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Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.33 -0.32 -0.38 -0.2 -0.86 -1.52 -0.34 -0.06 -0.95 -0.71 -0.78 -0.78 -0.18 0.93 0.47 1.07 0.04 0.3 0.06 -1.06 0.92 -0.81 0.4 -0.41 0.93 0.38
-0.45 -0.46 -0.52 -0.54 -1.06 -1.95 -0.46 -0.15 -1.3 -1.0 -1.27 -1.03 -0.33 1.27 0.76 1.58 0.51 0.73 0.31 -0.92 0.78 -1.41 -0.26 -0.98 0.72 0.2
-0.98 -0.64 -0.76 -0.68 -0.65 -1.25 -0.53 -0.52 -0.66 -0.31 -0.56 -0.89 -0.97 0.34 0.67 0.5 0.13 0.97 0.65 0.28 0.68 0.54 0.8 0.16 -0.27 0.24
-0.6 -0.41 -0.46 -0.52 -0.25 -0.19 -0.31 -0.31 -0.27 -0.23 -0.33 -0.51 -0.52 0.31 0.59 0.3 0.01 0.66 0.84 0.17 0.27 0.27 0.29 -0.21 -0.45 0.33
-1.14 -0.99 -0.7 -0.7 -0.68 -1.04 -0.55 -1.1 -0.61 -0.51 -0.46 -0.68 -2.1 0.64 0.54 0.01 0.32 0.51 0.57 0.02 0.69 0.42 0.9 0.71 0.59 0.55
-1.21 -0.6 -0.51 -0.45 -0.26 -0.05 -0.0 -0.15 0.02 0.01 -0.31 -0.53 -1.35 0.46 0.71 0.68 0.24 0.76 0.55 0.15 0.16 0.31 -0.05 -0.19 -0.5 -0.16
-0.53 -0.38 -0.36 0.0 0.17 0.14 0.25 0.08 -0.0 -0.32 -0.39 -0.49 -0.46 -0.15 -0.31 0.12 -0.18 0.26 -0.0 -0.49 0.63 0.77 0.41 0.09 0.17 -0.11
-1.01 -0.31 -0.08 -0.01 0.02 -0.08 0.06 -0.04 -0.01 -0.02 -0.23 -0.39 -0.91 0.17 0.22 0.27 -0.01 0.69 0.41 -0.29 0.46 1.03 0.36 -0.47 -0.98 -1.06
-2.16 -1.22 -0.4 0.21 -0.29 -0.3 0.72 0.56 1.05 0.67 0.27 -0.25 -2.61 0.22 -0.15 0.6 -0.26 1.16 0.03 0.05 -2.01 -2.93 0.48 -0.7 -0.13 -0.28
-0.7 -0.25 -0.55 -0.1 0.09 -0.05 0.3 0.21 0.84 0.5 0.6 0.24 -1.01 0.18 -0.72 0.06 -0.58 -0.15 -0.67 -0.8 0.39 0.14 0.54 0.08 -0.31 -0.29
-0.31 -0.3 -0.62 -0.51 -0.38 -0.58 -0.57 -0.63 -0.55 -0.42 -0.53 -0.59 -0.23 0.32 0.81 0.5 -0.26 0.79 0.74 -0.22 0.77 -0.41 0.61 -0.12 0.15 0.15
-1.29 -0.88 -0.96 -0.58 -0.47 -0.89 -0.35 -0.41 -0.41 -0.52 -0.44 -0.8 -1.25 0.69 0.62 1.31 -0.01 0.89 0.62 -0.46 0.4 0.77 0.7 -0.01 -0.44 -0.35
-0.21 -0.75 -0.66 -0.25 -0.33 -0.57 0.19 0.2 0.11 -0.17 -0.17 -0.53 -0.31 0.63 -0.01 0.64 0.13 -0.07 -0.65 -0.64 0.42 0.05 0.73 0.39 0.22 0.02
