Heatmap: Cluster_149 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.03 0.39 0.58 0.76 0.79 0.65 0.6 0.63 1.0 0.87 0.85 0.57 0.01 0.41 0.42 0.37 0.52 0.78 0.6 0.75 0.04 0.86 0.37 0.71 0.75 0.57
0.31 0.23 0.31 0.35 0.53 1.0 0.8 0.58 0.63 0.39 0.35 0.32 0.27 0.24 0.23 0.4 0.16 0.26 0.26 0.25 0.04 0.88 0.16 0.11 0.4 0.28
0.47 0.64 0.6 0.62 0.65 0.86 0.75 0.76 0.81 0.6 0.51 0.54 0.38 0.48 0.68 1.0 0.73 0.92 0.8 0.6 0.1 0.54 0.31 0.34 0.46 0.41
0.2 0.38 0.49 0.49 0.66 0.93 0.98 0.83 0.94 0.65 0.61 0.55 0.16 0.33 0.54 0.7 0.7 1.0 0.8 0.79 0.1 0.79 0.32 0.49 0.83 0.49
0.36 0.58 0.54 0.85 0.88 0.71 0.81 0.9 0.94 0.88 1.0 0.93 0.36 0.33 0.34 0.35 0.37 0.77 0.59 0.53 0.31 0.85 0.87 0.56 0.75 0.62
0.4 0.53 0.63 0.59 0.78 0.79 0.88 0.92 0.79 0.74 0.72 0.57 0.4 0.97 0.45 0.94 0.49 0.81 1.0 0.83 0.04 0.79 0.26 0.24 0.46 0.37
0.32 0.32 0.5 0.53 0.54 0.44 0.75 0.71 0.53 0.66 0.56 0.5 0.29 1.0 0.44 0.96 0.5 0.93 0.97 0.75 0.03 0.54 0.22 0.24 0.5 0.38
0.23 0.64 0.51 0.68 0.77 0.73 0.77 0.72 0.84 0.84 0.94 0.63 0.17 0.33 0.42 0.34 0.49 0.81 0.67 0.59 0.05 1.0 0.75 0.78 0.77 0.51
0.48 0.39 0.35 0.6 0.73 0.56 0.69 0.82 1.0 0.65 0.85 0.65 0.34 0.28 0.25 0.3 0.24 0.72 0.32 0.33 0.15 0.79 0.86 0.45 0.86 0.47
0.19 0.41 0.58 0.62 0.76 0.96 0.95 0.88 0.95 0.89 0.73 0.66 0.23 0.66 0.93 0.86 0.63 1.0 0.8 0.73 0.04 0.56 0.25 0.32 0.47 0.48
0.36 0.43 0.41 0.46 0.69 0.85 0.8 0.67 0.72 0.83 0.76 0.75 0.41 0.22 0.16 0.22 0.32 0.49 0.42 0.58 0.15 1.0 0.64 0.77 0.58 0.58
0.45 0.24 0.32 0.55 0.57 0.69 0.83 0.77 0.69 0.52 0.38 0.28 0.43 0.38 0.31 0.48 0.28 0.67 0.47 0.44 0.15 0.99 0.26 0.33 1.0 0.57
0.21 0.13 0.42 0.78 0.99 0.87 0.62 0.47 0.54 0.79 0.83 0.8 0.25 0.02 0.1 0.03 0.22 0.67 0.4 0.77 0.16 0.81 0.96 1.0 0.44 0.64
0.09 0.05 0.17 0.32 0.37 0.43 0.97 0.9 0.79 0.46 0.19 0.09 0.05 0.1 0.23 0.22 0.32 0.53 0.48 0.43 0.25 1.0 0.11 0.06 0.76 0.36
0.43 0.71 0.65 0.85 0.94 0.88 0.84 0.88 0.87 0.75 0.76 0.59 0.34 0.34 0.46 0.46 0.53 1.0 0.75 0.65 0.17 0.97 0.98 0.62 0.78 0.51
