.51 0.13 0.14 0.24 0.43 0.3 0.32 0.25 0.22 0.37 0.45 0.05 0.21
Gb_24391 (CRK2)
 0.59 0.05 0.15 0.17 0.09 1.0 0.0 0.5 0.06 0.08 0.03 0.04 0.05 0.05 0.0 0.0 0.03 0.1 0.05 0.52
0.53 0.16 0.2 0.3 0.17 1.0 0.09 0.39 0.05 0.04 0.06 0.09 0.07 0.04 0.1 0.07 0.13 0.21 0.43 0.41
Gb_27117 (CLT3)
 0.32 0.14 0.29 0.25 0.32 1.0 0.26 0.27 0.02 0.03 0.07 0.13 0.04 0.05 0.07 0.02 0.05 0.25 0.12 0.27
0.3 0.26 0.09 0.1 0.1 0.97 0.19 0.29 0.45 0.32 0.38 0.27 0.47 0.41 0.41 1.0 0.25 0.21 0.08 0.49
0.13 0.14 0.17 0.14 0.14 1.0 0.05 0.17 0.11 0.1 0.07 0.18 0.12 0.08 0.09 0.12 0.19 0.19 0.14 0.02
Gb_28688 (ZAT)
 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.18 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
Gb_28689 (ZAT)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 1.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.04 0.07 0.04 0.09 0.08 1.0 0.07 0.24 0.1 0.12 0.09 0.11 0.1 0.07 0.11 0.05 0.14 0.17 0.32 0.07
0.09 0.01 0.04 0.05 0.12 1.0 0.12 0.36 0.13 0.17 0.28 0.12 0.09 0.07 0.27 0.11 0.23 0.2 0.4 0.16
0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.4
0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.05 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.04
0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01 0.12 0.01 0.01 0.03 0.09 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.45
0.22 0.1 0.21 0.2 0.21 1.0 0.04 0.16 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.07 0.04 0.06 0.15 0.16 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.21 0.03 0.04 0.02 0.01 0.05 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02
0.25 0.29 0.28 0.2 0.19 1.0 0.05 0.25 0.09 0.09 0.19 0.12 0.06 0.07 0.19 0.11 0.14 0.16 0.08 0.12
Gb_35370 (INT2)
 0.53 0.14 0.21 0.21 0.29 1.0 0.35 0.51 0.04 0.03 0.06 0.18 0.09 0.12 0.04 0.03 0.04 0.11 0.04 0.68
Gb_35579 (EXL2)
 0.34 0.47 0.42 0.27 0.17 1.0 0.0 0.19 0.11 0.11 0.02 0.06 0.05 0.09 0.05 0.54 0.14 0.39 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.03 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.03 0.02 0.02 0.08 0.13 1.0 0.03 0.33 0.02 0.02 0.09 0.03 0.06 0.09 0.13 0.02 0.02 0.17 0.37 0.09
Gb_36876 (PP2C5)
 0.27 0.04 0.09 0.02 0.04 1.0 0.07 0.17 0.13 0.07 0.01 0.08 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.04 0.03 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.01 0.05 0.03 0.0 0.03 1.0 0.05 0.06 0.13 0.12 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.0 0.1 0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)