Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.14 -0.68 0.56 0.89 -0.12 -0.97 -0.77 0.08 0.11 -0.16 0.01 -0.57 -0.46 -0.53 -0.2 1.07 0.35 -0.45 -1.3 -1.66
1.04 -0.13 0.7 0.87 -0.28 -1.72 -1.76 -0.09 0.15 -0.15 0.17 -0.83 -0.4 -0.05 0.02 1.23 0.05 -0.52 -1.42 -1.58
1.45 0.57 0.92 1.21 0.09 -1.09 -2.14 -0.24 -0.14 -0.61 -0.3 -0.99 -1.84 -1.85 -0.23 1.07 -0.06 -0.49 -0.71 -1.7
0.57 0.91 0.44 0.35 -0.47 -1.49 -2.62 0.13 0.4 -0.14 -0.66 -1.0 -0.07 0.27 -0.48 1.81 -0.25 -0.24 -2.94 -3.28
0.92 0.19 1.05 1.03 0.25 -0.41 -1.84 0.03 0.01 -0.47 -0.28 -0.78 0.22 -0.09 -0.19 -0.27 0.25 -0.17 -1.8 -1.7
2.63 -0.45 1.0 2.73 0.17 -0.31 -5.62 -0.61 -7.3 -6.93 - -4.69 - -11.41 - -1.76 -0.44 -0.45 - -6.91
1.35 0.31 0.63 2.23 -0.02 0.16 -4.65 -0.19 -1.54 -1.25 -4.66 -1.4 -3.79 -3.84 -5.41 0.66 1.47 0.3 - -8.13
0.67 -0.07 0.32 1.17 0.07 -0.27 -1.51 0.01 -0.03 -0.46 -0.54 -0.98 -0.15 -0.31 -0.67 0.84 0.27 0.24 -0.71 -0.52
0.51 -0.65 0.05 0.7 0.57 -3.29 -0.83 0.3 0.59 0.3 0.65 -0.59 0.02 -0.09 0.52 0.35 0.31 -1.36 -0.99 -3.02
0.94 -0.06 0.99 0.81 -0.06 -0.5 -1.59 0.17 -0.02 -0.67 -0.09 -0.95 -0.37 -0.62 -0.3 0.79 0.05 -0.06 -0.49 -0.96
0.98 -0.19 0.48 0.99 0.26 -0.99 -1.84 0.27 0.05 -0.44 0.42 -0.35 -0.26 -0.18 0.22 0.93 -0.42 -0.51 -2.2 -2.14
1.51 0.03 1.03 0.75 0.84 -0.02 -3.57 -0.41 -0.56 -1.16 -0.89 -0.45 -5.85 -4.75 -0.89 1.11 0.44 0.35 -0.43 -1.96
1.08 0.32 0.94 0.92 0.7 -0.54 -2.73 -0.08 -0.57 -1.5 0.19 -0.56 -1.84 -1.56 -0.75 1.21 0.2 0.09 -1.64 -0.99
1.31 0.19 0.78 1.5 0.44 -0.52 -2.17 -0.31 -0.77 -1.25 -0.13 -0.71 -2.17 -1.51 -0.53 1.15 0.37 -0.23 -2.01 -1.52
2.29 -0.28 1.2 1.53 1.14 -1.28 0.03 -0.15 -1.28 -2.01 -2.73 -0.77 -1.25 -0.98 -3.66 -2.01 -0.23 -0.64 -1.4 -5.32
0.59 -0.03 0.5 0.91 -0.82 -0.91 -2.72 0.04 0.3 -0.11 -0.0 -0.28 -0.47 -0.27 -0.08 1.52 0.62 -0.75 -1.71 -2.49
0.84 0.95 0.97 1.0 0.25 0.14 -0.67 -0.15 -0.6 -1.07 -0.48 -1.07 -0.43 -0.49 -0.54 0.29 -0.37 0.01 -0.78 -1.18
