Heatmap: Cluster_253 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
Ehy_g00203 (TOM9-2)
0.05 0.13 -0.2
Ehy_g00224 (FKBP12)
0.17 -0.02 -0.16
0.25 0.08 -0.41
0.28 0.22 -0.69
Ehy_g00437 (CYN)
0.22 -0.18 -0.07
0.21 0.16 -0.46
Ehy_g00608 (PRXIIF)
0.11 0.04 -0.16
0.15 0.34 -0.68
Ehy_g00755 (PUR ALPHA-1)
0.01 -0.04 0.03
0.21 -0.12 -0.12
Ehy_g00828 (ATP5)
0.26 -0.05 -0.26
Ehy_g01074 (ST1)
0.15 -0.09 -0.08
0.06 0.12 -0.2
0.15 0.11 -0.3
0.53 0.12 -1.09
0.08 -0.02 -0.06
Ehy_g01486 (ACX3)
0.06 -0.04 -0.02
0.16 0.05 -0.24
0.15 -0.02 -0.15
Ehy_g02326 (UCH2)
0.14 -0.06 -0.09
0.17 -0.21 0.01
Ehy_g02959 (CTS)
0.1 -0.0 -0.11
Ehy_g03163 (DET2)
0.34 0.21 -0.78
Ehy_g03268 (GAMMA CA1)
0.25 0.12 -0.47
0.26 0.1 -0.44
Ehy_g03351 (PBC1)
0.08 0.05 -0.14
0.14 0.2 -0.42
Ehy_g03694 (GR1)
0.18 -0.02 -0.18
0.17 0.12 -0.34
0.31 0.25 -0.81
Ehy_g04230 (TH9)
0.23 -0.03 -0.24
0.25 0.07 -0.39
Ehy_g04782 (LKS1)
0.53 -0.11 -0.67
0.12 -0.03 -0.1
0.53 0.01 -0.86
0.25 -0.13 -0.16
Ehy_g05592 (TLP8)
0.49 0.0 -0.74
0.28 -0.08 -0.25
0.23 -0.11 -0.15
0.03 0.06 -0.09
0.22 0.35 -0.84
0.25 -0.0 -0.3
Ehy_g06553 (PAB1)
0.16 -0.15 -0.02
0.2 0.02 -0.26
Ehy_g06772 (ATMDAR2)
0.08 -0.04 -0.05
Ehy_g07113 (TOP1)
0.18 -0.06 -0.13
0.32 0.09 -0.54
0.09 0.06 -0.17
0.31 0.07 -0.49
0.23 0.05 -0.33
0.77 0.11 -2.19
Ehy_g07558 (CKA2)
0.17 0.21 -0.48
Ehy_g07612 (SK13)
0.18 -0.09 -0.11
0.35 0.22 -0.84
0.19 0.27 -0.62
0.23 0.17 -0.51
Ehy_g08172 (MBF1B)
0.32 0.06 -0.5
0.09 0.0 -0.1
0.57 0.17 -1.35
0.41 -0.07 -0.48
0.15 0.18 -0.4
0.28 -0.06 -0.27
0.24 0.36 -0.9
Ehy_g08953 (COS1)
0.07 0.2 -0.32
0.21 0.18 -0.51
Ehy_g08999 (FOLT1)
0.17 0.08 -0.29
Ehy_g09026 (emb1187)
0.25 0.16 -0.53
Ehy_g09110 (SHL)
0.23 -0.02 -0.25
0.23 -0.05 -0.22
0.22 0.11 -0.4
0.26 0.21 -0.64
Ehy_g09779 (IAA3)
0.31 0.15 -0.61
0.23 -0.05 -0.21
Ehy_g10302 (SK1)
0.34 -0.37 -0.06
0.1 0.21 -0.37
0.16 -0.19 0.01
Ehy_g10708 (OPT4)
0.12 -0.0 -0.13
0.1 -0.18 0.06
0.08 -0.03 -0.05
0.32 0.01 -0.42
0.29 -0.01 -0.35
0.01 0.21 -0.25
Ehy_g11546 (NFD1)
0.09 0.19 -0.33
0.43 -0.02 -0.58
0.52 0.1 -1.0
Ehy_g11878 (MGT4)
0.04 0.01 -0.04
0.3 -0.2 -0.16
0.19 0.18 -0.47
0.08 0.06 -0.14
0.27 0.01 -0.35
0.19 -0.11 -0.1
0.5 0.3 -1.49
0.13 -0.16 0.02
0.38 -0.11 -0.38
0.09 -0.07 -0.02
0.09 -0.08 -0.01
