Heatmap: Cluster_330 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.97 0.96 0.81 0.84 0.64 1.0 0.63 0.59 0.39 0.35 0.52 0.31 0.35 0.37 0.5 0.7 0.37 0.63 0.88 0.48
0.78 0.99 0.78 1.0 0.6 0.49 0.54 0.46 0.29 0.33 0.55 0.33 0.24 0.23 0.55 0.35 0.32 0.46 0.71 0.34
0.87 0.7 0.67 0.8 0.72 1.0 0.58 0.56 0.34 0.37 0.59 0.49 0.46 0.43 0.67 0.44 0.47 0.87 0.59 0.54
1.0 0.83 0.86 1.0 0.89 0.27 0.41 0.43 0.25 0.23 0.27 0.21 0.34 0.27 0.27 0.3 0.39 0.6 0.48 0.35
0.6 0.62 0.76 0.84 0.89 1.0 0.6 0.67 0.83 0.77 0.79 0.64 0.56 0.54 0.71 0.69 0.87 0.87 0.83 0.78
0.19 0.05 0.03 0.23 0.21 0.07 0.0 0.43 0.34 0.29 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.28 0.22 1.0 0.51 0.0
0.98 1.0 0.86 0.97 0.81 0.47 0.01 0.38 0.35 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0
0.8 0.65 0.82 1.0 0.65 0.43 0.23 0.3 0.17 0.16 0.05 0.15 0.25 0.19 0.06 0.08 0.05 0.5 0.43 0.38
1.0 0.58 0.66 0.72 0.82 0.49 0.3 0.53 0.21 0.21 0.24 0.18 0.52 0.39 0.27 0.1 0.09 0.62 0.47 0.53
0.9 0.46 0.85 1.0 0.91 0.97 0.6 0.74 0.48 0.4 0.47 0.62 0.73 0.61 0.49 0.63 0.66 0.7 0.53 0.45
0.77 1.0 0.85 0.22 0.56 0.33 0.23 0.55 0.14 0.23 0.3 0.18 0.51 0.39 0.29 0.15 0.12 0.44 0.73 0.13
0.72 1.0 0.75 0.95 0.56 0.29 0.22 0.37 0.25 0.23 0.41 0.22 0.21 0.17 0.4 0.36 0.24 0.46 0.46 0.35
0.6 0.79 0.54 1.0 0.63 0.36 0.68 0.56 0.4 0.39 0.74 0.32 0.38 0.35 0.7 0.59 0.47 0.55 0.73 0.53
0.82 0.71 1.0 0.98 0.74 0.8 0.33 0.63 0.37 0.34 0.51 0.37 0.33 0.31 0.38 0.38 0.48 0.66 0.91 0.41
0.51 0.78 1.0 0.41 0.57 0.49 0.24 0.38 0.21 0.2 0.35 0.27 0.14 0.17 0.3 0.25 0.36 0.47 0.58 0.35
0.8 0.64 0.82 0.85 0.81 1.0 0.64 0.74 0.31 0.33 0.42 0.48 0.36 0.28 0.4 0.21 0.38 0.73 0.86 0.69
0.64 0.96 1.0 0.72 0.81 0.74 0.5 0.71 0.42 0.47 0.51 0.5 0.41 0.32 0.57 0.37 0.33 0.8 0.95 0.58
0.78 0.96 1.0 0.87 0.77 0.36 0.49 0.56 0.3 0.28 0.46 0.35 0.37 0.33 0.44 0.27 0.37 0.48 0.46 0.33
1.0 0.19 0.78 0.88 0.67 0.35 0.13 0.57 0.55 0.46 0.5 0.62 0.41 0.39 0.51 0.7 0.76 0.56 0.73 0.22
0.62 0.65 1.0 0.67 0.68 0.45 0.1 0.43 0.35 0.26 0.1 0.52 0.53 0.35 0.1 0.61 0.74 0.41 0.55 0.18
