Heatmap: Cluster_357 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.27 0.11 0.15 -0.46 0.09 0.67 -0.66 0.3 -0.25 -0.41 0.3 -0.91 0.34 -0.17 0.37 -0.85 -0.41 -0.04 0.61 -0.39
0.46 0.92 -0.01 0.1 0.79 -0.42 -0.46 0.01 -0.64 -0.66 0.1 -1.05 0.21 0.27 -0.16 -0.75 -1.0 0.48 0.3 -0.67
0.65 -0.71 0.58 0.44 0.03 -1.12 0.97 0.12 -0.27 -0.32 0.15 0.03 -0.76 -0.81 -0.03 -1.09 -0.25 0.08 0.72 -0.92
0.66 0.6 1.37 -0.23 0.5 -1.09 -1.13 -0.23 -0.03 -0.36 -0.63 -1.26 -0.06 -0.23 -0.75 0.31 -0.02 0.35 -0.76 -0.06
-0.19 -0.07 0.29 0.07 -0.22 -0.35 -0.58 0.3 -0.17 -0.25 0.43 0.07 0.41 0.39 0.47 -0.42 -0.15 -0.45 0.21 -0.6
-4.06 -3.15 -2.11 -2.61 -4.31 1.11 -0.82 0.58 0.66 0.1 0.89 0.79 1.07 0.89 0.61 -0.85 -0.94 -1.79 0.61 -0.79
-1.24 -0.64 -0.08 -3.9 -0.25 0.59 1.53 0.63 -0.99 -0.92 0.88 -0.25 0.42 0.42 0.93 -1.62 -0.56 -2.01 -3.91 0.61
0.56 -0.81 0.41 0.88 -0.31 -2.73 -2.11 0.21 -0.32 -0.6 1.42 -0.47 0.5 -0.36 1.51 -0.79 -1.28 -0.13 -3.92 -0.8
0.01 0.25 0.04 -0.01 0.51 0.23 -0.86 0.06 -0.22 -0.3 0.25 -0.32 0.32 0.29 0.22 -0.24 -0.3 0.16 -0.46 -0.35
-0.04 0.64 0.36 0.47 0.3 0.0 -0.59 0.21 -0.33 -0.6 0.32 -0.64 0.31 -0.08 0.43 0.4 -0.79 -0.6 -0.18 -1.2
-0.31 -1.0 -0.45 0.22 0.43 -0.52 -1.56 0.46 -0.14 -0.05 0.7 -0.3 0.33 0.16 0.69 -0.28 -0.32 0.01 0.7 -1.08
0.4 -0.9 0.18 0.94 0.23 0.01 -0.42 0.26 -0.24 -0.44 0.37 -1.34 0.19 -0.01 0.35 -0.67 -1.24 -0.1 0.29 0.1
-1.32 -3.25 -1.29 -0.13 -0.14 -0.47 1.36 0.15 0.43 0.56 0.5 -1.15 0.81 0.22 0.26 -1.63 -1.11 -0.6 0.99 -0.67
-0.02 0.64 -0.49 -1.09 -0.08 -0.23 -0.52 0.18 0.48 0.39 0.23 -1.58 0.25 -0.05 0.23 -0.49 -1.25 0.08 0.33 0.74
-0.08 1.01 -0.69 -1.41 -0.32 -0.21 -0.73 0.4 0.2 0.17 0.26 -1.44 1.11 0.69 0.25 -0.92 -1.75 -0.16 -0.35 0.2
-0.38 -0.65 -0.97 -0.59 -0.09 -1.45 -0.65 -0.08 0.27 0.29 0.74 -0.62 0.61 0.37 0.72 -0.21 -0.03 0.32 0.7 -0.75
0.01 -0.55 -0.08 -0.09 0.1 0.15 0.14 0.22 -0.36 -0.44 0.31 -0.02 0.44 0.22 0.29 -0.6 -0.3 0.03 -0.33 0.29
