Heatmap: Cluster_142 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.66 0.13 -0.21 -0.02 0.16 0.36 0.41 0.54 0.65 0.38 0.25 0.15 0.63 -0.62 -0.78 -0.7 -0.73 -0.4 -0.91 -0.75 -2.82 -0.93 0.41 -0.09 0.22 0.19
0.18 -0.24 -0.23 0.09 0.28 0.03 0.16 0.32 0.31 0.33 0.5 0.52 0.49 -0.16 -0.54 -0.72 -0.93 -0.11 -0.27 -0.92 -2.13 -0.13 0.59 0.42 -0.14 -0.2
0.46 -0.23 -0.22 -0.07 -0.07 -0.15 0.41 0.5 0.25 0.01 -0.13 -0.26 0.31 -0.53 0.24 -0.17 0.15 0.46 0.18 0.41 -3.33 -1.05 0.1 -0.04 -0.15 -0.09
0.35 0.15 -0.06 -0.22 -0.06 -0.3 0.04 0.02 -0.2 0.02 -0.02 0.06 0.14 -0.64 0.22 0.17 0.04 0.61 0.64 0.02 -3.23 -1.47 0.65 -0.09 -0.03 -0.07
0.6 0.34 0.47 0.47 0.43 0.31 0.37 0.33 0.13 0.06 0.0 0.02 0.47 -0.89 -0.75 -0.57 -0.33 -0.51 -0.4 -0.16 -2.97 0.2 0.24 -0.51 -0.11 -0.5
0.43 0.75 0.21 0.21 0.26 0.44 0.41 0.26 0.2 -0.05 -0.26 -0.31 0.09 -0.68 -0.7 -0.74 -0.32 0.33 0.06 0.1 -2.67 -0.24 0.84 -0.78 -0.47 -0.59
0.81 0.54 0.07 0.25 -0.07 0.34 0.23 0.4 0.24 -0.3 -0.31 -0.17 0.53 -0.55 -0.34 -0.59 -0.57 0.11 -0.04 -0.52 -2.22 -0.27 0.53 -0.66 0.07 -0.03
0.42 0.19 0.25 0.31 0.16 0.2 0.15 0.27 0.07 -0.11 -0.06 0.18 0.2 -0.64 -0.24 -0.38 -0.32 -0.34 -0.13 0.12 -0.36 -1.18 0.19 0.47 -0.47 -0.01
0.63 0.33 0.03 -0.04 0.06 0.21 0.1 0.13 0.1 0.24 0.35 0.54 0.54 -1.25 -1.16 -1.25 -0.32 -0.8 -0.83 -0.15 -1.26 -0.22 0.78 0.35 0.21 -0.23
1.09 0.58 -0.15 -0.02 0.06 0.3 0.66 0.66 0.06 0.19 0.51 0.32 0.73 -2.51 -1.76 -2.38 -0.73 -0.56 -0.71 -0.51 -2.03 -1.24 0.83 -0.1 0.43 -0.87
0.52 0.39 0.09 0.09 0.03 0.16 0.37 0.5 0.08 -0.17 -0.31 -0.35 0.31 -0.57 -0.45 0.2 -0.53 0.3 -0.05 -0.2 -2.2 0.22 0.06 -0.8 0.41 -0.22
0.47 0.57 0.53 0.27 0.26 -0.15 -0.21 -0.09 -0.14 -0.12 -0.06 0.31 0.29 -0.31 -0.26 -0.55 -0.65 0.64 0.47 -0.24 -3.21 -0.68 -0.13 0.08 -0.05 -0.15
0.61 0.38 0.1 0.01 -0.0 0.2 0.21 0.25 0.2 -0.1 -0.12 0.07 0.25 -0.35 -0.49 -0.4 -0.23 -0.41 0.15 0.04 -2.38 -0.26 0.58 -0.16 -0.24 0.12
0.3 0.36 0.32 0.36 -0.23 -0.39 0.08 0.25 0.22 0.07 0.09 0.17 0.36 -0.93 -0.62 -0.9 -0.37 0.15 0.47 -0.12 -2.37 -1.31 0.88 -0.16 0.29 -0.06
