Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.27 -0.94 -1.03 0.24 0.42 0.15 0.69 0.98 1.18 1.21 1.56 1.06 0.07 -2.58 -4.35 -3.98 -1.74 -1.05 -1.7 -1.14 -4.68 -1.42 -0.74 -0.04 0.29 -0.21
0.03 -1.93 -2.17 0.93 1.26 -0.01 1.05 0.53 0.89 0.28 1.04 0.27 -0.28 -4.23 -4.97 -3.85 -4.67 -0.54 -1.18 -3.17 -0.63 -0.2 0.82 -1.16 1.07 0.36
-4.52 -5.13 -4.27 -2.76 -0.4 0.43 0.72 0.31 1.14 1.19 1.11 0.67 -3.47 -0.08 -2.1 -0.39 -0.42 0.09 0.16 0.76 -2.82 -3.88 0.75 0.85 0.24 -0.04
-0.1 -1.56 -0.62 0.17 0.1 -0.32 0.32 0.67 0.68 0.92 1.63 1.56 -0.19 -1.95 -3.11 -2.66 -1.97 -0.37 -0.92 -0.71 -5.41 -2.93 -0.46 0.25 0.7 0.51
-0.57 -0.67 -0.65 -0.21 0.18 -0.04 0.34 0.35 0.79 0.78 0.85 0.69 -0.24 -0.25 -0.05 -0.39 -0.01 -0.45 0.09 -0.41 -4.18 -0.3 -0.91 0.34 0.2 -0.15
-3.96 -1.19 -0.95 -0.5 -0.16 -0.03 0.31 0.8 1.02 1.32 1.01 0.59 -4.03 -0.88 -0.82 -0.4 0.19 0.18 0.12 0.41 -3.54 -2.71 0.54 -0.01 0.17 -0.09
-1.05 -2.16 -0.79 -0.52 -0.72 -0.55 0.15 0.53 0.87 1.32 1.45 1.31 -0.66 -0.79 -2.07 -1.48 -0.79 -0.44 -0.35 -0.33 -4.27 -1.46 0.03 0.28 1.03 0.33
-1.81 - - 0.48 - -0.42 1.17 0.42 1.13 2.21 2.29 1.4 - -1.67 - - - -1.25 -1.86 0.13 - -0.17 -1.88 -0.02 0.2 -2.01
-0.5 0.26 -1.18 1.32 0.86 -0.28 -0.22 0.86 0.73 0.76 1.09 0.58 -0.64 -1.71 -1.64 -2.3 -2.87 -1.76 - -4.22 -4.28 -0.46 0.2 -1.08 1.54 0.68
-0.26 -3.49 -3.42 -1.16 -1.49 -1.4 -0.21 -0.01 0.36 1.23 1.86 1.22 -0.26 -0.01 -4.26 -0.46 -2.2 -0.73 -1.66 -2.41 -3.78 -1.2 0.61 1.26 1.42 0.38
-0.46 - -2.01 -2.93 -0.88 -1.02 0.29 -1.08 1.08 1.43 2.22 1.41 -0.7 0.45 -0.84 -2.86 - -0.86 -1.65 -1.3 - -1.29 -0.45 -0.71 2.06 -2.55
-1.12 -2.05 -1.2 -0.25 0.01 -0.05 0.46 0.41 0.71 0.97 1.24 1.06 -0.76 -1.09 -0.49 -1.43 -0.51 0.24 0.46 -0.14 -4.54 -1.56 0.77 0.37 0.05 -0.74
-0.32 -0.37 -0.25 -0.35 -0.03 0.0 0.23 0.25 0.44 0.61 0.53 0.62 -0.05 0.34 0.07 0.1 -0.19 -0.19 -0.56 -0.11 -1.28 -0.27 -0.03 -0.59 0.12 -0.12
