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Heatmap: Cluster_330 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.66 0.64 0.4 0.46 0.07 0.7 0.04 -0.07 -0.66 -0.8 -0.23 -0.98 -0.82 -0.72 -0.3 0.18 -0.73 0.03 0.52 -0.36
0.59 0.94 0.59 0.95 0.2 -0.07 0.05 -0.18 -0.82 -0.66 0.09 -0.63 -1.12 -1.17 0.09 -0.54 -0.68 -0.16 0.46 -0.61
0.51 0.21 0.14 0.4 0.25 0.72 -0.06 -0.13 -0.83 -0.73 -0.05 -0.3 -0.4 -0.49 0.15 -0.47 -0.38 0.51 -0.03 -0.17
1.05 0.78 0.83 1.05 0.88 -0.84 -0.23 -0.16 -0.95 -1.05 -0.82 -1.22 -0.49 -0.83 -0.84 -0.66 -0.32 0.3 0.01 -0.47
-0.31 -0.26 0.03 0.17 0.26 0.43 -0.3 -0.15 0.16 0.04 0.09 -0.21 -0.4 -0.47 -0.07 -0.12 0.23 0.23 0.16 0.07
-0.03 -2.03 -2.72 0.23 0.1 -1.51 -6.94 1.12 0.78 0.58 - - -2.61 -2.26 - 0.51 0.18 2.35 1.38 -7.76
1.52 1.55 1.33 1.5 1.24 0.46 -5.34 0.14 0.03 0.0 - - - - - - - 0.96 -6.29 -7.03
1.12 0.82 1.16 1.44 0.83 0.22 -0.65 -0.3 -1.14 -1.18 -2.97 -1.3 -0.53 -0.96 -2.72 -2.26 -2.81 0.45 0.24 0.04
1.16 0.38 0.57 0.68 0.88 0.14 -0.57 0.25 -1.12 -1.08 -0.89 -1.35 0.21 -0.21 -0.71 -2.2 -2.34 0.48 0.08 0.25
0.45 -0.52 0.36 0.6 0.47 0.56 -0.15 0.16 -0.47 -0.71 -0.5 -0.09 0.15 -0.12 -0.44 -0.06 0.01 0.09 -0.31 -0.56
0.92 1.3 1.06 -0.9 0.47 -0.29 -0.84 0.45 -1.51 -0.82 -0.44 -1.17 0.33 -0.07 -0.47 -1.4 -1.75 0.11 0.84 -1.6
0.74 1.22 0.8 1.14 0.37 -0.55 -0.98 -0.22 -0.77 -0.89 -0.06 -0.97 -1.06 -1.32 -0.11 -0.26 -0.86 0.09 0.09 -0.31
0.08 0.48 -0.07 0.82 0.15 -0.65 0.27 -0.01 -0.5 -0.53 0.39 -0.8 -0.56 -0.69 0.31 0.05 -0.26 -0.05 0.37 -0.08
0.52 0.3 0.8 0.78 0.36 0.47 -0.8 0.15 -0.62 -0.75 -0.17 -0.61 -0.81 -0.9 -0.6 -0.6 -0.26 0.21 0.67 -0.5
0.34 0.96 1.32 0.03 0.5 0.29 -0.71 -0.08 -0.9 -1.01 -0.2 -0.59 -1.55 -1.24 -0.44 -0.65 -0.15 0.22 0.53 -0.2
0.45 0.13 0.47 0.54 0.46 0.77 0.13 0.33 -0.91 -0.84 -0.49 -0.3 -0.71 -1.09 -0.56 -1.5 -0.63 0.31 0.55 0.24
0.07 0.64 0.7 0.23 0.39 0.27 -0.3 0.21 -0.54 -0.4 -0.28 -0.31 -0.58 -0.96 -0.11 -0.72 -0.9 0.38 0.63 -0.09
0.61 0.91 0.97 0.77 0.6 -0.52 -0.06 0.13 -0.79 -0.86 -0.16 -0.53 -0.48 -0.63 -0.21 -0.92 -0.48 -0.1 -0.17 -0.63
0.86 -1.52 0.5 0.69 0.28 -0.66 -2.03 0.05 0.01 -0.27 -0.13 0.18 -0.42 -0.49 -0.1 0.35 0.46 0.03 0.42 -1.31
0.42 0.48 1.11 0.52 0.56 -0.04 -2.27 -0.11 -0.39 -0.86 -2.19 0.15 0.19 -0.4 -2.16 0.4 0.66 -0.19 0.24 -1.41