0.7 0.26 0.07 0.05 -0.03 -0.02 0.3 0.37 0.2 0.16 0.26 0.23 0.73 -0.91 -0.84 -0.99 -0.67 -0.02 -0.4 -0.39 -1.11 -1.08 0.73 -0.33 0.42 -0.24
0.33 0.46 0.38 0.44 0.22 -0.04 -0.16 0.04 -0.35 -0.46 -0.2 0.2 0.32 -0.48 -0.33 -0.24 -0.24 -0.2 -0.09 -0.19 -2.9 -0.36 0.09 0.55 0.44 0.25
0.24 -0.75 -1.22 0.06 0.01 -0.09 0.23 -0.06 0.13 0.06 0.57 0.5 0.02 -0.08 -0.13 0.32 -0.48 0.19 -0.44 -0.88 -2.1 -0.74 0.48 0.7 0.37 0.31
1.01 0.89 0.25 -0.4 -0.41 -0.2 0.15 0.27 0.2 0.39 0.37 0.34 0.77 -0.59 -1.22 -0.91 -0.35 -0.15 -0.25 0.01 -3.45 -1.27 0.63 -0.32 -0.15 -0.75
1.34 0.11 -0.98 -0.66 -0.42 0.0 0.49 0.61 0.06 -0.05 -0.04 0.24 1.18 -1.12 -1.07 -1.28 -0.41 0.08 -0.15 -0.19 -2.83 -1.86 1.13 -0.52 0.19 -0.41
0.86 0.25 0.22 0.23 -0.12 -0.26 0.22 0.55 -0.06 -0.15 -0.18 -0.46 0.72 -1.06 -0.95 -1.16 -1.09 0.09 -0.07 -0.47 -1.64 -2.37 0.93 -0.48 0.86 0.62
0.84 0.99 0.25 -0.31 -0.34 0.21 0.45 0.55 0.33 0.06 -0.11 -0.16 0.62 -0.72 -0.24 -1.09 -0.09 -0.21 -0.17 -0.09 -2.37 -0.75 0.46 -0.71 -0.11 -0.9
0.01 0.05 0.06 -0.08 0.49 0.38 0.01 -0.26 -0.05 0.16 0.54 0.76 0.36 0.02 -0.86 -1.16 -1.03 -0.93 -0.35 -0.82 -1.25 0.39 0.97 0.07 -0.48 0.11
1.14 -0.66 -1.86 -2.13 -1.18 -0.62 0.43 0.27 0.76 0.87 0.76 0.86 1.36 -0.89 -0.82 -0.64 -0.72 0.08 -0.22 -0.7 -0.84 -1.27 0.4 0.06 -0.43 -1.17
-1.82 -2.65 -0.86 0.36 1.34 1.27 0.85 1.02 1.31 0.83 0.76 0.67 -1.77 -1.08 -1.76 -1.6 -1.38 -1.31 -0.13 -0.37 -2.78 -3.85 0.91 -1.05 -2.24 -0.37
0.41 0.08 0.14 0.38 0.42 0.17 0.5 0.56 0.24 0.11 0.01 -0.07 0.39 -0.53 -0.63 -0.17 -0.44 -0.16 -0.16 -0.39 -2.72 -0.27 0.6 -0.68 -0.0 -0.51
0.31 0.05 -0.13 0.0 0.38 0.52 0.14 0.06 0.04 0.11 0.11 0.22 0.21 -0.29 -0.26 -0.37 -0.33 0.05 0.01 -0.08 -3.0 0.19 0.37 -0.28 -0.07 -0.15
0.15 -0.21 0.18 0.45 0.45 0.66 0.62 0.41 0.33 0.21 -0.0 0.1 0.24 -0.56 -0.83 -0.53 -0.87 -0.13 -0.3 -0.57 -2.14 -0.77 0.02 -0.22 0.52 0.07
1.13 -0.8 -2.07 -1.65 -0.97 -0.14 0.33 0.56 0.05 0.23 0.64 0.62 0.95 -0.71 -1.38 -1.22 -0.63 -0.09 -0.34 -0.69 -0.67 -0.39 1.15 0.36 0.3 -0.43