-0.01 0.51 -0.1 0.04 0.58 -0.14 -0.2 0.25 -0.2 -0.39 -0.17 -0.95 0.77 0.39 -0.12 -0.53 -0.94 -0.14 0.29 -0.26
-0.07 0.44 -1.56 0.24 0.03 -0.49 -0.62 0.34 0.36 0.69 0.25 -1.62 0.93 0.39 0.24 -0.02 -0.64 -0.32 -0.13 -1.49
-0.19 -0.19 -0.02 0.47 -0.27 0.04 -0.86 0.22 -0.32 -0.14 0.93 -0.67 -0.7 -0.55 1.0 0.37 0.03 -0.08 0.11 -1.29
0.36 -1.15 -0.85 0.45 0.5 0.16 -1.19 0.25 -0.04 -0.02 0.36 -0.27 -0.05 -0.09 0.29 0.23 0.06 0.22 -0.73 0.01
0.39 -0.41 -0.34 0.31 0.59 0.34 -1.31 0.16 -0.22 -0.33 -0.32 -0.43 0.27 0.11 -0.22 0.25 0.06 0.46 -0.31 -0.22
-0.69 0.93 -0.89 0.18 0.34 -0.27 -1.87 0.23 -0.21 -0.22 0.61 -0.49 0.42 0.09 0.56 -1.07 -0.61 -0.03 0.35 0.06
0.06 -0.04 -1.02 -0.22 0.3 -0.47 -1.09 0.23 -0.16 -0.38 0.55 -0.52 0.83 0.96 0.31 -0.08 -0.57 0.37 -0.79 -0.41
-0.22 0.05 -0.34 -1.41 0.33 -0.54 -1.47 0.36 -0.17 -0.29 0.67 -0.23 0.47 -0.1 0.6 0.29 -0.1 0.53 0.05 -0.44
0.43 -0.15 -0.27 -0.3 0.14 0.52 -0.83 0.07 -0.09 -0.12 -0.14 -1.06 0.96 0.65 -0.08 -0.63 -0.74 0.22 0.24 -0.61
0.43 0.4 -0.26 0.7 0.73 0.2 -0.74 0.08 -0.24 -0.38 -0.1 -0.35 0.35 0.08 -0.4 -0.37 -1.19 0.01 -0.09 -0.26
0.12 -0.37 -0.58 0.33 0.82 -0.08 -0.74 0.07 -0.08 -0.27 0.31 -0.86 1.1 0.87 0.09 -0.46 -0.8 -0.67 -0.5 -0.7
-0.32 -1.37 -1.08 0.05 0.39 -1.44 -0.53 -0.07 0.17 -0.13 1.28 -1.58 0.89 0.81 1.19 -0.82 -1.03 -1.14 0.73 -3.05
-0.1 -0.23 -0.45 0.01 0.16 0.33 -0.05 0.19 -0.35 -0.47 0.35 -0.44 0.41 0.14 0.29 -0.21 -0.26 0.25 -0.0 -0.09
-0.99 -2.27 - -0.92 0.9 - 2.44 1.24 - - 1.95 1.13 - - -0.59 1.11 - - -2.06 -
0.18 0.05 -0.2 0.5 0.2 0.67 -0.48 0.17 -0.34 -0.26 -0.02 -0.55 0.57 0.3 -0.02 -0.41 -0.79 0.01 0.31 -1.36
0.14 -0.8 -0.59 0.22 0.84 -0.99 -1.39 0.44 -0.42 -0.41 -0.2 -0.47 0.95 0.85 -0.03 -1.11 -0.45 0.6 0.19 -0.32
0.31 0.14 0.36 0.83 0.37 -0.0 -0.35 0.25 -0.38 -0.66 0.75 -0.27 -0.09 -0.36 0.72 -0.45 -0.95 -0.68 -0.26 -1.48
-0.29 0.28 -0.45 -0.28 0.25 -0.38 0.14 0.29 0.0 -0.12 0.57 -0.41 -0.21 -0.47 0.49 -0.45 -0.83 -0.03 0.57 0.29