1.38 -0.53 0.69 0.99 0.31 -0.73 -1.11 -0.18 -0.04 -0.25 0.36 -0.8 -1.84 -1.67 0.4 0.69 -0.01 -0.28 -0.87 -1.44
1.33 -0.41 0.4 1.71 0.57 0.27 -0.2 -0.27 -0.88 -1.71 -0.53 -1.03 0.15 0.3 -0.68 -0.6 -1.2 0.0 -1.97 -1.32
1.2 1.13 1.32 1.23 0.33 0.46 -0.4 -0.13 -0.63 -1.07 -1.97 -1.19 -0.87 -0.95 -1.04 -0.26 -0.94 -0.12 -1.5 -1.5
1.18 0.06 0.64 1.35 0.65 -0.04 -0.1 -0.04 -1.11 -1.12 -0.65 -0.51 -0.81 -0.76 -0.71 0.03 0.1 0.13 -0.79 -1.61
0.88 0.34 0.39 0.81 -0.42 -1.55 -2.56 0.01 1.14 0.13 -0.73 -1.03 -0.26 -0.09 -0.34 1.26 0.23 -0.56 -2.32 -2.55
1.1 0.38 0.67 1.06 -0.06 -1.45 -0.76 -0.39 -0.16 -0.55 -0.62 -0.58 0.02 0.18 -0.57 0.79 0.14 -0.56 -0.48 -1.87
1.39 -0.83 0.74 0.93 0.11 -2.08 -1.56 0.02 -0.21 -0.54 -0.29 0.03 -0.48 -0.65 -0.45 0.53 1.01 -0.99 -0.33 -1.54
1.66 0.64 0.59 0.8 0.78 -2.55 -3.08 -0.14 -0.38 -0.12 -0.0 0.03 0.08 -0.67 -0.25 0.14 0.42 -1.19 - -
1.83 0.89 0.6 1.29 0.85 -1.92 -3.35 -0.1 -0.69 -0.46 -0.16 -0.33 -0.03 -0.9 -0.45 -0.31 -0.04 -1.17 -10.11 -6.55
1.0 0.58 0.71 1.04 -0.18 -1.01 -2.57 0.09 0.52 0.15 -0.32 -1.12 -1.2 -0.82 -0.36 0.85 -0.03 -0.22 -0.76 -1.39
0.2 0.41 0.79 0.17 -0.77 -0.75 -3.73 0.16 0.51 0.2 -0.62 -0.04 0.14 -0.02 -0.7 1.36 0.84 -0.29 -3.09 -3.62
1.22 1.24 0.23 0.88 0.4 -1.28 -1.99 0.03 0.05 0.64 -0.71 -0.07 -0.67 -1.97 -1.32 -0.07 0.46 0.5 -4.8 -3.82
1.1 0.44 0.55 1.45 0.13 0.21 -1.35 -0.05 -0.45 -0.49 -0.28 -1.13 -0.33 -0.59 -0.32 -0.02 -0.59 0.2 -2.05 -0.57
0.83 -0.07 0.31 0.56 0.02 -0.48 -0.75 -0.23 0.27 -0.06 0.16 -1.36 -0.2 -0.2 0.09 1.08 -0.32 -0.23 -0.76 -0.95
1.06 0.01 0.39 0.48 0.58 -1.34 -0.6 -0.26 0.2 0.03 -0.06 -0.82 -0.04 0.09 -0.37 0.0 -0.44 -0.21 -0.12 -0.35
1.2 -0.56 -0.21 0.8 -0.21 -2.22 -1.05 -0.33 0.04 -0.39 -0.09 -1.2 0.21 0.35 0.05 1.16 -0.25 0.03 -0.39 -0.77
1.62 0.21 0.92 1.24 -0.03 -2.51 -1.94 -0.75 0.11 -0.21 0.1 -2.05 -1.72 -1.2 -0.07 0.72 0.25 -0.05 -1.52 -1.32
