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Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.13 -0.3 -0.64 -0.33 -0.35 -0.75 -0.33 -0.16 -0.58 -0.39 0.06 0.48 1.17 -0.4 -0.37 -0.51 -0.86 -0.35 -0.64 -0.98 0.37 0.86 -0.07 0.36 0.32 0.1
0.36 -0.42 -0.62 -0.44 -0.47 -0.57 -0.05 -0.0 0.07 0.3 0.51 0.9 0.91 0.21 -0.76 -0.05 -0.68 -0.42 -0.83 -0.9 0.41 0.16 0.1 0.07 0.01 0.01
0.88 0.71 0.32 0.31 0.08 -0.58 -0.34 -0.38 -0.46 -0.4 -0.21 0.08 0.95 0.44 -0.96 0.28 -0.13 -0.27 -0.92 -0.49 -0.59 -0.15 -0.7 -0.2 0.45 -0.09
0.74 1.25 1.35 1.3 0.54 -1.62 -2.2 -1.74 -2.35 -1.36 -0.37 0.37 0.91 -1.07 -1.31 -0.97 -0.02 -0.32 -0.67 -0.11 -2.57 1.61 -3.28 -0.72 -0.29 -0.67
2.21 -0.89 -1.86 -3.42 -5.22 -5.25 -3.7 -2.99 -4.19 -1.78 -0.32 1.36 2.53 -0.87 -1.84 -0.19 -2.53 -1.39 -1.78 -2.21 2.19 -1.7 -1.58 -0.62 -0.05 0.18
1.58 -0.18 -0.29 -0.02 -0.28 -0.63 -0.48 -0.3 -1.12 -0.67 -0.16 0.6 1.63 -1.35 -1.58 -1.61 -1.53 -1.48 -1.61 -0.8 0.82 0.73 -0.37 -0.2 0.6 0.56
0.38 -0.4 -0.47 -0.77 -1.08 -1.1 -0.38 -0.23 -0.46 0.03 0.12 0.48 0.62 0.23 0.3 0.16 -0.06 0.36 0.09 0.2 -0.73 0.51 -0.17 -0.06 -0.06 0.58
0.59 -0.15 -0.22 -0.16 -0.48 -0.45 -0.59 -0.13 -0.62 -0.51 0.11 0.8 0.94 -0.8 -1.05 -0.3 -0.85 -0.46 -1.02 -0.82 0.62 -0.42 0.68 0.55 1.0 0.23
1.09 0.33 -0.21 -0.59 -0.75 -1.26 -0.79 -1.16 -1.2 -1.0 -0.97 -0.46 1.32 -0.26 -0.6 -0.25 -0.04 -0.06 -0.5 -0.67 0.28 1.15 -0.93 0.72 0.57 0.75
0.71 0.33 -0.07 -0.55 -1.23 -1.33 -0.75 -0.55 -0.76 -0.49 -0.34 0.02 0.71 0.1 0.1 0.02 -0.02 0.16 -0.32 0.06 0.96 0.82 -0.73 -0.11 0.02 0.35
2.28 1.24 0.79 0.55 -0.82 -2.27 -1.75 -1.13 -3.93 -2.73 -1.35 0.32 2.39 -4.2 -4.71 -4.53 -4.03 -2.84 -3.27 -1.56 1.44 0.73 -3.24 -1.39 -0.88 -0.41
0.85 -0.52 -0.98 -0.82 -1.52 -2.07 -1.33 -0.98 -1.14 -0.57 0.27 0.68 1.0 -2.03 -1.16 -2.22 -1.17 -0.43 -1.77 -0.88 0.95 1.83 0.53 0.81 0.82 0.69
1.45 -0.38 -0.51 -0.67 -1.21 -1.89 -1.16 -0.84 -2.14 -1.02 -0.21 0.83 1.99 0.2 -0.47 -0.02 -0.69 -0.84 -1.51 -1.25 -0.1 1.78 -1.33 -0.72 0.15 -0.29
1.54 -0.33 -0.85 -0.72 -1.09 -1.55 -0.98 -0.77 -1.87 -1.19 -0.04 0.75 2.09 -0.05 -0.7 -0.2 -0.79 -1.15 -1.23 -1.2 0.01 1.67 -1.63 -0.63 0.21 -0.06
0.81 0.14 0.35 0.33 -0.67 -1.78 -0.71 -0.02 -0.17 -0.09 0.15 0.35 0.03 -1.89 -1.99 -1.88 -1.73 -0.23 -0.91 -1.14 1.37 -0.64 -0.7 0.65 1.14 1.21
