Heatmap: Cluster_185 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.85 0.55 0.66 0.92 0.75 0.31 0.41 0.47 0.45 0.45 0.52 0.28 0.5 0.4 0.55 0.42 0.39 0.68 0.61 1.0
0.69 0.33 0.34 0.4 0.39 0.25 0.29 0.28 0.24 0.24 0.34 0.17 0.27 0.21 0.35 0.21 0.18 0.33 0.41 1.0
0.57 0.21 0.38 0.55 0.45 0.35 0.36 0.38 0.25 0.24 0.43 0.24 0.16 0.14 0.41 0.31 0.37 0.42 0.71 1.0
0.39 0.24 0.3 0.35 0.4 0.33 0.34 0.27 0.16 0.15 0.26 0.18 0.2 0.19 0.28 0.14 0.18 0.39 0.47 1.0
1.0 0.89 0.68 0.82 0.82 0.75 0.58 0.65 0.39 0.42 0.63 0.39 0.33 0.23 0.59 0.25 0.36 0.69 0.89 0.75
0.18 0.15 0.16 0.18 0.17 0.54 0.51 0.21 0.09 0.08 0.22 0.08 0.09 0.1 0.21 0.09 0.13 0.15 0.27 1.0
1.0 0.65 0.57 0.94 0.63 0.46 0.29 0.54 0.33 0.37 0.89 0.39 0.21 0.15 0.81 0.43 0.46 0.56 0.91 0.35
0.5 0.45 0.21 0.28 0.34 0.35 0.21 0.17 0.15 0.13 0.16 0.11 0.19 0.13 0.16 0.16 0.13 0.3 0.31 1.0
0.65 0.72 0.4 0.54 0.66 0.37 0.44 0.42 0.26 0.27 0.38 0.27 0.09 0.08 0.5 0.31 0.26 0.29 1.0 0.79
0.56 0.44 0.32 0.5 0.68 0.37 0.58 0.34 0.25 0.28 0.44 0.25 0.15 0.1 0.39 0.39 0.28 0.35 0.71 1.0
1.0 0.78 0.79 0.9 0.74 0.8 0.43 0.49 0.38 0.3 0.41 0.22 0.58 0.45 0.38 0.46 0.29 0.5 0.78 0.38
0.76 0.3 0.53 0.5 0.71 0.66 0.53 0.41 0.37 0.36 0.35 0.2 0.36 0.31 0.49 0.21 0.27 0.56 1.0 0.38
0.22 0.07 0.1 0.07 0.13 0.37 0.09 0.1 0.07 0.06 0.09 0.1 0.03 0.05 0.1 0.11 0.11 0.11 0.2 1.0
0.48 0.82 0.45 0.52 0.63 0.43 0.58 0.48 0.51 0.4 0.57 0.38 0.42 0.43 0.57 0.42 0.4 0.7 1.0 0.44
0.79 0.59 0.48 0.52 0.68 0.53 0.6 0.46 0.38 0.35 0.52 0.32 0.22 0.16 0.54 0.4 0.44 0.58 0.66 1.0
0.36 0.23 0.21 0.26 0.34 0.3 0.32 0.3 0.22 0.2 0.3 0.14 0.26 0.24 0.28 0.2 0.16 0.35 0.41 1.0
1.0 0.8 0.89 0.83 0.96 0.34 0.38 0.53 0.37 0.4 0.46 0.33 0.41 0.35 0.46 0.58 0.33 0.81 0.93 0.93
1.0 0.8 0.75 0.81 0.96 0.49 0.61 0.58 0.47 0.4 0.71 0.41 0.37 0.34 0.71 0.54 0.49 0.84 0.98 0.98
0.4 0.29 0.27 0.43 0.39 0.47 0.47 0.33 0.21 0.18 0.45 0.22 0.24 0.16 0.46 0.31 0.24 0.33 0.58 1.0
1.0 0.45 0.6 0.79 0.85 0.31 0.42 0.4 0.32 0.28 0.35 0.23 0.15 0.17 0.39 0.36 0.32 0.75 0.96 0.45
0.73 0.81 0.59 0.83 0.89 0.99 0.7 0.64 0.6 0.53 0.8 0.51 0.34 0.37 0.73 0.61 0.65 0.79 1.0 0.62
1.0 0.78 0.59 0.65 0.58 0.95 0.74 0.46 0.32 0.24 0.37 0.26 0.2 0.21 0.36 0.28 0.16 0.37 0.55 0.52
1.0 0.55 0.54 0.52 0.48 0.06 0.13 0.28 0.13 0.19 0.12 0.09 0.26 0.15 0.12 0.01 0.02 0.93 0.6 0.83
1.0 0.71 0.88 0.87 0.8 0.63 0.44 0.6 0.48 0.46 0.56 0.49 0.39 0.3 0.51 0.55 0.75 0.82 0.82 0.83
1.0 0.24 0.24 0.26 0.37 0.02 0.12 0.1 0.12 0.14 0.16 0.06 0.05 0.05 0.16 0.15 0.13 0.29 0.44 0.54
0.94 0.67 0.77 1.0 0.79 0.74 0.27 0.54 0.37 0.31 0.43 0.3 0.57 0.5 0.46 0.3 0.29 0.79 0.7 0.63
0.99 0.75 0.59 0.97 0.83 0.63 0.33 0.62 0.36 0.34 0.91 0.46 0.15 0.14 0.97 0.45 0.42 0.75 0.99 1.0
