Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.42 -0.22 0.03 0.07 0.05 -0.43 0.24 0.13 0.07 0.33 0.26 -0.1 -1.56 0.35 0.44 0.51 0.24 0.42 0.71 0.51 -6.55 -0.08 -0.82 0.09 -0.29 -0.28
-0.58 -0.3 -0.43 -0.49 -0.58 -0.95 -0.07 -0.06 0.15 0.56 0.49 0.34 -0.48 0.59 0.0 -0.32 0.3 0.53 0.53 0.3 -2.83 0.23 -1.76 0.17 0.25 0.49
-0.48 -0.03 0.02 0.36 0.17 0.04 0.17 0.04 0.12 0.25 0.11 -0.12 -0.33 -0.48 0.25 0.14 0.2 0.49 0.56 0.14 -1.57 0.1 -0.41 -0.8 -0.09 -0.26
-1.63 -0.44 -0.62 -0.66 -0.27 -0.54 0.18 0.39 0.65 0.82 0.87 0.53 -1.24 0.11 -0.59 0.37 -0.02 0.58 0.07 0.23 -2.3 0.54 -1.55 -0.26 0.08 0.06
-1.39 -0.58 -0.93 -0.56 -0.23 -0.26 0.09 0.07 0.5 0.66 0.45 0.07 -1.53 0.17 -0.23 0.11 0.07 0.25 0.47 0.34 -2.06 0.77 -1.29 0.22 0.52 0.35
0.1 -0.06 -0.09 -0.08 0.05 0.13 0.34 0.33 0.39 0.53 0.51 0.41 0.19 -1.34 -0.68 -1.72 -0.21 -0.07 -0.29 0.09 -2.73 0.02 -0.36 0.17 0.28 0.55
-0.46 0.38 -0.04 -0.1 -0.39 -0.45 0.02 0.02 0.31 0.29 0.2 -0.08 -0.6 0.11 -0.2 0.03 -0.13 0.36 0.31 0.18 -2.72 0.93 -0.86 -0.0 0.26 -0.04
0.01 -0.22 -0.18 0.18 0.06 -0.47 0.08 0.16 0.42 0.38 0.52 0.43 -0.41 -1.51 -0.94 -1.54 -0.65 -0.22 -0.07 -0.33 -3.79 -0.07 -0.26 0.0 1.2 1.26
-0.27 0.09 0.02 0.24 0.07 -0.38 0.33 0.33 0.27 0.59 0.57 0.58 -0.48 -0.94 -0.45 -0.9 -0.02 -0.2 -0.13 0.31 -5.44 -0.39 -1.03 -0.15 0.47 0.84
0.12 -0.51 -0.35 -0.3 -0.35 -0.46 -0.13 0.03 -0.0 0.44 0.52 0.45 0.13 -0.43 -0.91 -2.17 -0.19 -0.32 0.06 -0.04 -3.3 -0.16 -0.05 1.0 0.71 1.1
-0.3 0.05 -0.01 -0.01 0.04 -0.01 0.34 0.24 0.36 0.37 0.42 0.29 -0.32 -0.79 -0.68 -1.08 -0.27 0.05 0.07 0.11 -4.89 -0.14 -0.11 0.17 0.56 0.71
-0.53 0.03 -0.16 -0.07 -0.0 -0.27 0.33 0.46 0.64 0.9 0.69 0.45 -0.21 0.2 -0.37 -0.72 0.14 0.11 -0.11 0.19 -3.2 -0.52 -0.78 -0.64 -0.09 -0.06
-0.75 -0.19 0.03 0.05 0.11 -0.14 -0.0 0.09 -0.02 0.23 0.14 0.08 -0.68 0.2 -0.0 0.48 0.06 0.54 0.56 0.47 -2.18 -0.67 -0.54 0.19 -0.21 0.08
-0.28 -1.1 -0.94 -0.36 0.14 0.08 0.2 -0.1 -0.06 0.33 0.56 0.61 -0.0 0.21 -0.39 0.35 0.05 0.44 0.51 -0.1 -4.06 -0.19 -1.42 0.33 0.27 0.31
0.02 0.09 0.15 -0.08 -0.05 0.05 0.16 -0.11 0.27 0.28 0.08 0.02 -0.03 0.05 -0.1 0.04 -0.37 0.01 0.01 -0.15 -3.41 1.07 -0.78 0.05 0.0 -0.21
-1.73 -0.49 0.06 0.22 0.16 -0.19 0.41 0.15 0.58 0.68 0.47 0.4 -1.3 0.04 -0.12 -0.23 -0.29 0.29 -0.04 0.27 -2.05 -0.11 -0.1 0.45 -0.38 -0.18
