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Heatmap: Cluster_149 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-4.4 -0.56 0.02 0.42 0.46 0.19 0.06 0.14 0.81 0.6 0.56 0.01 -5.88 -0.48 -0.44 -0.64 -0.13 0.45 0.07 0.38 -3.9 0.59 -0.63 0.31 0.39 0.0
-0.29 -0.69 -0.29 -0.11 0.5 1.42 1.09 0.63 0.74 0.05 -0.09 -0.22 -0.47 -0.66 -0.69 0.11 -1.19 -0.52 -0.54 -0.6 -3.3 1.23 -1.23 -1.72 0.11 -0.44
-0.36 0.11 0.01 0.05 0.12 0.52 0.32 0.35 0.43 -0.0 -0.24 -0.16 -0.66 -0.32 0.19 0.74 0.29 0.62 0.42 0.01 -2.58 -0.16 -0.94 -0.8 -0.39 -0.53
-1.58 -0.68 -0.3 -0.31 0.13 0.63 0.7 0.46 0.63 0.1 0.0 -0.15 -1.96 -0.88 -0.17 0.21 0.21 0.72 0.41 0.37 -2.67 0.39 -0.93 -0.29 0.45 -0.31
-0.87 -0.18 -0.28 0.39 0.43 0.12 0.32 0.47 0.52 0.44 0.61 0.51 -0.87 -0.98 -0.95 -0.88 -0.81 0.23 -0.15 -0.29 -1.07 0.38 0.42 -0.23 0.2 -0.07
-0.67 -0.26 0.01 -0.09 0.3 0.32 0.48 0.54 0.33 0.24 0.2 -0.14 -0.67 0.62 -0.48 0.57 -0.36 0.37 0.67 0.39 -4.1 0.33 -1.28 -1.41 -0.45 -0.77
-0.75 -0.78 -0.12 -0.02 -0.01 -0.31 0.47 0.4 -0.02 0.27 0.03 -0.11 -0.92 0.88 -0.29 0.83 -0.11 0.77 0.83 0.47 -4.1 -0.01 -1.29 -1.18 -0.12 -0.53
-1.4 0.06 -0.26 0.16 0.33 0.25 0.33 0.22 0.45 0.45 0.62 0.04 -1.9 -0.89 -0.55 -0.86 -0.34 0.4 0.12 -0.06 -3.74 0.7 0.29 0.35 0.33 -0.27
-0.18 -0.47 -0.64 0.14 0.43 0.03 0.34 0.59 0.88 0.26 0.65 0.26 -0.68 -0.93 -1.13 -0.84 -1.2 0.41 -0.75 -0.73 -1.9 0.53 0.66 -0.27 0.66 -0.2
-1.71 -0.63 -0.12 -0.03 0.25 0.59 0.58 0.47 0.58 0.48 0.2 0.05 -1.45 0.06 0.55 0.43 -0.02 0.65 0.33 0.19 -4.13 -0.19 -1.36 -1.01 -0.42 -0.41
-0.62 -0.36 -0.42 -0.26 0.32 0.63 0.54 0.29 0.38 0.6 0.48 0.44 -0.42 -1.33 -1.75 -1.35 -0.76 -0.15 -0.4 0.08 -1.85 0.87 0.22 0.49 0.09 0.09
-0.17 -1.04 -0.67 0.12 0.17 0.47 0.72 0.62 0.45 0.05 -0.42 -0.83 -0.21 -0.41 -0.69 -0.06 -0.82 0.42 -0.09 -0.2 -1.72 0.98 -0.94 -0.6 1.0 0.18
-1.38 -2.01 -0.34 0.54 0.89 0.7 0.22 -0.18 0.02 0.56 0.64 0.57 -1.1 -4.71 -2.47 -4.08 -1.29 0.31 -0.41 0.52 -1.77 0.59 0.85 0.9 -0.27 0.26
-2.11 -2.77 -1.15 -0.23 -0.01 0.2 1.37 1.27 1.08 0.29 -0.95 -2.02 -2.92 -1.92 -0.71 -0.74 -0.23 0.5 0.35 0.2 -0.59 1.42 -1.81 -2.56 1.03 -0.07
-0.66 0.06 -0.06 0.32 0.47 0.37 0.3 0.37 0.35 0.13 0.15 -0.21 -1.0 -1.01 -0.55 -0.57 -0.37 0.55 0.13 -0.06 -2.01 0.52 0.52 -0.14 0.21 -0.41
