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Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.6 -0.05 -0.22 0.17 0.63 0.33 0.44 0.46 0.26 0.17 0.08 -0.06 0.63 -0.49 -0.21 0.15 -0.1 -0.02 -0.13 -0.15 -4.31 -1.19 0.13 -0.64 -0.6 -0.31
0.92 0.1 0.09 0.18 0.1 -0.05 0.37 0.6 0.11 0.01 0.03 0.07 1.04 -0.98 -0.89 0.77 -0.7 -0.07 -0.22 -0.3 -2.9 -0.2 -1.04 -1.03 -0.06 -0.23
1.12 0.52 -0.23 -0.48 0.09 0.46 0.76 0.72 0.32 0.22 -0.21 -0.63 0.83 -0.94 -0.07 -0.97 0.16 0.63 0.54 0.4 -4.49 -1.56 -2.0 -1.29 -0.88 -1.61
1.04 0.16 -0.6 -0.66 -0.36 0.16 0.45 0.55 0.37 0.32 0.06 -0.15 0.83 -0.94 -0.48 -0.82 -0.58 0.41 0.34 0.06 -2.31 -0.5 0.16 0.05 -0.34 -0.75
0.85 0.13 0.26 0.43 0.46 0.5 0.56 0.55 -0.09 -0.45 -0.35 -0.1 1.25 -0.62 -0.64 -0.38 -0.55 -0.17 -0.57 -0.42 -2.76 0.47 -1.51 -0.91 -0.07 -0.63
1.17 0.7 0.49 0.37 -0.14 -0.38 0.61 0.17 0.64 0.74 0.49 0.45 1.0 -0.14 -1.51 0.87 -1.59 -1.74 -1.01 -1.17 -3.91 -0.78 -2.27 -2.14 -0.11 -1.18
1.07 0.4 -0.38 -0.57 -0.05 0.14 0.82 0.6 0.12 0.12 -0.23 -0.62 0.56 -1.03 -0.19 -0.71 0.28 0.65 0.45 0.38 -4.22 -0.57 -1.25 -0.53 -0.4 -0.74
0.71 0.23 -0.05 0.0 0.18 0.45 0.38 0.48 0.2 0.17 0.33 0.67 0.69 -0.76 -0.52 -0.64 -0.38 -0.11 0.02 0.13 -5.3 -1.17 -0.15 -0.47 -0.47 -0.43
0.99 0.15 0.08 0.29 0.4 0.31 0.64 0.66 0.22 0.22 0.11 -0.11 0.88 -0.68 -0.47 -0.46 -0.32 -0.03 0.06 -0.22 -3.61 -0.72 -1.58 -1.07 -0.14 -0.78
0.06 -0.22 -0.27 0.17 0.46 0.52 0.59 0.41 0.49 0.19 -0.08 -0.15 0.38 -0.35 -0.02 0.3 -0.76 0.19 -0.22 -0.35 -3.02 -1.07 0.34 0.11 -0.08 -0.86
0.88 0.41 0.16 0.08 0.13 0.2 0.45 0.54 -0.19 -0.06 -0.07 -0.17 0.73 -0.51 -0.23 -0.28 0.18 0.57 0.32 0.25 -2.56 -1.69 -1.21 -0.76 -0.43 -0.79
1.09 0.48 0.03 -0.16 -0.13 -0.12 0.35 0.49 0.08 0.41 0.69 0.91 1.05 -3.24 -1.57 -2.53 -0.13 0.44 -0.1 0.49 -4.34 -1.58 -0.76 -0.07 -1.03 -1.16
0.69 0.2 0.12 0.04 -0.09 -0.07 0.28 0.4 0.24 0.2 0.16 0.17 0.76 -0.23 0.22 0.04 -0.11 0.24 -0.03 -0.11 -2.85 -0.38 -0.98 -0.64 -0.53 -0.64
1.16 0.39 -0.05 -0.12 0.19 0.1 0.24 0.37 0.31 0.56 0.43 0.4 1.05 -0.88 -1.0 0.29 -0.76 -0.37 -0.71 -0.69 -6.08 -0.66 -1.04 -0.88 0.02 -0.16
