Heatmap: Cluster_289 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Internodes of Aerial Stem	Leaf Sheath at Stem Node	Root
Ehy_g00619	0.02	0.0	-0.02
Ehy_g00782	-0.13	0.0	0.11
Ehy_g01064	0.02	-0.06	0.04
Ehy_g01292	0.05	-0.05	-0.0
Ehy_g01632	-0.01	0.04	-0.02
Ehy_g01636 (PSD)	-0.19	0.03	0.15
Ehy_g01816	0.04	0.01	-0.05
Ehy_g02393	-0.2	0.01	0.17
Ehy_g02715	-0.1	0.02	0.08
Ehy_g03203	-0.13	0.04	0.08
Ehy_g03543 (TIM50)	-0.0	-0.16	0.15
Ehy_g03584	-0.25	0.09	0.13
Ehy_g03791	-0.08	-0.03	0.1
Ehy_g03958 (SPL7)	-0.07	-0.29	0.3
Ehy_g04046 (MRP10)	-0.29	0.02	0.23
Ehy_g04218	-0.12	0.01	0.11
Ehy_g04245	-0.17	0.03	0.13
Ehy_g04348 (U2AF35B)	-0.04	-0.03	0.07
Ehy_g04480	-0.05	0.01	0.05
Ehy_g04564	-0.04	-0.16	0.18
Ehy_g04671 (COX15)	0.04	-0.04	0.0
Ehy_g04878 (SRPK4)	-0.0	-0.07	0.07
Ehy_g04908	0.04	-0.11	0.07
Ehy_g04938	0.05	-0.1	0.04
Ehy_g04992 (PUM23)	-0.12	0.0	0.11
Ehy_g05117 (BIG)	-0.16	-0.07	0.21
Ehy_g05532	-0.19	0.18	-0.01
Ehy_g05618 (CCR1)	0.08	-0.01	-0.08
Ehy_g06045 (PAB2)	-0.12	-0.01	0.12
Ehy_g06057	-0.2	0.13	0.05
Ehy_g06460	-0.42	-0.25	0.49
Ehy_g06686	-0.05	-0.04	0.09
Ehy_g06788	0.03	-0.14	0.1
Ehy_g06885 (PRMT4B)	-0.05	-0.05	0.1
Ehy_g06927 (S6K2)	-0.06	-0.07	0.12
Ehy_g07011	-0.04	0.06	-0.02
Ehy_g07134	-0.06	-0.02	0.08
Ehy_g07642	-0.19	-0.03	0.2
Ehy_g07814	-0.23	-0.02	0.22
Ehy_g08029	-0.82	-0.11	0.59
Ehy_g08139	-0.08	0.03	0.05
Ehy_g08407 (HCT)	-0.05	-0.19	0.21
Ehy_g08628	-0.07	-0.01	0.08
Ehy_g08794	-0.11	0.07	0.04
Ehy_g08825	-0.25	0.26	-0.06
Ehy_g08981	-0.21	-0.05	0.22
Ehy_g09146	-0.38	0.06	0.25
Ehy_g09403	-0.02	0.02	0.0
Ehy_g09426	0.08	-0.04	-0.04
Ehy_g09617 (XIK)	0.01	-0.17	0.14
Ehy_g09869 (UBP8)	-0.01	-0.18	0.17
Ehy_g09953 (SYN4)	-0.1	-0.42	0.4
Ehy_g10099 (HAT14)	-0.12	-0.28	0.33
Ehy_g10150	-0.16	0.06	0.09
Ehy_g10300	-0.01	-0.02	0.03
Ehy_g10600	-0.03	-0.0	0.03
Ehy_g10642 (WIG)	-0.14	0.01	0.12
Ehy_g11205	-0.13	-0.02	0.13
Ehy_g11458	-0.05	-0.27	0.27
Ehy_g11587	-0.06	-0.16	0.2
Ehy_g11691	0.02	-0.0	-0.01
Ehy_g11714	-0.14	0.04	0.09
Ehy_g12267	-0.11	0.09	0.01
Ehy_g12379 (FKBP53)	-0.14	0.03	0.1
Ehy_g12613	-0.07	-0.04	0.1