0.29 1.0 0.36 0.17 0.36 0.24 0.18 0.19 0.15 0.16 0.14 0.16 0.09 0.08 0.14 0.12 0.09 0.25 0.5 0.27
1.0 0.92 0.67 0.98 0.83 0.41 0.59 0.41 0.28 0.3 0.5 0.3 0.41 0.34 0.5 0.28 0.23 0.62 0.97 0.47
0.63 0.47 0.84 0.52 1.0 0.28 0.29 0.42 0.26 0.32 0.18 0.36 0.03 0.01 0.2 0.19 0.14 0.99 0.51 0.25
0.63 0.75 0.87 0.58 0.56 1.0 0.37 0.22 0.11 0.1 0.12 0.13 0.03 0.04 0.06 0.13 0.18 0.3 0.52 0.4
0.61 0.61 0.76 1.0 0.82 0.59 0.28 0.44 0.23 0.2 0.26 0.26 0.42 0.4 0.27 0.21 0.22 0.49 0.44 0.58
0.91 1.0 1.0 0.74 0.83 0.57 0.5 0.53 0.48 0.48 0.77 0.44 0.6 0.6 0.63 0.51 0.52 0.72 0.5 0.62
0.89 0.93 0.62 0.99 0.86 0.51 0.7 0.61 0.48 0.43 0.84 0.36 0.54 0.42 0.79 0.6 0.42 0.69 1.0 0.54
0.07 0.05 0.03 0.34 0.18 0.04 0.02 0.79 0.6 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01
0.81 0.97 0.92 0.67 0.78 0.96 0.75 0.54 0.58 0.52 0.82 0.42 0.3 0.28 0.83 0.58 0.47 0.74 1.0 0.93
0.7 1.0 0.6 0.65 0.61 0.44 0.72 0.52 0.4 0.4 0.69 0.32 0.37 0.35 0.59 0.6 0.45 0.4 0.59 0.46
1.0 0.25 0.24 0.84 0.82 0.32 0.05 0.32 0.37 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0
0.65 0.95 1.0 0.61 0.85 0.68 0.35 0.42 0.2 0.24 0.31 0.45 0.23 0.19 0.25 0.2 0.3 0.38 0.39 0.36
0.95 0.46 0.79 0.44 0.68 1.0 0.48 0.57 0.28 0.24 0.45 0.34 0.26 0.23 0.57 0.42 0.47 0.76 0.75 0.48
0.91 0.62 0.76 0.53 1.0 0.94 0.54 0.6 0.33 0.31 0.5 0.39 0.34 0.31 0.53 0.28 0.39 0.88 0.97 0.78
0.16 0.55 0.13 1.0 0.25 0.21 0.0 0.27 0.14 0.13 0.08 0.03 0.15 0.12 0.04 0.04 0.09 0.7 0.01 0.11
0.56 0.61 1.0 0.58 0.51 0.5 0.32 0.43 0.23 0.21 0.51 0.31 0.26 0.22 0.47 0.24 0.35 0.42 0.48 0.45
0.72 0.58 1.0 0.37 0.83 0.88 0.38 0.44 0.36 0.38 0.28 0.45 0.07 0.08 0.27 0.4 0.57 0.74 0.34 0.52
0.64 0.55 0.48 0.59 0.68 1.0 0.44 0.42 0.29 0.27 0.69 0.32 0.17 0.17 0.65 0.4 0.46 0.82 0.61 0.48
0.84 0.64 0.82 0.81 1.0 0.49 0.31 0.59 0.41 0.38 0.61 0.41 0.33 0.36 0.56 0.34 0.43 0.55 0.53 0.31
0.8 0.65 0.82 0.6 0.72 0.88 0.54 0.68 0.43 0.37 0.66 0.47 0.25 0.26 0.61 0.4 0.47 0.74 1.0 0.52
0.84 0.63 0.93 0.31 0.55 1.0 0.62 0.4 0.18 0.17 0.19 0.2 0.33 0.21 0.12 0.11 0.13 0.72 0.55 0.59