-2.21 -1.24 -0.29 0.26 0.07 0.37 0.61 0.58 0.98 1.23 1.42 1.35 -1.16 0.27 -1.73 -0.75 -1.29 -1.16 -1.68 -0.47 -4.43 -3.26 -0.99 -0.74 0.55 0.35
-2.87 -1.58 -0.79 -0.96 -0.47 -0.19 0.25 0.73 1.24 1.29 1.41 1.3 -2.19 0.19 -0.21 -0.77 -0.44 -0.71 -0.33 -1.03 -3.63 -2.03 -0.36 -0.96 0.84 0.28
-0.12 -1.72 -1.58 -1.44 -3.37 -4.56 -0.41 0.61 0.39 1.04 1.37 0.92 -0.17 -1.0 -2.47 1.16 -1.34 -1.06 -1.09 -0.4 -2.58 -2.29 0.43 0.88 1.12 1.11
0.62 -0.35 -0.95 -0.26 0.63 -0.74 0.08 0.33 0.57 1.16 1.3 0.88 0.73 -2.48 -1.26 -0.92 -1.14 -0.65 0.21 -0.73 -2.4 -0.82 0.07 0.08 -0.43 -0.74
0.07 -0.41 -0.69 0.3 0.49 0.21 0.33 0.49 0.64 0.66 0.8 0.23 0.16 -0.17 -0.58 0.02 -0.89 -0.37 -0.45 -0.95 -2.64 -0.27 0.18 -0.52 0.15 -0.17
-0.31 -0.17 -0.36 0.17 0.08 -0.13 0.17 0.64 0.79 0.93 1.14 1.11 -0.06 -1.75 -1.49 -1.08 -1.17 -0.05 -0.15 -0.65 - -2.27 -0.54 -2.41 1.33 0.16
0.6 0.22 -0.42 0.22 0.7 -0.19 0.16 0.54 0.72 0.84 0.84 0.27 -0.16 -1.16 -0.75 -1.15 -1.03 -0.57 -0.31 -0.48 -3.36 -1.27 0.56 -0.49 0.11 0.08
-0.62 -0.62 -0.41 -0.18 -0.13 -0.12 0.26 0.39 0.66 0.85 0.92 0.71 -0.47 -1.2 -0.64 -0.72 -0.41 0.13 0.26 0.2 -3.07 -0.91 0.49 0.48 -0.16 -0.23
-2.66 -1.88 -0.16 -0.59 -0.52 -0.05 0.29 0.42 0.87 1.15 1.34 1.2 -2.28 -0.96 -0.87 -0.52 -0.41 -0.39 -0.33 0.42 -2.45 -1.52 0.0 0.83 0.11 -0.16
-0.52 0.03 -0.22 0.34 0.22 -0.35 0.18 0.36 1.05 1.34 1.71 1.5 -0.1 -0.64 -1.03 -1.48 -1.18 -1.69 -2.97 -1.8 -5.47 -6.62 -2.53 -0.01 0.37 0.03
-0.73 0.16 -0.04 0.25 0.32 -0.22 0.06 0.13 0.47 0.85 0.93 0.72 -0.49 -0.82 -0.66 0.22 -1.51 -1.42 -0.65 -1.14 -1.21 -1.62 0.1 0.17 0.67 0.75
-0.74 -0.78 -0.64 0.36 0.24 -0.33 0.69 0.73 1.02 0.9 1.45 0.98 -1.52 -1.63 -1.39 -2.66 -1.56 -0.9 -0.54 -0.11 -3.51 -1.52 0.44 -0.53 0.84 0.1
-1.98 0.03 -0.09 -0.09 -0.45 -0.45 0.2 0.68 1.13 1.09 1.18 0.43 -1.65 -1.43 -1.1 -1.18 -0.54 0.36 0.26 -0.1 -0.78 -0.64 -0.3 -0.03 0.51 -0.8
-1.14 -0.51 -0.88 -1.49 -1.25 -1.03 0.06 0.39 1.16 1.33 1.45 1.06 -0.92 -0.31 -1.54 -0.49 -0.08 -0.55 -0.96 -0.33 -3.16 -1.17 0.54 0.61 0.04 0.28