0.24 2.01 0.55 -0.51 0.56 -0.04 -0.46 -0.39 -0.75 -0.67 -0.8 -0.66 -1.41 -1.56 -0.78 -1.0 -1.48 -0.01 1.02 0.11
0.86 0.73 0.28 0.83 0.6 -0.42 0.1 -0.44 -0.98 -0.88 -0.14 -0.86 -0.44 -0.68 -0.14 -0.96 -1.28 0.17 0.82 -0.22
0.67 0.24 1.1 0.4 1.34 -0.5 -0.45 0.08 -0.6 -0.29 -1.16 -0.12 -3.66 -4.91 -0.95 -1.08 -1.49 1.32 0.37 -0.65
0.83 1.09 1.29 0.7 0.66 1.5 0.07 -0.67 -1.68 -1.89 -1.61 -1.46 -3.68 -3.3 -2.62 -1.5 -0.99 -0.24 0.56 0.19
0.42 0.42 0.75 1.14 0.85 0.37 -0.72 -0.03 -0.97 -1.21 -0.8 -0.79 -0.1 -0.17 -0.77 -1.12 -1.07 0.11 -0.05 0.36
0.49 0.62 0.63 0.2 0.37 -0.19 -0.38 -0.28 -0.44 -0.42 0.24 -0.57 -0.1 -0.12 -0.05 -0.35 -0.31 0.16 -0.36 -0.07
0.42 0.49 -0.09 0.59 0.38 -0.36 0.09 -0.1 -0.45 -0.61 0.34 -0.87 -0.3 -0.67 0.26 -0.15 -0.66 0.05 0.6 -0.3
-1.33 -1.89 -2.46 0.92 -0.02 -2.1 -3.34 2.11 1.72 1.47 - - - - - - - 2.46 - -4.65
0.23 0.48 0.41 -0.05 0.17 0.47 0.11 -0.37 -0.25 -0.4 0.25 -0.74 -1.23 -1.3 0.26 -0.26 -0.55 0.09 0.53 0.42
0.36 0.88 0.14 0.25 0.16 -0.3 0.41 -0.06 -0.43 -0.43 0.34 -0.78 -0.57 -0.63 0.13 0.14 -0.26 -0.44 0.13 -0.25
1.92 -0.07 -0.14 1.66 1.63 0.29 -2.39 0.29 0.5 0.7 - -9.42 -8.86 - - -7.18 -7.35 1.25 -7.09 -6.74
0.53 1.07 1.15 0.44 0.92 0.59 -0.38 -0.11 -1.14 -0.94 -0.55 -0.0 -0.95 -1.22 -0.84 -1.18 -0.6 -0.23 -0.22 -0.31
0.83 -0.22 0.58 -0.27 0.36 0.91 -0.13 0.09 -0.92 -1.12 -0.24 -0.64 -1.02 -1.22 0.1 -0.35 -0.16 0.51 0.5 -0.15
0.61 0.07 0.36 -0.18 0.75 0.66 -0.14 0.02 -0.87 -0.93 -0.26 -0.62 -0.81 -0.94 -0.18 -1.08 -0.6 0.56 0.71 0.39
-0.36 1.39 -0.72 2.25 0.25 -0.0 -8.69 0.37 -0.56 -0.73 -1.44 -2.87 -0.53 -0.79 -2.54 -2.26 -1.24 1.73 -3.84 -0.98
0.38 0.49 1.21 0.43 0.24 0.22 -0.44 -0.0 -0.92 -1.06 0.23 -0.49 -0.75 -0.97 0.12 -0.84 -0.31 -0.03 0.14 0.05
0.57 0.28 1.05 -0.39 0.79 0.87 -0.34 -0.15 -0.4 -0.34 -0.79 -0.1 -2.78 -2.67 -0.86 -0.27 0.25 0.61 -0.52 0.11
0.33 0.13 -0.09 0.21 0.43 0.98 -0.19 -0.27 -0.82 -0.89 0.45 -0.68 -1.54 -1.55 0.36 -0.35 -0.13 0.69 0.26 -0.08
0.64 0.26 0.62 0.6 0.9 -0.14 -0.79 0.15 -0.39 -0.51 0.18 -0.39 -0.69 -0.57 0.07 -0.67 -0.3 0.04 -0.02 -0.79
0.42 0.13 0.48 0.01 0.27 0.57 -0.13 0.2 -0.46 -0.69 0.16 -0.34 -1.27 -1.22 0.05 -0.57 -0.34 0.33 0.75 -0.19
