Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.12 0.12 0.14 0.4 0.91 0.7 0.09 0.63 0.43 0.36 0.27 0.5 0.47 0.53 0.29 0.54 0.58 1.0 0.42 0.14
0.11 0.15 0.26 0.17 0.29 0.32 0.12 0.57 0.15 0.15 0.22 0.41 0.39 0.39 0.17 0.09 0.2 1.0 0.68 0.53
0.32 0.69 0.39 1.0 0.57 0.0 0.0 0.4 0.09 0.26 0.3 0.47 0.22 0.44 0.07 0.53 0.22 0.2 0.11 0.0
0.42 0.32 0.5 0.14 0.59 0.53 0.15 0.6 0.49 0.43 0.35 0.5 0.49 0.46 0.39 0.37 0.34 1.0 0.12 0.19
0.33 0.53 0.53 0.69 0.96 0.84 0.15 0.97 0.49 0.47 0.85 0.81 0.57 0.53 0.77 0.55 0.72 1.0 0.34 0.35
0.27 0.25 0.27 0.47 0.59 0.86 0.1 0.7 0.65 0.68 1.0 0.61 0.75 0.65 0.88 0.54 0.75 0.69 0.35 0.28
0.58 0.56 0.55 0.38 1.0 0.78 0.78 0.71 0.7 0.61 0.71 0.89 0.72 0.61 0.49 0.88 0.68 0.89 0.53 0.62
0.53 0.22 0.35 0.61 0.79 1.0 0.22 0.6 0.37 0.36 0.34 0.52 0.49 0.4 0.36 0.21 0.33 0.88 0.33 0.32
0.88 0.21 0.77 0.31 0.61 0.44 0.4 0.42 0.36 0.31 0.43 0.36 0.01 0.01 0.37 0.43 0.43 1.0 0.7 0.57
0.81 0.59 0.94 0.89 0.8 0.23 0.06 0.6 0.51 0.37 0.43 0.28 0.38 0.34 0.45 0.58 0.29 1.0 0.15 0.24
0.04 0.0 0.02 0.38 0.65 1.0 0.0 0.37 0.41 0.7 0.44 0.23 0.45 0.24 0.51 0.23 0.32 0.07 0.0 0.01
0.4 0.54 0.72 0.31 1.0 0.42 0.51 0.73 0.56 0.59 0.58 0.59 0.36 0.33 0.61 0.48 0.44 0.75 0.45 0.55
0.93 0.57 0.7 0.41 0.4 0.98 0.09 1.0 0.78 0.55 0.54 0.86 0.27 0.26 0.23 0.12 0.49 0.78 0.34 0.42
0.41 0.86 0.22 1.0 0.75 0.36 0.0 0.76 0.69 0.57 0.34 0.16 0.41 0.47 0.21 0.3 0.27 0.96 0.0 0.01
1.0 0.17 0.43 0.74 0.42 0.94 0.27 0.78 0.17 0.13 0.14 0.11 0.24 0.18 0.12 0.1 0.19 0.98 0.29 0.25
0.54 0.36 0.49 0.47 1.0 0.16 0.21 0.18 0.13 0.12 0.03 0.13 0.29 0.14 0.05 0.04 0.07 0.43 0.61 0.21
0.57 0.76 0.71 0.5 0.84 0.35 0.47 0.32 0.27 0.26 0.18 0.27 0.09 0.12 0.27 0.22 0.32 1.0 0.49 0.44
0.44 0.27 0.37 0.56 0.64 0.99 0.34 0.91 0.78 0.73 1.0 0.48 0.96 0.88 0.99 0.81 0.78 0.82 0.43 0.35
0.37 0.46 0.44 0.33 0.46 0.63 0.45 0.58 0.5 0.49 0.6 0.61 0.33 0.32 0.63 0.78 0.68 1.0 0.34 0.36
0.4 1.0 0.29 0.98 0.39 0.03 0.01 0.28 0.4 0.29 0.09 0.06 0.12 0.12 0.1 0.32 0.16 0.63 0.0 0.0
0.27 0.87 0.28 1.0 0.58 0.01 0.01 0.37 0.38 0.24 0.13 0.09 0.23 0.32 0.14 0.33 0.14 0.54 0.01 0.0
0.55 0.49 0.37 0.46 1.0 0.73 0.64 0.65 0.43 0.42 0.55 0.53 0.64 0.63 0.53 0.38 0.38 0.87 0.89 0.4
0.37 0.48 0.68 0.51 0.66 0.55 0.08 0.39 0.17 0.17 0.04 0.14 0.14 0.12 0.03 0.12 0.12 1.0 0.95 0.37
0.13 0.37 0.17 0.38 0.79 1.0 0.19 0.33 0.45 0.46 0.16 0.48 0.33 0.36 0.18 0.22 0.31 0.44 0.2 0.25