0.48 -0.34 -0.53 -0.57 -0.25 -0.23 0.45 0.34 0.57 0.58 0.81 0.71 0.42 -0.02 -0.41 -0.3 -0.27 0.09 -0.09 -0.47 -3.14 -1.22 -0.2 -0.21 0.15 -0.11
0.08 -0.27 -0.02 -0.23 -0.19 0.06 0.16 0.23 0.67 0.43 0.84 0.73 0.26 -0.28 -0.43 -0.43 -0.71 0.03 -0.12 -0.37 -3.69 -0.5 -0.24 0.37 -0.07 -0.04
-0.01 -0.61 -1.23 0.67 0.68 0.09 0.24 0.12 0.91 0.96 1.23 1.12 -0.44 -1.81 -2.44 -0.95 -1.77 -0.85 -1.18 -2.45 -1.72 0.17 -0.03 -0.63 0.57 0.42
-0.26 -0.76 -1.54 -0.78 -1.29 -2.02 -0.62 0.06 0.99 1.22 1.41 0.79 -0.47 -1.45 -1.76 -1.22 -1.91 0.02 -0.3 -1.16 -2.47 0.79 0.75 0.77 1.13 -0.38
-0.73 -0.77 -0.73 -0.31 0.09 -0.65 0.32 0.28 0.61 0.81 1.2 0.99 -0.64 -1.37 -1.22 -0.77 -0.48 0.47 0.13 0.13 -2.24 -2.23 0.12 0.59 0.53 -0.18
-0.03 -0.7 -0.92 0.37 0.71 0.38 0.8 0.73 0.74 0.73 0.98 0.69 0.16 -0.95 -1.02 -1.3 -0.84 -0.48 -0.25 -0.86 -4.49 -1.08 -0.68 0.28 -0.05 -0.28
0.31 -1.97 -1.11 0.31 0.83 -0.11 -0.14 0.58 0.88 -0.0 1.03 0.71 -0.94 - -3.52 -3.45 - 0.06 -0.44 -1.79 -4.42 0.97 0.43 -0.36 1.83 -0.44
0.74 -0.5 -1.06 0.63 0.48 0.28 0.47 1.26 0.72 1.1 0.94 0.54 0.3 -0.81 -1.78 -2.12 -1.3 -0.51 -0.8 -3.13 -2.98 -2.78 -0.26 -0.84 0.75 -0.81
-0.94 -1.28 -0.89 -0.2 0.06 -0.24 0.41 0.79 0.89 1.06 1.04 0.3 -1.01 -1.95 -1.27 -2.28 -0.65 0.37 0.38 0.42 -3.31 -0.33 0.48 -0.03 0.35 -0.03
-0.78 -0.49 -0.85 0.29 0.7 0.28 0.5 1.04 0.95 1.33 1.32 0.52 -0.83 -1.05 -0.94 -0.64 -0.97 -0.26 -1.05 -0.24 -4.89 -2.49 -1.16 -0.19 0.27 -0.66
-3.26 -0.56 -0.56 0.94 0.73 -0.36 0.35 0.26 0.74 0.89 1.29 1.32 -5.07 -2.73 -1.74 -1.97 -5.49 -0.85 -1.77 -1.78 -3.23 0.06 0.09 -0.5 1.52 0.65
-3.59 -2.38 -0.87 0.19 0.54 -0.13 -0.05 0.12 0.63 0.99 1.14 0.98 -2.02 -0.13 0.05 -0.05 0.16 -0.22 -0.35 -1.23 -3.3 -2.31 -0.44 -0.01 1.36 -0.06
-1.27 -0.46 -1.92 0.46 1.15 -0.54 0.31 0.22 0.75 0.43 1.44 0.47 - -2.11 -3.33 -2.8 -3.4 -1.07 -0.5 -2.29 -1.5 0.47 0.61 -1.04 1.81 0.64