-2.59 -1.9 -1.14 -1.24 -1.33 -0.96 -0.55 -0.59 -0.38 -0.42 -0.46 -0.43 -2.41 0.69 0.45 0.68 -0.45 0.63 0.14 -0.87 1.39 0.71 1.12 0.53 0.53 0.51
-0.79 -0.01 0.06 -0.16 -0.09 -0.23 -0.41 -0.42 -0.44 -0.57 -0.86 -0.87 -0.89 -0.11 0.73 0.19 -0.0 1.08 0.74 -0.03 0.58 0.41 -0.43 0.03 0.01 0.11
-2.36 -2.75 -1.31 -0.77 -0.53 0.09 0.7 0.75 0.81 0.44 -0.36 -0.76 -2.36 0.54 -0.41 0.83 -0.12 1.02 -0.01 -0.01 0.33 -0.17 0.5 -0.88 0.23 -0.44
-3.04 -2.01 -0.44 0.55 0.12 -0.28 0.28 0.83 0.57 0.55 0.52 -0.14 -3.1 -1.93 -1.47 -1.88 -0.51 0.24 0.35 -0.74 0.28 -0.06 1.23 -1.2 1.34 -0.04
-2.3 -1.78 -0.9 -1.05 -0.68 -1.54 -0.73 -0.79 -0.9 -0.5 -0.96 -0.31 -2.28 1.03 0.58 0.57 -0.12 1.06 0.37 0.07 0.88 0.66 0.98 -0.13 0.29 0.73
-2.76 -2.08 -1.31 -0.85 -0.74 -0.31 0.48 -0.08 0.18 0.2 0.01 -0.1 -2.04 0.65 0.38 0.82 -0.21 0.47 0.24 -0.44 0.63 -0.65 0.83 -0.04 0.34 0.53
-3.1 -2.14 -1.49 -1.08 -1.05 -0.78 0.38 0.06 0.03 0.04 0.03 -0.22 -2.24 0.81 0.41 1.03 -0.01 0.73 0.18 -0.3 0.8 -0.47 0.89 -0.79 0.45 0.37
-1.51 -1.13 -1.02 -0.61 -0.53 -0.63 -0.23 -0.1 0.46 0.52 0.58 0.45 -0.87 0.68 0.63 0.75 -0.45 -0.06 -0.41 -0.85 0.52 -0.16 0.6 0.33 -0.32 -0.06
-1.27 -0.45 -0.33 -0.33 -0.16 -0.4 -0.09 -0.31 -0.39 -0.09 -0.55 -0.61 -1.61 0.22 0.49 0.21 0.2 1.04 0.92 0.43 0.73 -1.3 -0.25 -0.3 -0.04 0.7
-1.29 -1.17 -2.17 -0.85 -0.17 0.87 0.73 0.22 1.07 0.84 0.76 0.7 -0.65 -0.56 -0.18 -0.66 -1.6 -0.43 -0.22 -0.74 0.78 -0.5 0.49 0.33 -1.06 -0.52
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - - 1.7 - 3.61
0.21 -0.44 -0.63 -1.88 -2.08 -2.41 -0.66 -0.26 -0.53 0.26 0.09 -0.17 0.36 -0.13 0.1 0.35 0.41 0.73 0.46 0.28 1.35 -2.27 0.97 -0.14 -0.06 -0.38
-3.06 -2.89 -1.95 -0.86 -0.4 0.07 0.36 0.2 0.95 0.61 0.56 -0.49 -3.17 0.71 0.2 0.31 -0.46 -0.44 -0.75 -0.96 0.99 -0.78 1.32 -0.21 0.21 0.33
-1.28 -0.52 -0.25 -0.29 -0.2 -0.11 -0.18 -0.5 -0.51 -0.42 -0.59 -0.58 -1.36 0.73 0.12 0.38 0.12 0.28 0.36 0.17 0.41 -0.16 0.04 0.43 0.2 1.11
- -0.69 - - - -0.69 - - 0.63 -1.06 - - - - -1.19 -0.96 1.5 2.58 -1.01 - 2.85 -1.33 0.84 -1.04 -1.55 1.17