0.16 -0.14 -0.01 0.08 0.23 0.38 0.19 0.2 0.22 0.13 0.2 0.31 0.32 -0.67 -0.72 -0.45 -0.52 -0.31 -0.44 -0.34 -1.87 0.46 0.08 0.55 0.24 -0.11
-0.49 -0.23 -0.09 0.15 0.41 0.75 0.61 0.23 0.19 -0.16 -0.32 -0.25 -0.5 0.07 -0.08 0.38 0.03 0.22 0.22 0.07 -1.37 -0.33 -0.31 -0.65 -0.1 0.03
-0.14 -0.04 0.1 0.39 0.64 1.24 0.48 0.58 0.49 -0.26 0.1 -0.14 -0.35 -0.78 -0.66 -0.38 -0.86 -0.02 0.18 -0.35 -2.81 0.71 -0.83 -0.53 -0.69 -0.28
-2.11 -1.46 -0.69 -0.3 0.79 1.79 0.96 0.27 0.39 0.1 -0.25 -0.76 -2.11 -0.46 -0.4 -0.82 -0.63 -0.33 -0.25 -0.16 -0.81 1.51 -0.02 -1.31 -0.41 -0.3
-0.6 -0.1 -0.12 -0.03 0.19 0.57 0.56 0.39 0.67 0.45 -0.03 -0.13 -0.88 -0.26 -0.44 0.0 0.02 0.62 0.37 0.16 -3.12 -0.38 -0.58 -0.56 0.01 -0.12
-3.14 -0.18 -0.51 0.18 0.58 0.18 0.52 0.5 0.3 -0.0 0.14 -0.27 -3.37 -0.8 -0.09 -0.32 -0.14 1.06 0.79 0.13 -4.73 -0.75 -0.33 0.65 0.28 0.13
-0.5 -0.65 -0.73 -0.08 0.41 0.61 0.65 0.58 0.5 0.29 -0.08 -0.36 -0.55 -0.07 -0.17 0.25 -0.31 0.15 0.14 0.06 -2.77 0.53 -0.73 -0.57 0.35 -0.13
-1.1 -0.84 -0.62 0.12 0.26 0.67 0.51 0.47 0.27 0.29 -0.01 -0.29 -0.92 -0.38 -0.64 -0.53 -0.98 0.13 -0.02 0.36 -4.63 1.05 -0.3 -0.44 1.01 0.28
-1.24 -0.65 -0.32 0.09 0.46 0.65 1.12 0.67 0.78 0.16 -0.35 -0.64 -1.42 -0.9 -0.53 -0.2 -0.08 1.0 0.48 -0.28 -2.19 -0.14 -0.34 -0.19 -0.13 -0.39
-0.42 -0.36 -0.35 0.24 0.38 0.24 0.17 0.27 0.01 -0.09 -0.25 -0.57 -0.84 -0.62 -0.41 0.13 0.03 0.33 0.36 0.17 -3.77 0.51 0.72 -0.09 0.47 0.04
-0.26 -0.11 0.01 -0.04 0.03 0.48 0.98 0.69 0.72 0.21 0.06 -0.33 -0.19 0.11 -0.17 0.4 -0.37 0.75 0.15 0.04 -2.34 -0.54 -1.4 -1.76 -0.35 -0.97
-0.93 0.24 -0.12 0.24 0.48 0.29 0.13 -0.03 0.39 0.51 0.72 0.53 -0.47 -1.2 -0.58 -0.78 -0.72 -0.08 -0.24 -0.38 -4.04 0.92 0.1 0.17 0.05 -0.12
-0.57 -0.08 -0.05 0.07 0.3 0.53 0.31 0.33 0.49 0.31 0.14 0.05 -0.66 0.13 0.09 0.02 0.02 0.3 0.32 0.17 -1.58 -0.65 -0.57 -0.44 -0.65 -0.06
-3.06 -0.41 -0.27 -0.08 -0.03 0.5 0.56 0.41 0.24 0.42 0.34 0.08 -2.44 -0.18 -0.03 0.31 -0.32 1.04 0.73 0.04 -3.24 -0.31 -0.67 0.18 -0.02 -0.27
-1.39 -0.29 -0.04 -0.05 0.42 0.67 -0.1 -0.19 0.71 0.35 0.29 0.15 -1.62 0.25 -0.38 0.64 -0.14 0.26 0.53 0.26 -2.93 0.46 -1.45 -0.63 -0.08 -0.29
-4.95 -0.91 -0.32 0.28 0.3 0.35 0.31 0.12 0.24 0.03 0.09 -0.46 -3.95 -0.63 0.07 -0.34 -0.08 1.23 0.55 0.26 -2.5 0.11 -0.17 0.2 0.99 -0.31
