Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00269490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.441)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.11 0.11 0.06 0.36 0.02 0.33 0.34 0.24 0.07 0.02 0.0 0.03 0.42 0.06 0.42
AMTR_s00001p00272740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.558)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.54 0.11 0.06 0.0 0.0 0.03 0.05 0.11 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11
AMTR_s00002p00186590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.163)
0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.16 0.06 0.41 0.28 0.37 0.51 0.04 0.05 0.33 0.12 0.39 0.21 0.13 0.05 0.33 0.07
AMTR_s00002p00266390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.508)
0.0 0.0 0.72 0.06 1.0 0.0 0.18 0.0 0.15 0.14 0.56 0.32 0.52 0.32 0.31 0.32 0.81 0.35 0.37 0.24 0.17 0.41
AMTR_s00006p00143870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.56)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.06 0.45 0.0 0.11 0.07 0.22 0.22 0.56 0.0 0.12 0.11 0.75 0.04
AMTR_s00007p00049440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.25)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.01 0.2 0.21 0.12 0.17 0.34 1.0 0.24 0.19 0.2 0.09 0.27 0.1 0.1 0.11 0.11 0.13
AMTR_s00007p00049660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.26)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.26 0.0 0.15 0.06 0.13 0.16 0.4 1.0 0.15 0.16 0.17 0.15 0.35 0.08 0.06 0.11 0.16 0.12
AMTR_s00007p00155890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.115)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.89 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.87 0.66 0.42 0.28 0.23 0.07 1.0 0.0 0.41 0.32 0.59 0.12
AMTR_s00008p00055030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.17)
0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.02 0.14 0.12 0.01 0.53 0.63 0.09 0.04 0.04 0.14 0.11 0.18 0.26 0.05 0.16 0.09
AMTR_s00009p00082170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.29)
0.51 0.37 0.66 0.12 1.0 0.54 0.6 0.45 0.7 0.65 0.81 0.67 0.69 0.69 0.58 0.21 0.49 0.43 0.39 0.3 0.2 0.29
AMTR_s00009p00263240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.357)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.15 0.11 0.46 0.46 0.2 0.09 0.48 0.08 0.68 0.02 0.09 0.06 0.04 0.08
AMTR_s00011p00082710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.18)
0.41 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.03 0.0 0.11 0.03 0.48 1.0 0.13 0.07 0.26 0.11 0.31 0.15 0.0 0.02 0.13 0.02
AMTR_s00013p00166440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.90)
0.0 0.29 0.19 0.19 0.95 0.0 0.11 0.21 0.12 0.18 0.91 0.41 0.5 0.65 0.35 0.64 1.0 0.37 0.31 0.28 0.23 0.61
AMTR_s00014p00228980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00014.88)
0.0 0.0 0.32 0.05 1.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.09 0.37 0.05 0.23 0.17 0.25 0.14 0.4 0.14 0.34 0.24 0.04 0.1
AMTR_s00020p00091620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.33)
0.28 0.06 0.58 0.14 0.93 0.01 0.04 0.11 0.04 0.02 1.0 0.72 0.32 0.31 0.85 0.79 0.82 0.11 0.35 0.26 0.15 0.15
AMTR_s00021p00203530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.170)
0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.15 0.11 0.45 0.3 0.92 0.41 0.4 0.2 0.67 0.28 0.09 0.71 0.96 0.24 0.64 0.28
AMTR_s00022p00184470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.197)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.74 1.0 0.23 0.17 0.36 0.29 0.24 0.25 0.25 0.26 0.45 0.28
AMTR_s00024p00057560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.22)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.75 0.25 0.51 0.25 0.19 0.0 0.09 0.45 0.57 0.3 1.0 0.2
AMTR_s00024p00243360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.296)
0.0 0.0 0.33 0.0 0.54 0.0 0.23 0.0 0.23 0.2 0.79 0.56 1.0 0.39 0.44 0.07 0.91 0.25 0.19 0.09 0.12 0.33
AMTR_s00025p00116370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.106)
0.04 0.08 0.0 0.01 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.42 0.65 0.42 0.56 0.61 0.02 0.6 0.23 0.13 0.1 0.4 0.43
AMTR_s00025p00190370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.234)
0.0 0.0 0.15 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.07 0.03 0.06 0.01 0.07 0.04 0.02 0.06 0.01 0.29
AMTR_s00025p00207310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.268)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.46 0.55 0.39 0.55 0.14 0.21 0.48 0.61 0.28 0.26 0.38 0.4 0.19
AMTR_s00027p00189910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.61)
0.2 0.21 0.0 0.02 1.0 0.0 0.1 0.0 0.2 0.12 0.5 0.52 0.34 0.15 0.54 0.63 0.42 0.61 0.47 0.13 0.45 0.2
AMTR_s00028p00229280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.111)