-3.4 -3.44 -3.58 -3.49 -3.58 -2.87 -4.02 -3.8 -2.36 -2.87 -2.53 -2.48 -2.68 0.19 1.0 1.26 0.14 1.12 0.82 0.43 1.41 -0.42 1.58 1.52 0.66 0.75
- - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - 2.6 - - 2.94 - - - - 2.84
-2.06 -0.76 -0.57 0.09 0.27 0.14 0.51 0.37 0.48 0.47 0.37 0.24 -1.67 0.22 -0.21 0.31 -0.38 -0.16 -0.42 -0.51 0.14 0.13 0.21 0.13 0.07 -0.06
-1.91 -0.82 -0.77 -0.33 -0.5 -0.34 0.06 -0.26 0.07 0.17 0.03 -0.22 -1.84 0.55 0.37 0.83 -0.13 0.77 0.67 -0.49 0.03 0.27 -0.18 0.01 0.38 0.26
-1.09 -0.97 -0.5 -0.14 0.01 -0.1 0.26 0.1 0.09 -0.19 -0.49 -0.74 -1.31 0.47 0.0 0.64 -0.17 0.68 -0.07 -0.22 0.61 0.48 0.63 -0.39 0.11 -0.0
-2.03 -1.24 -1.73 -0.88 -0.5 -1.83 0.77 1.06 0.53 1.12 -2.03 0.72 - -0.04 -2.06 0.96 -0.24 0.56 -2.32 -1.54 1.43 -0.98 1.42 -1.67 -0.13 0.1
-1.52 -0.97 -0.85 0.23 0.28 0.25 0.55 0.55 0.72 0.44 0.51 0.11 -1.46 -0.11 -1.0 -0.04 -0.39 -0.11 -0.71 -0.59 0.24 0.2 0.49 0.55 -0.23 -0.33
-1.15 -0.87 -0.3 -0.14 -0.36 -0.61 0.33 0.19 -0.03 -0.44 -0.89 -1.24 -1.13 -0.04 0.14 0.49 0.19 0.61 0.37 -0.14 1.07 -0.43 0.87 -0.01 0.15 0.24
-1.14 -1.1 -0.57 -0.44 -0.58 -0.81 -0.02 -0.06 -0.06 -0.63 -0.67 -0.95 -0.71 -0.19 -0.51 -0.49 -0.15 1.0 -0.06 -0.36 1.6 1.02 0.74 -0.55 0.44 0.49
-1.03 -0.56 -0.25 0.3 0.35 0.18 0.28 0.44 0.68 0.45 0.61 0.6 -0.73 -0.76 -1.09 -0.63 -1.02 -0.45 -0.65 -0.63 1.22 -0.2 -0.35 0.11 0.14 -0.35
0.33 -0.16 -0.42 -0.49 -0.94 -0.88 -0.15 0.21 -0.03 0.08 0.09 0.04 0.42 -0.42 0.46 0.07 -0.11 0.35 0.11 -0.34 0.51 0.14 0.38 -0.04 -0.18 -0.22
-0.03 -0.18 -0.5 -0.76 -1.3 -1.59 -0.45 0.07 -0.49 -0.26 -0.28 -0.33 -0.08 -0.39 0.2 0.25 0.02 0.98 0.24 -0.31 1.12 0.12 0.93 -0.48 0.31 0.0
-1.98 -1.2 -1.05 -0.99 -0.76 -0.82 -0.49 -0.73 -0.69 -0.5 -1.0 -1.2 -2.01 0.62 1.05 1.14 -0.03 0.76 0.38 -0.51 1.37 0.6 0.86 0.1 -0.03 -0.18
-1.08 -0.81 -0.58 0.02 -0.01 0.04 0.22 0.32 0.67 0.56 0.51 0.27 -0.81 0.13 -0.26 0.18 -0.19 0.45 0.03 -0.19 -0.19 -1.39 0.16 0.04 0.02 -0.05
-1.43 -0.49 -0.27 -0.33 -0.14 -0.15 -0.05 -0.23 -0.3 -0.29 -0.52 -0.61 -1.3 0.52 -0.31 0.63 -0.25 0.66 0.57 0.11 0.79 -0.84 0.56 0.36 -0.19 0.66