0.48 1.05 0.64 0.54 1.18 0.28 0.81 -0.31 -1.88 -1.02 -0.6 -3.14 1.32 0.56 -0.4 -1.79 -3.49 -1.65 -2.57 -1.55
0.79 2.43 1.28 -0.03 0.86 0.69 0.54 -1.0 -2.34 -0.96 -0.52 -3.2 -1.06 -1.13 -0.7 -2.77 -2.15 -3.24 -2.5 -1.39
-0.16 0.33 0.39 -0.38 0.18 -0.1 0.92 0.05 -0.04 -0.12 0.26 -0.79 -0.46 -0.39 0.38 -1.12 -1.32 0.07 0.74 -0.46
-0.37 -2.09 -0.74 -0.48 0.7 -0.18 -0.99 0.07 0.43 0.33 0.28 -0.77 0.75 0.26 0.61 -0.94 -0.57 0.79 -0.63 0.3
1.03 0.07 -0.01 1.89 0.97 -1.45 0.78 -0.01 -0.88 -1.32 -1.87 -0.05 -0.12 -0.03 -2.01 -2.12 -2.01 0.46 -0.31 -2.46
0.15 - 0.52 - 0.55 1.55 -2.73 -0.05 -0.75 -1.38 - -1.01 1.56 0.33 -2.96 -0.37 -0.91 1.09 0.79 -0.03
0.05 -0.81 0.33 -0.5 0.03 0.09 0.99 0.25 -0.22 -0.7 -1.03 0.33 0.52 0.6 -0.55 -0.4 -0.05 0.32 0.27 -2.82
-0.04 -0.13 -0.23 0.31 0.28 0.05 -0.5 0.31 -0.17 -0.31 0.1 -0.05 0.77 0.37 0.2 -0.47 -0.42 0.03 -0.38 -0.54
0.39 0.34 0.53 0.04 0.53 -0.01 -0.11 0.17 -0.25 -0.41 -0.64 -0.22 0.32 0.03 -0.4 -0.51 -0.52 0.52 -0.14 -0.77
0.18 -0.28 -0.07 -0.32 -0.01 -0.14 0.12 0.27 -0.24 -0.23 0.36 -0.2 0.36 0.06 0.49 -0.94 -0.21 -0.31 0.6 -0.33
0.1 0.53 0.14 -0.11 0.54 0.11 -0.3 -0.07 -0.26 -0.45 -0.27 -0.54 0.29 0.2 -0.15 -0.65 -1.03 0.31 0.43 0.12
-0.29 0.08 -0.18 -0.3 0.39 0.34 0.55 0.05 -0.07 -0.13 0.42 -0.78 -0.23 -0.07 0.32 -0.02 -0.44 -0.13 0.39 -0.86
-0.21 -0.17 -0.59 -0.39 0.38 0.34 -0.32 0.32 -0.36 -0.29 0.44 -0.57 0.59 0.22 0.46 -0.76 -0.18 -0.18 0.61 -0.64
-0.03 0.44 -0.57 0.15 -0.73 -1.91 -1.18 -0.04 0.07 0.42 0.75 -1.22 -0.02 -0.25 0.93 -0.32 0.42 -0.11 0.39 -0.01
0.37 -0.36 0.16 0.36 -0.15 0.16 -0.36 0.29 -0.24 -0.61 0.51 -0.34 -0.09 -0.47 0.29 -0.07 0.13 -0.29 0.33 -0.35
0.32 0.56 0.51 0.14 0.1 -0.17 0.17 -0.04 -0.24 -0.48 -0.67 -0.36 0.46 0.48 -0.58 -0.5 -0.78 0.1 -0.18 0.08
1.44 0.91 0.62 0.81 0.92 -0.88 1.07 -0.14 -0.76 -1.2 -2.5 -0.75 -0.6 -0.49 -2.4 -1.47 -0.98 0.49 -0.14 -2.97