Ehy_g12819	-0.21	-0.01	0.19
Ehy_g12863 (VNI1)	-0.07	-0.05	0.11
Ehy_g12925	0.1	-0.35	0.19
Ehy_g13115 (ETFQO)	0.04	-0.05	0.01
Ehy_g13330	-0.13	0.11	0.01
Ehy_g13382	-0.21	0.02	0.16
Ehy_g13692	0.04	-0.07	0.02
Ehy_g13697 (CYP704B1)	-0.03	0.01	0.02
Ehy_g13789 (EDA26)	-0.08	-0.22	0.26
Ehy_g13877	-0.45	-0.22	0.5
Ehy_g14094	-0.13	0.04	0.08
Ehy_g14305 (HK3)	-0.35	-0.2	0.43
Ehy_g14314	0.2	-0.06	-0.16
Ehy_g14351	-0.19	0.01	0.16
Ehy_g14602	0.03	-0.84	0.51
Ehy_g14691	-0.16	0.19	-0.06
Ehy_g14793	0.23	-0.12	-0.14
Ehy_g14821	-0.16	0.04	0.11
Ehy_g14822 (ORF145A)	0.02	-0.05	0.03
Ehy_g14836	-0.23	0.01	0.19
Ehy_g15220 (ROPGEF1)	-0.01	0.07	-0.07
Ehy_g15408 (PKL)	-0.33	0.08	0.2
Ehy_g15447 (LIG4)	-0.18	-0.01	0.17
Ehy_g15531	-0.2	-0.27	0.38
Ehy_g15698 (MIRO1)	-0.03	-0.12	0.14
Ehy_g15866	-0.14	-0.03	0.16
Ehy_g15962 (SWEETIE)	-0.07	-0.1	0.16
Ehy_g16081	-0.12	-0.02	0.12
Ehy_g16464	-0.14	-0.12	0.23
Ehy_g16499	-0.25	-0.3	0.43
Ehy_g16603	-0.08	0.06	0.02
Ehy_g16790	-0.12	0.14	-0.02
Ehy_g17028	0.07	-0.22	0.13
Ehy_g17477	-0.07	0.11	-0.05
Ehy_g17478	-0.03	-0.23	0.22
Ehy_g18525	-0.05	-0.6	0.46
Ehy_g18751	-0.18	-0.01	0.17
Ehy_g18756	-0.09	-0.02	0.1
Ehy_g18867	0.03	0.01	-0.04
Ehy_g19195	-0.19	0.08	0.09
Ehy_g19343	-0.01	-0.01	0.03
Ehy_g19433 (ATCHR12)	-0.07	0.01	0.06
Ehy_g19824	-0.07	0.03	0.04
Ehy_g20355	-0.09	-0.04	0.12
Ehy_g20664 (CUM2)	-0.3	0.05	0.21
Ehy_g20709	-0.13	-0.29	0.34
Ehy_g20872	-0.06	0.09	-0.04
Ehy_g20909	-0.17	-0.17	0.28
Ehy_g20934	-0.16	0.1	0.04
Ehy_g21064	-0.3	0.01	0.23
Ehy_g21161	-0.0	0.09	-0.1
Ehy_g21293	-0.12	0.15	-0.04
Ehy_g21386	-0.29	-0.07	0.3
Ehy_g21505	-0.45	-0.03	0.37
Ehy_g21593	-0.37	-0.1	0.37
Ehy_g21632 (PHB1)	-0.13	-0.06	0.17
Ehy_g21833	-0.44	0.39	-0.07
Ehy_g21993	0.07	-0.16	0.08
Ehy_g22337	0.0	-0.1	0.09
Ehy_g22535	-0.17	0.21	-0.07
Ehy_g22865	-0.6	-0.13	0.51
Ehy_g22916	-0.07	-0.01	0.07
Ehy_g22965 (ATB' BETA)	-0.09	-0.1	0.17
Ehy_g23115	-0.09	0.13	-0.06
Ehy_g23134 (LINC2)	-0.22	0.06	0.14
Ehy_g23337	-0.09	-0.25	0.29
Ehy_g23657	-0.12	0.01	0.1
Ehy_g23802	0.01	0.02	-0.03
Ehy_g23976	0.01	0.07	-0.08
