Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.16 0.37 0.19 0.12 0.16 0.42 0.14 0.19 0.13 0.12 0.23 0.16 0.21 0.17 0.24 0.08 0.08 0.16 0.29 1.0
0.74 0.31 0.31 0.2 0.16 0.41 0.16 0.24 0.16 0.17 0.05 0.19 0.09 0.12 0.04 0.24 0.24 0.37 0.08 1.0
0.63 0.29 0.27 0.14 0.15 0.38 0.18 0.3 0.17 0.19 0.06 0.25 0.12 0.17 0.05 0.24 0.25 0.35 0.16 1.0
0.1 0.03 0.09 0.03 0.03 0.45 0.0 0.11 0.01 0.01 0.04 0.12 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.05 0.02 1.0
0.27 0.19 0.12 0.12 0.11 0.27 0.05 0.19 0.14 0.14 0.16 0.14 0.16 0.15 0.16 0.13 0.12 0.12 0.22 1.0
0.75 0.07 0.16 0.04 0.07 0.13 0.02 0.27 0.13 0.11 0.34 0.19 0.08 0.04 0.3 0.05 0.06 0.28 0.18 1.0
0.14 0.03 0.02 0.05 0.1 0.12 0.23 0.28 0.1 0.1 0.14 0.09 0.26 0.13 0.08 0.02 0.01 0.13 0.19 1.0
0.22 0.03 0.06 0.09 0.09 0.4 0.06 0.18 0.23 0.22 0.1 0.26 0.13 0.13 0.1 0.13 0.2 0.28 0.15 1.0
0.18 0.03 0.13 0.02 0.15 0.5 0.11 0.09 0.04 0.05 0.05 0.09 0.04 0.02 0.03 0.04 0.12 0.14 0.02 1.0
0.22 0.02 0.15 0.07 0.13 0.39 0.05 0.09 0.03 0.03 0.09 0.08 0.04 0.05 0.09 0.03 0.04 0.51 0.1 1.0
0.23 0.11 0.16 0.07 0.14 0.29 0.02 0.07 0.01 0.02 0.02 0.1 0.02 0.05 0.01 0.0 0.02 0.2 0.0 1.0
0.38 0.07 0.13 0.19 0.14 0.24 0.18 0.43 0.2 0.2 0.43 0.33 0.23 0.19 0.35 0.18 0.26 0.4 0.32 1.0
0.12 0.01 0.04 0.0 0.01 0.04 0.0 0.02 0.06 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.06 0.01 1.0
0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 1.0
0.1 0.04 0.03 0.04 0.06 0.35 0.09 0.12 0.06 0.06 0.1 0.07 0.04 0.04 0.1 0.05 0.06 0.12 0.08 1.0
0.04 0.02 0.03 0.02 0.01 0.08 0.02 0.06 0.02 0.02 0.09 0.07 0.03 0.03 0.05 0.0 0.01 0.04 0.03 1.0
0.08 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.06 0.03 0.03 0.07 0.18 0.1 0.07 0.03 0.0 0.0 0.19 0.03 1.0
0.03 0.0 0.01 0.02 0.03 0.2 0.02 0.13 0.05 0.06 0.05 0.05 0.03 0.02 0.06 0.05 0.06 0.11 0.05 1.0
0.19 0.07 0.09 0.06 0.07 0.36 0.03 0.18 0.15 0.13 0.11 0.08 0.1 0.08 0.1 0.2 0.22 0.24 0.13 1.0
0.14 0.06 0.08 0.05 0.07 0.9 0.08 0.33 0.07 0.08 0.2 0.11 0.06 0.04 0.19 0.06 0.07 0.38 0.14 1.0
0.09 0.01 0.03 0.0 0.01 0.19 0.02 0.11 0.03 0.01 0.03 0.06 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 1.0
0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.1 0.01 0.11 0.02 0.03 0.06 0.08 0.07 0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.01 1.0
0.53 0.02 0.1 0.02 0.01 0.05 0.03 0.29 0.08 0.07 0.2 0.36 0.4 0.44 0.12 0.03 0.27 0.2 0.05 1.0
0.31 0.09 0.25 0.12 0.17 0.1 0.02 0.12 0.06 0.06 0.11 0.12 0.02 0.02 0.09 0.09 0.19 0.17 0.04 1.0
0.14 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 1.0
0.08 0.01 0.02 0.01 0.04 0.84 0.01 0.36 0.16 0.16 0.25 0.04 0.26 0.21 0.29 0.01 0.0 0.05 0.16 1.0
0.02 0.01 0.01 0.04 0.04 1.0 0.01 0.1 0.02 0.02 0.09 0.01 0.01 0.01 0.2 0.02 0.04 0.1 0.06 0.83
0.33 0.06 0.06 0.03 0.06 0.09 0.03 0.04 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.1 0.06 1.0
0.12 0.01 0.02 0.01 0.01 0.51 0.01 0.11 0.07 0.06 0.09 0.03 0.04 0.02 0.07 0.02 0.02 0.12 0.09 1.0
0.2 0.0 0.02 0.0 0.0 0.17 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.26 0.1 0.11 0.09 0.14 0.24 0.14 0.1 0.03 0.03 0.03 0.05 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.17 0.07 1.0
0.73 0.25 0.31 0.23 0.31 0.71 0.19 0.39 0.19 0.2 0.35 0.27 0.26 0.16 0.31 0.11 0.14 0.33 0.15 1.0
