Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.28 -0.32 0.06 0.25 0.08 -0.46 0.39 0.64 0.34 0.61 0.26 -0.22 -0.49 -0.51 -1.27 -0.49 0.18 0.05 -0.08 0.32 -6.08 -1.72 -0.28 -1.26 1.39 0.64
0.33 -0.56 -0.85 -1.18 -2.58 -2.04 -0.18 0.26 0.11 1.01 1.05 1.06 1.05 -1.07 -1.44 -0.96 0.23 0.06 -0.7 -0.52 -2.67 -1.64 -0.45 -0.42 1.64 0.39
-2.95 -0.71 -0.24 0.15 0.25 0.09 0.62 0.44 0.57 0.66 0.71 0.52 -2.59 -0.16 -1.08 -0.72 0.08 0.02 -0.07 -0.23 -5.18 -1.43 -1.47 0.27 1.43 0.42
-0.78 0.0 0.38 0.75 0.24 -0.17 0.57 0.86 0.03 0.08 0.0 -0.15 -0.78 -0.09 -0.7 -0.02 -0.79 0.02 -0.3 -0.1 -4.46 -1.72 0.29 -1.41 0.98 0.78
0.68 0.45 0.12 0.39 0.35 -0.18 -0.43 -0.14 -0.55 -0.36 0.04 0.09 0.18 -0.62 -1.26 -0.58 -1.11 -0.3 -0.23 -1.65 -3.65 -0.03 0.13 0.15 1.64 0.64
0.65 -1.66 -2.72 -1.28 -1.12 -0.49 -0.44 -2.21 -1.48 -0.67 -1.01 -0.4 0.63 0.62 0.75 1.01 1.12 0.74 0.59 -0.2 -1.07 - -0.32 1.19 0.69 0.05
-0.05 -0.13 -0.3 -0.07 0.03 -0.28 0.32 0.66 -0.04 0.39 0.45 0.05 0.11 -0.56 -0.9 -1.03 0.31 -0.06 -0.42 -0.65 -2.91 -0.51 -0.49 -0.82 1.52 0.72
-0.26 -0.68 -0.78 -0.38 -0.06 0.05 0.15 0.31 0.2 0.47 0.65 0.4 0.21 -0.54 -0.77 -0.08 -0.08 -0.37 -0.66 -0.92 -0.22 -0.23 0.43 0.08 1.08 -0.1
0.12 -1.55 -0.73 -0.69 -0.84 -0.98 -0.95 -0.46 -0.94 -0.54 0.16 0.17 0.06 0.86 0.41 0.2 0.29 0.47 -0.09 -0.04 -0.42 -2.22 -0.05 1.01 1.01 0.83
0.24 0.27 0.35 0.82 0.24 -0.7 -0.14 0.36 -0.5 0.25 0.77 0.77 0.72 -0.52 -1.72 -0.83 -0.02 -1.19 -1.5 -1.1 -3.08 -1.64 -0.35 -0.02 1.19 0.41
0.75 0.2 -0.79 -0.05 -0.57 -0.9 -0.15 0.12 -0.36 0.43 0.52 0.52 0.86 -0.65 -0.63 -0.88 -0.23 0.49 -0.13 -0.3 -3.37 -0.22 -0.05 -0.33 1.09 -0.04
0.27 0.74 0.21 0.2 -0.21 -0.48 0.21 0.63 0.05 0.36 0.62 0.65 -0.4 -0.53 -2.07 -0.79 -0.18 -0.34 -0.99 -0.71 -1.8 -0.26 -0.66 -0.66 1.17 0.48
-1.28 -1.17 -1.25 0.03 0.24 -0.62 0.93 1.16 0.09 0.37 0.36 -0.48 -0.23 -1.27 -1.6 -1.29 -1.58 -0.66 -1.04 -0.58 -0.99 -0.19 -0.39 0.24 1.73 1.39