0.77 0.62 0.68 0.72 0.8 0.89 0.78 0.78 0.79 0.75 0.78 0.85 0.85 0.43 0.42 0.5 0.48 0.55 0.5 0.54 0.19 0.94 0.73 1.0 0.81 0.64
0.42 0.5 0.56 0.66 0.79 1.0 0.91 0.7 0.68 0.53 0.48 0.5 0.42 0.62 0.56 0.77 0.6 0.69 0.69 0.62 0.23 0.47 0.48 0.38 0.55 0.61
0.39 0.41 0.46 0.56 0.66 1.0 0.59 0.63 0.59 0.35 0.46 0.39 0.33 0.25 0.27 0.33 0.23 0.42 0.48 0.33 0.06 0.7 0.24 0.29 0.26 0.35
0.07 0.11 0.18 0.23 0.5 1.0 0.56 0.35 0.38 0.31 0.24 0.17 0.07 0.21 0.22 0.16 0.19 0.23 0.24 0.26 0.16 0.82 0.29 0.12 0.22 0.24
0.41 0.59 0.58 0.62 0.72 0.94 0.93 0.83 1.0 0.86 0.62 0.57 0.34 0.53 0.47 0.63 0.64 0.97 0.82 0.71 0.07 0.49 0.42 0.43 0.63 0.58
0.05 0.42 0.34 0.54 0.71 0.54 0.68 0.68 0.59 0.48 0.53 0.4 0.05 0.27 0.45 0.38 0.43 1.0 0.83 0.52 0.02 0.28 0.38 0.75 0.58 0.53
0.45 0.41 0.39 0.6 0.85 0.97 1.0 0.96 0.9 0.78 0.6 0.5 0.43 0.61 0.57 0.76 0.51 0.71 0.7 0.66 0.09 0.92 0.38 0.43 0.81 0.58
0.23 0.27 0.31 0.53 0.58 0.77 0.69 0.67 0.58 0.59 0.48 0.4 0.25 0.37 0.31 0.33 0.24 0.53 0.48 0.62 0.02 1.0 0.39 0.36 0.97 0.59
0.2 0.29 0.37 0.49 0.63 0.72 1.0 0.73 0.79 0.51 0.36 0.29 0.17 0.25 0.32 0.4 0.44 0.92 0.64 0.38 0.1 0.42 0.36 0.4 0.42 0.35
0.45 0.47 0.47 0.72 0.79 0.71 0.68 0.73 0.61 0.57 0.51 0.41 0.34 0.39 0.46 0.67 0.62 0.76 0.78 0.68 0.04 0.86 1.0 0.57 0.84 0.62
0.43 0.47 0.51 0.49 0.52 0.71 1.0 0.82 0.84 0.59 0.53 0.4 0.45 0.55 0.45 0.67 0.39 0.85 0.56 0.52 0.1 0.35 0.19 0.15 0.4 0.26
0.28 0.62 0.49 0.62 0.73 0.64 0.58 0.52 0.69 0.75 0.87 0.76 0.38 0.23 0.35 0.31 0.32 0.5 0.45 0.41 0.03 1.0 0.57 0.59 0.55 0.49
0.47 0.65 0.67 0.72 0.85 1.0 0.86 0.87 0.97 0.86 0.76 0.72 0.44 0.75 0.74 0.7 0.7 0.85 0.86 0.77 0.23 0.44 0.47 0.51 0.44 0.66
0.06 0.36 0.4 0.46 0.48 0.69 0.72 0.64 0.57 0.65 0.61 0.51 0.09 0.43 0.47 0.6 0.39 1.0 0.81 0.5 0.05 0.39 0.31 0.55 0.48 0.4
0.23 0.5 0.6 0.59 0.82 0.97 0.57 0.54 1.0 0.78 0.75 0.68 0.2 0.72 0.47 0.95 0.55 0.73 0.88 0.73 0.08 0.84 0.22 0.39 0.58 0.5
0.01 0.23 0.34 0.52 0.52 0.54 0.53 0.46 0.5 0.43 0.45 0.31 0.03 0.27 0.45 0.34 0.4 1.0 0.62 0.51 0.08 0.46 0.38 0.49 0.84 0.34
