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Heatmap: Cluster_119 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
-0.12 0.0 0.11
0.07 -0.26 0.16
0.04 -0.08 0.03
0.02 0.0 -0.03
0.03 -0.01 -0.02
-0.37 0.16 0.15
0.04 0.02 -0.06
-0.34 0.16 0.13
0.01 -0.05 0.04
-0.02 -0.05 0.06
-0.06 -0.14 0.18
-0.01 0.05 -0.04
0.01 -0.02 0.02
-0.2 0.02 0.16
-0.1 -0.01 0.1
-0.24 -0.07 0.27
0.11 -0.1 -0.02
Ehy_g03840 (DREB2)
 -0.13 -0.35 0.38
0.04 -0.01 -0.02
-0.1 0.1 -0.01
0.04 -0.04 0.0
-0.05 -0.08 0.12
0.07 0.19 -0.31
Ehy_g04464 (LWD1)
 -0.07 -0.09 0.15
-0.06 -0.14 0.18
-0.09 0.0 0.08
Ehy_g05403 (TOM20-2)
 -0.07 -0.1 0.16
0.11 0.11 -0.25
-0.47 0.28 0.09
-0.06 -0.03 0.09
Ehy_g06101 (WRKY53)
 -0.33 0.23 0.04
-0.12 0.31 -0.26
-0.2 0.19 -0.01
-0.07 -0.02 0.08
-0.14 0.09 0.04
0.44 0.2 -1.0
0.03 0.11 -0.15
-0.08 0.13 -0.06
Ehy_g06825 (AtATG18a)
 -0.04 -0.05 0.09
-0.2 -0.09 0.25
-0.17 -0.05 0.19
0.02 -0.11 0.08
0.05 0.08 -0.14
Ehy_g07841 (IDD7)
 0.08 -0.2 0.11
-0.18 0.1 0.07
Ehy_g08990 (MPK6)
 0.08 -0.08 -0.01
-0.25 0.11 0.11
-0.22 0.11 0.08
-0.09 -0.13 0.19
0.14 -0.07 -0.07
Ehy_g09586 (SR30)
 -0.03 -0.03 0.06
Ehy_g09850 (MPK6)
 -0.13 -0.1 0.21
0.1 -0.19 0.08
-0.35 0.09 0.2
-0.43 0.35 -0.02
-0.17 -0.11 0.25
-0.27 -0.1 0.31
-0.15 -0.08 0.2
0.13 -0.06 -0.08
-0.28 0.13 0.11
-0.07 -0.26 0.28
0.16 -0.12 -0.06
Ehy_g11824 (ACR2)
 0.12 -0.08 -0.04
-0.24 -0.54 0.55
Ehy_g12018 (ATSGS1)
 -0.15 -0.12 0.24
0.03 -0.08 0.04
-0.57 0.29 0.15
-0.09 -0.07 0.15
0.18 -0.32 0.09
-0.07 0.07 -0.0
0.57 -1.02 0.03
0.07 -0.31 0.2
0.02 -0.39 0.29
Ehy_g13568 (WRKY28)
 -0.08 -0.11 0.17
-0.03 -0.03 0.06
0.39 -0.32 -0.16
0.15 0.09 -0.28
Ehy_g14063 (SCL30A)
 -0.06 0.06 -0.01
0.05 -0.12 0.06
-0.05 -0.08 0.12
0.01 0.06 -0.07
-0.12 0.1 0.01
-0.17 -0.11 0.24
-0.16 0.03 0.12
-0.13 -0.07 0.17
0.22 -1.26 0.5
0.0 0.04 -0.05
-0.13 0.01 0.11
-0.09 -0.05 0.13
Ehy_g16743 (DCL2)
 0.04 -0.05 0.01
Ehy_g16955 (BRIZ2)
 -0.13 -0.11 0.22
Ehy_g17180 (GSO2)
 -0.4 0.37 -0.07
-0.19 -0.52 0.51
-0.07 -0.08 0.14
0.05 -0.08 0.03
