Heatmap: Cluster_197 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00294	0.92	0.43	1.0	0.87	0.33	0.39	0.23	0.05	0.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.06	0.09	0.63
Gb_00475	0.41	0.2	0.18	0.36	0.95	0.68	0.09	0.22	0.11	0.1	0.13	0.07	0.02	0.03	0.1	0.16	0.24	0.54	0.23	1.0
Gb_00811	1.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.36	0.05	0.02	0.07	0.24	0.03	0.0	0.0	0.05	0.1	0.0	0.06	0.1	0.15
Gb_01091	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02311	1.0	0.14	0.26	0.21	0.22	0.1	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.23	0.01	0.03	0.02	0.0	0.01	0.15	0.06	0.04
Gb_03917	1.0	0.05	0.35	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01
Gb_04451	0.84	0.74	1.0	0.72	0.89	0.82	0.49	0.3	0.05	0.08	0.08	0.34	0.15	0.26	0.06	0.06	0.1	0.7	0.84	0.46
Gb_05163	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05630	0.73	0.6	1.0	0.35	0.17	0.07	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.03	0.1	0.13	0.01	0.0	0.07	0.05	0.0	0.06
Gb_05810	0.11	0.32	1.0	0.13	0.19	0.0	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.18	0.04	0.09
Gb_06485	0.74	0.58	0.66	1.0	0.73	0.22	0.27	0.06	0.02	0.02	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.1	0.1	0.21	0.08	1.0
Gb_07001	0.19	0.2	1.0	0.0	0.12	0.0	0.03	0.03	0.0	0.12	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.37
Gb_07474	1.0	0.11	0.91	0.16	0.19	0.15	0.02	0.16	0.14	0.1	0.17	0.15	0.15	0.12	0.1	0.02	0.01	0.88	0.15	0.73
Gb_08465	1.0	0.29	0.31	0.27	0.26	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04
Gb_09311	0.94	0.26	1.0	0.53	0.32	0.02	0.12	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.27	0.14	0.59
Gb_09743	0.76	0.67	0.73	1.0	0.64	0.74	0.25	0.62	0.26	0.21	0.29	0.6	0.36	0.33	0.26	0.26	0.28	0.36	0.24	0.22
Gb_09809	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09970	0.68	1.0	0.6	0.42	0.47	0.69	0.21	0.45	0.23	0.2	0.15	0.34	0.06	0.05	0.15	0.17	0.24	0.38	0.77	0.41
Gb_10402	1.0	0.54	0.52	0.37	0.52	0.48	0.34	0.29	0.1	0.1	0.07	0.24	0.14	0.14	0.07	0.1	0.08	0.76	0.46	0.73
Gb_11225	1.0	0.06	0.07	0.03	0.04	0.01	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.03	0.03
Gb_11258	0.58	0.41	0.56	0.41	0.53	0.95	0.53	0.5	0.29	0.34	0.25	0.4	0.57	0.57	0.24	0.32	0.32	0.68	0.28	1.0
Gb_12377	1.0	0.42	0.91	0.6	0.4	0.63	0.25	0.41	0.11	0.07	0.13	0.16	0.05	0.04	0.07	0.15	0.23	0.87	0.66	0.79
Gb_12733	0.39	1.0	0.4	0.35	0.02	0.15	0.49	0.27	0.24	0.13	0.1	0.48	0.04	0.06	0.08	0.42	0.33	0.29	0.09	0.4
Gb_13330	0.24	0.66	1.0	0.3	0.16	0.07	0.12	0.11	0.12	0.12	0.07	0.15	0.04	0.04	0.07	0.17	0.14	0.1	0.21	0.07
Gb_14316	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14344	1.0	0.69	0.8	0.78	0.58	0.3	0.14	0.32	0.09	0.08	0.23	0.26	0.08	0.06	0.16	0.18	0.24	0.4	0.41	0.51
