Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000017.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.36	-	1.96	-	-	-	-	-	-	-	1.49	-	-	2.49	1.76	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000025.42	3.64	-	-	-	3.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000076.146	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000117.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000133.28	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000158.39	2.78	1.23	-	-	-	1.66	-	1.67	1.77	-	-	-	2.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000180.16	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000190.30	3.26	-	-	-	-	-	-	-	-	4.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000203.1	3.38	-	-	-	-	-	-	2.14	-	1.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.92	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000217.5	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000262.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000325.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000342.70	1.19	1.22	0.06	-	-	0.31	0.07	1.08	0.1	1.99	-	0.17	1.45	-	-	0.04	-	0.31	0.7	-	-	0.66	-	-	-	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000367.4	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000381.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000396.14	-	-	-	2.46	-	1.81	-	0.68	-	3.29	-	-	-	-	0.54	-	-	-	-	2.06	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000396.35	1.07	0.58	0.99	0.11	0.95	0.6	-0.02	1.45	0.2	1.25	-0.51	-0.38	-0.3	-	-0.56	-1.58	-1.5	-0.8	-0.11	-	-	-	1.23	-0.18	-	-1.97
Cpa\|evm.model.tig00000402.59	1.68	-0.61	-1.26	0.17	-0.44	-0.59	-1.49	0.67	1.23	1.61	0.9	-1.4	-1.1	-	1.42	-	-1.26	-0.83	-0.57	-0.58	-2.48	-0.82	0.3	0.27	-1.14	-1.03
Cpa\|evm.model.tig00000405.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000431.9	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000471.5	-	1.2	0.23	-0.04	-	-	1.82	1.12	1.09	1.49	-	-	-0.1	1.35	-0.25	-	0.24	-	-	-	-	-	-	1.61	-	1.23
Cpa\|evm.model.tig00000473.28	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000681.23	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000764.9	-	-1.6	1.44	-	0.69	-	-3.04	-3.47	-3.5	3.82	-	-3.4	-	1.09	-	-	-3.29	-4.03	-	-0.65	-	-3.89	-	-	-	1.93
Cpa\|evm.model.tig00000788.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000940.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001033.7	1.07	-	-	-	0.27	-	-	-	-	2.88	1.9	-	-	-	1.29	-	-	1.29	-	-	1.56	-	-	0.98	-	0.84
Cpa\|evm.model.tig00001128.4	4.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001355.14	3.58	-	-	1.65	2.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.56	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00001706.5	-0.86	-3.57	-2.59	-0.62	-2.08	-	-1.98	-0.52	-2.04	2.99	-0.56	-2.62	-2.52	-	-2.88	-2.57	-3.51	-0.11	-2.75	-2.93	-1.16	1.68	1.18	0.22	2.3	-0.91
Cpa\|evm.model.tig00020510.141	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020510.39	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020562.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020567.20	1.67	-	-	-	-	0.55	0.55	-	-	3.53	1.47	0.63	0.43	-	-	-	0.77	-	-	-	-	-	-	-	-0.08	-
Cpa\|evm.model.tig00020592.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.18	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020610.3	-	-0.02	0.84	-0.08	-0.45	-	1.09	-	-	1.76	-0.19	-	-0.26	0.48	-	-0.17	-	1.81	0.49	-0.24	-	-	1.47	0.74	-0.83	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020629.52	2.1	1.85	2.1	0.59	1.06	-1.06	-	1.96	-0.95	-	0.44	-	0.34	-	0.84	-	-0.84	-	-	-1.4	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020660.4	3.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020660.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.12	-	-	-	-	3.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020693.13	1.67	-	1.53	-	-	-	-	-	-	3.03	-	-	-	1.88	-	-	-	-	-	-	-	-	0.87	-	0.92	2.11
Cpa\|evm.model.tig00020704.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020754.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.51	-	1.87	-	-	-	-	-	-	-	3.79	-	2.39	-	-	-	-	-	1.7	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020824.49	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020829.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020851.25	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020851.3	-	-	-	-	-	-	-	3.19	-	3.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.92	-	-	1.92	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020876.3	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020911.22	-	-	-	-	-	-	2.86	2.74	-	2.63	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.55
Cpa\|evm.model.tig00020920.1	-	-	-	-	-	2.29	-	-	-	1.96	-	2.15	-	-	-	-	-	1.3	-	-	1.06	-	-	-	1.37	2.5
Cpa\|evm.model.tig00020927.75	3.0	-	1.1	-	-	-	1.3	1.12	1.23	-	-	-	-	-	1.01	0.99	-	-	-	0.72	-	-	-	-	-	1.68
Cpa\|evm.model.tig00020936.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020943.99	-0.83	-	-	-0.89	0.26	-	-0.76	-	1.87	2.7	0.01	-	-	0.15	-	0.34	-0.73	-0.63	-1.32	-1.05	-	-0.04	1.08	-1.07	1.95	-
Cpa\|evm.model.tig00020952.25	2.18	0.62	1.55	-	0.48	1.11	1.49	-	-0.58	1.32	-	0.52	2.36	-0.74	-	-	-	-	-	-	-1.51	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021013.18	-	-	-	-	0.44	-	-	1.21	0.38	3.34	0.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.13	-	-	-0.13	1.85	-0.43	1.83
Cpa\|evm.model.tig00021036.69	-	-	-	-	-4.12	-	-	-	-	3.72	-	-	3.59	-	-2.49	-3.85	-	-	-	-	-3.18	-4.08	-	-1.64	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021038.51	-	-	-	1.99	-	-	-	1.13	-	2.83	0.92	2.01	1.31	-	-	-	-	-	-	-	0.93	-	-	-	0.24	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021046.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021072.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.11	-	-	-	-	-	-	-	-	3.12	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021073.69	1.96	-	-	-	-	-	-	-	-	4.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021105.68	4.56	-	-	-	-	-	-	-	1.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021108.83	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021123.20	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021128.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021137.57	3.79	-	-	3.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021137.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021168.37	2.42	1.79	0.29	-	-1.48	-1.37	-1.17	-	-1.25	2.34	-	0.3	-	-1.03	-	-1.4	-1.15	1.35	-1.39	-	-	-	-	-	1.01	0.85
Cpa\|evm.model.tig00021178.4	-	-0.32	-0.48	-0.46	-1.29	-1.58	-	0.8	1.33	1.6	0.8	0.61	0.73	-0.84	-0.73	0.5	-	-2.07	0.24	-	-0.87	-0.24	-0.46	-1.58	0.67	1.47
Cpa\|evm.model.tig00021181.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021247.10	3.78	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021348.14	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021428.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021494.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021572.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021586.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021684.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.