Heatmap: Cluster_223 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.23 0.09 0.0 0.0 0.06 0.18 0.0 0.39 0.5 0.58 1.0 0.68 0.4 0.07 0.7 0.0 0.0 0.09 0.4 0.73
0.34 0.83 0.21 0.3 0.24 0.15 0.25 0.87 1.0 0.94 0.77 0.8 0.54 0.52 0.74 0.79 0.87 0.49 0.22 0.97
0.05 0.07 0.02 0.06 0.07 0.06 0.06 0.58 0.68 0.67 0.67 0.4 1.0 0.68 0.6 0.4 0.29 0.29 0.24 0.42
0.37 0.19 0.08 0.62 0.2 0.01 0.01 0.44 0.7 0.54 0.03 0.17 0.54 0.26 0.03 0.58 1.0 0.23 0.09 0.94
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.04 0.04 0.03 0.04 0.25 0.12 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.03 0.06 0.08 0.03 0.2 0.1 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0
0.14 0.0 0.16 0.08 0.02 0.23 0.02 0.62 0.36 0.37 1.0 0.2 0.81 0.41 0.65 0.1 0.14 0.16 0.14 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.02 0.05 0.07 0.02 0.51 0.48 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.46 0.61 0.76 0.4 0.39 0.35 0.37 0.0 0.11 0.01 0.0 1.0
0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.31 0.3 0.42 0.47 0.33 0.35 0.25 0.34 0.03 0.15 0.05 0.0 1.0
0.4 0.41 0.3 0.33 0.22 0.36 0.24 0.77 0.57 0.52 0.77 0.33 1.0 0.54 0.84 0.23 0.17 0.25 0.61 0.45
0.49 0.35 0.33 0.26 0.36 0.32 0.12 0.57 0.61 0.64 1.0 0.39 0.47 0.4 1.0 0.51 0.49 0.55 0.29 0.38
0.06 0.06 0.1 0.05 0.02 0.15 0.03 0.36 0.33 0.35 0.14 0.52 0.7 1.0 0.09 0.03 0.4 0.19 0.0 0.82
0.08 0.08 0.06 0.04 0.22 0.26 0.57 0.38 0.51 0.5 0.31 0.42 0.28 0.31 0.26 0.49 0.98 0.03 0.07 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.43 0.46 0.47 1.0 0.25 0.65 0.53 0.9 0.21 0.25 0.02 0.53 0.35
0.07 0.36 0.18 0.06 0.1 0.14 0.06 0.35 0.33 0.26 0.71 0.56 0.4 0.26 0.71 0.4 0.33 0.04 0.0 1.0
0.08 0.01 0.02 0.08 0.05 0.17 0.14 0.4 0.13 0.17 0.71 0.24 0.55 0.37 0.78 0.1 0.09 0.15 0.31 1.0
0.31 0.37 0.36 0.36 0.29 0.16 0.11 0.41 1.0 0.93 0.75 0.8 0.7 0.46 0.53 0.91 0.81 0.36 0.21 0.55
0.21 0.32 0.17 0.15 0.31 0.82 0.16 0.71 0.25 0.3 0.58 0.43 1.0 0.75 0.55 0.19 0.3 0.24 0.61 0.64
0.08 0.01 0.02 0.01 0.04 0.15 0.06 0.75 0.47 0.56 0.81 0.41 0.44 0.26 0.48 0.02 0.16 0.06 0.08 1.0
0.01 0.0 0.01 0.02 0.05 0.02 0.02 0.21 0.19 0.15 0.64 0.28 0.24 0.34 0.4 0.15 0.06 0.21 0.26 1.0
0.22 0.02 0.07 0.03 0.05 0.09 0.17 0.52 0.23 0.32 1.0 0.34 0.73 0.62 0.81 0.19 0.15 0.09 0.03 0.87
0.07 0.05 0.12 0.11 0.11 0.09 0.14 0.63 0.7 0.81 1.0 0.45 0.73 0.72 0.98 0.97 0.77 0.33 0.16 0.49
0.57 0.31 0.33 0.15 0.35 0.59 0.49 0.63 0.6 0.59 0.73 0.23 0.87 0.61 0.76 0.3 0.34 0.27 0.26 1.0
0.17 0.18 0.28 0.18 0.13 0.3 0.15 0.56 0.64 0.49 0.9 0.58 0.06 0.09 1.0 0.47 0.48 0.27 0.24 0.27
0.1 0.45 0.13 0.16 0.05 0.05 0.0 0.08 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.05 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 1.0
0.06 0.03 0.08 0.07 0.07 0.09 0.01 0.5 0.48 0.41 1.0 0.21 0.59 0.68 0.75 0.41 0.45 0.05 0.08 0.83
0.1 0.05 0.18 0.07 0.11 0.07 0.01 0.33 0.29 0.24 0.33 0.17 0.37 0.36 0.32 0.29 0.33 0.04 0.09 1.0
0.29 0.45 0.24 0.31 0.31 0.08 0.28 0.36 0.47 0.5 1.0 0.24 0.47 0.38 0.92 0.36 0.2 0.12 0.05 0.48
0.17 0.27 0.14 0.09 0.21 0.15 0.23 0.33 0.32 0.34 0.48 0.14 0.56 0.4 0.49 0.19 0.12 0.21 0.33 1.0
0.09 0.26 0.15 0.2 0.28 0.3 0.67 0.62 0.54 0.5 0.36 0.52 0.66 0.41 0.35 0.32 0.72 0.36 0.02 1.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 1.0 0.7 0.0 0.18 0.38 0.27 0.0 0.0 0.4 0.05 0.01 0.29