-0.0 0.02 0.1 0.42 0.4 0.45 0.41 0.54 0.19 -0.36 -0.43 -0.49 -0.07 -0.15 0.29 -0.17 -0.49 0.33 -0.09 -0.61 -1.19 -0.28 0.37 -0.23 -0.29 -0.05
0.5 0.0 0.07 0.52 0.38 0.16 0.28 0.32 0.46 0.23 0.6 0.3 0.19 -0.38 -0.34 -0.52 -0.62 -0.23 -0.27 -0.46 -2.58 -1.43 0.2 0.32 -0.18 -0.62
0.97 0.4 0.64 1.0 0.74 0.17 0.03 -0.49 -0.21 0.05 0.49 0.43 1.1 0.16 -2.48 -0.42 -1.33 -0.87 -1.39 -2.15 -2.96 -0.87 0.49 -0.78 0.07 -0.84
0.28 0.25 0.02 -0.02 0.06 0.51 0.86 0.61 0.6 0.3 0.13 -0.04 0.47 -0.67 -0.79 -0.41 -0.53 0.05 -0.18 -0.09 -3.84 -0.9 -0.06 -0.23 -0.53 -0.06
1.34 0.35 -0.18 -0.04 0.21 0.06 0.37 0.41 0.27 0.26 0.47 0.45 1.31 -1.23 -1.0 -0.81 -0.92 -0.47 -0.35 -0.61 -5.7 -0.41 -1.31 -0.88 0.22 -0.26
1.24 -0.02 -0.43 0.06 0.27 0.38 0.71 0.92 0.48 0.23 0.01 -0.29 1.29 -1.26 -1.41 -1.09 -1.09 -0.25 -0.28 -1.08 -4.3 0.01 -1.32 -0.87 0.58 -0.7
0.89 0.52 0.31 0.75 0.57 -0.07 0.27 0.38 0.25 0.32 0.48 0.54 1.04 -1.11 -1.23 -1.05 -0.9 -0.43 -0.6 -0.8 -3.0 -0.44 -0.52 -0.5 -0.83 -0.31
0.49 -0.08 0.29 0.81 0.53 0.01 -0.22 -0.05 -0.33 0.04 0.47 0.7 0.91 -0.34 -1.22 0.02 -0.9 -1.32 -1.55 -1.3 -2.35 -1.05 0.13 0.83 0.24 0.05
0.74 0.28 0.04 0.05 0.13 0.3 0.57 0.45 0.3 0.01 -0.07 -0.16 0.83 -0.02 0.26 -0.01 -0.73 0.24 -0.12 -0.27 -4.77 0.34 -1.5 -1.6 -0.42 -0.81
0.91 -0.46 -0.07 0.65 0.9 0.83 0.82 0.79 0.82 0.41 0.16 -0.41 1.12 -0.51 -1.05 0.56 -1.29 -0.53 -0.07 -1.0 -2.36 -3.7 -4.24 -3.22 -1.02 -1.16
1.15 0.38 0.15 0.3 0.07 -0.41 0.09 0.33 0.22 0.35 0.78 0.94 1.1 -1.21 -1.55 -1.27 -1.15 -0.51 -0.51 -0.74 -4.24 -1.25 -0.63 -0.34 0.37 -0.06
0.99 0.57 0.37 0.53 0.42 0.19 0.24 0.44 0.22 0.03 0.14 0.06 1.13 -0.89 -0.97 -0.78 -0.98 -0.34 -0.61 -0.61 -2.69 -0.1 -1.05 -0.9 0.18 -0.4
0.75 -0.81 -0.28 0.72 1.14 1.0 1.1 0.79 -0.05 -0.63 -0.46 0.19 1.12 -1.21 -1.28 -0.75 -1.17 -0.69 -0.8 -1.01 -0.57 -0.75 -0.88 -1.43 -0.06 -0.24
1.48 0.83 0.6 1.08 0.74 -0.17 -0.09 0.1 -0.8 -0.76 -0.02 0.3 1.45 -0.51 -2.26 -1.2 -1.25 -2.01 -2.32 -1.81 -1.85 0.24 -0.76 -1.11 0.38 -0.3