1.07 0.76 -0.07 0.41 0.32 0.39 0.53 0.78 0.55 0.28 0.11 -0.24 0.15 -1.62 -0.85 -1.6 -0.76 -0.44 -0.28 -0.15 -3.8 -1.24 0.14 -1.66 0.51 -0.16
-0.37 0.34 0.12 -0.16 -0.12 0.37 0.29 0.31 -0.08 0.19 0.09 0.38 0.12 -0.33 -0.1 -0.21 -0.2 -0.27 -0.17 -0.22 -2.54 -1.07 0.34 0.37 0.63 -0.03
0.52 0.59 0.68 0.3 -0.04 -0.02 -0.08 0.09 0.35 0.3 0.45 0.57 0.43 -1.64 -1.25 -1.34 -0.2 -0.56 -0.31 0.24 -0.44 -1.12 0.69 -0.12 -0.73 -0.87
0.5 0.23 0.13 0.12 0.18 0.33 0.45 0.47 0.33 0.19 0.04 -0.02 0.39 -0.4 -0.4 -0.5 -0.27 -0.15 -0.39 -0.19 -2.51 -0.39 -0.24 -0.13 0.27 -0.22
0.78 0.71 0.54 0.47 -0.15 -0.36 0.02 0.31 -0.09 -0.27 -0.19 -0.26 0.38 -0.8 -0.61 -0.75 -0.77 -0.04 -0.32 -0.15 -1.09 -1.35 0.42 -0.12 0.55 0.52
0.73 -0.03 -0.45 -0.55 -0.21 0.13 0.44 0.52 0.53 0.26 0.36 0.29 0.27 -0.59 -0.58 -0.68 -0.21 -0.36 0.02 -0.19 -2.89 -1.03 0.67 -0.03 0.2 0.01
0.38 -0.08 -0.31 0.31 0.23 0.45 0.58 0.64 0.03 0.18 0.31 0.7 0.41 -0.92 -0.82 -0.26 -0.75 -0.01 -0.62 -0.87 -3.21 -1.32 -0.35 0.09 0.6 0.23
0.73 0.2 -0.37 -0.56 -0.22 0.11 0.31 0.3 0.14 0.35 0.32 0.31 0.75 -0.24 -0.64 -0.58 -0.06 -0.05 0.05 -0.21 -2.91 -2.51 0.74 -0.09 -0.17 0.01
0.82 0.4 0.46 0.41 0.21 0.11 0.3 0.27 0.12 -0.12 0.41 0.49 0.16 -0.64 -0.48 -0.72 -0.95 -0.23 -0.14 -0.36 -3.96 -1.12 0.12 -0.58 0.36 0.14
0.43 0.09 0.15 0.68 0.7 0.72 0.2 0.75 0.34 0.5 0.52 0.36 -0.69 -0.37 -1.05 -1.39 -1.66 -0.86 -0.46 -0.9 -3.07 -2.43 0.72 -0.54 0.55 -0.17
0.61 0.06 -0.67 -0.84 -0.53 -0.43 0.2 0.03 -0.2 -0.24 -0.2 -0.14 0.51 -0.0 0.12 0.13 0.13 0.8 0.5 -0.48 -2.29 -0.06 0.52 -0.02 -0.0 -0.01
0.49 0.63 0.57 0.29 0.0 0.32 0.12 0.22 0.28 0.06 0.11 0.34 0.23 -0.71 -0.62 -0.73 -0.57 -0.72 -0.37 -0.29 -0.88 -0.33 0.75 -0.67 -0.16 -0.33
0.28 -0.21 -0.42 0.07 0.36 0.1 0.22 0.19 0.0 -0.07 0.09 -0.22 0.22 -0.68 -0.35 -0.36 -0.52 0.25 0.14 -0.29 -1.14 0.03 0.66 0.07 0.36 0.05
0.97 0.4 -0.01 0.41 0.11 0.11 0.6 0.81 0.26 -0.06 0.01 -0.17 0.84 -1.36 -0.91 -1.08 -0.74 -0.22 -0.37 -0.34 -4.17 -1.07 -0.21 -0.1 0.29 0.22