0.94 0.52 1.07 -0.49 0.33 1.19 0.5 -0.12 -1.3 -1.34 -1.22 -1.11 -0.42 -1.08 -1.88 -2.0 -1.79 0.72 0.32 0.43
0.36 0.68 0.88 0.51 0.56 0.27 -0.6 0.25 -0.62 -0.77 -0.1 -0.49 -0.43 -0.92 -0.02 -1.31 -0.87 0.13 0.27 -0.12
1.0 0.87 0.41 -0.1 0.48 0.34 0.2 0.13 -2.1 -1.71 -0.98 -0.91 -2.51 -2.34 -0.79 -4.32 -2.23 0.92 1.88 -0.65
0.49 1.79 0.04 -0.04 0.22 -1.11 -0.62 -0.36 -0.49 -0.67 -0.61 -0.79 -0.45 -0.56 -0.37 -0.29 -0.76 0.11 0.25 0.71
0.11 0.12 0.32 0.72 0.32 0.7 -0.45 -0.08 -0.51 -0.74 0.51 -0.83 -0.85 -0.96 0.46 -0.16 -0.39 0.2 0.16 -0.47
1.07 0.61 1.33 0.52 0.76 -0.84 1.38 0.14 -1.92 -1.39 -1.34 -0.54 -1.72 -2.31 -1.79 -1.38 -0.81 0.71 -0.23 -0.95
0.86 0.28 0.72 0.71 0.71 0.82 0.02 -0.14 -1.17 -1.44 -0.46 -1.06 -1.2 -1.26 -0.26 -1.0 -1.23 0.18 0.71 -0.07
0.85 0.41 0.79 1.04 0.7 0.69 -0.21 -0.13 -1.11 -1.58 -0.91 -1.4 -0.65 -0.73 -0.62 -0.87 -0.79 0.26 0.25 -0.08
0.46 -1.29 -2.96 1.89 0.33 -5.05 -1.39 1.02 -0.93 -0.52 0.13 -0.53 -0.57 -1.19 -0.29 -0.33 -0.2 1.39 0.42 -3.04
0.52 0.58 0.52 -0.03 0.56 -0.01 -0.34 -0.02 -0.49 -0.49 0.02 -0.66 0.02 -0.25 0.03 -0.47 -0.61 -0.03 0.06 0.12
-0.09 0.7 0.13 -0.47 1.15 1.03 -0.08 -0.04 -0.53 -0.83 -0.73 -0.63 -0.23 -0.43 -0.82 -0.73 -1.0 0.59 0.54 -0.49
0.28 0.52 0.48 0.29 0.16 0.91 0.53 0.11 -0.77 -0.71 -0.32 -0.7 -0.56 -0.71 -0.34 -0.68 -0.47 -0.33 0.63 -0.28
0.4 0.72 0.59 0.63 0.9 0.4 -0.02 0.15 -0.55 -0.62 -0.2 -0.43 -1.88 -2.03 -0.1 -0.86 -0.7 0.25 0.46 -0.83
0.28 0.78 0.81 0.15 0.31 0.27 -0.21 0.18 -0.44 -0.51 -0.21 -0.32 -1.01 -1.29 -0.17 -0.53 -0.32 0.25 0.34 -0.12
0.66 0.66 0.85 0.62 0.94 0.15 -0.51 0.14 -0.77 -1.4 -1.28 0.17 -3.06 -3.76 -0.68 -1.22 -0.37 1.22 0.08 -0.37
0.28 0.14 0.33 0.42 0.47 0.52 0.09 -0.18 -0.99 -0.95 -0.8 -0.36 -0.05 0.04 -0.6 -0.78 -0.54 0.5 0.41 0.36
1.03 0.66 0.77 1.7 0.3 -0.9 0.35 -0.49 -1.21 -1.22 -0.52 -1.25 -1.41 -1.48 -0.53 -0.49 -0.43 0.11 0.09 -0.58
0.01 -0.18 0.03 0.64 0.39 1.0 -0.3 0.03 -0.79 -0.64 -0.89 0.05 -0.2 -0.12 -0.63 -0.69 0.13 0.06 0.37 0.14
-0.01 0.09 0.71 -0.25 -0.05 0.45 -0.46 -0.13 -0.1 -0.05 0.15 -0.17 -0.61 -1.12 -0.05 -0.37 -0.2 -0.1 0.76 0.3
0.28 -0.06 0.31 0.31 0.57 0.84 -0.57 0.44 -0.73 -0.94 -0.21 0.09 -1.02 -1.13 -0.15 -0.75 -0.18 0.31 0.7 -0.33