1.86 1.24 1.22 2.02 -0.27 -1.28 -0.02 -1.28 -4.2 -4.18 -6.73 -4.76 -3.92 -3.27 -6.54 0.26 -1.11 0.33 0.43 -1.4
0.96 0.03 0.67 0.55 0.41 -0.87 -1.52 -0.07 -0.06 -0.33 0.2 -0.64 -0.75 -0.68 0.16 0.83 0.23 -0.28 -0.86 -0.72
1.22 0.67 0.84 1.41 0.98 0.19 -4.18 -0.67 -0.99 -1.04 -1.17 -0.21 -1.06 -0.82 -0.97 0.36 0.15 0.24 -2.05 -2.83
1.27 -0.05 0.66 1.0 -0.07 -0.29 -0.75 -0.19 -0.36 -0.53 -0.25 -0.14 -0.17 -0.23 -0.3 0.12 -0.25 -0.53 -0.43 -0.6
0.74 0.28 0.64 1.27 0.48 -2.08 -4.21 0.08 -0.71 -1.25 -2.24 -1.94 -1.55 -1.07 -2.16 0.82 0.03 1.69 -0.62 0.27
1.82 0.7 0.74 1.29 -0.22 -1.49 -1.78 0.0 0.04 -0.35 0.46 -0.88 -0.54 -0.82 0.07 -0.44 -0.35 -0.88 -4.47 -4.02
1.53 0.34 -0.1 2.3 1.11 1.06 -6.06 -0.42 -4.5 -3.81 -4.6 -1.2 -3.67 -3.59 -5.06 -0.22 0.65 0.82 -11.05 -5.87
0.59 -0.82 -0.34 0.32 -0.36 -1.48 -1.45 -0.14 0.41 0.23 1.25 -0.43 -0.71 -0.99 1.02 0.8 0.7 -0.65 -1.38 -1.63
0.92 -0.11 0.27 1.11 0.01 -1.63 -1.78 -0.13 0.19 -0.16 0.58 -0.84 -0.61 -0.58 0.41 1.14 0.05 -0.43 -1.57 -2.17
1.37 1.5 0.86 1.12 0.57 -1.62 -0.99 -0.67 -0.49 -0.53 -0.17 -1.37 -0.86 -0.84 -0.22 -0.0 -1.54 -0.59 -0.99 -1.02
1.13 0.32 0.91 0.83 -0.68 -0.6 -2.88 0.15 0.26 -0.26 -0.45 -0.77 -0.88 -1.07 -0.39 1.53 0.55 -0.69 -2.64 -3.33
2.15 1.21 1.38 1.53 1.19 -0.81 0.04 -1.35 -3.96 -3.95 -4.04 -2.03 -4.12 -4.35 -4.78 -0.45 -1.22 0.57 -2.65 -3.43
1.89 1.36 1.97 2.34 1.09 -1.13 -4.65 -1.1 - -8.13 - - -7.71 - - -5.44 -5.1 0.61 -7.96 -3.98
1.25 -0.11 0.53 1.21 0.27 -3.2 -2.06 -0.28 0.35 -0.16 0.23 -1.45 -0.94 -0.92 0.03 1.07 0.39 -0.38 -1.48 -2.08
0.6 0.02 0.08 0.86 0.05 -0.75 -0.42 -0.09 0.01 -0.23 0.08 -0.22 -0.09 -0.05 0.04 0.42 0.16 -0.44 -0.39 -0.69
1.91 0.25 0.6 1.73 0.63 -0.42 -4.19 -0.21 -2.9 -2.38 -5.28 -0.38 -3.04 -3.48 -5.07 0.44 1.35 0.73 -4.36 -5.77
1.33 -0.47 0.89 2.24 1.91 -0.63 -2.21 0.38 - - - - - - - -3.2 -2.07 1.89 -2.68 -4.02
1.52 -0.1 0.91 0.97 0.04 0.19 -2.81 0.27 -0.17 -1.08 -0.2 -0.68 -0.71 -0.9 -0.55 0.53 0.42 -0.64 -1.0 -2.16