0.26 0.35 0.27 0.19 0.25 0.64 0.48 0.58 0.29 0.36 0.5 0.4 0.56 0.52 0.45 0.26 0.19 0.45 0.21 1.0
0.29 0.09 0.16 0.18 0.17 0.83 0.06 0.69 0.21 0.24 0.25 0.4 0.42 0.34 0.17 0.04 0.07 0.08 0.01 1.0
0.01 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.08 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.01 1.0
0.19 0.3 0.05 0.16 0.1 0.39 0.37 0.84 0.28 0.38 0.51 0.29 1.0 0.37 0.48 0.08 0.0 0.23 0.67 0.2
0.09 0.0 0.09 0.0 0.24 0.46 0.03 0.43 0.24 0.24 0.19 0.2 1.0 0.77 0.17 0.0 0.0 0.08 0.38 0.09
0.03 0.05 0.03 0.0 0.01 0.06 0.04 0.55 0.29 0.28 1.0 0.31 0.47 0.2 0.68 0.0 0.01 0.12 0.04 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.46 0.63 0.35 0.01 0.08 0.16 0.43 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0
0.26 0.12 0.13 0.16 0.18 0.44 0.03 0.88 0.8 0.86 0.59 0.61 1.0 0.95 0.5 0.21 0.61 0.57 0.18 0.95
0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04 0.32 0.26 0.24 0.55 0.15 0.56 0.36 0.53 0.32 0.17 0.13 0.17 1.0
0.28 0.17 0.25 0.26 0.21 0.21 0.02 0.88 0.85 0.89 1.0 0.96 0.92 0.83 0.89 0.82 0.97 0.62 0.47 0.61
0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.22 0.13 0.35 0.18 0.23 0.57 0.17 0.23 0.13 0.55 0.08 0.07 0.16 0.66 1.0
0.05 0.03 0.03 0.13 0.16 0.47 0.17 0.56 0.38 0.39 0.32 0.25 1.0 0.68 0.27 0.04 0.12 0.04 0.06 0.35
0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.47 0.3 0.26 0.18 0.19 0.08 1.0 0.3 0.25 0.03 0.08 0.0 0.0 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.16 0.37 0.24 0.83 0.21 0.17 0.16 0.56 0.35 0.12 0.0 0.08 1.0
0.17 0.1 0.14 0.12 0.15 0.09 0.08 0.46 0.44 0.37 0.75 0.29 0.54 0.36 0.59 0.21 0.29 0.24 0.17 1.0
0.19 0.05 0.06 0.08 0.08 0.14 0.36 0.61 0.5 0.62 0.42 0.31 0.83 0.58 0.45 0.29 0.38 0.58 0.47 1.0
0.23 0.21 0.59 0.19 0.39 0.13 0.35 0.64 0.52 0.7 0.47 0.27 1.0 0.73 0.52 0.09 0.27 0.08 0.01 0.02
0.15 0.21 0.25 0.14 0.29 0.02 0.31 0.51 0.24 0.32 0.37 0.24 0.56 0.34 0.36 0.04 0.24 0.16 0.17 1.0
0.14 0.26 0.13 0.13 0.28 0.29 0.04 0.7 0.5 0.51 0.51 0.62 0.91 0.7 0.42 0.39 0.2 0.61 0.25 1.0
0.07 0.09 0.29 0.06 0.18 0.08 0.05 0.17 0.19 0.19 0.5 0.38 0.19 0.27 0.49 1.0 0.14 0.09 0.11 0.85
0.07 0.04 0.04 0.21 0.04 0.02 0.03 0.46 0.67 0.76 1.0 0.41 0.52 0.44 0.71 0.43 0.41 0.03 0.0 0.87
0.1 0.06 0.03 0.05 0.06 0.29 0.09 0.42 0.29 0.27 0.42 0.34 0.34 0.34 0.36 0.5 0.48 0.18 0.12 1.0
0.62 0.15 0.21 0.23 0.29 0.51 0.25 0.63 0.24 0.24 0.49 0.56 0.9 1.0 0.25 0.03 0.1 0.19 0.01 0.68
0.71 0.26 0.26 0.34 0.28 1.0 0.24 0.58 0.19 0.19 0.28 0.48 0.76 0.62 0.17 0.03 0.1 0.25 0.02 0.52
0.03 0.01 0.03 0.0 0.08 0.29 0.0 0.48 0.22 0.21 0.17 0.12 0.48 0.58 0.13 0.09 0.14 0.25 0.01 1.0
0.12 0.07 0.08 0.06 0.06 0.15 0.01 0.41 0.31 0.35 1.0 0.37 0.75 0.51 0.82 0.1 0.1 0.08 0.11 0.22
0.07 0.05 0.04 0.1 0.02 0.08 0.0 0.47 0.62 0.44 0.71 0.32 1.0 0.65 0.73 0.33 0.29 0.14 0.06 0.43
0.25 0.29 0.27 0.25 0.28 0.22 0.35 0.43 0.56 0.56 0.28 0.36 0.75 0.67 0.3 0.27 0.2 0.33 0.5 1.0
0.11 0.72 0.13 0.08 0.06 0.05 0.13 0.58 1.0 0.87 0.81 0.4 0.97 0.91 0.85 0.58 0.18 0.3 0.0 0.31
0.07 0.02 0.12 0.16 0.16 0.06 0.0 0.53 0.21 0.2 0.08 0.07 1.0 0.51 0.07 0.02 0.05 0.07 0.07 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)