0.62 -0.23 -0.42 0.18 0.33 0.15 0.28 0.39 0.24 -0.04 0.01 -0.11 0.43 -0.22 -0.53 -0.09 -0.69 -0.16 -0.2 -0.77 -2.78 -0.39 0.31 0.69 0.33 -0.12
0.62 0.96 0.72 0.62 0.06 -0.88 -0.9 -0.56 -0.06 0.12 0.35 0.28 0.4 -0.29 -0.6 -0.35 -0.41 -0.46 -0.06 -0.12 -2.48 -1.72 0.25 -0.27 0.11 0.56
0.44 0.42 -0.0 0.47 0.11 0.13 0.33 0.26 0.3 -0.03 0.08 0.26 0.36 -0.86 -0.59 -1.14 -1.22 0.26 0.0 -0.55 -2.84 -0.91 0.68 -0.21 0.43 0.09
0.43 -0.06 -0.16 0.13 0.18 0.24 0.29 0.39 0.29 -0.01 0.23 0.22 0.51 -0.65 -0.31 -0.45 -0.96 0.12 -0.13 -0.64 -1.57 0.01 0.5 -0.04 -0.08 -0.17
1.22 0.72 -0.04 0.03 -0.26 -0.25 0.14 0.54 -0.14 -0.11 -0.04 -0.21 0.5 -2.46 -1.27 -2.41 -0.55 0.16 0.19 -0.16 -1.87 -0.88 0.86 0.53 0.22 -0.23
0.56 0.18 0.03 0.01 0.04 -0.2 -0.2 0.01 -0.15 -0.18 0.05 0.18 0.57 -0.33 -0.09 -0.22 -0.5 0.3 0.11 -0.35 -2.91 -0.44 0.52 -0.13 0.38 0.28
0.52 0.45 0.16 0.19 0.04 0.35 0.49 0.46 0.11 -0.19 -0.25 -0.31 0.16 -0.36 -0.61 -0.55 -0.39 -0.08 -0.07 -0.36 -2.52 0.01 0.23 -0.38 0.45 0.12
-0.56 0.36 0.2 0.71 0.5 0.34 0.33 0.16 0.05 0.29 0.26 0.35 -0.64 -0.62 -0.17 -1.3 -0.4 0.31 0.28 -0.11 -2.14 -0.33 -0.14 -0.53 0.12 0.05
0.83 0.17 0.26 0.51 0.61 0.69 0.75 0.69 0.15 -0.17 0.08 -0.21 0.23 -1.2 -1.18 -1.51 -1.0 -0.15 -0.26 -0.56 -4.66 -0.85 -0.3 -0.04 0.4 0.14
1.1 -0.7 -1.76 -1.52 -0.47 0.18 0.48 0.43 0.78 0.42 0.42 0.31 0.92 -0.36 -0.46 -0.89 -0.62 0.07 -0.25 -0.67 -1.29 -1.33 0.79 -0.4 0.57 -1.07
0.2 -0.06 0.03 0.12 0.2 -0.01 -0.04 0.02 -0.06 0.23 0.31 0.5 0.41 -0.43 -0.45 -0.28 -0.29 -0.43 -0.37 -0.33 -0.75 -0.15 0.54 0.44 -0.15 -0.14
0.25 0.34 0.36 0.41 0.13 0.36 0.4 0.47 -0.04 -0.25 -0.18 -0.35 0.07 -0.79 -0.83 -0.81 -0.64 0.11 -0.16 -0.38 -0.76 -0.66 0.7 -0.22 0.24 0.43
-0.07 0.11 0.43 0.53 0.31 0.31 0.14 0.29 0.29 0.01 0.22 0.17 -0.59 -0.15 -0.85 -0.54 -0.03 0.01 -0.51 -0.02 -1.59 -0.92 0.68 -0.65 -0.1 0.43
0.41 0.25 -0.02 -0.04 0.12 0.46 0.18 0.33 0.55 0.22 0.2 0.13 0.35 -0.42 -0.4 -0.56 -0.6 -0.2 -0.39 -0.47 -0.11 -1.26 1.14 -0.36 -0.85 -1.18