0.69 0.87 1.0 0.77 0.8 0.65 0.36 0.64 0.35 0.32 0.51 0.39 0.4 0.29 0.54 0.22 0.3 0.59 0.65 0.5
0.54 0.5 0.36 0.25 0.38 0.34 0.31 0.3 0.06 0.08 0.14 0.14 0.05 0.05 0.16 0.01 0.06 0.51 1.0 0.17
0.41 1.0 0.3 0.28 0.34 0.13 0.19 0.22 0.21 0.18 0.19 0.17 0.21 0.2 0.22 0.24 0.17 0.31 0.34 0.47
0.66 0.66 0.76 1.0 0.76 0.99 0.44 0.57 0.43 0.36 0.86 0.34 0.34 0.31 0.84 0.54 0.46 0.7 0.68 0.44
0.8 0.58 0.97 0.55 0.65 0.21 1.0 0.42 0.1 0.15 0.15 0.26 0.12 0.08 0.11 0.15 0.22 0.63 0.33 0.2
1.0 0.67 0.91 0.9 0.9 0.97 0.56 0.5 0.24 0.2 0.4 0.26 0.24 0.23 0.46 0.27 0.23 0.62 0.9 0.53
0.87 0.64 0.84 1.0 0.79 0.78 0.42 0.44 0.22 0.16 0.26 0.18 0.31 0.29 0.31 0.26 0.28 0.58 0.58 0.46
0.37 0.11 0.03 1.0 0.34 0.01 0.1 0.55 0.14 0.19 0.3 0.19 0.18 0.12 0.22 0.22 0.24 0.71 0.36 0.03
0.96 1.0 0.96 0.66 0.99 0.66 0.53 0.66 0.48 0.48 0.68 0.42 0.68 0.56 0.69 0.49 0.44 0.66 0.7 0.73
0.42 0.73 0.49 0.32 1.0 0.92 0.43 0.44 0.31 0.25 0.27 0.29 0.38 0.33 0.26 0.27 0.22 0.68 0.65 0.32
0.64 0.76 0.74 0.65 0.59 1.0 0.77 0.57 0.31 0.32 0.42 0.33 0.36 0.33 0.42 0.33 0.38 0.42 0.82 0.44
0.71 0.89 0.81 0.83 1.0 0.71 0.53 0.6 0.37 0.35 0.47 0.4 0.15 0.13 0.5 0.29 0.33 0.64 0.74 0.3
0.69 0.98 1.0 0.63 0.71 0.69 0.49 0.65 0.42 0.4 0.49 0.46 0.28 0.23 0.51 0.4 0.46 0.68 0.72 0.53
0.68 0.68 0.77 0.66 0.82 0.48 0.3 0.47 0.25 0.16 0.18 0.48 0.05 0.03 0.27 0.18 0.33 1.0 0.45 0.33
0.84 0.77 0.88 0.93 0.96 1.0 0.74 0.61 0.35 0.36 0.4 0.54 0.67 0.72 0.46 0.41 0.48 0.98 0.93 0.89
0.63 0.49 0.52 1.0 0.38 0.17 0.39 0.22 0.13 0.13 0.22 0.13 0.12 0.11 0.21 0.22 0.23 0.33 0.33 0.21
0.51 0.44 0.51 0.78 0.66 1.0 0.41 0.51 0.29 0.32 0.27 0.52 0.44 0.46 0.32 0.31 0.55 0.52 0.65 0.55
0.59 0.63 0.97 0.5 0.57 0.81 0.43 0.54 0.55 0.57 0.65 0.53 0.39 0.27 0.57 0.46 0.52 0.55 1.0 0.73
0.68 0.54 0.69 0.7 0.83 1.0 0.38 0.76 0.34 0.29 0.48 0.6 0.28 0.26 0.5 0.33 0.5 0.69 0.91 0.44
0.92 0.98 1.0 0.81 0.83 0.43 0.04 0.64 0.56 0.52 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.24 0.32 0.96 0.19 0.02
