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Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.09 -0.18 -0.26 -0.25 -0.17 -0.13 -0.04 -0.16 -0.41 -0.35 -0.31 -0.13 -0.25 -0.3 -0.12 -0.17 -0.47 -0.04 -0.06 -0.11 -1.48 0.19 0.15 1.35 0.86 0.65
0.33 -0.58 -1.02 -1.07 -0.7 -0.63 0.21 -0.18 -0.45 0.15 0.22 0.12 -0.04 0.46 -1.66 -0.78 0.21 -0.0 -0.12 -0.04 -0.07 -1.25 0.78 1.18 0.06 1.01
0.22 -0.62 -1.18 -1.01 -0.64 -0.52 -0.01 -0.28 -0.55 -0.02 -0.01 0.12 -0.14 0.3 -1.81 -1.16 -0.18 0.12 -0.17 -0.39 0.43 -0.88 1.0 1.16 0.46 1.22
0.51 -0.41 -0.93 -0.76 -0.24 0.19 0.14 -0.09 -0.08 0.25 0.33 0.34 0.26 -0.04 -2.08 -1.26 -0.38 -0.65 -0.49 -0.64 -0.05 -1.11 0.88 1.05 0.36 0.88
1.24 0.94 0.53 -0.05 -1.03 -1.26 -0.76 -0.45 -0.33 -0.19 -0.16 0.21 1.1 -0.98 -0.43 -0.96 -0.43 -0.01 0.33 -0.22 -0.65 -0.57 -0.23 0.49 0.11 -0.09
1.57 0.23 -2.4 -1.78 -3.34 -1.53 -0.09 0.39 -0.17 0.3 0.05 -0.31 1.28 0.21 -1.02 -0.61 -0.44 -0.69 -0.36 -0.25 -1.64 -1.64 1.38 -0.38 1.09 -0.19
1.37 0.7 0.35 -0.21 -0.36 -0.98 -0.37 -0.18 -1.74 -1.22 -1.1 -0.41 1.53 -0.91 -1.42 -0.63 -1.23 -0.38 -0.09 -0.83 0.47 -2.24 -0.73 -1.93 1.94 0.39
0.06 0.08 0.11 -0.75 -1.14 -0.78 -0.42 0.1 -0.01 0.24 -0.05 -0.17 0.35 0.73 0.6 0.51 -0.64 -0.12 0.18 0.11 -1.07 -2.12 -0.05 0.67 0.05 0.48
-0.2 -0.42 0.4 -0.49 -2.01 -3.13 -0.25 0.23 -0.35 0.26 0.24 -0.48 -0.28 0.74 0.31 0.71 0.12 0.3 -0.02 0.38 0.02 -2.57 0.63 -0.1 -0.33 0.73
-3.27 -5.25 -6.16 -5.48 -5.88 -5.8 -4.22 -4.79 -3.81 -2.57 -2.14 -1.96 -3.47 -4.65 0.29 -6.21 1.01 -1.49 -1.38 -3.96 1.07 1.27 2.29 2.79 0.64 1.53
0.59 -0.12 -0.4 -0.38 -1.1 -1.73 -0.73 -0.3 -0.37 -0.23 -0.11 -0.09 0.33 0.32 0.27 0.27 -0.14 0.69 0.42 -0.26 0.25 -0.93 0.84 -0.27 0.14 0.39
0.95 0.3 -0.07 -0.22 -0.44 -0.89 -0.72 -0.37 -1.21 -1.77 -0.84 -0.15 1.15 -0.55 -0.87 0.02 -0.94 -0.76 -1.23 -1.59 1.32 0.28 -0.32 0.02 1.69 0.13
0.57 0.32 0.01 -0.12 -0.42 -0.97 -0.45 -0.41 -0.63 -0.52 -0.11 0.11 0.53 -0.4 -0.25 -0.17 0.02 0.23 0.04 -0.44 0.78 -0.96 -0.57 -0.09 1.21 0.26
0.42 -0.5 -1.04 -0.91 -0.81 -0.32 -0.24 -0.34 -0.36 -0.18 0.02 0.55 0.69 0.28 -0.02 0.37 -0.45 -0.18 0.08 -0.55 0.33 0.31 0.81 0.43 0.04 -0.56
0.59 0.03 -0.1 -0.52 -0.98 -0.8 -0.64 -0.3 -0.5 -0.24 0.11 0.3 0.75 -0.23 0.06 -0.05 -0.75 0.72 0.64 -0.21 -0.03 -1.22 0.51 0.15 0.07 0.34
