Heatmap: Cluster_288 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Internodes of Aerial Stem	Leaf Sheath at Stem Node	Root
Ehy_g00078	0.11	0.02	-0.14
Ehy_g00493	0.33	0.22	-0.79
Ehy_g00544	0.02	0.31	-0.43
Ehy_g00838	0.18	0.08	-0.29
Ehy_g00886	0.32	0.05	-0.48
Ehy_g00921	0.2	0.05	-0.29
Ehy_g01068 (SSP5)	-0.03	0.27	-0.29
Ehy_g01099	0.2	-0.0	-0.23
Ehy_g01279	0.24	0.09	-0.41
Ehy_g01369	0.12	0.14	-0.3
Ehy_g01491	0.37	-0.18	-0.28
Ehy_g01556 (TPC1)	0.25	-0.01	-0.3
Ehy_g01770	0.42	0.11	-0.79
Ehy_g02030	0.19	0.02	-0.24
Ehy_g02155	0.16	0.09	-0.29
Ehy_g02473 (CLPX)	0.08	0.11	-0.22
Ehy_g02554 (INT2)	0.07	0.19	-0.31
Ehy_g03048	0.17	0.1	-0.31
Ehy_g03140	0.22	0.08	-0.36
Ehy_g03260	0.13	0.08	-0.24
Ehy_g03424	0.41	0.09	-0.72
Ehy_g03501 (CHY1)	-0.01	0.24	-0.27
Ehy_g03736	0.18	0.16	-0.41
Ehy_g03776	0.11	0.0	-0.12
Ehy_g04331	0.35	0.2	-0.8
Ehy_g04495	0.31	0.02	-0.42
Ehy_g04537 (ZAT)	0.19	-0.04	-0.18
Ehy_g04608 (P44)	0.09	0.08	-0.19
Ehy_g04739	0.31	0.08	-0.5
Ehy_g04789 (CDS2)	0.16	-0.01	-0.17
Ehy_g05210	0.28	0.13	-0.53
Ehy_g05372	0.25	-0.06	-0.23
Ehy_g05539 (MES11)	0.39	0.14	-0.76
Ehy_g05673 (NFA3)	0.19	0.12	-0.37
Ehy_g05836	0.23	0.1	-0.4
Ehy_g05992	0.17	0.14	-0.36
Ehy_g06092 (SEU)	0.23	-0.04	-0.22
Ehy_g06328	0.18	0.08	-0.31
Ehy_g06445 (ADF8)	0.19	0.04	-0.27
Ehy_g06566	0.29	-0.04	-0.3
Ehy_g06589 (VPS26B)	0.2	0.08	-0.33
Ehy_g06593 (CSN6A)	0.22	-0.1	-0.15
Ehy_g06901 (SYTB)	0.29	-0.07	-0.27
Ehy_g06972 (SIS3)	0.1	0.11	-0.23
Ehy_g06977	0.38	-0.14	-0.35
Ehy_g07201	0.61	-0.36	-0.51
Ehy_g07267 (ARLA1C)	0.3	0.19	-0.67
Ehy_g07356 (CBL2)	0.3	-0.15	-0.21
Ehy_g07662 (NHX6)	0.33	-0.01	-0.41
Ehy_g07668 (LIP1)	0.12	0.03	-0.16
Ehy_g07742 (EMB2756)	0.49	0.29	-1.41
Ehy_g07838	0.08	0.08	-0.18
Ehy_g08065	0.2	0.28	-0.65
Ehy_g08107 (HRT1)	0.23	0.15	-0.47
Ehy_g08232	0.42	-0.03	-0.55
Ehy_g08237	0.29	-0.01	-0.36
Ehy_g08471 (CPK2)	0.13	0.02	-0.16
Ehy_g08475 (NTMC2T4)	0.3	-0.04	-0.32
Ehy_g08529 (CPK10)	0.27	-0.04	-0.28