1.67 0.56 -0.07 -0.51 -1.46 -1.91 -1.63 -1.42 -1.85 -1.31 0.08 1.04 2.06 -0.02 -0.26 -0.14 -0.22 -0.67 -0.9 -1.73 -1.9 1.38 -2.21 -0.97 0.18 -0.69
1.32 0.1 -0.44 -0.26 -1.04 -2.13 -1.94 -0.71 -1.85 -0.88 -0.04 0.05 1.27 -0.52 -0.75 -0.3 -1.8 0.36 -0.22 0.03 -1.14 0.92 -1.15 0.58 1.39 0.65
-0.13 0.18 0.16 -0.14 -0.89 -1.48 -0.93 -0.37 -0.44 -0.28 -0.1 -0.15 0.2 -0.23 0.47 0.12 -0.5 0.35 0.61 -0.56 -0.02 1.41 0.23 -0.17 -0.17 0.11
0.03 0.44 0.31 0.09 -0.81 -1.17 -0.57 -0.38 -0.26 -0.22 -0.21 0.17 0.43 -0.46 0.38 0.18 -0.59 0.29 0.21 -0.74 0.28 1.09 -0.03 -0.27 -0.13 -0.07
0.29 -0.04 -0.48 -0.21 -0.31 -1.51 -1.24 -0.73 -1.25 -0.63 -0.42 -0.32 0.76 -0.12 0.48 0.35 -0.6 0.39 -0.78 -0.53 0.7 1.27 0.38 0.49 0.27 -0.07
0.32 0.05 -0.34 -0.11 -0.15 -1.03 -0.64 -0.59 -0.83 -0.66 -0.33 -0.63 0.76 0.34 0.68 0.76 -0.65 0.31 -0.21 -1.14 0.5 0.73 -0.21 0.18 0.35 -0.21
0.31 -0.51 -0.31 -0.14 -0.23 -0.28 -0.18 -0.08 -0.15 -0.01 0.34 0.64 0.31 -0.51 -0.9 -0.05 -0.84 -0.38 -0.24 -0.62 -0.13 0.44 0.01 0.4 0.58 0.81
1.44 0.31 0.27 -0.07 -1.8 -2.87 -1.63 -0.4 -2.14 -1.02 -0.36 0.32 1.78 -1.02 -0.45 -0.94 -1.47 -0.87 -1.17 -1.1 1.43 0.23 -1.7 -0.33 1.1 0.61
0.85 -0.23 -0.92 -0.63 -0.75 -0.75 -0.2 0.05 0.0 -0.03 0.27 0.18 0.53 -0.12 -0.73 -0.39 -0.99 -0.66 -0.63 -1.31 1.09 0.2 1.02 0.16 0.62 -0.19
2.04 -0.8 -2.63 -4.24 -5.76 -7.23 -4.14 -3.95 -4.25 -1.48 0.64 1.84 2.56 -1.33 -2.13 -1.66 -2.22 -2.23 -2.22 -3.24 1.45 0.29 -1.24 -0.54 0.49 0.4
0.81 -0.05 -0.41 -0.74 -1.52 -1.94 -0.99 -0.66 -1.08 -0.98 0.13 -0.19 0.92 -1.38 -0.32 -2.07 -1.67 0.06 0.08 -0.05 1.5 0.24 0.46 -0.01 1.24 0.85
1.4 0.44 0.33 0.47 0.07 -0.6 -0.09 0.32 -0.02 0.1 0.08 -0.14 1.01 -2.16 -1.88 -1.99 -1.42 -0.4 -1.1 -0.53 0.08 0.02 -0.27 0.03 0.29 0.35
0.6 -0.41 -0.98 -0.82 -0.59 -0.58 0.27 0.38 0.11 0.11 0.2 0.08 0.37 -0.52 -0.75 -0.31 -0.59 0.15 -0.12 -0.48 0.62 0.88 0.59 0.16 -0.09 -0.49
1.39 -1.05 -2.0 -4.5 -2.57 -2.27 -3.13 -0.65 -1.56 0.45 0.39 1.37 1.61 -0.76 -0.37 -0.5 -1.63 -0.22 -0.35 -2.12 2.18 0.83 -3.96 0.38 -1.53 -0.95
1.87 1.47 0.93 0.79 -0.11 -1.04 -1.16 -0.94 -3.3 -2.44 -1.71 -1.28 2.18 -0.49 -2.68 -0.36 -1.06 -2.44 -3.1 -2.54 1.16 -1.1 -0.39 -1.96 0.28 -1.07