0.64 0.6 0.36 0.42 0.56 0.38 0.34 0.33 0.23 0.21 0.42 0.23 0.2 0.16 0.44 0.36 0.28 0.45 0.84 1.0
1.0 0.41 0.48 0.48 0.46 0.19 0.2 0.35 0.15 0.17 0.4 0.24 0.18 0.15 0.38 0.15 0.24 0.6 0.4 0.47
0.67 0.23 0.2 0.28 0.34 0.24 0.28 0.34 0.23 0.23 0.41 0.19 0.31 0.23 0.35 0.19 0.22 0.33 0.21 1.0
1.0 0.41 0.49 0.53 0.5 0.38 0.33 0.24 0.2 0.19 0.33 0.19 0.18 0.15 0.34 0.25 0.25 0.64 0.5 0.74
0.51 0.33 0.18 0.44 0.45 0.49 0.38 0.37 0.22 0.28 0.29 0.31 0.12 0.11 0.32 0.2 0.2 0.36 0.17 1.0
0.76 0.92 0.52 0.69 0.78 0.54 0.77 0.58 0.46 0.4 0.59 0.52 0.24 0.24 0.61 0.5 0.55 0.78 1.0 0.86
0.72 0.54 0.49 0.74 1.0 0.59 0.44 0.44 0.3 0.31 0.43 0.31 0.31 0.28 0.45 0.27 0.28 0.95 0.86 0.65
0.91 0.44 0.67 0.78 0.84 0.77 0.65 0.6 0.36 0.34 0.54 0.37 0.32 0.28 0.52 0.43 0.46 0.76 0.71 1.0
1.0 0.62 0.66 0.74 0.62 0.65 0.39 0.54 0.34 0.34 0.62 0.27 0.37 0.26 0.57 0.4 0.38 0.58 0.66 0.61
0.66 0.17 0.16 0.15 0.19 0.54 0.24 0.2 0.13 0.14 0.21 0.16 0.18 0.17 0.21 0.13 0.06 0.43 0.24 1.0
0.92 0.61 0.58 0.65 0.7 0.65 0.67 0.48 0.42 0.47 1.0 0.33 0.25 0.25 0.98 0.71 0.69 0.54 0.85 0.47
0.9 0.47 0.54 0.72 0.82 0.84 0.58 0.63 0.41 0.45 0.87 0.46 0.34 0.32 0.82 0.45 0.73 0.83 1.0 0.84
0.64 0.11 0.16 0.09 0.12 0.3 0.29 0.16 0.1 0.11 0.22 0.12 0.1 0.08 0.19 0.08 0.1 0.22 0.43 1.0
0.88 0.58 0.77 0.89 0.84 0.75 0.58 0.73 0.6 0.54 0.74 0.46 0.68 0.56 0.77 0.4 0.61 0.89 1.0 0.97
0.53 0.51 0.37 0.49 0.75 0.54 0.58 0.5 0.29 0.24 0.43 0.47 0.31 0.3 0.46 0.31 0.2 0.83 0.93 1.0
1.0 0.67 0.56 0.83 0.72 0.65 0.61 0.5 0.4 0.39 0.76 0.28 0.42 0.41 0.69 0.35 0.26 0.54 0.57 0.61
0.68 0.2 0.24 0.35 0.4 0.31 0.15 0.25 0.2 0.21 0.29 0.13 0.3 0.24 0.28 0.2 0.2 0.41 0.44 1.0
0.89 0.66 0.66 1.0 0.94 0.34 0.6 0.37 0.22 0.26 0.46 0.26 0.22 0.24 0.4 0.38 0.26 0.83 0.74 0.85
0.73 0.56 0.49 0.6 0.75 1.0 0.45 0.62 0.5 0.5 0.7 0.41 0.54 0.42 0.69 0.44 0.48 0.57 0.73 0.56
0.66 0.69 0.56 0.58 0.93 0.97 0.54 0.7 0.62 0.57 0.88 0.43 0.74 0.71 1.0 0.72 0.7 0.75 0.71 0.84
0.79 0.15 0.24 0.14 0.23 0.34 0.18 0.22 0.14 0.13 0.15 0.18 0.15 0.13 0.15 0.1 0.15 0.37 0.34 1.0
0.66 0.5 0.56 0.49 0.61 0.38 0.64 0.41 0.33 0.32 0.48 0.25 0.39 0.35 0.48 0.29 0.34 0.51 0.57 1.0
0.42 0.61 0.44 0.66 0.74 0.62 0.54 0.54 0.22 0.27 0.33 0.37 0.63 0.43 0.24 0.19 0.17 0.82 0.79 1.0
0.66 0.37 0.49 0.61 0.4 1.0 0.48 0.45 0.22 0.2 0.41 0.21 0.23 0.19 0.44 0.2 0.16 0.42 0.47 0.63
0.75 0.08 0.19 0.26 0.32 0.04 0.05 0.14 0.05 0.05 0.08 0.09 0.05 0.05 0.08 0.05 0.07 0.47 0.48 1.0
1.0 0.38 0.58 0.63 0.71 0.79 0.63 0.41 0.25 0.27 0.55 0.23 0.38 0.31 0.56 0.29 0.25 0.58 0.55 0.96
0.91 0.56 0.52 0.73 0.79 0.58 0.52 0.54 0.49 0.44 0.74 0.43 0.45 0.4 0.71 0.54 0.58 0.78 1.0 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)