-0.12 -0.76 -0.85 -0.35 -1.16 -1.46 -0.69 0.67 1.16 1.42 1.48 0.81 -0.03 -0.93 -1.0 -0.78 -1.3 -0.43 -0.6 -0.89 -3.42 0.58 -0.28 -0.12 0.1 0.44
-1.65 -1.97 -1.6 -1.39 -0.93 -0.71 -0.04 0.12 1.44 1.86 1.77 1.09 -2.23 -1.5 -1.59 -2.07 -0.57 0.04 -0.82 0.06 -3.28 0.18 -0.02 -0.37 -0.07 0.3
-4.4 -0.85 -0.72 -0.12 0.13 -0.23 0.4 0.65 1.36 1.36 1.55 1.01 -3.77 -1.57 -0.94 -1.2 -1.19 -0.27 -0.34 -0.88 -1.85 -0.71 -0.84 -0.25 0.51 0.34
-1.01 -0.45 -0.57 -0.89 -1.02 -0.0 0.5 1.01 1.06 0.97 1.07 0.87 -1.12 -0.88 -0.5 -0.52 -1.13 0.23 0.31 -0.12 -3.27 -0.72 -0.85 0.03 0.49 -0.35
-2.65 -2.21 -0.28 -0.03 -0.3 -0.38 0.47 0.9 1.15 0.99 1.36 1.29 -1.97 -1.28 -0.92 -0.7 -0.78 -0.41 -0.34 -0.43 -2.05 -1.71 0.35 -0.33 0.43 0.18
-1.69 -1.6 -1.26 -0.62 -0.49 -0.62 -0.18 0.29 1.04 1.43 1.9 1.53 -1.03 -0.88 -1.64 -0.87 -0.61 -0.7 -0.82 -0.81 -3.99 -1.65 -0.14 0.45 0.3 0.32
-0.84 -1.41 -0.59 0.03 0.53 0.63 0.83 0.63 0.79 0.87 0.82 0.52 -0.24 0.02 -1.5 -1.17 -1.01 0.6 0.08 -0.22 -4.41 -1.52 -1.97 -0.94 0.35 0.36
-0.52 -0.32 -0.21 0.13 0.05 -0.47 0.16 0.35 0.57 0.85 0.83 0.65 -0.43 0.07 -0.2 -0.24 -0.29 -0.06 -0.07 -0.35 -2.09 -0.32 -0.46 -0.03 0.01 -0.05
-2.1 -1.44 -1.5 -0.93 -0.19 0.14 0.51 0.47 1.15 1.2 1.06 0.95 -2.0 -1.48 -1.95 -1.8 -0.38 0.18 -0.27 0.25 -3.15 -0.35 0.42 0.83 0.13 0.04
-1.92 -0.62 -0.57 0.06 0.15 -0.04 0.44 0.75 0.82 0.86 1.03 0.56 -1.42 -0.9 -1.04 -1.0 -0.08 0.29 -0.29 0.13 -4.73 -0.62 -0.01 0.6 -0.04 0.01
0.5 -0.16 -0.57 0.07 0.04 -0.68 -0.21 0.22 0.54 0.87 1.13 0.86 0.59 -0.02 -0.02 -0.23 -0.29 -0.15 -0.02 -0.29 -1.72 -2.7 -0.27 -0.51 -1.16 -0.49
-0.43 -1.03 -0.79 0.08 0.03 -0.3 0.39 0.32 0.54 0.52 0.83 1.21 -0.36 -0.96 -1.41 -1.24 -1.21 -0.0 -0.18 -1.13 -1.83 0.27 0.51 0.65 0.69 -0.31
-0.01 -1.04 -1.0 -0.01 -0.38 -1.17 0.32 0.34 1.23 1.38 1.39 1.19 0.08 -1.14 -1.19 -0.58 -1.6 -0.78 -1.07 -0.82 -4.29 -0.59 0.36 -0.42 0.28 -0.15
-0.17 -0.39 -0.46 0.75 0.47 -0.43 0.33 0.82 0.81 1.19 1.45 0.77 -0.2 -0.45 -1.28 -0.22 -3.13 0.11 -1.67 -3.45 -3.53 -1.65 -2.51 0.72 -0.26 -0.33