1.76 1.49 1.1 0.86 0.24 -1.17 -0.89 -1.2 -4.09 -2.83 -1.52 -1.25 2.17 -0.81 -2.59 -0.2 -0.93 -3.49 -3.12 -2.47 0.91 -1.9 0.04 -1.04 0.23 -1.25
1.01 -1.04 -1.33 -2.75 -4.34 -4.37 -2.58 -0.8 -1.25 0.01 0.65 0.96 1.45 -0.4 -0.78 -1.05 -1.49 -0.6 -0.74 -0.81 2.1 -0.56 -0.31 1.07 0.35 0.39
0.04 0.59 0.7 0.68 -0.09 -0.55 -0.1 0.34 -0.67 -0.6 -0.66 -0.54 -0.65 0.27 -0.41 -0.06 0.09 0.17 0.1 -0.24 -0.66 1.25 -1.92 -2.21 0.61 0.16
1.01 -0.42 -1.11 -1.74 -1.98 -1.54 -0.31 0.04 -0.24 0.27 0.73 1.12 1.19 -1.5 -1.68 -1.65 -0.82 -0.15 -0.94 -0.72 1.14 1.02 0.01 0.17 0.1 -0.22
0.06 0.58 0.61 0.73 0.01 -0.68 0.09 0.51 -0.64 -0.53 -0.3 -0.53 -0.77 0.4 -0.5 0.02 0.29 0.01 -0.03 -0.23 -0.75 1.21 -1.53 -2.87 0.45 -0.21
1.18 0.39 0.26 -0.34 -1.55 -2.08 -0.74 -0.15 -0.99 -0.34 0.07 0.51 1.32 -0.18 -0.22 -0.2 -0.34 -0.34 -0.49 -0.26 0.42 -0.32 -0.46 -0.03 0.07 0.57
0.48 -0.67 -0.6 0.11 -0.24 -1.02 -0.55 0.33 0.16 0.33 0.76 0.85 0.89 -0.42 -1.18 -0.22 -1.53 -0.91 -1.42 -1.15 -0.15 -0.13 0.32 0.49 0.55 0.64
1.03 -0.37 -0.39 0.61 -0.54 -1.35 -0.86 -0.38 -1.27 -0.95 -0.31 -1.55 0.99 -1.11 -1.77 -2.94 -3.23 -1.91 -1.99 -2.43 1.79 0.56 0.77 -0.63 1.63 1.23
0.57 0.45 -0.41 0.3 0.24 -0.23 -0.29 -0.03 -0.12 -0.13 0.27 0.23 0.17 -0.86 -1.05 -1.74 -1.06 -0.51 -1.32 -1.01 0.23 0.95 -0.05 0.72 0.72 0.29
0.77 -0.3 -0.48 -0.4 -0.86 -1.32 -0.43 -0.16 -0.88 -0.49 -0.19 0.19 0.89 0.29 -0.31 0.1 -0.6 -0.33 -0.51 -0.84 1.1 -0.21 0.7 -0.17 0.73 0.36
0.67 0.33 0.03 -0.3 -0.47 -0.73 -0.28 -0.19 -0.16 -0.02 0.03 0.11 0.46 0.07 0.08 -0.3 0.02 0.15 -0.17 0.01 -0.69 0.57 -0.32 -0.13 0.11 0.13
0.67 0.48 0.11 -0.1 -0.39 -0.73 -0.69 -0.61 -0.71 -0.31 -0.12 0.23 0.25 -0.69 -0.65 -0.74 -0.39 -0.2 -0.36 -0.21 0.01 1.41 -1.09 0.65 0.64 0.34
1.02 0.67 0.18 -0.44 -1.54 -2.04 -1.25 -0.61 -0.61 -0.49 0.15 0.64 0.93 -0.83 -1.02 -0.72 -0.51 -0.92 -0.81 -0.66 1.48 -0.45 1.03 0.34 0.34 -0.45
0.26 -0.95 -0.85 -0.2 -0.25 -0.67 0.11 0.29 0.23 0.12 0.37 0.37 0.67 0.32 -0.28 0.36 -0.68 -0.45 -0.3 -1.04 -0.03 -0.14 0.59 0.16 0.33 -0.19
1.39 0.83 0.54 -0.31 -2.08 -2.8 -0.91 0.16 -2.14 -0.74 -0.15 0.31 1.5 -2.13 -1.66 -1.59 -1.99 -0.66 -1.09 -0.47 1.41 -0.16 -0.52 -0.13 0.77 0.77