1.1 1.18 1.21 0.9 0.93 -0.01 -3.37 0.57 0.37 0.28 - -8.61 -2.26 -2.13 - -0.84 -0.45 1.16 -1.2 -4.63
0.39 0.22 1.05 1.61 0.57 0.56 0.24 0.72 0.21 0.5 -4.69 -7.45 -3.47 -3.0 -4.27 -0.91 -0.18 0.63 -0.85 -2.31
0.7 0.24 0.74 0.81 1.0 -0.11 -0.83 0.1 -0.73 -0.78 -0.21 -0.5 -0.86 -1.12 -0.16 -0.86 -0.73 0.25 0.64 -0.64
0.44 0.21 0.31 0.6 0.63 0.06 -0.61 0.12 -0.44 -0.39 0.05 -0.7 0.05 -0.15 -0.18 -0.69 -0.55 0.41 -0.01 -0.29
1.16 1.14 0.99 2.03 0.9 0.7 - 0.5 -0.01 -0.44 - - - - - - - 1.5 - -
0.56 1.44 0.74 0.25 0.45 0.16 -0.65 0.2 -0.59 -0.8 -0.62 -0.48 -0.25 -0.35 -0.56 -1.08 -1.15 0.3 -0.04 -0.61
0.55 -0.0 0.87 0.15 0.88 0.54 -1.08 0.35 -0.64 -0.8 -0.38 -0.39 -0.01 -0.25 -0.38 -1.35 -1.13 0.34 0.44 -0.45
0.45 0.51 0.3 -0.16 0.53 0.46 -0.36 -0.13 -0.16 -0.35 -0.07 -0.48 -1.93 -2.1 -0.01 0.2 0.41 0.32 -0.08 0.07
0.18 0.4 0.08 0.49 0.3 0.19 0.08 -0.07 -0.67 -0.69 0.27 -0.7 -0.43 -0.59 0.42 -0.88 -0.6 0.23 0.61 -0.03
0.08 0.61 0.51 -0.13 0.14 0.28 -0.02 0.31 -0.24 -0.38 -0.23 -0.25 0.1 -0.14 -0.11 -0.85 -0.63 -0.28 0.64 -0.43
0.23 0.75 0.68 0.36 0.52 0.26 -0.67 -0.18 -0.24 -0.43 -0.27 -0.17 -0.38 -0.42 -0.32 -0.5 -0.85 0.26 0.32 -0.33
0.68 0.14 0.9 0.66 0.45 0.82 0.53 0.0 -1.43 -1.4 -0.81 -0.45 -1.31 -1.61 -0.52 -1.25 -0.56 0.43 0.43 -0.02
-0.4 0.02 0.13 -0.2 0.36 -0.18 -0.16 0.04 0.27 0.06 0.55 0.35 -2.61 -2.56 0.3 0.34 0.26 0.02 -0.4 0.49
1.23 -0.11 1.02 1.59 0.68 -0.26 -4.42 0.85 0.21 0.02 - -8.38 -0.79 -2.3 - -0.34 -0.06 1.09 -0.84 -
1.31 -0.98 0.33 1.66 0.6 -0.73 -4.8 0.62 0.46 0.21 -5.07 -4.28 -0.24 -1.9 - 0.28 0.61 1.14 -2.34 -4.82
1.2 -1.39 -0.16 0.65 0.08 0.22 -2.32 0.8 -0.13 -0.12 - -3.54 0.51 0.35 - -0.14 -0.47 1.56 0.58 -
-0.34 0.25 0.13 -0.33 0.58 0.16 -0.58 0.14 -0.61 -0.66 0.0 -0.23 0.04 -0.29 -0.03 -0.87 -0.64 0.65 0.85 0.29
1.15 0.15 0.48 0.79 0.56 0.64 -0.64 -0.28 -0.85 -0.76 -0.04 -1.38 -0.71 -0.77 -0.04 -1.13 -1.23 0.16 0.31 0.19
-0.03 0.64 0.28 -0.18 0.54 0.86 -0.66 -0.18 -0.26 -0.21 -0.42 -0.3 -0.49 -0.73 -0.36 -0.17 -0.4 0.18 0.56 -0.03
0.79 0.22 0.6 0.49 0.76 0.23 -0.98 0.08 -0.82 -0.84 -0.18 -0.67 -0.53 -0.72 -0.33 -0.54 -0.34 0.02 0.24 0.43
1.31 0.67 0.84 0.27 0.95 -0.25 - 0.74 0.67 0.53 - - - - - -5.06 -5.23 2.13 0.01 -5.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.