Ehy_g13075 (VDAC1)
0.14 -0.02 -0.13
0.15 0.07 -0.24
0.13 -0.0 -0.14
Ehy_g13287 (NFD3)
0.26 0.21 -0.62
0.15 0.11 -0.3
0.23 0.49 -1.25
Ehy_g13687 (IDH-V)
0.15 -0.13 -0.03
Ehy_g13739 (WRM)
0.09 -0.15 0.05
Ehy_g13743 (RR24)
0.28 -0.26 -0.07
0.24 0.06 -0.37
Ehy_g13760 (RAPTOR1)
0.11 0.02 -0.14
0.16 0.07 -0.27
Ehy_g14136 (UVR8)
0.24 0.13 -0.47
0.67 0.47 -5.42
0.29 0.1 -0.51
0.18 0.1 -0.34
0.32 0.25 -0.84
0.58 -0.29 -0.53
Ehy_g15386 (UPP)
0.14 0.08 -0.24
Ehy_g15481 (FTR)
0.2 0.0 -0.24
0.51 0.12 -1.04
Ehy_g15732 (HSP60)
0.16 0.08 -0.27
0.39 0.02 -0.57
0.15 0.1 -0.29
0.09 0.07 -0.18
Ehy_g16383 (DSO)
0.69 -0.01 -1.32
0.22 0.01 -0.27
0.19 0.2 -0.5
0.31 0.35 -1.05
0.12 -0.02 -0.11
0.16 -0.09 -0.09
0.58 0.08 -1.15
0.11 0.34 -0.61
Ehy_g17923 (ARR11)
0.13 0.02 -0.17
0.36 0.37 -1.23
Ehy_g18028 (CYCB2;2)
0.33 0.26 -0.88
Ehy_g18159 (MTN2)
0.3 0.03 -0.42
Ehy_g18794 (ATXR4)
0.09 0.09 -0.19
0.13 0.08 -0.24
0.15 -0.1 -0.06
0.36 0.13 -0.68
0.07 0.09 -0.17
Ehy_g19604 (PME2)
0.48 0.16 -1.04
0.04 0.04 -0.08
0.44 0.0 -0.63
Ehy_g20225 (HIT3)
0.06 0.03 -0.1
0.12 -0.0 -0.12
0.11 0.1 -0.24
0.3 0.23 -0.74
0.02 0.58 -1.03
0.2 0.14 -0.4
0.06 -0.06 0.0
Ehy_g21725 (OPT4)
0.3 -0.1 -0.26
0.42 0.38 -1.48
0.24 0.06 -0.36
0.58 -0.25 -0.59
0.08 -0.1 0.01
Ehy_g22429 (SAPX)
0.28 0.1 -0.49
Ehy_g22484 (PS1)
0.3 0.13 -0.57
Ehy_g22633 (PHR2)
0.3 -0.16 -0.2
0.19 0.02 -0.24
0.26 -0.3 -0.01
0.23 -0.31 0.03
Ehy_g22990 (PDI5)
0.4 -0.05 -0.48
Ehy_g23133 (DPL1)
0.13 -0.07 -0.07
0.28 0.19 -0.64
0.29 -0.05 -0.3
0.37 -0.13 -0.33
0.29 -0.12 -0.22
0.25 0.14 -0.49
0.19 0.15 -0.41
Ehy_g24154 (HSP81-3)
0.21 0.04 -0.3
0.22 0.06 -0.34
0.09 0.41 -0.73
0.34 0.25 -0.87
0.55 0.27 -1.61
0.23 0.23 -0.62
0.37 0.1 -0.65
0.33 -0.24 -0.16
0.08 0.22 -0.37
0.12 0.09 -0.24
0.14 0.29 -0.56
0.53 0.16 -1.19
Ehy_g26230 (PBG1)
0.09 0.07 -0.18
0.47 -0.06 -0.6
Ehy_g27395 (PHT3;1)
0.27 -0.26 -0.06
0.18 -0.06 -0.13
Ehy_g27886 (PAA1)
0.31 0.26 -0.82
0.12 -0.05 -0.08
0.21 -0.03 -0.21
Ehy_g28439 (TOM1)
0.26 0.01 -0.34
0.25 -0.09 -0.2
0.25 0.16 -0.52
0.21 0.27 -0.65
0.41 -0.02 -0.55
0.04 0.0 -0.04
0.22 0.02 -0.28
0.29 0.02 -0.4
0.21 0.2 -0.53
0.18 -0.06 -0.14
0.32 0.07 -0.5
0.14 -0.01 -0.14
0.31 -0.15 -0.22
0.13 -0.05 -0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.