1.08 0.49 0.52 0.25 -0.98 -1.52 -0.59 0.06 -1.26 -0.78 -0.42 -0.16 1.53 -0.33 0.14 -0.41 -0.09 0.06 -0.59 -0.41 -1.75 1.21 -1.23 -1.35 0.2 0.2
0.88 0.11 0.07 0.22 0.16 -0.1 0.08 -0.04 -0.62 -0.6 -0.51 -0.3 1.02 -0.18 -0.41 -0.28 -0.47 0.11 -0.47 -0.58 -0.51 1.12 -0.64 -0.7 0.3 -0.09
0.88 -0.03 -0.02 0.03 -0.38 -0.53 -0.73 0.14 -0.22 -0.28 -0.14 -0.08 0.7 -0.53 -0.34 -0.57 -0.98 0.08 0.01 -0.58 0.53 0.86 0.21 -0.25 0.19 0.07
1.43 0.55 0.2 0.39 -0.56 -1.64 -0.94 -0.47 -1.22 -0.32 0.54 0.81 1.59 -1.87 -3.01 -0.61 -1.52 -0.98 -1.51 -1.19 0.82 0.28 -0.66 -0.5 0.71 0.07
0.63 -0.25 0.47 0.56 -0.51 -1.45 -0.49 -0.57 -1.22 -0.95 -0.07 0.27 1.25 -0.55 -0.82 0.15 0.24 -0.53 -0.96 -1.59 -0.83 1.06 0.05 0.45 0.61 0.21
1.5 0.64 -0.03 -0.9 -1.48 -1.74 -1.56 -1.42 -1.93 -1.2 -0.92 -0.24 1.4 -0.04 -0.93 0.2 -1.33 -0.7 -1.3 -1.1 1.7 -0.65 0.59 0.36 0.27 0.68
1.67 0.77 0.21 -0.77 -1.08 -1.19 -1.29 -1.16 -1.47 -1.1 -0.6 0.01 1.68 -0.02 -0.85 0.18 -1.13 -1.0 -1.2 -1.1 1.17 -1.2 0.22 0.25 0.15 0.31
1.07 0.14 -0.09 0.6 -0.55 -2.03 -1.18 -0.42 -0.45 -0.3 0.42 0.41 0.95 -0.18 -1.42 -0.72 -0.34 -1.13 -1.21 -1.47 1.38 -0.4 0.2 0.11 0.4 0.35
1.57 0.45 -0.23 -1.18 -1.68 -1.1 -0.25 0.12 -0.87 -0.57 -0.08 0.48 1.59 -0.82 -0.7 -0.76 -0.82 -0.35 -0.61 -0.45 1.39 -0.18 -0.97 -0.77 0.05 -0.07
0.45 -0.42 -0.46 -0.13 -0.61 -0.9 -0.5 -0.09 -0.69 -0.66 -0.29 0.03 1.08 0.32 0.79 0.27 -0.67 -0.43 -0.92 -1.01 0.03 1.12 -0.39 -0.17 0.57 0.39
1.61 0.12 -0.75 -0.71 -1.77 -1.15 -1.45 -1.11 -1.95 -0.94 0.3 1.17 1.8 -1.97 -1.98 -1.95 -1.55 -1.16 -1.2 -1.45 1.63 0.91 -1.4 -0.34 0.76 0.18
0.25 -1.03 -1.26 0.03 -0.65 -1.57 -0.62 -0.56 -0.79 -0.14 0.35 0.64 0.34 -1.03 -1.66 -1.79 -0.76 -0.73 -1.23 -1.41 1.63 1.49 0.72 0.27 0.9 0.35
0.65 -0.54 -0.22 0.29 0.04 -0.62 -0.21 -0.04 -0.25 0.25 0.93 1.42 1.18 -0.73 -1.88 -1.4 -1.22 -1.48 -1.51 -1.27 0.58 0.62 -0.0 0.14 -0.85 -0.37
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0.83 0.27 -0.25 0.16 -0.4 -2.64 -1.36 -1.14 -1.41 -0.16 0.9 1.33 1.5 -2.06 -2.94 -2.21 -1.38 -1.99 -4.13 - 0.58 0.43 -0.59 1.48 1.3 -0.33
0.47 -0.19 -0.48 -0.67 -1.17 -1.65 -1.42 -1.29 -0.54 0.4 0.99 1.53 0.67 -1.15 -1.23 -0.69 -0.13 -0.18 -0.77 -0.33 0.63 0.82 -1.03 0.61 0.41 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.