Ehy_g08708	0.27	-0.01	-0.31
Ehy_g08777 (RPS15A)	0.16	0.08	-0.28
Ehy_g08779	0.39	0.29	-1.12
Ehy_g08937	0.24	-0.05	-0.24
Ehy_g08987	0.2	0.21	-0.53
Ehy_g08994 (eIFiso4G1)	0.19	-0.01	-0.21
Ehy_g09007	0.15	0.08	-0.26
Ehy_g09044	0.05	0.04	-0.1
Ehy_g09049	0.59	-0.11	-0.8
Ehy_g09051 (APK3)	0.2	0.1	-0.36
Ehy_g09081	0.15	0.08	-0.27
Ehy_g09104	0.63	0.14	-1.52
Ehy_g09123	0.05	0.11	-0.17
Ehy_g09711	0.15	0.25	-0.52
Ehy_g09963	0.12	0.02	-0.16
Ehy_g10122 (GRX4)	0.09	0.11	-0.23
Ehy_g10245	0.17	0.2	-0.46
Ehy_g10254	0.21	-0.03	-0.21
Ehy_g10629	0.19	0.24	-0.55
Ehy_g10857	0.22	0.06	-0.33
Ehy_g11053	0.23	0.09	-0.38
Ehy_g11223	0.2	0.04	-0.29
Ehy_g11301	0.17	0.24	-0.53
Ehy_g11340 (LACS6)	0.11	0.2	-0.37
Ehy_g11720	0.13	0.12	-0.29
Ehy_g11733	0.3	-0.02	-0.36
Ehy_g11762 (PLMT)	0.22	-0.0	-0.26
Ehy_g11929 (DMS4)	0.18	-0.06	-0.14
Ehy_g12041	0.57	-0.22	-0.61
Ehy_g12072	0.14	0.12	-0.3
Ehy_g12095	0.25	0.14	-0.49
Ehy_g12276	0.32	-0.15	-0.23
Ehy_g12401	0.12	0.11	-0.26
Ehy_g12487 (ORP1C)	0.3	0.01	-0.39
Ehy_g12644	0.32	0.19	-0.71
Ehy_g12676	0.22	0.16	-0.47
Ehy_g13367	0.06	0.06	-0.12
Ehy_g13532 (DET1)	0.11	0.12	-0.27
Ehy_g14328	0.27	-0.08	-0.24
Ehy_g14366 (VPS25)	0.11	0.07	-0.2
Ehy_g14624 (GEM)	0.4	-0.23	-0.27
Ehy_g14762	0.18	-0.04	-0.17
Ehy_g15042	0.21	0.14	-0.42
Ehy_g15081	0.24	0.28	-0.73
Ehy_g15234	0.24	0.13	-0.47
Ehy_g15930 (CAX5)	0.2	-0.05	-0.17
Ehy_g15941	0.32	0.04	-0.47
Ehy_g16241	0.3	0.28	-0.84
Ehy_g16400	0.35	-0.01	-0.46
Ehy_g16676 (CYSD2)	0.19	0.01	-0.23
Ehy_g16932	0.53	0.3	-1.62
Ehy_g17075	0.27	0.15	-0.55
Ehy_g17161	0.49	-0.09	-0.61
Ehy_g17331 (DFB)	0.21	0.05	-0.31
Ehy_g17528	0.23	-0.05	-0.21
Ehy_g17686 (PSAT1)	0.18	0.01	-0.21
Ehy_g17963 (NAP3)	0.18	0.13	-0.37
Ehy_g18164	0.06	0.16	-0.25
Ehy_g18284	0.21	0.08	-0.35
Ehy_g19016	0.24	-0.1	-0.17
Ehy_g19028	0.35	0.01	-0.48
Ehy_g19352	0.17	0.07	-0.28
Ehy_g19441	0.54	0.33	-1.78
Ehy_g19825 (CPK13)	0.34	-0.12	-0.3
Ehy_g19838	0.08	0.14	-0.25
Ehy_g19843	0.55	-0.11	-0.72