0.37 0.43 0.47 0.57 0.65 0.7 0.67 0.72 0.66 0.78 0.67 0.61 0.43 0.75 0.62 0.71 0.77 1.0 0.87 0.58 0.1 0.7 0.27 0.44 0.71 0.53
0.5 0.59 0.67 0.85 0.98 1.0 0.89 0.82 0.94 0.99 0.93 0.88 0.54 0.32 0.3 0.42 0.45 0.78 0.66 0.6 0.19 0.93 0.85 0.83 0.62 0.74
0.34 0.21 0.31 0.51 0.59 0.74 1.0 0.94 0.69 0.45 0.28 0.21 0.35 0.25 0.29 0.41 0.38 0.4 0.43 0.43 0.05 0.89 0.12 0.09 0.47 0.3
0.17 0.28 0.29 0.54 0.62 0.66 0.68 0.73 0.53 0.66 0.44 0.35 0.16 0.49 0.42 0.53 0.27 0.94 0.42 0.39 0.18 1.0 0.12 0.29 0.53 0.66
0.39 0.39 0.38 0.46 0.63 0.72 0.66 0.57 0.6 0.57 0.51 0.41 0.37 0.43 0.41 0.49 0.42 0.54 0.51 0.51 0.06 1.0 0.48 0.62 0.73 0.53
0.34 0.53 0.63 0.7 0.87 0.97 1.0 0.83 0.9 0.95 0.79 0.61 0.43 0.75 0.53 0.85 0.79 0.74 0.8 0.75 0.02 0.8 0.22 0.33 0.76 0.62
0.25 0.2 0.22 0.4 0.53 0.56 0.75 0.78 0.61 0.57 0.4 0.27 0.28 0.26 0.28 0.55 0.24 0.4 0.38 0.39 0.07 1.0 0.04 0.23 0.41 0.44
0.12 0.27 0.45 0.6 0.8 1.0 0.87 0.76 0.73 0.64 0.53 0.35 0.15 0.5 0.46 0.69 0.53 0.79 0.62 0.57 0.1 1.0 0.3 0.39 0.65 0.56
0.41 0.35 0.35 0.51 0.59 0.72 0.78 0.75 0.85 0.91 0.6 0.5 0.41 0.41 0.32 1.0 0.54 0.89 0.67 0.63 0.04 0.97 0.46 0.56 0.77 0.57
0.04 0.09 0.2 0.45 0.64 0.8 0.47 0.29 0.19 0.26 0.25 0.17 0.04 0.14 0.08 0.17 0.11 0.09 0.18 0.26 0.02 1.0 0.03 0.1 0.19 0.19
0.02 0.12 0.2 0.35 0.59 0.55 0.4 0.24 0.18 0.27 0.19 0.12 0.03 0.19 0.13 0.17 0.12 0.18 0.16 0.31 0.03 1.0 0.04 0.09 0.38 0.31
0.17 0.46 0.52 0.66 0.73 0.77 0.71 0.68 0.85 0.73 0.59 0.5 0.16 0.35 0.34 0.26 0.37 0.83 0.5 0.59 0.07 1.0 0.48 0.46 0.57 0.59
0.46 0.58 0.69 0.75 0.94 1.0 0.98 0.87 0.97 0.97 0.87 0.71 0.37 0.98 0.86 0.86 0.79 0.99 0.8 0.93 0.05 0.58 0.35 0.42 0.63 0.71
0.13 0.5 0.73 0.84 0.87 0.55 0.72 0.68 0.73 0.74 0.64 0.57 0.07 0.44 0.48 0.5 0.58 0.7 0.65 0.72 0.04 1.0 0.46 0.64 0.65 0.81
0.22 0.22 0.24 0.34 0.55 1.0 0.92 0.73 0.61 0.52 0.38 0.29 0.22 0.18 0.11 0.22 0.15 0.13 0.17 0.26 0.01 0.85 0.08 0.16 0.37 0.4
0.47 0.42 0.51 0.61 0.76 0.93 0.7 0.68 0.69 0.63 0.64 0.65 0.65 0.4 0.41 0.57 0.51 0.42 0.51 0.61 0.25 1.0 0.31 0.39 0.57 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)