0.71 -1.24 -2.42 -2.59 -1.81 -0.31 0.78 0.82 0.49 0.57 0.45 0.29 0.64 -0.5 -0.58 -0.77 -0.04 0.04 0.09 -0.01 0.36 -1.08 0.7 0.09 -0.12 -0.77
0.16 -0.46 -0.26 0.0 -0.27 -0.33 -0.23 -0.38 0.09 0.39 0.37 0.33 -0.16 0.14 -0.53 -0.0 -0.4 0.41 0.3 -0.69 -0.3 -0.39 0.55 0.55 -0.09 0.11
0.79 0.6 0.4 0.28 -0.14 -0.8 -0.49 -0.09 -0.9 -0.9 -0.52 -0.17 1.0 0.16 -0.36 -0.13 0.2 -0.5 -0.4 -0.81 -0.19 0.05 -1.47 -0.84 1.05 0.6
0.56 0.43 0.18 0.19 -0.36 -1.3 -0.59 -0.2 -1.11 -0.97 -0.66 -0.36 0.78 0.03 -0.58 -0.2 0.06 -0.28 -0.73 -1.07 0.39 0.52 -0.95 -0.6 1.52 0.84
0.55 -0.6 -0.91 -0.71 -0.88 -0.65 -0.88 -0.52 -1.06 0.06 -0.23 -0.07 0.22 0.44 0.27 -0.12 -0.57 0.26 0.33 0.12 0.06 -1.45 1.01 0.53 0.68 0.72
0.95 0.34 -0.01 -0.31 -0.12 0.06 -0.22 0.23 -0.07 -0.26 0.14 0.14 0.83 -0.37 0.04 -0.2 -0.35 -0.05 0.12 -0.39 -0.65 -1.65 0.7 -0.52 -0.29 -0.2
0.74 0.27 -0.47 -1.23 -1.34 -0.71 -0.0 0.02 0.17 0.12 -0.0 -0.04 0.44 0.18 -0.62 -0.15 -0.13 0.03 -0.3 -0.07 -0.24 -0.78 0.54 0.15 0.66 0.54
1.85 0.39 -1.44 -1.92 -1.89 -1.98 -0.08 0.26 -1.16 -0.06 -0.06 -0.41 1.77 -0.41 -0.8 -1.77 -1.44 -0.25 0.33 -0.52 0.12 -1.01 0.66 0.18 0.15 0.11
0.96 1.03 0.63 0.12 -0.73 -1.1 -0.92 -0.29 -0.67 -0.7 -0.23 0.09 0.99 -0.85 -0.82 -0.61 -0.35 -0.37 -0.5 -0.57 -0.42 -0.08 -0.41 0.0 1.41 0.0
1.3 0.22 -0.26 -0.44 -0.86 -1.53 -0.46 0.0 -1.51 -0.33 -0.09 0.29 1.58 -0.23 -0.68 -0.39 -0.8 0.51 -0.41 -0.8 -0.28 -0.14 -0.49 -1.18 1.08 0.41
0.62 -0.16 -1.72 -1.89 -0.61 0.37 0.75 0.41 0.0 -0.57 -0.54 -0.78 0.37 0.06 -0.24 -1.15 0.45 -0.2 0.12 -0.43 0.29 -2.07 1.59 0.2 -0.18 -0.15
0.29 0.83 -0.94 -0.74 -1.22 -0.75 0.23 -0.46 -0.55 -0.47 -0.17 -0.33 0.44 -0.51 -0.13 -0.2 -1.12 -0.51 -0.16 -0.8 1.08 -1.51 0.51 0.09 1.19 1.1
1.04 0.08 0.24 -0.34 -2.21 -2.78 -1.33 -0.3 -1.82 -0.87 -0.2 0.09 1.17 -0.43 -0.46 0.31 -0.26 -0.19 -0.22 -0.4 0.24 -0.35 -1.52 -0.3 1.81 0.72
0.3 -0.54 -0.74 -0.32 -0.79 -0.55 -0.11 -1.16 -0.78 -0.71 0.48 0.62 0.29 -1.16 -1.31 -1.0 -2.57 -0.9 -0.68 -0.69 -0.11 -2.2 1.67 1.61 0.89 1.13
0.28 0.41 0.08 -0.22 -0.7 -1.32 -0.78 -0.37 -0.32 0.01 -0.12 -0.03 0.03 -0.39 -0.87 0.28 -0.14 0.56 0.38 0.17 -0.26 0.19 0.71 0.55 0.02 0.01