0.11 0.05 0.07 0.35 0.72 0.6 0.03 0.56 0.51 0.49 0.99 0.59 1.0 0.84 0.99 0.34 0.52 0.58 0.0 0.05
0.16 0.13 0.34 0.36 0.56 1.0 0.08 0.39 0.24 0.33 0.37 0.33 0.39 0.36 0.31 0.29 0.53 0.48 0.01 0.78
0.23 0.29 0.26 0.74 0.5 1.0 0.18 0.59 0.24 0.17 0.1 0.17 0.17 0.14 0.09 0.14 0.14 0.74 0.24 0.17
0.49 0.81 0.7 0.93 0.96 0.59 0.03 0.83 0.46 0.38 0.3 0.33 0.23 0.23 0.28 0.32 0.27 1.0 0.22 0.15
0.65 0.38 0.63 0.63 0.64 0.99 0.32 0.8 0.34 0.39 0.55 0.69 0.42 0.49 0.38 0.42 1.0 0.77 0.82 0.49
0.05 0.02 0.01 0.11 0.32 0.26 0.0 0.46 0.12 0.15 0.05 0.15 0.05 0.15 0.04 0.04 0.06 1.0 0.1 0.02
0.53 0.23 0.33 0.32 0.38 0.74 0.34 0.49 0.12 0.12 0.13 0.33 0.06 0.05 0.14 0.17 0.41 0.63 1.0 0.56
0.04 1.0 0.13 0.35 0.46 0.07 0.0 0.36 0.12 0.29 0.0 0.24 0.19 0.02 0.17 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.27 0.39 0.36 0.57 0.73 0.85 0.17 0.98 0.71 0.7 0.59 0.73 0.73 0.6 0.56 0.45 0.59 1.0 0.38 0.47
0.41 0.32 0.46 0.44 0.7 0.93 0.31 0.69 0.4 0.4 0.32 0.45 0.46 0.43 0.36 0.44 0.62 1.0 0.8 0.62
0.02 0.01 0.02 0.08 0.17 0.43 0.03 0.5 0.36 0.3 0.52 0.19 0.29 0.23 0.52 0.32 0.41 1.0 0.29 0.52
0.7 0.7 1.0 0.84 0.75 0.54 0.11 0.59 0.37 0.31 0.36 0.49 0.32 0.34 0.38 0.55 0.63 0.78 0.36 0.39
0.45 0.52 0.84 1.0 0.4 0.64 0.31 0.78 0.35 0.3 0.64 0.63 0.28 0.19 0.66 0.2 0.49 0.54 0.69 0.43
0.44 0.57 0.37 0.75 1.0 0.54 0.09 0.74 0.17 0.19 0.19 0.29 0.46 0.28 0.18 0.14 0.2 0.91 0.62 0.16
0.54 0.3 0.8 0.51 0.87 0.59 0.31 0.48 0.37 0.43 0.3 0.32 0.01 0.03 0.24 0.17 0.47 1.0 0.85 0.35
0.19 1.0 0.27 0.47 0.47 0.02 0.01 0.19 0.05 0.1 0.03 0.19 0.07 0.07 0.01 0.07 0.07 0.21 0.0 0.01
0.65 0.4 0.58 0.61 0.82 0.98 0.7 0.97 0.44 0.29 0.14 0.65 0.67 0.63 0.15 0.17 0.2 0.92 1.0 0.29
0.61 0.52 0.36 0.59 0.69 0.36 0.21 0.58 0.52 0.43 0.47 0.44 0.81 0.68 0.43 0.26 0.18 1.0 0.49 0.38
0.65 0.6 0.39 0.39 0.72 0.41 0.19 0.48 0.48 0.4 0.34 0.48 0.55 0.5 0.31 0.28 0.16 1.0 0.53 0.27
0.58 0.44 0.58 0.98 0.96 0.39 0.12 0.84 0.56 0.69 0.55 0.52 0.26 0.37 0.44 0.05 0.08 1.0 0.14 0.02
0.35 0.27 0.19 0.54 1.0 0.53 0.65 0.49 0.46 0.42 0.63 0.4 0.57 0.47 0.64 0.49 0.48 0.72 0.74 0.82
0.24 0.12 0.14 0.5 0.63 0.11 0.03 0.58 0.48 0.55 0.46 0.18 0.33 0.39 0.31 0.39 0.37 1.0 0.33 0.17
0.37 0.44 0.24 0.68 0.46 0.57 0.32 0.86 0.44 0.52 0.76 0.22 0.24 0.2 0.78 0.65 0.63 1.0 0.49 0.97
0.39 0.3 0.23 0.31 0.44 0.47 0.37 0.67 0.45 0.52 0.66 0.19 0.41 0.41 0.74 0.73 0.65 0.69 0.22 1.0