0.02 -0.06 0.05 0.38 0.31 -0.43 -0.17 -0.23 -0.21 -0.08 0.13 0.2 -0.34 0.45 -0.1 0.14 -0.36 -0.57 -0.31 -0.67 -2.52 -0.39 0.24 0.38 1.17 0.2
0.86 -0.16 -0.22 0.17 -0.74 -1.62 -0.34 0.21 -0.39 0.28 0.81 0.72 0.78 0.52 -1.02 -0.03 -0.54 -0.21 -0.37 -0.45 -3.33 -1.02 -1.54 -0.43 1.21 0.46
0.64 -0.45 -0.58 -0.06 -0.76 -1.09 -0.17 0.57 0.18 0.37 0.52 0.33 0.86 -0.04 -0.3 -0.36 -1.13 -0.27 -0.83 -0.83 -3.99 0.64 -2.63 -0.41 1.22 0.91
-0.01 -0.74 -0.23 0.24 -0.12 -0.41 0.05 0.4 0.39 0.6 0.76 0.44 -0.14 0.37 -1.01 -0.18 -1.17 -0.33 -0.74 -0.45 -2.96 0.48 -0.33 -0.25 0.61 0.71
-0.37 -0.76 -0.51 -0.05 -0.12 -0.09 0.13 0.13 -0.43 0.19 0.19 -0.07 -0.27 -0.56 -1.42 -0.93 -0.32 0.24 0.21 -0.31 -0.73 -0.93 -0.66 -0.3 1.69 1.48
0.07 -0.25 -0.17 0.63 0.34 -0.45 -0.12 0.04 -0.42 -0.35 -0.22 -0.44 -0.16 0.56 -0.82 -0.01 -0.8 -0.46 -0.31 -0.55 -1.52 -2.7 0.33 0.06 1.51 1.14
-0.4 -1.11 -2.12 -0.31 0.28 -0.12 0.63 0.14 1.14 0.39 0.75 0.14 -0.32 0.62 -0.16 0.2 -0.2 -1.2 -0.64 -1.02 -0.66 -1.07 0.41 -0.38 0.68 0.04
0.35 -0.12 -0.37 0.13 0.18 -0.42 0.12 0.4 0.46 1.17 1.02 0.17 -0.01 -2.03 -2.3 -2.15 -0.83 0.18 -1.5 -0.53 -3.2 -0.38 -0.4 -0.04 1.39 0.3
0.84 0.08 -0.58 0.31 0.05 -0.62 0.12 0.06 0.13 0.56 0.49 0.69 0.75 -0.78 -1.5 -1.98 -0.55 0.37 -0.47 -1.05 -4.14 -1.89 -0.3 -0.99 1.49 0.43
0.47 0.32 0.18 0.78 0.98 0.33 0.5 0.78 0.01 0.24 0.72 0.47 1.24 -0.65 -2.43 -1.87 -1.7 -1.67 -2.34 -2.58 -1.48 -2.65 -2.43 -3.02 1.17 0.5
0.06 0.13 -0.06 0.28 -0.15 -0.31 0.07 0.31 0.17 0.27 0.59 0.33 0.38 0.0 -0.8 -0.19 -1.17 0.05 -0.27 -0.09 -2.28 -1.78 -0.49 0.24 0.81 0.53
-0.57 -0.87 -0.87 -0.79 -0.66 -0.11 0.74 0.82 0.29 0.41 0.3 -0.09 -0.02 -0.9 -0.98 -0.02 -1.35 -0.9 -1.42 -1.06 -0.24 0.31 0.26 0.42 1.26 1.08
-1.5 -0.41 -0.57 0.24 0.5 0.23 0.06 0.69 0.63 0.86 1.08 0.73 -2.73 -0.24 -1.47 -1.62 -1.47 -0.44 -0.67 -0.68 - 0.16 -1.09 0.02 1.58 0.05
0.01 -0.01 -0.51 0.08 -0.28 -0.67 0.3 0.53 -0.14 0.15 0.29 0.3 0.19 -0.19 -0.47 -0.62 -0.26 -0.29 -0.53 -1.06 -2.76 -0.25 -0.51 -0.09 1.63 0.76