-0.8 -0.21 -0.13 -0.18 0.19 -0.02 0.12 -0.07 -0.41 -0.12 -0.3 -0.67 -1.58 0.37 0.34 0.36 0.01 0.57 0.65 0.2 -0.39 0.33 -0.35 0.09 -0.47 0.59
-0.08 -0.46 -0.4 -0.18 -0.23 -0.2 0.14 0.06 -0.15 -0.07 -0.14 -0.1 -0.21 0.23 -0.14 0.19 -0.2 0.32 0.17 -0.17 -0.09 -0.07 -0.26 0.46 0.25 0.69
-0.72 -0.73 -0.45 -0.57 -0.5 -0.66 -0.14 -0.21 -1.03 -0.57 -0.63 -0.66 -1.21 0.76 0.26 0.63 0.27 0.37 -0.04 0.24 0.76 0.81 1.04 -0.67 0.33 -0.1
-0.73 -0.58 -0.43 -0.49 -0.56 -0.56 -0.15 -0.38 -0.89 -0.37 -0.93 -0.81 -1.45 0.67 0.25 0.44 0.09 0.1 -0.05 0.09 0.74 1.01 1.07 -0.37 0.58 0.16
-0.5 -0.54 -0.31 -0.49 -0.28 -0.33 0.04 -0.33 -0.73 -0.38 -0.72 -0.58 -1.25 0.59 0.27 0.35 0.14 0.05 0.05 0.07 0.66 0.87 0.92 -0.77 0.54 0.05
-0.76 -0.61 -0.32 -0.48 -0.48 -0.7 -0.11 -0.45 -1.0 -0.36 -0.95 -0.96 -1.36 0.65 0.42 0.47 0.28 0.1 -0.03 0.21 0.79 0.99 0.9 -0.77 0.85 -0.2
-0.63 -0.6 -0.47 -0.51 -0.52 -0.58 0.04 -0.5 -0.87 -0.49 -0.69 -0.79 -1.28 0.64 0.25 0.35 0.27 -0.25 -0.07 0.2 0.62 0.81 1.16 -0.1 0.67 0.13
-0.67 -0.9 -0.46 -0.38 -0.47 -0.67 -0.03 -0.45 -0.79 -0.39 -0.71 -0.66 -1.4 0.71 0.22 0.4 0.24 -0.13 0.02 0.28 0.77 0.49 1.1 -0.29 0.67 0.25
-0.81 -0.59 -0.5 -0.48 -0.26 -0.6 -0.0 -0.29 -0.84 -0.38 -0.59 -0.8 -1.48 0.71 0.34 0.5 0.34 0.25 0.11 0.22 0.59 0.71 1.04 -0.64 0.45 -0.14
-0.46 -0.42 -0.2 -0.17 -0.14 -0.35 0.27 -0.12 -0.58 -0.08 -0.39 -0.43 -1.07 0.82 0.39 0.6 0.33 0.08 0.18 0.21 0.07 0.39 0.39 -0.28 -0.08 -0.53
-0.91 -0.73 -0.52 -0.54 -0.52 -0.64 -0.15 -0.6 -0.86 -0.36 -0.94 -0.78 -1.4 0.45 0.03 0.26 0.19 -0.16 0.04 0.07 0.83 1.04 1.31 0.22 0.46 0.28
-0.57 -0.61 -0.08 -0.34 -0.06 -0.52 0.13 -0.18 -0.66 0.13 -0.3 -0.67 -1.01 0.88 0.45 0.76 0.53 0.13 0.27 0.37 0.17 0.25 0.48 -0.81 -0.48 -0.51
-0.68 -0.52 -0.44 -0.33 -0.38 -0.68 0.05 -0.24 -0.73 -0.3 -0.51 -0.69 -1.15 0.41 0.03 0.26 -0.08 -0.01 -0.06 -0.04 0.73 0.92 1.18 -0.1 0.6 0.03
-0.67 -0.57 -0.37 -0.32 -0.26 -0.76 0.15 -0.22 -0.64 -0.11 -0.44 -0.61 -1.17 0.49 0.12 0.39 0.08 0.02 0.17 0.08 0.54 0.76 1.0 -0.21 0.39 -0.08