-0.7 -0.49 -0.38 -0.09 0.11 0.21 0.14 0.24 0.12 0.36 0.14 0.01 -0.51 0.3 0.04 0.22 0.35 0.72 0.52 -0.07 -2.66 0.21 -1.17 -0.46 0.23 -0.19
-0.5 -0.25 -0.07 0.28 0.48 0.51 0.34 0.22 0.42 0.49 0.41 0.33 -0.37 -1.13 -1.23 -0.73 -0.65 0.15 -0.1 -0.23 -1.92 0.41 0.27 0.24 -0.19 0.08
-0.35 -1.03 -0.45 0.26 0.47 0.79 1.22 1.13 0.68 0.07 -0.62 -1.03 -0.3 -0.77 -0.55 -0.06 -0.16 -0.11 -0.0 -0.01 -3.23 1.06 -1.83 -2.18 0.15 -0.51
-1.5 -0.77 -0.71 0.18 0.4 0.48 0.52 0.62 0.17 0.47 -0.12 -0.43 -1.53 0.03 -0.18 0.15 -0.8 0.99 -0.18 -0.29 -1.43 1.07 -1.95 -0.72 0.15 0.48
-0.4 -0.4 -0.44 -0.16 0.29 0.49 0.36 0.14 0.23 0.13 -0.03 -0.32 -0.48 -0.25 -0.31 -0.07 -0.29 0.07 -0.02 -0.03 -3.17 0.96 -0.09 0.27 0.5 0.03
-0.98 -0.36 -0.09 0.06 0.37 0.53 0.57 0.3 0.42 0.49 0.22 -0.15 -0.66 0.16 -0.34 0.34 0.23 0.14 0.25 0.16 -4.81 0.25 -1.59 -1.02 0.17 -0.12
-0.68 -1.04 -0.9 0.0 0.4 0.46 0.88 0.94 0.59 0.48 -0.02 -0.58 -0.51 -0.64 -0.51 0.46 -0.73 -0.0 -0.09 -0.05 -2.5 1.31 -3.29 -0.79 0.0 0.12
-2.16 -1.01 -0.3 0.1 0.52 0.85 0.65 0.45 0.39 0.2 -0.06 -0.64 -1.89 -0.15 -0.26 0.31 -0.08 0.51 0.16 0.03 -2.45 0.85 -0.88 -0.5 0.22 0.01
-0.54 -0.76 -0.79 -0.23 -0.03 0.27 0.38 0.32 0.5 0.6 0.01 -0.26 -0.54 -0.53 -0.89 0.74 -0.15 0.57 0.16 0.08 -3.82 0.69 -0.39 -0.09 0.36 -0.07
-2.59 -1.42 -0.33 0.84 1.37 1.68 0.92 0.25 -0.38 0.08 0.02 -0.56 -2.54 -0.88 -1.67 -0.54 -1.15 -1.44 -0.43 0.09 -3.48 2.01 -3.16 -1.35 -0.35 -0.42
-3.57 -1.08 -0.29 0.51 1.27 1.16 0.69 -0.04 -0.41 0.14 -0.33 -1.08 -2.92 -0.35 -0.97 -0.49 -1.08 -0.44 -0.6 0.35 -2.94 2.03 -2.68 -1.51 0.64 0.35
-1.67 -0.23 -0.05 0.31 0.45 0.52 0.4 0.34 0.66 0.45 0.15 -0.09 -1.77 -0.63 -0.66 -1.06 -0.52 0.63 -0.1 0.15 -3.04 0.9 -0.17 -0.23 0.1 0.14
-0.66 -0.33 -0.09 0.03 0.36 0.44 0.41 0.25 0.41 0.4 0.23 -0.05 -0.98 0.41 0.23 0.23 0.11 0.43 0.13 0.33 -4.03 -0.35 -1.08 -0.81 -0.22 -0.05
-2.23 -0.24 0.3 0.5 0.55 -0.1 0.29 0.2 0.3 0.33 0.1 -0.05 -3.17 -0.45 -0.31 -0.26 -0.03 0.24 0.13 0.27 -3.78 0.75 -0.38 0.12 0.12 0.44
-0.71 -0.7 -0.61 -0.07 0.61 1.48 1.36 1.02 0.76 0.55 0.1 -0.3 -0.72 -1.02 -1.68 -0.71 -1.27 -1.46 -1.11 -0.46 -6.12 1.25 -2.18 -1.14 0.06 0.16
-0.28 -0.43 -0.15 0.1 0.42 0.7 0.31 0.25 0.28 0.15 0.17 0.19 0.18 -0.5 -0.47 -0.01 -0.14 -0.42 -0.16 0.11 -1.2 0.81 -0.89 -0.55 0.01 -0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.