0.7 -0.35 -0.05 0.45 -0.34 -0.88 -0.18 0.44 0.17 0.47 0.76 0.5 0.12 0.51 -0.51 0.11 -0.87 -0.52 -1.11 -1.13 -3.82 0.23 -2.16 -0.73 0.8 0.85
0.06 -0.45 -0.69 0.57 0.46 -0.48 0.66 0.72 0.54 0.96 1.17 0.83 0.0 -0.26 -1.76 -0.86 -1.57 -1.32 -2.19 -1.6 -4.79 -0.68 -0.03 -1.49 1.25 0.04
-0.09 0.07 0.11 0.53 0.0 -0.16 0.31 0.58 -0.07 0.01 0.05 0.11 -0.3 0.31 -0.43 -0.59 -0.58 -0.09 -0.53 -0.43 -4.38 -0.88 -0.22 -0.56 1.21 0.87
-0.02 -0.13 -0.34 0.45 0.43 -0.26 -0.27 -0.17 0.03 0.38 0.23 0.24 -0.24 -0.48 -2.23 -0.72 -0.67 -0.32 -0.64 -0.3 0.44 -2.61 -0.27 0.61 1.23 0.89
-0.66 -0.21 0.13 0.37 0.29 -0.06 -0.08 -0.21 -0.02 0.14 0.17 0.4 -0.17 0.39 -0.17 0.1 -0.36 -0.1 -0.64 -0.44 -1.51 0.19 0.02 0.08 0.61 0.34
0.27 -0.67 -0.33 0.2 -0.43 -0.56 0.32 0.73 0.28 -0.04 0.14 -0.38 -0.61 0.23 -1.32 0.17 -0.97 -0.65 -1.01 -0.81 -1.98 -0.91 0.72 -0.28 1.56 1.05
-0.25 -0.81 -0.91 0.03 0.37 -0.2 0.25 0.04 0.08 0.37 0.53 0.32 0.22 0.33 -0.74 0.06 -0.84 -0.38 -0.7 -1.12 -1.18 -0.26 0.88 0.18 0.89 0.06
-0.34 -0.57 -0.7 0.13 0.11 -0.68 -0.15 0.04 0.28 0.66 0.69 0.34 -0.17 -0.05 -0.52 -0.23 -0.38 -0.12 -0.35 -0.37 -2.5 0.68 0.34 -0.34 0.47 0.73
-0.33 -0.1 0.41 0.55 0.2 -0.41 -0.76 -0.4 -0.33 0.53 0.48 0.64 0.06 -0.04 -0.35 0.22 -1.2 -0.39 -0.81 -0.47 -1.8 -0.43 0.08 -0.12 0.81 0.86
-0.11 0.1 0.18 0.31 -0.08 -0.69 -0.1 0.38 -0.48 0.11 0.37 0.23 0.41 0.05 -1.05 0.2 -1.2 -0.41 -0.6 -0.08 -1.83 -2.82 -0.24 -0.28 1.3 1.16
-1.17 -0.32 -0.0 0.34 0.31 -1.65 -0.95 0.07 0.08 0.52 0.65 1.19 -0.06 -0.82 -1.61 -0.84 -0.75 -0.64 -0.73 -1.29 -1.58 -1.5 0.38 -0.98 2.02 0.87
-0.56 0.03 0.41 0.44 -0.55 -1.87 -0.14 0.5 -0.19 0.02 0.39 0.59 -0.04 -0.25 -0.57 -0.06 0.18 -0.02 -0.11 -0.4 -2.21 -1.34 -0.4 -0.63 1.38 0.83
-6.18 -2.84 -0.87 0.46 0.17 0.24 0.92 0.94 1.14 0.96 1.03 0.37 -4.11 0.56 -1.39 -0.13 -1.16 -0.33 -0.9 -1.23 -2.98 -2.44 -0.58 -0.98 1.49 -0.01
0.16 -0.07 -0.12 0.23 0.34 -0.28 0.31 0.4 0.29 0.42 0.74 0.67 0.66 -0.6 -0.99 -0.96 -0.92 0.0 -0.53 -0.62 -4.04 -0.42 -0.73 -0.78 1.06 0.22