0.03 -0.65 -0.83 0.56 -0.16 -0.93 0.44 0.64 1.37 1.06 1.69 0.85 0.28 -0.59 -0.22 0.06 -1.78 0.02 -1.36 -0.76 -3.03 -3.87 -2.6 -2.6 -0.69 0.11
-1.7 -1.36 -1.26 -1.59 -0.79 -0.53 0.83 0.77 1.41 1.53 1.28 0.69 -1.3 -0.88 -1.14 -0.78 -0.08 -0.56 -0.67 -0.12 -3.44 -0.28 -0.47 -0.05 -0.01 0.51
-1.33 -0.88 -0.08 0.1 0.05 0.01 0.64 0.7 0.77 0.97 0.9 0.87 -1.23 -0.93 -0.95 -1.32 -0.7 -0.13 -0.54 0.25 -2.51 -1.11 0.16 0.03 0.25 0.27
-1.76 -1.63 -4.09 -1.04 -0.82 -2.49 -1.0 -2.0 0.63 1.99 2.42 1.62 -0.32 - - - -4.12 - - - -2.09 -0.75 0.75 0.65 1.69 0.3
-0.25 0.15 -0.14 -0.27 -0.96 -1.49 0.27 0.48 0.76 0.95 1.16 1.22 -0.12 -1.38 -0.8 -1.12 -0.34 0.33 -0.17 -0.4 -6.2 -0.65 -0.72 0.16 0.64 -0.53
-0.05 -0.27 -0.5 -0.31 -1.41 -2.1 -0.09 0.58 0.79 0.81 1.51 1.21 0.2 -1.29 -1.09 -1.52 -0.8 -0.41 -0.26 -1.1 -4.19 -0.55 0.01 0.67 0.87 -0.27
-1.3 -0.61 -0.74 0.05 0.17 0.39 0.67 0.85 1.08 0.85 1.01 1.09 -1.58 -0.86 -2.11 -1.5 -0.99 0.13 0.23 0.18 -3.6 -5.46 -0.16 -0.77 0.26 0.35
0.33 -0.1 -0.06 0.47 0.61 0.27 0.56 0.57 0.65 0.69 0.72 0.51 0.0 -0.97 -0.69 -0.87 -1.02 -0.11 -0.22 -0.54 -3.71 -1.14 0.06 -0.51 -0.15 -0.51
-0.9 -0.5 -1.92 -0.37 -0.21 -0.49 0.59 0.88 1.62 1.52 1.96 1.1 -0.72 -2.21 -4.64 -2.87 -2.4 -2.51 -2.11 -1.8 - -2.59 0.12 -0.14 1.16 -0.89
-1.61 -0.89 -0.79 -0.87 -0.27 -0.17 0.37 0.19 0.89 1.1 0.99 0.96 -1.12 -1.21 -0.88 -1.04 0.09 0.1 0.3 0.02 -2.79 -1.81 0.14 0.64 0.21 0.46
-0.99 0.06 0.19 0.39 0.37 -0.14 0.65 0.9 1.05 1.27 1.36 1.08 -0.62 -0.78 -0.7 -0.23 -1.57 -1.32 -2.1 -0.81 -2.66 -4.49 -2.34 -1.05 0.32 -0.24
-0.46 -0.54 -0.66 -0.12 0.37 -0.06 0.4 0.54 0.85 0.92 1.11 0.89 -0.7 -0.5 -1.27 -0.54 -0.22 -0.73 -0.75 -0.3 -2.64 -1.04 -0.57 -0.01 0.47 0.4
-0.42 -0.51 -1.09 -0.05 0.73 0.09 0.4 0.37 0.79 0.8 1.07 0.95 -0.27 -0.62 -1.12 -1.36 -0.82 -0.92 -0.05 -0.73 -2.26 -1.03 0.11 -1.13 0.85 0.34
-0.76 -0.86 -0.76 -0.25 -0.46 -0.21 0.9 1.19 1.21 1.14 1.08 0.69 -0.86 -2.01 -2.6 -2.0 -0.89 0.45 -0.18 0.12 -3.09 -0.74 -0.52 -0.3 0.45 -0.39