1.08 -0.84 0.13 0.56 0.24 -2.21 -1.42 0.02 0.33 -0.05 0.28 -0.69 -0.51 -0.6 0.13 1.05 0.37 -0.27 -0.59 -0.72
0.29 0.12 0.23 0.98 0.41 -0.42 -1.52 0.05 -0.07 -0.35 -0.16 -0.4 0.29 0.2 -0.23 0.48 0.19 -0.12 -0.6 -1.5
2.73 0.65 2.28 1.66 0.27 -1.35 -1.2 -0.61 - - - -8.89 - - - - - 0.15 - -7.38
1.01 0.02 0.9 1.58 0.08 -0.92 -2.16 -0.24 -0.67 -0.98 -0.3 -0.79 0.25 0.33 -0.12 0.09 -0.41 -0.25 -0.81 -1.64
0.82 0.58 0.71 1.3 -0.47 -0.18 -5.69 -0.19 -0.58 -1.32 -0.99 -0.69 -1.07 -0.49 -1.38 1.67 0.95 -0.26 -4.7 -1.4
1.08 -0.48 -0.31 0.9 0.74 -2.04 -3.23 0.08 0.79 0.23 -0.14 -0.92 -1.18 -0.84 0.09 1.17 -0.33 -0.17 -1.2 -0.66
2.05 1.88 1.11 1.75 1.42 -0.52 -0.76 -1.13 -5.71 -5.01 -3.89 -3.39 -4.66 -5.13 -4.19 -1.22 -1.36 0.13 -5.92 -
2.0 1.32 1.2 2.03 0.93 -2.07 -2.09 -0.45 -1.98 -1.86 -4.21 -4.97 -2.7 -3.34 -4.04 0.05 0.16 -0.27 -4.69 -4.19
0.99 -0.2 -0.07 2.14 1.4 0.13 -3.85 0.15 -0.86 -1.08 -3.48 -0.89 -3.85 -3.25 -3.68 -0.72 0.54 1.43 -3.73 -2.84
0.76 0.33 -0.12 0.6 0.07 -1.86 -2.25 0.11 0.45 -0.04 0.08 -0.51 -0.15 -0.12 0.13 0.8 0.3 0.14 -0.44 -2.62
1.07 0.28 0.93 0.89 0.13 -0.3 -2.96 0.01 -0.46 -0.99 -0.32 -0.98 -0.36 -0.32 -0.49 1.03 0.29 -0.05 -1.06 -1.47
0.9 -0.31 0.78 0.64 0.04 -1.02 -2.52 0.21 0.19 -0.0 -0.26 -0.79 -0.93 -0.68 -0.38 1.17 1.24 -1.07 -1.36 -1.98
0.99 1.13 1.28 1.8 1.42 -1.44 -0.29 -0.88 -4.62 -4.98 -5.04 -3.71 -6.67 -5.29 -5.58 -3.99 -2.77 0.38 0.85 0.97
1.55 -0.16 1.47 1.29 0.42 -0.38 -0.72 -0.93 -1.24 -1.44 0.2 -1.79 -4.03 -2.39 0.33 0.13 -1.1 -0.45 -0.33 -0.14
0.43 0.47 0.43 0.72 -0.27 -0.43 -1.35 -0.07 -0.04 -0.44 0.4 -0.43 -0.08 -0.09 0.39 0.77 0.14 -0.64 -0.91 -1.37
0.77 1.05 0.78 0.47 0.05 -0.6 -2.22 -0.03 0.29 -0.14 -0.73 -0.54 -0.66 -0.28 -0.72 0.81 0.23 0.1 -1.05 -1.85
1.09 0.52 0.5 1.14 0.82 0.8 0.16 -0.27 -0.77 -0.97 -1.44 -1.15 -0.36 -0.39 -1.41 -0.49 -0.38 -0.17 -1.2 -0.45