Ehy_g24020 (ESD4)	-0.07	-0.1	0.16
Ehy_g24116	-0.14	-0.03	0.15
Ehy_g24133	-0.07	-0.05	0.11
Ehy_g24156	-0.62	0.37	0.09
Ehy_g24252	-0.18	-0.31	0.39
Ehy_g24253	-0.01	0.01	0.01
Ehy_g24259	-0.08	0.04	0.03
Ehy_g24358 (THH1)	-0.04	-0.09	0.12
Ehy_g24380 (HIT2)	-0.11	-0.06	0.16
Ehy_g24396	0.14	-0.11	-0.04
Ehy_g24483	-0.07	0.05	0.02
Ehy_g24604	-0.19	-0.01	0.17
Ehy_g24911	-0.11	0.03	0.07
Ehy_g24915 (DEK1)	-0.04	-0.03	0.08
Ehy_g25001	-0.34	0.0	0.27
Ehy_g25070	-0.29	0.04	0.21
Ehy_g25106	0.08	-0.2	0.11
Ehy_g25681	0.13	-0.43	0.22
Ehy_g26546 (MATR)	-0.1	0.02	0.07
Ehy_g26636 (EMB2769)	0.08	-0.08	-0.0
Ehy_g26829	-0.15	-0.12	0.24
Ehy_g26865	-0.31	-0.12	0.35
Ehy_g27072	0.02	-0.15	0.12
Ehy_g27156	0.08	-0.33	0.2
Ehy_g27357	-0.1	0.14	-0.04
Ehy_g27427 (IMPA-9)	-0.12	0.04	0.07
Ehy_g27589	-0.09	-0.05	0.13
Ehy_g27893	-0.04	0.13	-0.09
Ehy_g27918	-0.29	0.09	0.16
Ehy_g27980	-0.18	-0.12	0.26
Ehy_g28187	-0.2	0.05	0.12
Ehy_g28568	-0.4	0.12	0.2
Ehy_g28636	-0.24	-0.03	0.23
Ehy_g28889	-0.24	-0.35	0.46
Ehy_g28990	-0.18	-0.13	0.27
Ehy_g29292	-0.11	0.04	0.06
Ehy_g29373	-0.31	0.16	0.1
Ehy_g29456	-0.03	-0.09	0.12
Ehy_g29492	-0.02	-0.15	0.16
Ehy_g29510	-0.7	0.0	0.47
Ehy_g29543	-0.09	0.04	0.05
Ehy_g29592	-0.05	0.01	0.04
Ehy_g29656 (CHR24)	-0.78	-0.24	0.65
Ehy_g29789	-0.24	0.14	0.08
Ehy_g29857	-0.07	-0.12	0.17
Ehy_g29937	-0.32	-0.03	0.29
Ehy_g29941	-0.16	-0.1	0.23
Ehy_g29943	-0.11	-0.11	0.19
Ehy_g29944	-0.24	0.11	0.1
Ehy_g29971	-0.22	-0.1	0.27
Ehy_g30388	-0.04	0.02	0.02
Ehy_g30415	-0.14	0.02	0.12
Ehy_g30554	0.02	-0.13	0.1
Ehy_g30665	-0.09	-0.12	0.19
Ehy_g30861	0.06	-0.14	0.06
Ehy_g31095	0.01	-0.01	0.0
Ehy_g31119	-0.25	0.03	0.18
Ehy_g31154	-0.27	0.11	0.12
Ehy_g31328	-0.02	-0.03	0.05
Ehy_g31399	-0.04	-0.09	0.12
Ehy_g31481 (VAM3)	-0.04	-0.07	0.11
Ehy_g31673	0.02	-0.07	0.05
Ehy_g31799 (UBP19)	-0.02	-0.07	0.08
Ehy_g31845	-0.11	0.1	0.01
Ehy_g31868	-0.1	0.01	0.09
Ehy_g31966	-0.11	0.0	0.1
Ehy_g32126	-0.08	0.03	0.05
Ehy_g32180	-0.49	-0.27	0.54
Ehy_g32256 (gsl12)	-0.16	-0.2	0.3
Ehy_g32270	-0.33	-0.05	0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.