0.03 -0.06 -0.1 0.43 0.33 -0.15 0.36 0.41 -0.13 0.24 0.65 0.77 0.79 -0.08 -1.68 -0.12 -0.71 -0.68 -1.55 -1.16 -0.8 -0.72 -0.43 -0.69 0.97 0.21
0.22 0.16 0.15 0.62 0.38 -0.14 0.41 0.61 -0.11 0.27 0.45 0.36 0.62 -1.81 -1.76 -0.82 0.07 -0.44 -1.13 -0.89 -2.3 -0.49 -0.73 -1.23 1.54 -0.13
0.64 -0.56 -2.53 -1.18 -0.27 0.48 0.2 0.44 -0.14 0.47 0.21 0.66 0.56 -0.08 -0.93 0.44 -0.61 -0.57 -0.48 -0.49 -2.14 -1.08 0.65 0.89 0.29 -0.01
0.33 -0.21 -0.33 0.26 0.08 -0.68 0.01 0.26 0.03 0.26 0.37 -0.07 -0.07 -0.23 -1.63 -0.36 -0.64 -0.29 -0.97 -0.42 -0.14 -1.27 0.25 -0.7 1.44 1.05
-1.1 -0.44 -0.04 0.69 0.74 0.82 1.13 1.38 0.33 -0.52 -0.86 -1.31 -1.47 -0.7 -0.6 -1.12 -1.49 -0.99 -1.24 -0.71 -6.12 -0.59 -1.29 -1.5 1.67 1.3
-0.35 -1.25 -1.17 -0.55 -0.13 0.56 1.33 1.51 0.92 0.5 0.08 -0.65 -0.01 -1.55 -2.34 -0.51 -1.53 -1.6 -1.8 -0.58 -3.95 -0.41 -0.33 -1.44 1.58 1.06
-0.54 -0.66 -0.5 0.47 0.25 -0.4 -0.72 0.0 0.21 0.34 1.06 0.66 -0.14 -0.18 -0.25 -0.07 -0.82 -1.08 -1.35 -0.83 -1.38 -1.59 0.93 0.16 1.27 0.28
-0.66 -0.08 -0.55 0.31 0.3 -0.18 0.24 0.29 0.58 0.62 0.77 0.73 0.37 0.26 -0.59 -0.27 -1.39 -1.72 -1.03 -0.91 -1.16 -1.49 0.39 -0.33 0.74 0.37
0.53 -0.23 -0.65 -0.46 -0.41 -0.44 -0.24 -0.05 -0.01 0.16 0.46 0.38 0.6 -0.12 0.23 -0.01 -0.44 0.98 -0.49 -0.24 -1.08 -1.45 -0.02 -0.23 0.84 -0.12
0.33 -0.1 -1.3 -0.62 -1.08 -2.57 -1.0 -0.12 -0.5 -0.54 0.41 -0.01 0.11 0.96 0.26 0.45 -0.65 -0.43 0.45 -0.04 0.15 -0.85 0.4 1.09 0.32 0.41
0.29 0.04 -0.65 -0.64 -1.36 -0.69 -0.56 -0.06 -0.61 0.06 0.45 0.34 0.85 0.56 -0.49 -0.01 -1.45 0.54 -0.07 -0.43 -0.03 -1.07 0.25 0.86 0.51 0.15
-0.45 -0.39 -0.2 0.35 0.04 -0.11 0.48 0.71 0.26 0.35 0.63 0.4 -0.19 0.16 -0.67 -0.14 -0.12 -0.81 -1.08 -0.79 -4.9 -0.29 -1.15 -0.73 1.24 0.76
0.45 -0.06 0.34 0.45 -0.38 -0.97 -0.07 0.62 -0.1 0.08 0.4 0.67 0.48 0.77 -1.12 -0.72 -0.92 -0.78 -0.91 -0.67 -3.65 -0.0 -1.14 -1.16 1.25 0.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.