-1.2 -0.1 0.1 0.44 -0.3 -0.71 0.47 0.84 0.65 0.92 0.87 0.75 -0.54 -0.25 -0.41 -0.3 -0.48 -0.08 -0.33 -0.15 -7.95 -0.84 -1.77 -0.36 0.34 0.38
-2.51 -1.0 -0.08 0.48 0.36 0.66 0.84 0.67 1.06 1.05 0.87 0.94 -2.05 -0.25 -1.1 -1.06 -1.09 -0.71 -1.39 -0.52 -2.96 -2.2 -1.14 -0.51 0.34 0.91
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0.45 -0.23 -0.4 0.36 0.18 0.37 0.56 1.06 0.86 1.13 1.19 0.19 -0.22 -2.19 -1.77 -2.87 -1.6 -0.23 -0.23 -0.35 -3.62 -2.67 -0.11 -0.24 0.18 -0.26
-1.12 -0.76 -0.39 0.4 0.37 0.45 0.44 0.72 1.04 1.34 1.29 0.64 -1.7 -0.58 -1.02 -1.1 -1.02 -0.52 -0.52 -0.06 -6.45 -0.36 -1.52 -0.91 -0.06 0.28
0.12 -0.01 -0.59 -0.03 0.53 -0.22 0.42 0.6 0.88 0.92 1.16 0.85 -0.04 -0.21 -0.83 -0.6 -0.62 -0.2 -1.04 -1.99 -4.13 -2.82 -0.15 0.25 0.1 -0.56
0.35 -0.26 -0.61 0.49 0.4 0.27 0.59 0.66 0.73 0.51 0.52 0.49 0.51 -0.6 -0.93 -0.38 -1.08 -0.21 -0.3 -0.87 -5.12 -1.28 -0.82 0.39 0.23 -0.42
-1.45 -0.39 -0.19 0.45 0.34 -0.04 0.33 0.76 0.69 0.9 0.9 0.65 -1.53 -0.9 -1.38 -1.73 -0.61 0.21 -0.09 -0.05 -4.9 -1.27 -1.64 -0.03 0.84 0.75
-0.02 -3.29 -2.66 -1.81 -1.98 -1.79 0.6 0.93 1.46 2.04 2.0 1.0 0.43 -1.91 -1.95 -1.28 -1.8 0.04 -0.69 0.09 -4.97 -4.43 -1.05 -1.01 -0.92 -0.36
-0.51 -0.81 -0.56 -0.48 -0.11 0.14 0.47 0.42 0.45 0.8 0.65 0.56 0.05 0.33 -1.1 -0.67 -0.08 -0.08 -0.12 0.27 -1.09 -1.54 -0.1 0.02 -0.07 0.37
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-0.13 -1.69 -1.24 -0.34 -0.17 -0.9 0.01 0.26 0.88 1.25 1.75 1.26 -0.45 -0.31 -1.5 -1.18 -1.84 -0.97 -0.61 -0.89 -2.99 -0.92 -0.12 0.32 0.71 0.22
-0.01 -1.1 -1.79 0.18 0.45 0.07 0.16 -0.01 0.03 1.05 1.72 1.15 0.5 -2.08 -3.52 -3.42 -2.06 -2.49 -3.12 -1.43 -2.4 0.71 -2.1 -1.11 1.7 0.56
-0.4 -0.55 -0.53 -0.28 -0.02 0.2 0.31 0.26 0.64 0.8 0.56 0.67 0.14 0.31 -0.09 0.16 -0.28 -0.33 -0.57 -0.01 -1.81 -0.91 -0.39 -0.2 -0.05 0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.