0.33 0.44 0.26 0.47 0.39 0.69 0.26 0.69 0.35 0.4 0.53 0.17 0.13 0.1 0.56 0.45 0.49 1.0 0.61 0.71
0.03 0.01 0.02 0.06 0.4 1.0 0.01 0.3 0.29 0.35 0.4 0.35 0.13 0.17 0.45 0.19 0.3 0.52 0.14 0.25
0.4 0.35 0.53 0.39 0.33 0.4 0.2 0.65 0.5 0.51 0.26 0.55 0.55 0.65 0.32 0.57 0.81 1.0 0.2 0.36
0.49 0.97 1.0 0.45 0.9 0.34 0.41 0.5 0.4 0.43 0.48 0.39 0.29 0.27 0.45 0.4 0.55 0.82 0.68 0.59
0.73 0.64 0.91 0.71 0.91 0.47 0.61 0.82 0.67 0.67 0.94 0.66 0.55 0.46 1.0 0.62 0.69 0.8 0.77 0.68
0.11 0.11 0.11 0.27 0.4 0.48 0.17 0.61 0.22 0.19 0.55 0.26 0.35 0.31 0.57 0.18 0.23 1.0 0.31 0.37
0.34 0.04 0.0 1.0 0.09 0.0 0.83 0.27 0.01 0.01 0.1 0.36 0.01 0.05 0.07 0.0 0.02 0.05 0.21 0.0
0.79 0.79 0.92 0.9 1.0 0.5 0.27 0.27 0.26 0.27 0.41 0.18 0.23 0.22 0.41 0.22 0.18 0.8 0.32 0.32
0.39 1.0 0.53 0.29 0.8 0.49 0.24 0.65 0.77 0.65 0.41 0.66 0.28 0.34 0.37 0.54 0.37 0.94 0.27 0.18
0.26 1.0 0.54 0.32 0.65 0.77 0.22 0.64 0.75 0.71 0.27 0.64 0.36 0.44 0.24 0.57 0.37 0.9 0.29 0.11
0.6 0.81 0.64 0.74 0.74 1.0 0.61 0.83 0.36 0.36 0.58 0.37 0.6 0.68 0.74 0.43 0.64 0.77 0.86 0.68
0.6 0.2 0.42 0.4 1.0 0.19 0.12 0.74 0.75 0.8 0.76 0.78 0.79 0.67 0.39 0.44 0.33 0.28 0.0 0.0
0.31 0.38 0.4 0.29 0.61 1.0 0.53 0.58 0.32 0.33 0.47 0.52 0.55 0.47 0.57 0.32 0.53 0.84 0.51 0.6
0.8 0.1 0.59 0.44 1.0 0.29 0.73 0.26 0.11 0.08 0.45 0.17 0.23 0.19 0.2 0.06 0.17 0.89 0.2 0.18
0.67 0.58 0.83 0.84 0.96 0.21 0.0 0.7 0.62 0.66 0.2 0.15 0.24 0.16 0.19 0.24 0.42 1.0 0.02 0.0
0.54 0.47 0.57 0.52 0.46 0.54 0.16 0.58 0.16 0.2 0.28 0.39 0.38 0.24 0.25 0.07 0.18 0.67 1.0 0.45
0.17 0.1 0.12 0.32 0.38 0.49 0.07 1.0 0.69 0.74 0.82 0.58 0.86 0.81 0.7 0.59 0.71 0.8 0.19 0.37
0.51 0.49 0.62 0.49 0.8 1.0 0.48 0.6 0.34 0.4 0.63 0.56 0.59 0.44 0.59 0.31 0.4 0.8 0.69 0.64
0.82 0.49 0.59 1.0 0.92 0.95 0.82 0.82 0.34 0.26 0.34 0.47 0.4 0.39 0.29 0.34 0.43 0.68 0.95 0.67
0.7 0.32 0.32 0.94 0.6 0.77 0.37 0.76 0.26 0.19 0.3 0.19 0.37 0.28 0.37 0.12 0.19 0.63 1.0 0.15
0.32 0.56 0.63 0.36 0.47 0.55 0.29 0.72 0.37 0.38 0.39 0.49 0.24 0.22 0.36 0.23 0.37 0.69 1.0 0.68
0.37 0.29 0.32 0.36 1.0 0.75 0.32 0.65 0.48 0.41 0.49 0.45 0.66 0.61 0.49 0.29 0.39 0.87 0.63 0.53
0.0 0.07 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.19 0.01 0.02 0.03 0.33 0.07 0.07 0.04 0.04 0.02 1.0 0.23 0.0
0.35 0.39 0.44 0.57 0.57 0.52 0.13 0.46 0.2 0.21 0.31 0.18 0.42 0.32 0.28 0.24 0.13 0.99 1.0 0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)