Heatmap: Cluster_197 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
-0.07 0.23 -0.19
-0.59 0.29 0.15
-0.18 0.24 -0.1
Ehy_g01165 (PAP18)
-0.21 0.19 -0.01
-0.23 0.34 -0.18
Ehy_g01358 (PDH-E1 ALPHA)
-0.17 0.25 -0.11
Ehy_g01412 (emb1688)
-0.23 0.45 -0.36
Ehy_g01455 (PED2)
-0.11 0.13 -0.02
-0.1 0.24 -0.18
-0.12 0.16 -0.05
-0.13 0.08 0.03
-0.13 0.12 -0.0
-0.08 0.22 -0.17
-0.12 0.05 0.06
-0.19 0.15 0.02
-0.15 0.14 0.0
-0.07 0.07 -0.01
-0.05 0.12 -0.07
0.06 0.19 -0.3
Ehy_g04720 (HGO)
-0.15 0.23 -0.11
Ehy_g04730 (CID7)
-0.1 0.08 0.01
-0.72 0.33 0.18
-0.41 0.29 0.04
Ehy_g05607 (LWD1)
-0.09 0.17 -0.09
-0.34 0.39 -0.16
Ehy_g06111 (MGP)
-0.15 0.27 -0.16
-0.33 0.39 -0.16
-0.19 0.37 -0.27
0.02 0.15 -0.19
-0.01 0.08 -0.07
Ehy_g06667 (ADT6)
0.03 0.24 -0.33
Ehy_g06796 (WIN2)
-0.02 0.13 -0.13
-0.07 0.08 -0.01
Ehy_g07052 (OTP84)
-0.26 0.15 0.08
Ehy_g07133 (LINC1)
-0.12 0.12 -0.01
-0.15 0.29 -0.18
-0.15 0.17 -0.04
-0.02 0.22 -0.24
Ehy_g08472 (KAS2)
-0.08 0.27 -0.23
Ehy_g08550 (KNAT3)
-0.09 0.17 -0.1
-0.22 0.16 0.03
Ehy_g09042 (COL3)
-0.22 0.34 -0.2
-0.08 0.11 -0.04
-0.16 0.17 -0.03
-0.1 0.23 -0.15
-0.1 0.12 -0.03
Ehy_g09891 (TFL2)
-0.2 0.13 0.05
-0.19 0.23 -0.06
Ehy_g10047 (BMY8)
-0.04 0.08 -0.05
-0.25 0.31 -0.13
0.06 0.18 -0.27
-0.26 0.22 0.0
-0.38 0.24 0.07
-0.05 0.1 -0.05
-1.71 0.68 0.13
-0.31 0.29 -0.05
Ehy_g12133 (TRANS11)
-0.28 0.35 -0.15
-0.39 0.48 -0.25
-0.66 0.42 0.04
-0.27 0.33 -0.13
-0.41 0.5 -0.27
-0.35 0.1 0.19
-0.14 0.16 -0.04
-0.3 0.39 -0.19
-0.02 0.1 -0.08
-0.49 0.87 -1.1
0.09 0.5 -0.94
0.04 0.41 -0.63
-0.44 0.52 -0.26
-0.14 0.21 -0.09
Ehy_g14537 (DOF1)
-0.16 0.25 -0.13
Ehy_g14678 (CRCK2)
-0.24 0.33 -0.17
0.11 0.36 -0.65
-1.44 0.82 -0.2
-0.75 0.48 0.01
Ehy_g15422 (EMB2083)
-0.27 0.32 -0.13
-0.05 0.11 -0.06
-0.36 0.34 -0.06
-0.12 0.15 -0.05
-0.08 0.22 -0.16
-0.17 0.06 0.09
-0.18 0.14 0.03
Ehy_g16388 (ACD1)
-0.14 0.14 -0.01
-0.26 0.23 -0.02
-0.36 0.2 0.09
Ehy_g17070 (TRB1)
-0.3 0.29 -0.06
-0.15 0.11 0.03
-0.47 0.48 -0.18
0.07 0.26 -0.41
-0.22 0.16 0.04
-0.2 0.21 -0.04
-0.6 0.35 0.09
0.06 0.37 -0.59
Ehy_g19119 (PGSIP6)
0.04 0.02 -0.06
-0.2 0.32 -0.18
-0.23 0.07 0.13
0.01 0.11 -0.13
-0.14 0.12 0.01
Ehy_g20193 (AGL26)
-0.33 0.33 -0.07
-0.16 0.08 0.06
-0.33 0.48 -0.3
-0.17 0.25 -0.12
-0.81 0.45 0.09
-0.31 0.57 -0.5
-0.12 0.37 -0.35
-0.66 0.32 0.16
Ehy_g21122 (POLGAMMA1)
-0.5 0.46 -0.12
-0.08 0.17 -0.11
-0.18 0.41 -0.34
-0.1 0.14 -0.05
-0.15 0.21 -0.09
-0.31 0.26 -0.01
-0.14 0.38 -0.35
-0.97 0.72 -0.26
-0.15 0.13 0.0
-0.05 0.17 -0.14
-0.19 0.09 0.08
-0.38 0.07 0.24
0.06 0.2 -0.31
-1.38 0.91 -0.45
-0.3 0.35 -0.14
-0.01 0.3 -0.38
-0.41 0.72 -0.72
-0.61 0.62 -0.31
-0.15 0.33 -0.25
-1.75 0.94 -0.36
-0.29 0.36 -0.15
-0.26 0.11 0.12
-0.05 0.07 -0.02
-0.88 0.19 0.4
-0.1 0.33 -0.3
-0.08 0.14 -0.06
-0.54 0.35 0.05
-0.22 0.22 -0.04
0.03 -0.03 0.01
-0.03 0.33 -0.39
Ehy_g27116 (GWD)
-0.33 0.34 -0.1
-0.09 0.13 -0.05
-0.29 0.28 -0.05
-0.09 0.18 -0.11
-0.23 0.11 0.1
0.15 0.08 -0.26
-0.27 0.61 -0.62
-0.08 0.01 0.06
-0.12 0.08 0.03
-0.34 0.21 0.07
Ehy_g28986 (SYNC1)
-0.18 0.18 -0.02
-0.21 0.15 0.03
-0.34 0.34 -0.09
-0.21 0.2 -0.02
-0.26 0.32 -0.13
-0.33 0.46 -0.26
-0.17 0.15 0.01
-0.24 0.33 -0.16
-0.41 0.59 -0.43
-0.77 0.33 0.2
-0.27 0.24 -0.01
-0.39 0.38 -0.1
-0.27 0.31 -0.1
-0.2 0.23 -0.07
Ehy_g32318 (XBAT35)
-0.05 0.07 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.