0.0 0.0 0.0 0.46 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.11 0.07 0.03 0.0 0.53 0.0 0.0 0.06 0.0 0.22
AMTR_s00029p00219690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.333)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.12 0.54 0.18 0.49 0.56 0.82 0.12 0.37 0.16 0.23 0.31 0.28 0.35
AMTR_s00032p00230670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.253)
0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.42 0.86 0.06 0.18 0.48 0.15 0.18 0.59 0.27 0.07 0.35 0.22
AMTR_s00037p00038160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.12)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.04 0.07 0.15 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.12
AMTR_s00039p00211100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.181)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 1.0 0.0 0.1 0.12 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.68 0.17
AMTR_s00044p00190800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.208)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.38 0.42 0.07 0.16 0.0 0.0 0.33 0.17 0.5 0.3 0.13
AMTR_s00049p00210820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.237)
0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.02 0.69 0.17 0.25 0.63 0.37 0.55 0.08 0.94 0.13 0.17 0.0 0.0 0.09 0.72 0.17
AMTR_s00054p00176730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00054.64)
0.0 0.07 0.08 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.04 0.02 0.65 0.78 0.27 0.05 0.1 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
AMTR_s00055p00049520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.16)
0.0 0.71 0.86 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.71 0.43 0.39 0.24 0.4 0.12 0.43 0.83 0.59 0.15 0.13 0.34
AMTR_s00056p00067330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.43)
0.18 1.0 0.66 0.26 0.55 0.07 0.28 0.27 0.2 0.17 0.61 0.53 0.59 0.59 0.3 0.32 0.49 0.55 0.44 0.28 0.35 0.42
AMTR_s00056p00191540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.179)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.03 0.0 0.02 0.06 0.72 0.64 0.29 0.42 0.26 0.0 0.0 0.0 0.25 0.16 1.0 0.05
AMTR_s00057p00126780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.106)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.24 0.03 0.39 0.44 0.36 0.0 0.23 0.11 0.17 0.0 0.63 0.19 0.27 0.04 1.0 0.16
AMTR_s00058p00040770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.11)
0.42 0.9 0.61 0.43 0.97 0.0 0.05 0.32 0.05 0.04 0.84 0.53 0.24 0.15 0.13 0.38 1.0 0.16 0.41 0.29 0.24 0.23
AMTR_s00061p00036000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.13)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.08 0.0 0.12 0.04 0.57 0.64 0.16 0.13 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 1.0 0.11
AMTR_s00062p00072320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.44)
0.0 0.0 0.0 0.12 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.0 0.04 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
AMTR_s00062p00096480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.70)
0.0 0.37 0.66 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.3 0.24 0.5 0.29 0.49 0.25 0.35 0.21 0.58 0.12 0.19 0.46
AMTR_s00066p00116650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.109)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.19 0.0 0.12 0.16 0.81 0.0 0.5 0.28 0.25 0.0 1.0 0.24 0.05 0.18 0.0 0.48
AMTR_s00066p00200650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.269)
0.6 0.0 0.44 0.1 1.0 0.01 0.21 0.23 0.26 0.22 0.91 0.72 0.38 0.63 0.42 0.1 0.45 0.07 0.11 0.05 0.07 0.07
AMTR_s00068p00180360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.136)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.38 0.0 0.02 0.01 0.04 0.03 0.23 1.0 0.05 0.01 0.03 0.05 0.26 0.07 0.0 0.01 0.18 0.01
AMTR_s00068p00180820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.137)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.03 0.0 0.08 0.1 0.44 1.0 0.07 0.02 0.11 0.19 0.27 0.13 0.03 0.05 0.11 0.05
AMTR_s00070p00009400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00070.2)
0.08 0.0 0.0 0.21 1.0 0.29 0.06 0.0 0.24 0.12 0.92 0.83 0.36 0.19 0.35 0.15 0.71 0.28 0.21 0.23 0.31 0.55
AMTR_s00070p00034470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00070.12)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.0 0.1 0.07 0.38 0.43 0.29 0.42 0.55 0.0 0.22 0.38 0.55 0.24 0.68 0.1
AMTR_s00071p00195460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.205)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.57 0.49 0.05 0.13 0.5 0.0 0.0 0.42 0.0 0.03 0.76 0.7
AMTR_s00092p00055650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.25)
0.0 0.0 0.6 0.0 0.61 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.48 0.38 0.48 0.69 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.21