1.05 0.36 -0.48 -0.61 -0.16 0.13 0.52 0.44 0.08 0.17 0.22 0.21 0.62 -1.16 -0.92 -0.55 0.08 0.19 -0.07 -0.16 -2.08 -0.49 -0.01 0.3 -0.05 -0.73
0.97 0.12 -0.48 -0.57 -0.21 0.0 0.51 0.56 0.12 0.3 0.37 0.4 0.73 -1.19 -1.04 -0.46 0.12 0.36 -0.42 -0.06 -2.04 -0.8 0.09 0.2 -0.08 -1.01
0.98 0.26 0.31 0.48 0.33 -0.19 0.26 0.53 -0.1 -0.09 -0.19 -0.33 0.85 -0.29 -0.27 -0.26 -0.24 -0.02 0.01 -0.23 -4.1 0.16 -1.33 -1.14 0.11 -0.32
0.79 -0.24 -0.32 0.24 0.45 0.64 0.86 0.95 0.83 0.11 0.1 0.07 0.86 -1.66 -1.43 -1.01 -0.66 -0.3 -0.43 -0.88 -4.14 -0.52 0.28 -0.54 -0.25 -0.83
-0.11 0.2 0.41 0.57 0.5 0.42 0.35 0.12 0.46 0.22 0.04 0.24 -0.14 -1.05 0.03 -0.67 -0.28 0.31 0.07 -0.46 -5.03 -1.28 0.13 0.12 -0.04 -0.4
0.82 0.28 0.12 0.01 0.11 0.1 0.66 0.73 0.25 0.24 0.02 -0.09 0.74 -0.74 -0.2 -0.68 -0.04 0.49 0.22 0.24 -6.02 -1.5 -1.26 -1.41 -0.14 -0.62
0.85 0.09 0.02 0.24 0.39 0.37 0.55 0.52 0.11 -0.14 -0.35 -0.47 0.89 0.06 -0.23 0.1 -0.69 0.29 0.15 -0.23 -2.46 -0.74 -0.51 -1.19 -0.27 -0.76
1.36 -0.74 -1.53 -1.0 -0.66 -0.23 0.45 0.33 0.95 0.77 0.92 0.64 0.9 -2.13 -1.28 1.31 -0.46 -0.14 -0.41 -0.47 -4.44 -4.04 -2.51 -2.56 0.57 -0.4
0.49 -0.14 -0.07 -0.03 0.19 0.41 0.42 0.38 0.43 0.48 0.58 0.76 1.05 -0.36 -0.7 -0.27 -0.27 0.13 -0.1 0.05 -4.31 -1.72 -1.17 -0.94 -0.59 -0.85
0.54 0.27 0.16 0.25 0.01 -0.66 0.26 0.31 -0.03 0.21 0.28 0.12 0.59 -0.18 -0.06 -0.06 -0.08 0.39 0.22 0.23 -1.53 -1.5 -0.46 -0.67 -0.31 -0.4
0.76 0.42 -0.08 0.33 0.32 0.2 0.69 0.67 0.47 0.18 0.18 0.18 0.97 -0.83 -0.61 -1.12 -0.86 0.05 -0.37 -0.52 -5.07 0.02 -0.89 -0.39 -0.43 -0.74
0.78 0.45 0.4 0.31 0.24 0.19 0.26 0.48 0.06 0.06 0.08 -0.0 0.89 -0.45 -0.39 -0.38 -0.45 0.2 -0.05 -0.25 -4.17 0.31 -2.1 -1.21 -0.35 -0.4
0.7 0.06 -0.13 0.1 0.19 0.35 0.43 0.46 0.0 -0.09 -0.24 -0.19 0.75 -0.34 -0.2 0.5 -0.28 0.4 -0.23 -0.49 -1.82 0.06 -0.68 -0.73 -0.39 -0.37
0.93 0.25 -0.09 0.39 0.42 -0.01 0.25 0.37 0.01 -0.03 0.07 -0.01 0.76 -0.31 -0.04 0.09 -0.48 0.15 0.16 -0.63 -3.86 -0.88 -0.73 -0.72 0.21 -0.49