0.31 -1.02 -0.65 0.36 0.61 -0.24 -1.12 0.1 0.04 -0.12 0.42 -0.2 -0.06 -0.14 0.16 0.52 0.31 0.29 -1.28 0.0
0.15 -0.25 0.1 -0.65 0.06 0.24 -0.28 0.16 -0.28 -0.39 0.32 -0.38 0.16 -0.14 0.39 -0.57 -0.6 0.36 0.52 0.25
-0.28 0.03 -0.18 -0.22 0.18 -0.76 0.11 0.33 0.19 0.09 0.2 -0.37 0.25 -0.17 0.16 0.23 0.31 0.32 -0.63 -0.48
-0.68 -0.69 -0.56 -0.6 -0.67 0.25 -0.17 0.35 -0.0 -0.01 0.36 -0.01 0.51 0.36 0.41 -0.44 -0.26 -0.24 0.58 0.29
-0.4 0.52 0.2 0.06 -0.01 -0.02 0.4 0.28 -0.4 -0.07 0.15 -0.31 0.07 -0.38 0.43 -0.27 -0.61 -0.54 0.42 -0.31
-0.48 -0.17 -0.63 -0.4 -0.09 0.12 0.0 0.24 -0.07 -0.13 0.41 -0.36 0.83 0.59 0.39 -1.09 -0.96 -0.13 0.43 -0.07
-0.02 0.49 -0.07 -1.07 0.59 -0.59 -1.12 0.41 0.17 0.63 -0.57 -0.14 1.22 1.0 -0.79 -0.86 -1.11 0.49 -1.43 -1.94
-0.13 -0.84 0.17 -0.15 0.16 -0.49 -0.5 0.49 0.49 0.41 0.35 -0.34 0.01 0.18 0.25 -0.67 -0.75 0.39 0.26 -0.47
0.02 -0.26 -0.14 -0.03 0.44 0.02 -0.47 0.18 -0.08 -0.06 -0.57 -0.86 0.97 0.67 -0.55 -0.89 -1.13 0.65 0.22 -0.1
-0.25 0.81 0.06 -1.07 0.21 -0.31 -1.8 0.63 -0.61 -0.49 0.5 -0.61 -0.08 -0.42 0.61 -0.01 -0.62 0.65 0.5 -0.31
-0.2 0.36 -0.77 -0.72 -0.0 -0.67 -0.2 0.22 0.07 0.06 0.33 -0.48 0.55 0.08 0.63 -0.31 -0.51 0.39 0.17 -0.13
-0.22 0.31 0.01 0.04 -0.07 -0.34 0.85 0.38 -0.24 -0.45 0.19 -0.25 -0.54 -0.45 0.28 0.26 -0.13 -0.36 0.05 -0.17
0.49 0.29 -0.17 0.24 0.5 -0.3 -0.8 0.19 -0.02 -0.08 -0.52 -0.34 0.75 0.64 -0.28 -0.83 -0.38 0.07 -0.29 -0.54
0.18 -0.39 -0.24 -0.23 0.35 -0.35 -1.05 0.33 0.01 0.08 0.23 -0.72 0.93 0.47 0.23 -0.73 -0.98 0.31 -0.11 0.04
0.02 -0.4 -0.15 0.03 0.3 -0.68 -1.1 0.17 0.24 0.3 0.31 -0.75 0.99 0.71 0.22 -0.76 -0.87 0.18 -1.08 0.12
0.6 1.27 1.17 -0.49 0.26 -0.75 0.12 -0.16 -0.24 -0.56 -0.42 -0.51 0.08 -0.16 -0.13 -1.11 -0.94 0.18 -0.28 -0.87
0.52 -0.19 0.28 -0.85 0.05 -1.32 -0.65 -0.02 -0.27 -0.29 -0.15 -0.86 0.5 0.39 0.1 -0.2 0.11 0.52 0.5 0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.