Gb_14350	1.0	0.8	0.91	0.89	0.53	0.39	0.13	0.25	0.09	0.09	0.11	0.23	0.15	0.14	0.11	0.16	0.23	0.29	0.37	0.42
Gb_14478	1.0	0.16	0.33	0.36	0.34	0.16	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.09
Gb_14984	0.93	0.98	0.71	0.99	0.74	0.15	0.0	0.12	0.18	0.22	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.14	0.16	0.0	0.0	1.0
Gb_15007	0.36	0.0	1.0	0.0	0.29	0.0	0.34	0.18	0.51	0.31	0.47	0.0	0.33	0.05	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15664	0.38	0.72	1.0	0.33	0.46	0.05	0.0	0.07	0.04	0.03	0.12	0.18	0.04	0.07	0.19	0.02	0.09	0.26	0.03	0.0
Gb_15674	1.0	0.14	0.61	0.19	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.12
Gb_15689	0.94	1.0	0.7	0.83	0.69	0.51	0.7	0.41	0.39	0.4	0.17	0.54	0.14	0.16	0.18	0.38	0.31	0.62	0.58	0.86
Gb_15693	0.25	0.82	1.0	0.0	0.14	0.0	0.07	0.06	0.04	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11
Gb_16338	0.35	0.64	1.0	0.19	0.37	0.4	0.29	0.32	0.31	0.33	0.44	0.47	0.2	0.19	0.33	0.47	0.39	0.37	0.24	0.28
Gb_16370	1.0	0.52	0.85	0.78	0.51	0.29	0.27	0.16	0.05	0.03	0.03	0.12	0.07	0.1	0.07	0.12	0.07	0.23	0.08	0.22
Gb_17111	0.32	0.59	1.0	0.27	0.3	0.28	0.15	0.22	0.14	0.14	0.19	0.3	0.07	0.07	0.18	0.32	0.45	0.27	0.22	0.21
Gb_17648	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17888	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19442	0.19	0.24	1.0	0.24	0.14	0.03	0.16	0.11	0.1	0.01	0.06	0.17	0.01	0.03	0.01	0.19	0.32	0.11	0.11	0.01
Gb_19904	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20156	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.0	0.07	0.22	0.08	0.0	0.0	0.0
Gb_20510	1.0	0.34	0.37	0.13	0.09	0.23	0.05	0.15	0.14	0.21	0.86	0.84	0.06	0.06	0.52	0.29	0.53	0.19	0.01	0.21
Gb_20511	1.0	0.4	0.4	0.02	0.08	0.26	0.06	0.11	0.09	0.15	0.48	0.99	0.02	0.02	0.27	0.28	0.51	0.15	0.14	0.19
Gb_21712	0.63	0.61	0.5	0.47	0.53	1.0	0.38	0.37	0.14	0.17	0.18	0.44	0.42	0.6	0.15	0.22	0.14	0.53	0.17	0.66
Gb_22508	0.85	0.0	0.38	0.29	0.07	0.52	0.13	0.08	0.05	0.02	0.0	0.01	0.09	0.07	0.0	0.05	0.03	0.09	0.74	1.0
Gb_22578	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23408	1.0	0.24	0.19	0.1	0.06	0.36	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.21
Gb_24048	0.05	0.48	0.65	0.05	0.18	0.01	0.15	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.0	0.02	0.02	0.1	1.0
Gb_24049	0.05	1.0	0.95	0.09	0.15	0.0	0.26	0.03	0.03	0.0	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.0	0.01	0.02	0.15	0.56
Gb_24065	0.4	0.23	1.0	0.36	0.12	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_24133	1.0	0.27	0.39	0.14	0.05	0.19	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.16
Gb_25485	0.35	0.24	1.0	0.2	0.02	0.0	0.0	0.02	0.09	0.04	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.03
Gb_25559	0.5	0.83	1.0	0.68	0.42	0.18	0.15	0.24	0.27	0.22	0.19	0.19	0.04	0.04	0.17	0.4	0.31	0.4	0.28	0.15