1.51 0.0 -1.06 -0.45 0.08 0.61 0.91 0.85 0.48 0.03 -0.16 -0.47 0.98 -0.96 -1.01 -1.59 -0.7 0.46 -0.14 -0.34 -6.11 0.05 -0.53 -0.83 -0.17 -1.18
1.14 0.43 0.06 0.42 0.73 0.62 0.81 0.87 0.04 -0.15 -0.37 -0.72 1.18 -0.93 -0.86 -0.81 -0.81 0.11 -0.54 -0.62 -5.27 0.11 -1.97 -2.24 -0.05 -0.91
0.95 0.53 0.23 0.48 0.52 0.35 0.64 0.61 0.19 -0.05 -0.1 -0.23 0.86 -0.76 -0.39 -0.5 -0.71 -0.23 -0.32 -0.8 -4.64 -0.15 -0.27 -1.18 -0.27 -0.69
0.41 0.05 0.17 0.22 0.39 0.53 0.45 0.46 0.34 0.21 0.17 0.05 0.6 -0.47 -0.42 -0.51 -0.24 -0.04 -0.14 -0.15 -5.31 -1.02 0.22 -0.33 -0.33 -0.55
2.4 0.81 0.32 0.74 0.37 -0.08 0.85 0.7 -0.22 0.39 0.9 0.69 1.94 - -2.79 -3.72 -4.42 -4.01 -4.73 -4.98 -4.59 -2.39 - -3.76 -3.72 -2.82
1.61 0.59 0.03 0.65 0.52 1.26 0.71 0.91 0.33 0.38 0.73 -0.19 1.48 -3.87 -3.77 -1.48 -2.96 -0.9 -2.94 -2.23 -3.67 -2.38 -2.42 -2.08 0.32 -2.33
0.53 -0.13 -0.01 0.32 0.54 0.69 1.04 0.87 0.53 -0.25 -0.38 -0.34 0.57 -0.53 -0.66 0.05 -0.57 -0.37 -0.23 -0.52 -1.26 -0.63 -0.23 -0.94 -0.44 -0.76
1.05 0.37 0.18 0.47 0.29 -0.02 0.42 0.54 0.34 0.33 0.36 0.23 1.1 -0.77 -1.04 -0.35 -0.81 -0.39 -1.01 -0.87 -3.31 -0.51 -0.62 -0.89 0.03 -0.42
-0.08 -0.07 0.13 0.36 0.54 0.71 0.3 0.2 0.33 0.41 0.17 0.08 -0.11 -0.61 -0.2 -0.12 -0.63 0.18 -0.57 -0.53 -3.88 -1.45 0.08 0.7 0.16 -0.44
0.37 0.21 0.2 0.48 0.17 -0.14 0.43 0.61 -0.09 -0.11 -0.02 0.08 0.77 -0.1 -0.41 0.34 -0.74 0.18 -0.12 -0.41 -2.09 -0.52 -0.15 -0.78 -0.15 -0.29
1.82 0.1 -0.12 0.68 0.14 0.04 0.2 0.74 -0.02 0.06 0.61 0.7 2.01 0.82 -3.95 -2.26 -5.2 -2.41 -2.51 -3.33 -5.36 -1.82 -0.1 -1.62 -1.49 -1.92
0.28 0.2 -0.03 0.32 0.35 0.37 0.3 0.28 0.59 0.42 0.46 0.54 0.44 -0.52 -0.42 -0.68 -0.44 -0.34 -0.12 -0.23 -5.62 -0.82 0.26 -0.35 -0.66 -0.33
1.8 -0.28 -1.15 -0.43 0.23 0.39 0.97 1.17 0.62 0.49 0.17 -0.26 1.6 -1.31 -1.95 -2.08 -1.8 -0.66 -1.27 -2.65 -5.09 0.05 -1.55 -1.42 0.18 -0.79
0.81 0.36 -0.0 -0.14 -0.21 -0.07 0.59 0.73 0.21 0.17 0.02 -0.22 0.54 -0.17 -0.46 0.03 0.08 0.49 -0.09 -0.21 -3.15 -0.82 -0.42 -0.4 -0.29 -0.84

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.