AMTR_s00096p00115410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.72)
0.0 0.0 0.09 0.03 0.95 0.0 0.11 0.01 0.12 0.09 0.84 0.37 0.41 0.25 0.38 0.02 1.0 0.09 0.15 0.05 0.03 0.28
AMTR_s00109p00069190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.54)
0.37 0.88 1.0 0.13 0.84 0.09 0.05 0.33 0.12 0.08 0.75 0.59 0.49 0.37 0.27 0.38 0.36 0.65 0.5 0.17 0.43 0.23
AMTR_s00109p00141140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.151)
0.36 0.59 0.78 0.24 1.0 0.02 0.01 0.13 0.08 0.07 0.81 0.61 0.38 0.4 0.46 0.27 0.83 0.36 0.48 0.44 0.46 0.38
AMTR_s00110p00131050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.103)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.02 0.76 0.21 0.67 0.36 0.51 0.42 0.88 0.0 0.25 0.64 0.33 0.22
AMTR_s00117p00088610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.30)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.01 0.0 0.05 0.04 0.28 1.0 0.05 0.02 0.28 0.08 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03
AMTR_s00118p00071600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00118.12)
0.0 0.53 0.0 0.02 1.0 0.0 0.07 0.01 0.07 0.09 0.65 0.54 0.3 0.37 0.31 0.25 0.18 0.47 0.58 0.13 0.3 0.09
AMTR_s00121p00069000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00121.12)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.15 1.0 0.12 0.17 0.41 0.0 0.18 0.0 0.11 0.18 0.2 0.26
AMTR_s00124p00094090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00124.17)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.93 0.0 0.75 0.0 0.86 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00125p00123750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00125.33)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.06 0.0 0.06 0.06 0.28 1.0 0.03 0.04 0.03 0.0 0.08 0.0 0.18 0.01 0.0 0.13
AMTR_s00127p00099910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.23)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.29 1.0 0.34 0.12 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
AMTR_s00133p00111400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.55)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.23 0.8 0.48 0.02 0.16 0.0 0.18 0.0 0.0 0.04 0.0 0.35
AMTR_s00137p00056870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00137.22)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.34 0.4 0.0 0.0 0.51 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.44 1.0 0.0
AMTR_s00140p00045380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.17)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.01 0.47 0.28 0.26 0.43 0.15 0.04 0.11 0.07 0.8 0.19 0.26 0.06 0.13 0.14
AMTR_s00148p00103230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00148.73)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.11 0.0 0.12 1.0 0.12 0.43 0.22 0.0 0.77 0.06
AMTR_s00164p00043960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.16)
0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.53 0.0 0.14 0.09 0.37 0.44 0.0 0.0 0.0 0.07 0.51 0.13
AMTR_s00173p00058300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00173.14)
0.15 0.59 0.81 0.0 0.96 0.01 0.05 0.24 0.07 0.09 1.0 0.96 0.55 0.48 0.44 0.21 0.38 0.34 0.44 0.15 0.06 0.38
AMTR_s00175p00056760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00175.28)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.63 0.0 0.09 0.11 0.11 0.22 0.23 0.28 0.37 0.05 1.0 0.02
AMTR_s00181p00060490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00181.36)
0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.29 0.76 0.93 0.69 0.12 0.51 0.2 0.17 0.11 0.12 0.35
AMTR_s00190p00021850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00190.6)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.07 0.12 0.82 0.44 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.27
AMTR_s00213p00017610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00213.4)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.17 0.06 0.16 0.45 0.11 0.71 0.0 0.04 0.19 0.0 0.17
AMTR_s00215p00029540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00215.7)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
AMTR_s00638p00003060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00638.1)
0.0 0.0 0.17 0.14 1.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.46 0.11 0.2 0.06 0.06 0.22 0.74 0.28 0.22 0.13 0.09 0.11
AMTR_s02269p00004750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold02269.1)
0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.04 0.28 0.07 0.06 0.17 0.23 0.14 0.21 0.19 0.0 0.54 0.0 0.04 0.26 0.0 0.11
AMTR_s04525p00001750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04525.1)
0.64 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.14 0.24 0.31 0.0 0.25 0.0 0.04 0.0 0.57 0.0 0.65 0.25 1.0 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)