1.75 1.57 1.46 1.73 1.14 -1.96 1.5 -1.7 -2.47 -1.82 -3.05 -2.09 -2.97 -3.9 -2.76 -2.64 -1.72 -1.9 -4.65 -3.63
0.43 -0.43 0.11 0.66 0.23 -0.11 -9.23 0.58 0.16 0.52 -0.83 0.25 -0.55 -0.62 -1.09 1.03 0.94 0.47 -7.06 -2.33
1.66 -0.06 0.71 2.4 1.64 -2.29 -3.72 -0.02 -6.62 -6.81 - - -7.38 -8.43 - -3.3 -2.39 1.98 -2.65 -2.57
2.22 0.3 1.59 2.33 1.07 -1.39 -3.69 0.33 - -11.25 - -8.05 - - - -1.52 -0.46 -0.27 -1.62 -5.8
0.87 0.14 1.05 0.79 -0.31 -0.88 -1.64 -0.17 0.09 -0.25 0.49 -0.97 -0.74 -0.61 0.42 0.48 0.13 -0.32 -0.75 -1.35
0.89 -0.74 -0.24 0.35 0.38 -1.42 -0.62 -0.21 -0.34 -0.56 0.72 -1.02 0.46 0.01 0.91 0.49 -0.54 0.11 -0.86 -0.61
1.82 0.2 1.17 1.7 0.26 -1.67 -1.08 -0.53 -0.59 -1.13 -0.91 -1.82 -0.83 -0.79 -0.7 -0.23 -1.12 -0.52 -0.7 -0.27
0.89 -0.12 0.5 0.8 -0.23 -0.54 -2.11 0.14 0.24 -0.3 0.42 -0.64 -0.72 -1.28 0.64 0.81 0.21 -0.2 -0.83 -1.71
1.49 1.01 1.11 1.65 -0.34 -1.55 -2.62 -0.84 0.06 -0.23 -0.45 -1.62 -2.36 -1.81 -0.29 0.28 -0.19 -0.12 -1.18 -1.7
1.2 0.12 0.48 0.7 -0.12 -1.25 -1.05 -0.13 -0.2 -0.59 0.09 -0.44 -0.01 0.07 0.05 0.79 0.39 -1.01 -0.84 -1.49
0.02 1.23 0.1 -0.01 0.0 -1.01 -0.19 -0.0 0.49 0.34 0.12 -0.13 -1.0 -0.93 0.29 0.56 -0.12 -0.08 -1.28 -0.89
1.58 0.11 0.72 1.54 0.91 0.6 -1.78 -0.43 -4.35 -4.94 -8.93 -1.44 -8.43 -6.04 -10.39 1.0 1.65 0.39 -7.33 -6.12
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0.73 -0.06 0.71 0.92 0.14 -0.61 -2.04 0.13 -0.07 -0.16 -0.31 -0.68 -0.24 -0.15 -0.5 0.82 0.31 0.14 -0.99 -1.25
1.38 1.08 0.92 2.0 1.32 -0.49 -1.7 -0.7 -4.45 -4.46 -4.85 -1.21 -4.05 -3.57 -4.42 -2.08 -0.7 0.74 0.29 -0.34
1.72 0.75 1.02 1.13 0.45 -1.04 -0.64 -0.83 -0.21 -0.09 -0.35 -0.85 -1.27 -1.93 -0.64 0.04 0.11 -0.38 -2.33 -2.09
1.51 0.16 1.26 1.38 0.54 -1.58 -1.67 -0.34 -0.57 -0.8 -0.61 -0.55 -0.82 -0.82 -0.73 0.08 -0.25 -0.28 -0.92 -0.87
1.19 0.24 0.11 1.09 0.28 -0.69 -1.8 -0.12 -0.43 -0.74 0.31 -0.41 -0.25 -0.1 0.21 0.9 -0.05 -0.54 -1.89 -2.06