Gb_25689	0.45	0.47	1.0	0.73	0.25	0.25	0.2	0.3	0.13	0.13	0.22	0.29	0.13	0.14	0.16	0.18	0.32	0.31	0.27	0.21
Gb_25991	1.0	0.84	0.96	0.86	0.74	0.16	0.06	0.2	0.06	0.07	0.15	0.23	0.16	0.19	0.16	0.02	0.11	0.22	0.0	0.17
Gb_26102	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26786	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27805	1.0	0.0	0.16	0.0	0.02	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.1	0.01	0.78
Gb_28321	0.25	1.0	0.29	0.22	0.42	0.22	0.06	0.25	0.19	0.13	0.05	0.04	0.11	0.11	0.11	0.16	0.03	0.63	0.16	0.42
Gb_28394	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29784	0.91	0.06	0.21	0.18	0.12	0.2	0.07	0.07	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.34	0.21	1.0
Gb_30314	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30917	0.39	1.0	0.7	0.45	0.63	0.08	0.49	0.1	0.03	0.04	0.03	0.11	0.04	0.0	0.03	0.04	0.12	0.38	0.1	0.42
Gb_31306	0.69	0.77	0.53	0.19	0.28	0.35	0.12	0.18	0.08	0.08	0.07	0.17	0.1	0.1	0.07	0.13	0.13	0.5	0.42	1.0
Gb_32065	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.03	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0
Gb_32547	0.1	0.0	1.0	0.31	0.2	0.06	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16
Gb_33125	1.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.05	0.09	0.07	0.05	0.06	0.13	0.03	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.07	0.01	0.2
Gb_34817	1.0	0.52	0.5	0.25	0.3	0.13	0.04	0.26	0.14	0.15	0.36	0.16	0.22	0.16	0.3	0.09	0.08	0.43	0.03	0.18
Gb_34848	0.57	0.19	0.48	0.38	0.21	0.14	0.07	0.19	0.19	0.27	0.16	0.16	0.19	0.24	0.1	0.05	0.03	0.54	0.18	1.0
Gb_35643	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36589	0.4	0.39	1.0	0.0	0.36	0.05	0.04	0.05	0.18	0.11	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.11	0.03	0.2
Gb_36759	1.0	0.51	0.76	0.74	0.69	0.37	0.72	0.33	0.12	0.11	0.15	0.28	0.15	0.19	0.11	0.13	0.22	0.53	0.73	0.69
Gb_36988	1.0	0.72	0.71	0.58	0.43	0.54	0.44	0.25	0.19	0.17	0.28	0.2	0.16	0.22	0.22	0.34	0.23	0.4	0.06	0.86
Gb_37088	0.07	0.75	1.0	0.0	0.1	0.04	0.3	0.03	0.08	0.06	0.14	0.01	0.04	0.02	0.13	0.0	0.1	0.03	0.02	0.1
Gb_37299	0.45	1.0	0.77	0.4	0.45	0.17	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.02	0.0	0.01	0.03	0.03	0.0	0.16
Gb_37835	0.31	0.61	1.0	0.11	0.3	0.34	0.23	0.23	0.18	0.21	0.19	0.28	0.09	0.09	0.16	0.18	0.3	0.32	0.39	0.24
Gb_39534	0.98	1.0	0.95	0.55	0.6	0.11	0.15	0.21	0.16	0.18	0.12	0.34	0.26	0.3	0.1	0.09	0.18	0.25	0.01	0.45
Gb_39967	0.38	0.72	1.0	0.31	0.29	0.35	0.13	0.25	0.19	0.19	0.18	0.2	0.15	0.13	0.14	0.24	0.31	0.32	0.17	0.25
Gb_40977	0.13	0.37	1.0	0.14	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41627	1.0	0.11	0.22	0.07	0.02	0.13	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.62

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)