1.55 0.54 -0.86 -1.64 -0.54 0.47 0.8 0.75 0.56 -0.15 0.15 0.85 0.55 0.07 -1.03 -1.07 -0.74 -1.09 -0.61 -0.78 -3.54 -3.74 -0.17 0.06 -0.17 0.27
0.49 0.17 -0.27 -0.36 -0.24 0.14 0.2 0.15 0.07 0.16 0.2 0.49 0.3 0.09 -0.46 -0.06 -0.15 -0.33 0.15 -0.28 -1.3 -1.29 0.42 0.07 0.19 -0.0
0.76 0.4 0.3 0.29 -0.01 0.31 0.05 0.15 0.1 -0.2 0.01 -0.0 0.41 -0.54 -0.39 -0.32 -0.31 -0.59 -0.37 -0.15 -2.27 -0.08 0.33 0.24 0.08 -0.24
0.08 1.01 0.34 0.42 0.13 0.24 0.17 0.32 0.24 -0.02 -0.04 0.05 -0.08 -0.59 -0.7 -0.49 -0.31 0.44 0.15 -0.57 -2.63 -0.53 0.18 -0.28 -0.08 -0.19
1.15 0.38 0.03 -0.05 -0.02 -0.19 0.29 0.35 -0.02 -0.08 0.14 0.15 1.02 -0.78 -0.63 -0.76 -0.55 0.07 -0.42 -0.5 -4.48 -1.08 0.25 -0.56 0.5 0.22
-0.39 0.06 0.23 0.12 0.25 0.46 0.29 0.2 0.41 0.47 0.53 0.44 -0.27 -1.66 -1.17 -1.61 -0.12 -0.21 -0.06 0.32 -0.23 -0.43 0.6 0.3 -0.51 -0.9
-1.02 -0.58 0.15 0.51 0.88 0.89 0.4 0.17 0.65 0.62 0.36 0.67 -0.56 -2.15 -2.34 -1.85 -1.32 0.02 0.26 -0.0 -0.62 0.1 0.89 -0.99 -0.81 -0.85
0.56 0.38 -0.13 0.4 0.38 0.04 0.07 0.66 0.04 0.13 0.49 0.94 0.79 -1.45 -1.53 -1.38 -1.71 -0.11 -0.8 -1.46 -0.93 -0.36 0.93 -0.75 0.15 -0.56
0.36 0.39 0.25 0.19 0.16 -0.14 0.3 0.41 0.2 0.13 0.25 0.19 0.46 -0.33 -0.4 -0.17 -0.53 0.0 -0.27 -0.39 -1.55 -0.18 0.33 -0.36 -0.26 -0.47
0.86 -0.83 -1.06 -0.47 -0.24 -0.01 0.55 0.59 0.36 0.38 0.46 0.29 0.94 -0.6 -1.15 -1.87 -0.5 -0.53 -0.25 -0.23 -2.59 -0.74 0.72 0.41 0.35 0.04
1.41 0.5 0.13 0.23 -0.29 -0.54 -0.09 0.33 -0.52 -0.07 -0.12 -0.11 0.92 -1.67 -0.97 -1.66 -0.76 0.12 0.01 -0.37 -3.56 -0.64 0.5 -0.35 0.76 0.44
0.67 0.5 0.53 0.46 0.25 0.2 -0.0 0.16 -0.13 -0.17 -0.05 0.35 0.42 -1.11 -1.02 -1.1 -0.87 -0.46 -0.43 -0.44 -0.82 -1.33 0.69 0.29 0.43 0.02
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0.35 0.38 0.15 0.17 -0.11 0.25 0.16 0.18 0.1 -0.02 0.04 0.43 -0.14 -0.22 -0.38 -0.34 -0.06 -0.35 -0.27 0.04 -2.14 -0.12 0.42 0.27 -0.12 -0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.