-0.12 -0.05 0.16
0.03 -0.05 0.01
-0.47 0.2 0.18
-0.54 0.42 -0.04
0.14 -0.06 -0.09
-0.47 0.11 0.27
Ehy_g18792 (UBC2)
 -0.09 0.12 -0.04
0.18 -0.11 -0.09
-0.65 0.07 0.39
-0.26 0.19 0.04
-0.04 -0.06 0.09
0.03 0.02 -0.06
Ehy_g19395 (TOPP4)
 0.05 -0.0 -0.05
Ehy_g19409 (HK5)
 0.14 0.18 -0.38
-0.23 0.07 0.13
0.14 -0.24 0.08
0.45 -0.12 -0.49
-0.19 -0.18 0.31
-0.02 0.17 -0.17
0.12 -0.14 0.01
0.01 0.03 -0.05
-0.43 0.2 0.14
-0.46 0.35 0.0
-2.78 0.95 -0.11
-0.5 0.1 0.29
-0.3 -0.06 0.3
-0.19 0.44 -0.39
-0.03 0.04 -0.01
0.14 -0.16 0.01
-0.09 -0.25 0.28
Ehy_g20772 (ICK3)
 -0.38 0.05 0.26
-0.25 0.08 0.14
-2.08 0.82 -0.01
-0.3 -0.15 0.36
0.23 -0.46 0.14
0.02 -0.1 0.07
-0.07 0.12 -0.06
-0.04 0.01 0.03
-0.3 0.13 0.13
Ehy_g21774 (DREB2)
 -0.31 0.16 0.11
-0.21 0.2 -0.02
Ehy_g22107 (NTF2A)
 -0.16 0.05 0.09
-0.39 -0.17 0.43
Ehy_g22250 (WRKY51)
 -0.23 -1.15 0.76
-0.98 0.22 0.41
-0.41 0.25 0.08
-0.1 -0.35 0.36
-0.11 0.08 0.02
0.06 -0.04 -0.02
-0.17 0.03 0.13
0.17 0.12 -0.35
-0.24 0.07 0.14
-0.1 -0.23 0.28
Ehy_g24094 (NF-YA6)
 -0.33 -0.63 0.64
-0.13 0.16 -0.05
-0.19 0.11 0.06
-0.21 -0.1 0.27
-0.38 -0.32 0.52
-0.09 0.02 0.07
Ehy_g24740 (CYP90D1)
 -0.57 0.19 0.24
0.07 0.11 -0.2
-0.28 0.4 -0.22
-0.11 -0.39 0.39
0.06 0.22 -0.34
-0.26 0.02 0.2
-0.04 -0.18 0.19
0.16 -1.14 0.51
-0.1 0.02 0.07
-0.33 -0.06 0.32
-0.69 0.01 0.46
-0.73 0.35 0.16
Ehy_g26854 (TINY2)
 0.29 -1.68 0.55
-1.12 0.24 0.44
-0.14 0.09 0.03
0.03 0.06 -0.09
0.53 -0.84 -0.01
0.05 0.02 -0.07
-0.04 -0.36 0.32
-1.0 -0.37 0.79
Ehy_g28377 (ORF240B)
 -0.32 0.09 0.19
-0.55 -0.42 0.65
0.06 0.08 -0.15
-0.3 0.16 0.1
-0.02 0.0 0.02
-0.02 -0.21 0.21
-0.39 -0.57 0.65
-0.21 -0.4 0.46
0.17 -0.77 0.36
Ehy_g29627 (UBC10)
 -0.21 -0.17 0.31
-0.17 -0.03 0.18
0.01 -0.17 0.14
-0.14 0.17 -0.05
Ehy_g31123 (RLK4)
 -0.18 0.38 -0.29
-0.12 0.0 0.11
-0.1 -0.1 0.18
-0.11 0.24 -0.17
-0.15 -0.58 0.52
-0.88 0.32 0.28
-0.11 0.11 -0.01
-0.44 0.35 -0.01
-0.03 -0.1 0.12
-0.1 -0.3 0.33
-0.54 -0.16 0.5
-0.25 -0.26 0.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.