1.1 0.33 0.72 1.52 0.45 -2.39 -1.77 -0.01 -0.22 -0.79 -0.07 -1.54 -0.96 -0.93 -0.29 1.05 0.36 -0.79 -0.91 -2.33
1.49 -0.13 1.13 1.17 0.58 -2.25 -2.83 -0.12 0.22 -0.31 -0.38 -0.73 -1.3 -0.62 -0.83 1.02 0.09 -0.17 -3.83 -4.21
1.03 0.62 0.88 0.91 0.11 -1.23 -1.02 -0.4 0.08 -0.11 0.05 -0.95 -0.4 -0.67 0.14 0.75 -0.67 -0.57 -1.22 -0.96
0.18 -0.6 0.38 0.56 0.21 -2.63 -1.39 0.13 0.52 0.28 0.36 -1.01 -0.39 -0.4 0.27 0.86 0.92 -0.49 -0.49 -1.51
1.22 -0.95 0.3 1.43 0.78 0.92 -6.95 0.71 -1.17 -1.06 -2.64 -0.92 -0.94 -1.16 -2.99 -0.34 1.11 1.18 -10.19 -4.17
0.09 0.8 0.76 0.31 -0.43 -0.41 -1.84 -0.08 0.25 -0.16 -0.48 0.08 -1.36 -0.92 -0.32 1.6 0.76 -0.46 -1.5 -2.47
0.99 -0.06 0.09 0.56 0.03 -0.01 -0.24 0.2 0.21 -0.01 0.15 -0.3 -0.86 -1.1 0.09 0.41 0.11 -0.25 -0.67 -1.07
2.76 1.48 1.85 1.41 -0.1 -0.82 -4.92 -2.0 -5.65 - - -4.05 - -5.47 - - -2.11 0.89 -4.07 -2.71
2.22 1.55 1.87 1.81 1.75 -2.27 -4.16 -0.68 - - - - - - - - - -0.74 -1.34 -5.13
0.76 -0.98 0.35 1.0 -0.33 -1.69 -1.83 -0.03 0.53 0.21 0.64 -0.84 -0.23 -0.36 0.56 0.74 0.43 -0.51 -1.72 -1.65
0.99 0.91 1.21 1.08 0.57 -1.36 -1.46 -0.18 -0.63 -0.58 0.1 -0.71 -0.28 -0.61 -0.0 -0.72 -0.94 -0.12 -0.58 -1.35
0.99 -0.4 1.2 1.7 0.19 -2.33 -2.99 -0.2 -1.14 -2.45 -1.2 -1.82 -3.36 -2.39 -1.48 -0.06 0.87 0.99 0.15 0.58
2.23 1.08 1.74 2.04 1.44 -0.75 -3.0 -1.05 -5.83 -11.21 -3.7 -4.06 -8.85 -5.89 -5.21 -0.22 -1.49 -1.34 -5.17 -8.37
2.23 0.76 1.35 2.43 1.4 -0.74 -2.82 -1.19 -5.28 -6.43 -4.79 -4.22 -10.23 -8.15 -5.9 -0.04 -1.42 -1.47 -6.19 -7.65
2.19 1.06 1.63 2.23 1.37 -0.72 -2.77 -1.16 -5.35 -6.81 -5.3 -3.97 -8.66 -5.87 -6.0 -0.38 -1.33 -1.2 -5.61 -6.94
1.2 -0.61 0.78 1.37 0.35 -1.47 -2.77 -0.16 -0.46 -0.8 -0.03 -0.55 -0.61 -0.58 -0.16 0.93 0.23 -0.24 -0.7 -1.56
1.13 -0.83 0.82 1.2 -0.06 -1.4 -1.46 -0.17 -0.01 -0.15 -0.22 -0.99 -0.29 -0.69 -0.22 0.72 0.66 -0.59 -0.89 -0.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.