1.15 0.97 0.59 0.13 -1.35 -2.1 -1.68 -0.84 -0.78 -0.58 -0.0 0.38 0.98 -1.13 -1.09 -0.93 -0.17 -0.4 -0.62 -0.51 -1.84 0.41 -0.36 0.32 1.5 0.36
1.97 0.9 0.16 -1.04 -2.7 -2.64 -1.24 -0.44 -0.34 0.27 0.35 0.65 1.35 -0.58 -0.38 -1.2 -0.56 -0.28 -0.39 -0.45 -3.42 -3.53 1.28 0.02 -0.31 -1.11
1.69 1.35 1.31 -0.1 -2.58 -4.37 -4.23 -1.95 -2.32 -2.63 -1.08 -0.91 0.93 0.85 -1.05 0.48 -0.33 -1.07 -0.86 -1.77 -0.19 -1.35 -2.53 -2.27 1.39 1.57
-0.53 -1.36 -1.08 -0.29 -0.71 -0.46 -0.57 -0.76 -0.67 -0.97 -0.13 -1.46 -0.95 -0.18 -0.74 0.22 -0.11 0.36 0.54 -0.76 -0.91 0.3 0.61 1.77 1.04 1.28
1.24 0.31 -0.35 -0.96 -0.9 -1.24 -0.19 0.21 -0.79 -1.1 -0.45 -0.07 1.21 -0.0 -0.25 -0.87 -0.33 0.65 0.56 -1.03 -0.04 -1.07 0.77 -0.01 0.44 -0.24
0.62 -0.55 -0.52 0.09 -0.08 -0.81 -0.3 0.11 0.06 0.06 0.38 0.48 0.69 0.64 -0.6 -0.88 -1.21 -0.48 -0.02 -0.92 0.29 -0.63 1.08 -0.73 0.47 -0.28
0.64 0.21 0.11 -0.21 -0.68 -1.06 -0.72 -0.26 -0.04 0.2 0.18 0.54 0.74 -0.6 -0.43 -0.28 0.12 0.11 -0.19 0.16 -0.58 -0.39 0.13 0.12 0.13 0.4
1.22 0.77 0.57 0.23 -0.55 -0.86 -0.21 0.24 -0.84 -0.73 -0.43 -0.23 0.94 -0.99 -1.31 -1.08 -0.82 -0.96 -0.86 -0.62 0.29 -0.92 0.08 -0.01 1.15 0.75
1.03 0.95 0.12 -0.34 -1.57 -1.43 -0.85 -0.17 -0.38 -0.28 -0.14 0.13 0.84 -0.19 -0.06 -0.45 -0.22 0.03 0.17 -0.48 -0.21 -1.28 0.49 -0.02 0.27 0.53
-5.34 -3.74 -5.04 -4.37 -3.57 - - - -4.05 -6.08 -6.07 - -4.6 0.77 0.78 0.57 -0.16 -1.51 -1.13 -0.17 0.22 -1.3 2.12 2.56 0.86 2.16
1.71 0.33 -1.39 -1.51 -1.57 -1.3 0.1 0.27 0.18 -0.18 0.19 0.38 1.29 -0.99 -2.0 -2.43 -0.72 0.25 -0.04 -0.83 -2.06 -2.43 0.44 0.62 0.98 0.32
2.13 1.1 -0.98 -2.01 -2.24 -1.61 -0.76 0.47 0.08 -0.23 0.11 0.12 1.69 -1.71 -2.39 -2.02 -1.02 0.17 0.23 -1.61 -1.68 -3.79 1.42 0.02 -0.64 -1.71
-5.82 -8.29 -8.37 -7.55 - -7.77 -7.94 -7.27 -7.72 -5.95 -5.51 -5.22 -5.82 -5.39 -3.48 -6.89 -0.42 -2.51 -3.05 -4.94 -0.23 1.57 1.87 3.16 1.85 2.22
-0.3 -0.08 -0.03 -0.11 -0.18 -0.6 -0.33 -0.35 -0.39 -0.48 -0.11 -0.03 -0.44 -0.06 -0.38 -0.21 -0.72 0.49 0.02 -0.55 0.55 -1.77 0.49 0.97 0.81 0.93
1.65 0.49 -0.24 -0.71 -1.12 -0.54 -0.02 0.08 -0.13 -0.09 0.29 -0.01 1.4 -0.17 -0.1 -0.25 -0.95 -0.13 0.08 -0.46 -1.22 -2.78 0.21 -1.03 0.17 -0.21
-1.89 -0.21 1.08 - -1.39 - -0.47 - - - - -0.49 - -0.94 - -1.44 0.21 -2.17 0.38 -1.96 0.91 -0.98 2.54 1.89 0.57 1.89