0.43 0.38 0.68 1.0 0.49 0.48 0.39 0.54 0.38 0.46 0.01 0.0 0.03 0.04 0.02 0.17 0.29 0.51 0.18 0.07
0.82 0.59 0.84 0.88 1.0 0.46 0.28 0.54 0.3 0.29 0.43 0.35 0.28 0.23 0.45 0.28 0.3 0.6 0.78 0.32
0.88 0.75 0.81 0.98 1.0 0.68 0.43 0.7 0.48 0.49 0.67 0.4 0.67 0.58 0.57 0.4 0.44 0.86 0.64 0.53
0.55 0.54 0.49 1.0 0.46 0.4 0.0 0.35 0.24 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0
0.55 1.0 0.62 0.44 0.5 0.41 0.24 0.42 0.25 0.21 0.24 0.26 0.31 0.29 0.25 0.17 0.17 0.45 0.36 0.24
0.8 0.54 0.99 0.6 1.0 0.79 0.26 0.69 0.35 0.31 0.42 0.41 0.54 0.46 0.42 0.21 0.25 0.69 0.74 0.4
0.95 0.99 0.85 0.62 1.0 0.95 0.54 0.63 0.62 0.54 0.66 0.5 0.18 0.16 0.69 0.79 0.92 0.86 0.65 0.73
0.74 0.86 0.69 0.92 0.8 0.74 0.69 0.62 0.41 0.4 0.79 0.4 0.48 0.44 0.88 0.35 0.43 0.77 1.0 0.64
0.68 0.98 0.91 0.59 0.7 0.78 0.63 0.8 0.54 0.49 0.55 0.54 0.69 0.58 0.6 0.36 0.41 0.53 1.0 0.48
0.7 1.0 0.95 0.76 0.85 0.71 0.37 0.53 0.5 0.44 0.49 0.53 0.46 0.44 0.48 0.42 0.33 0.71 0.75 0.47
0.86 0.59 1.0 0.85 0.74 0.95 0.78 0.54 0.2 0.2 0.31 0.39 0.22 0.18 0.38 0.23 0.36 0.73 0.72 0.53
0.52 0.69 0.75 0.59 0.88 0.6 0.61 0.7 0.83 0.72 1.0 0.87 0.11 0.12 0.84 0.86 0.82 0.69 0.52 0.96
0.78 0.31 0.67 1.0 0.53 0.28 0.02 0.6 0.38 0.33 0.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.26 0.32 0.7 0.19 0.0
0.79 0.16 0.4 1.0 0.48 0.19 0.01 0.49 0.43 0.37 0.01 0.02 0.27 0.09 0.0 0.38 0.48 0.7 0.06 0.01
0.78 0.13 0.3 0.53 0.36 0.39 0.07 0.59 0.31 0.31 0.0 0.03 0.48 0.43 0.0 0.31 0.24 1.0 0.51 0.0
0.44 0.66 0.61 0.44 0.83 0.62 0.37 0.61 0.36 0.35 0.55 0.47 0.57 0.45 0.54 0.3 0.36 0.87 1.0 0.68
1.0 0.5 0.63 0.78 0.67 0.7 0.29 0.37 0.25 0.27 0.44 0.17 0.27 0.26 0.44 0.21 0.19 0.5 0.56 0.51
0.54 0.86 0.67 0.49 0.8 1.0 0.35 0.48 0.46 0.47 0.41 0.45 0.39 0.33 0.43 0.49 0.42 0.62 0.81 0.54
1.0 0.68 0.88 0.82 0.98 0.68 0.29 0.61 0.33 0.32 0.51 0.36 0.4 0.35 0.46 0.4 0.46 0.59 0.68 0.78
0.56 0.36 0.41 0.28 0.44 0.19 0.0 0.38 0.36 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.23 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)