Ehy_g20285	0.42	0.07	-0.7
Ehy_g20416	0.46	0.19	-1.05
Ehy_g20476	0.35	0.07	-0.57
Ehy_g20485 (SELT)	0.13	-0.05	-0.09
Ehy_g20565	0.22	0.05	-0.32
Ehy_g20922	0.19	0.22	-0.52
Ehy_g21148	0.24	0.33	-0.83
Ehy_g21207	0.48	0.19	-1.1
Ehy_g21521	0.17	0.17	-0.42
Ehy_g21549	-0.03	0.38	-0.46
Ehy_g21638	0.43	-0.14	-0.43
Ehy_g21690 (DECR)	0.23	0.13	-0.44
Ehy_g21728 (UFD1)	0.2	-0.08	-0.13
Ehy_g21873	0.23	-0.01	-0.27
Ehy_g22123 (UVR8)	0.15	0.08	-0.26
Ehy_g22268	0.45	-0.12	-0.49
Ehy_g22279	0.25	-0.01	-0.28
Ehy_g22370	0.15	0.16	-0.38
Ehy_g22711	0.33	0.37	-1.15
Ehy_g22821	0.33	-0.0	-0.42
Ehy_g23095	0.27	-0.13	-0.19
Ehy_g23159	0.14	0.07	-0.24
Ehy_g23628	0.28	0.1	-0.49
Ehy_g23694	0.2	0.2	-0.52
Ehy_g23763	0.13	0.38	-0.73
Ehy_g23824	0.17	0.17	-0.41
Ehy_g23860	0.35	-0.0	-0.46
Ehy_g24186	0.19	0.19	-0.46
Ehy_g24376	0.32	-0.01	-0.41
Ehy_g24463	0.23	-0.03	-0.25
Ehy_g24531	0.32	-0.0	-0.42
Ehy_g24803	0.18	-0.02	-0.17
Ehy_g24821	0.62	-0.13	-0.86
Ehy_g24852	0.21	0.04	-0.29
Ehy_g24892	0.19	0.06	-0.3
Ehy_g25137	0.3	0.13	-0.58
Ehy_g25187	0.3	0.1	-0.52
Ehy_g25277 (UKL1)	0.1	0.2	-0.35
Ehy_g25397	0.45	-0.29	-0.29
Ehy_g25469	0.14	0.24	-0.47
Ehy_g25484 (UGT85A7)	0.59	-0.38	-0.46
Ehy_g25576	0.19	0.37	-0.82
Ehy_g25762	0.38	-0.06	-0.43
Ehy_g25788	0.23	0.16	-0.5
Ehy_g26121	0.25	-0.14	-0.14
Ehy_g26466	0.38	-0.03	-0.48
Ehy_g26842 (VPS2.1)	0.28	-0.09	-0.24
Ehy_g26967	0.23	-0.02	-0.25
Ehy_g27279	0.24	0.12	-0.44
Ehy_g27600	0.39	0.02	-0.57
Ehy_g27640	0.65	-0.68	-0.31
Ehy_g28237	0.34	-0.04	-0.4
Ehy_g28285	0.29	-0.01	-0.35
Ehy_g28382 (UBC5)	0.35	0.02	-0.5
Ehy_g28657	0.19	0.2	-0.5
Ehy_g28715	0.21	0.1	-0.37
Ehy_g28894	0.65	-0.14	-0.94
Ehy_g29083	0.19	-0.04	-0.18
Ehy_g29606	0.32	0.16	-0.66
Ehy_g30270	0.63	-0.52	-0.41
Ehy_g30404	0.28	0.26	-0.75
Ehy_g30708	0.2	0.16	-0.44
Ehy_g30748	0.38	0.03	-0.55
Ehy_g31164	0.14	0.43	-0.85
Ehy_g31247	0.55	0.17	-1.29
Ehy_g31336	0.23	0.01	-0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.