0.82 0.51 0.47 0.37 -0.01 -0.61 -0.7 -0.26 -1.05 -1.1 -1.19 -0.81 0.55 -0.63 -0.54 -0.23 -0.65 -0.19 -0.42 -0.65 0.29 0.26 0.01 -0.79 1.6 0.57
0.84 -0.61 -1.37 -1.28 -0.54 -0.44 0.38 0.39 -0.0 0.21 -0.1 -0.28 0.73 -0.13 -0.73 -0.86 -0.16 0.42 0.31 -0.06 -0.05 -1.68 0.83 0.58 -0.14 0.26
0.72 0.38 -0.2 -0.25 -0.92 0.06 -0.62 -1.08 -0.54 -0.17 0.14 0.15 1.19 0.08 -0.38 -0.67 -0.45 0.36 0.83 -0.05 -0.15 -1.55 -0.64 -0.12 0.15 0.54
1.48 -0.14 -0.03 0.06 -0.63 -1.44 -0.73 -0.24 -1.61 -0.78 -0.32 0.21 1.78 -0.21 -0.83 -0.77 -0.3 -0.3 -0.92 -1.32 0.02 -0.47 -0.65 -0.54 1.16 0.72
0.89 -0.64 -2.03 -2.51 -1.49 -0.16 0.39 0.16 0.11 0.06 -0.04 0.12 0.81 0.07 -0.05 -0.35 0.05 -0.01 0.09 -0.54 0.48 -0.76 1.06 0.62 -0.35 -0.99
0.82 1.06 0.38 0.03 -0.38 -0.16 -0.53 -0.55 -0.88 -0.81 -0.81 -0.57 0.57 -0.49 -0.88 -0.28 -0.64 0.07 -0.04 -0.46 -0.04 0.45 0.3 0.21 0.84 -0.09
1.41 -1.56 -2.51 -1.99 -2.02 -1.28 -0.4 -0.87 -1.46 -1.74 -0.8 -0.99 1.61 0.1 0.11 -0.28 -0.47 0.72 -0.28 -0.78 0.25 -2.52 1.88 -0.34 1.29 -0.34
1.23 1.14 0.9 0.31 -0.86 -1.86 -1.24 -0.48 -0.99 -1.33 -1.11 -0.74 0.9 -0.74 -0.11 -0.61 -0.34 -0.28 -0.3 -0.23 0.11 -0.47 -0.03 -0.86 1.22 0.54
1.81 0.37 -0.55 -0.63 -0.14 -0.11 0.4 0.14 -0.17 -0.82 -0.25 -0.15 1.35 -0.52 -0.22 -0.35 -0.57 -0.38 0.28 -0.78 -4.43 -1.8 0.76 -0.69 -0.03 -0.59
0.44 0.26 0.09 -0.78 -0.84 -0.53 -0.02 0.01 -0.43 -0.37 -0.49 -0.66 0.51 -0.72 -0.15 -0.5 -0.56 0.89 0.72 0.01 0.25 -1.44 0.32 -0.03 0.86 0.34
1.0 0.98 0.99 0.65 0.0 -0.58 -0.54 0.32 -0.16 -0.94 -0.59 -0.44 0.59 -1.67 -0.84 -1.29 -0.6 -0.39 -0.5 -0.07 -0.2 -1.26 -0.39 -0.95 1.29 0.23
1.19 0.23 -0.33 -0.58 -1.15 -1.43 -0.41 -0.24 -1.85 -1.29 -0.94 -0.68 1.48 -0.04 -0.25 0.03 -0.49 -0.16 -0.56 -0.91 0.25 -0.21 -0.07 -0.93 1.73 0.62
0.79 -0.65 -1.11 -0.13 0.48 0.13 -0.29 -0.71 -0.21 -0.67 0.04 -0.52 0.19 0.83 -0.54 0.31 -1.57 0.03 -0.16 -1.79 0.59 -0.31 1.04 -1.07 0.91 0.0
0.07 -0.05 0.07 -0.16 -0.32 -0.78 -0.64 -0.27 -1.72 -0.56 -0.53 -0.51 0.3 0.54 -0.06 0.31 0.05 0.11 -0.16 0.19 0.25 -0.93 0.84 -0.27 0.37 1.11
0.77 0.79 0.03 0.02 -0.33 -0.56 -0.37 -0.14 -0.94 -0.69 -0.33 -0.01 0.76 -0.83 -0.63 -0.59 -0.32 -0.61 -0.02 -0.81 0.51 -0.27 0.12 0.19 1.12 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.