0.05 0.05 0.0 0.07 0.13 0.59 0.04 0.17 0.05 0.06 0.04 0.09 0.06 0.08 0.04 0.09 0.1 0.22 0.31 1.0
0.12 0.01 0.04 0.03 0.04 0.11 0.0 0.12 0.06 0.06 0.11 0.09 0.08 0.07 0.08 0.03 0.06 0.21 0.03 1.0
0.1 0.05 0.11 0.04 0.09 0.16 0.01 0.06 0.03 0.04 0.09 0.08 0.03 0.02 0.07 0.02 0.01 0.15 0.15 1.0
0.07 0.05 0.03 0.03 0.06 0.02 0.02 0.06 0.02 0.02 0.05 0.12 0.04 0.05 0.04 0.08 0.02 0.12 0.2 1.0
0.13 0.08 0.07 0.07 0.11 0.31 0.03 0.15 0.14 0.14 0.08 0.13 0.09 0.08 0.08 0.13 0.08 0.33 0.2 1.0
0.09 0.02 0.03 0.03 0.02 0.25 0.02 0.11 0.05 0.08 0.05 0.06 0.07 0.05 0.04 0.02 0.03 0.06 0.03 1.0
0.39 0.06 0.22 0.24 0.21 0.07 0.15 0.13 0.05 0.06 0.11 0.07 0.07 0.06 0.09 0.07 0.11 0.09 0.07 1.0
0.15 0.03 0.17 0.07 0.1 0.17 0.05 0.07 0.05 0.07 0.02 0.06 0.02 0.02 0.02 0.03 0.07 0.26 0.02 1.0
0.19 0.05 0.04 0.02 0.01 0.08 0.04 0.15 0.1 0.11 0.06 0.21 0.22 0.21 0.02 0.01 0.01 0.06 0.07 1.0
0.12 0.01 0.03 0.01 0.03 0.66 0.01 0.2 0.06 0.07 0.03 0.1 0.03 0.05 0.01 0.0 0.02 0.11 0.02 1.0
0.03 0.04 0.06 0.01 0.02 0.17 0.32 0.15 0.02 0.03 0.07 0.1 0.11 0.08 0.05 0.0 0.01 0.04 0.16 1.0
0.05 0.01 0.04 0.0 0.06 0.69 0.05 0.14 0.06 0.1 0.04 0.08 0.03 0.03 0.05 0.04 0.08 0.07 0.08 1.0
0.93 0.37 0.66 0.39 0.39 0.46 0.22 0.45 0.34 0.32 0.36 0.66 0.28 0.31 0.3 0.36 0.47 0.57 0.44 1.0
0.35 0.06 0.17 0.05 0.1 0.08 0.01 0.07 0.05 0.05 0.03 0.05 0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 0.14 0.06 1.0
0.33 0.09 0.18 0.07 0.12 0.38 0.02 0.23 0.05 0.04 0.06 0.11 0.06 0.04 0.05 0.08 0.08 0.1 0.03 1.0
0.17 0.15 0.12 0.07 0.19 0.86 0.05 0.31 0.14 0.17 0.28 0.17 0.25 0.18 0.27 0.1 0.15 0.27 0.11 1.0
0.59 0.15 0.2 0.09 0.2 0.23 0.1 0.2 0.13 0.13 0.21 0.17 0.17 0.13 0.18 0.08 0.1 0.39 0.24 1.0
0.14 0.06 0.07 0.09 0.11 0.23 0.12 0.1 0.05 0.05 0.12 0.09 0.09 0.07 0.12 0.05 0.07 0.1 0.11 1.0
0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.07 0.11 0.09 0.06 0.07 0.02 0.19 0.04 0.02 0.02 0.01 0.06 0.04 0.07 1.0
0.16 0.1 0.09 0.06 0.08 0.13 0.04 0.08 0.04 0.05 0.03 0.05 0.03 0.04 0.02 0.04 0.03 0.23 0.12 1.0
0.19 0.11 0.11 0.1 0.14 0.3 0.1 0.16 0.07 0.06 0.15 0.1 0.12 0.11 0.15 0.05 0.08 0.18 0.19 1.0
0.05 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.14 0.03 0.05 0.09 0.11 0.12 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.44 0.17 0.19 0.14 0.18 0.27 0.11 0.18 0.1 0.09 0.14 0.12 0.13 0.12 0.12 0.06 0.07 0.42 0.17 1.0
0.28 0.03 0.16 0.02 0.03 0.07 0.03 0.14 0.06 0.07 0.06 0.04 0.05 0.04 0.03 0.0 0.01 0.14 0.07 1.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.08 0.01 0.03 0.05 0.07 0.14 0.06 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.08 0.09 0.02 0.01 0.07 0.08 0.07 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0
0.12 0.01 0.02 0.01 0.01 0.54 0.17 0.2 0.06 0.05 0.05 0.1 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.07 0.04 1.0
0.18 0.1 0.14 0.09 0.1 0.17 0.04 0.15 0.07 0.06 0.11 0.09 0.11 0.09 0.09 0.05 0.06 0.18 0.05 1.0
0.11 0.03 0.06 0.02 0.02 0.31 0.06 0.07 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 1.0
0.14 0.02 0.05 0.01 0.02 0.18 0.02 0.11 0.04 0.05 0.06 0.06 0.06 0.05 0.04 0.01 0.02 0.06 0.01 1.0
0.17 0.06 0.18 0.02 0.02 0.03 0.03 0.09 0.04 0.03 0.08 0.12 0.04 0.03 0.06 0.04 0.1 0.05 0.06 1.0
0.36 0.08 0.07 0.0 0.02 0.2 0.01 0.08 0.03 0.04 0.06 0.08 0.06 0.06 0.04 0.02 0.01 0.11 0.05 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)