-0.72 -0.57 -0.38 -0.28 -0.34 -0.78 0.26 -0.3 -0.6 -0.05 -0.31 -0.54 -1.14 0.3 -0.04 0.32 -0.03 0.07 0.16 0.03 0.61 0.75 1.02 -0.03 0.43 0.0
-0.32 -0.21 -0.09 0.07 0.19 0.12 0.5 0.09 0.0 0.17 -0.06 -0.13 -0.53 0.16 -0.05 0.15 -0.17 -0.04 0.18 -0.03 0.08 -0.06 0.49 -0.68 -0.15 -0.28
-1.63 -0.49 -0.25 0.29 0.31 -0.35 0.2 0.55 0.07 0.12 0.2 -0.27 -1.93 -0.69 -0.46 -0.68 -0.56 0.55 0.04 -0.69 1.09 0.34 0.55 -0.19 0.54 -0.1
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-0.51 0.36 0.25 0.11 0.07 -0.12 -0.35 -0.52 -0.59 -0.45 -0.5 -0.45 -0.73 -0.2 0.6 -0.05 0.05 0.23 0.18 0.21 0.87 -0.72 0.34 0.04 0.1 0.28
-0.65 -0.22 -0.01 -0.36 -0.15 0.3 -0.33 -0.32 -0.47 -0.59 -0.63 -0.78 -0.86 0.56 0.29 1.19 -0.21 0.83 0.49 0.17 0.38 -0.28 -0.27 -0.71 0.12 0.05
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0.08 -0.14 -0.12 -0.14 -0.1 -0.19 0.13 -0.01 -0.27 -0.32 -0.55 -0.55 0.08 -0.05 0.1 0.3 0.2 0.77 0.29 0.12 0.24 -0.07 -0.11 -0.54 0.1 0.02
-0.31 -0.66 -0.56 -1.02 -1.3 -1.79 -2.11 -1.52 -0.88 -0.55 -0.17 -0.06 -0.4 -0.38 -0.05 1.85 -0.19 -0.53 -0.02 -0.51 1.66 -0.65 1.27 1.06 -0.75 -0.36
-0.63 -1.12 -1.46 -0.82 -0.56 -0.95 -0.61 -0.54 -0.39 -0.14 0.17 0.16 -0.29 0.71 0.26 0.5 0.39 0.1 -0.04 0.05 0.85 0.27 0.59 0.44 0.15 0.09
-0.69 -1.1 -0.73 -0.64 -0.82 -0.89 -0.58 -0.45 -0.53 -0.13 -0.11 0.01 -0.38 1.21 0.69 0.85 0.6 0.12 0.4 0.26 0.6 -0.84 -0.03 0.08 -0.08 -0.05
-2.88 -1.51 -1.19 -0.87 -0.22 -0.21 -0.19 -0.88 -0.84 -1.25 -1.71 -2.01 -3.57 -0.1 0.45 0.19 0.65 1.21 1.15 0.37 1.57 0.64 0.69 0.35 -0.76 -0.12
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-2.54 -2.14 -1.5 -0.48 -0.01 0.15 0.57 -0.04 0.5 0.18 -0.08 -0.54 -2.77 0.08 0.08 0.51 0.16 0.7 0.16 -0.11 0.67 0.49 -0.03 -0.02 0.59 -0.2
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-2.1 -1.43 -1.28 -1.06 -1.03 -0.35 -0.64 -0.53 -0.39 -0.36 -0.76 -1.04 -2.89 0.13 0.62 0.85 0.73 1.2 0.82 0.14 1.05 -1.19 0.66 0.2 0.07 0.67
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.