-0.35 -0.05 0.06 0.19 0.13 -0.2 0.35 0.35 0.58 0.46 0.57 0.68 -0.83 0.25 0.07 0.19 -0.05 0.27 0.2 -0.19 -4.43 -2.33 -0.19 -0.45 -0.67 -0.06
-0.14 -0.3 -0.29 -0.06 0.03 -0.41 0.08 0.08 0.14 0.52 0.57 0.45 -0.08 -0.95 -0.67 -1.6 -0.18 -0.15 -0.29 -0.24 -4.17 0.61 -0.2 0.67 0.75 0.7
0.26 0.0 -0.06 -0.07 -0.09 -0.33 0.06 0.03 0.14 0.55 0.49 0.42 0.1 -0.82 -0.74 -1.66 -0.48 -0.07 -0.34 -0.13 -1.64 0.61 -0.13 0.27 0.45 0.61
-0.11 -0.08 0.04 0.2 0.22 0.09 0.41 0.46 0.36 0.72 0.69 0.52 -0.32 -2.0 -1.43 -2.86 -0.69 -0.42 -0.29 -0.33 -4.95 -0.09 -0.25 0.28 0.81 0.79
-1.04 -1.14 -0.7 -0.54 -0.82 -0.77 -0.32 -0.09 -0.13 0.41 0.58 0.7 -0.65 -0.71 -0.41 -2.0 0.21 0.58 -0.11 0.35 -1.62 1.26 -1.77 0.45 0.91 1.09
0.05 -0.18 -0.43 0.18 0.15 0.03 0.11 0.32 0.63 0.7 0.76 0.95 0.41 -1.26 -1.35 -1.56 -0.62 -0.14 -0.3 -0.4 -4.5 -0.35 -1.11 0.18 0.62 0.47
-0.37 -0.39 -0.11 0.09 -0.02 -0.45 -0.02 -0.01 0.08 0.53 0.47 0.28 -0.34 0.02 -0.02 -0.39 -0.4 -0.04 -0.33 0.03 -3.4 0.64 -1.07 0.15 0.61 0.86
0.2 0.17 0.13 0.15 0.21 0.18 0.21 0.23 0.26 0.35 0.38 0.3 0.16 -1.3 -0.66 -1.31 -0.18 0.17 -0.11 -0.25 -4.25 0.31 -0.88 0.19 0.36 0.4
-0.38 -0.19 -0.39 -0.5 -0.46 -0.6 -0.34 -0.34 0.13 0.46 0.6 0.58 -0.06 0.88 -0.06 -0.25 -0.09 0.29 0.3 -0.12 -1.18 -0.1 -1.62 0.57 0.06 0.37
0.12 -0.14 -0.26 -0.34 -0.21 -0.41 -0.04 -0.07 0.07 0.56 0.44 0.33 0.05 -1.12 -0.64 -0.53 0.1 0.04 -0.36 0.32 -3.32 0.53 -0.36 0.61 0.32 0.72
0.59 -0.2 -0.34 -0.42 -0.04 0.48 0.51 0.37 0.27 -0.12 -0.35 -0.18 0.72 -0.52 -0.31 -0.42 -0.39 0.17 0.03 -0.4 -3.43 0.89 -0.61 -0.34 0.37 -0.05
-0.15 -0.09 -0.45 -0.31 0.05 0.1 0.32 0.38 0.44 0.18 0.35 0.27 -0.07 -0.01 -0.59 -0.66 -0.25 0.41 0.12 -0.31 -2.0 -0.07 -1.13 -0.13 0.73 0.54
-1.21 -0.66 -0.23 0.06 -0.21 -0.19 0.38 0.36 0.38 1.12 0.95 0.48 -1.12 -0.58 -0.99 -1.22 -0.2 0.39 0.47 0.46 -6.08 0.29 -0.75 -0.77 0.68 -0.19
-1.76 -0.7 -0.37 0.24 -0.06 -0.47 0.6 0.47 0.32 1.12 0.91 0.54 -1.1 -0.12 -0.49 -0.5 0.53 0.49 0.39 0.98 -8.6 -0.77 -1.35 -1.03 -0.33 -0.75
-1.25 -0.85 -0.4 0.23 -0.44 -0.67 0.66 0.54 0.49 1.03 1.1 0.7 -1.33 -0.46 -0.99 -0.85 0.17 0.46 0.01 0.7 -6.62 0.08 -1.65 -0.14 0.05 -0.24
-0.18 -0.15 -0.78 -0.87 -0.72 -0.79 0.23 0.1 0.36 0.69 0.46 0.34 -0.2 0.53 -0.35 -0.48 0.15 0.58 0.28 0.23 -2.9 0.09 -0.35 -0.15 0.16 0.39
-2.92 -1.32 -0.61 -0.42 -0.05 0.05 0.27 0.15 0.42 0.69 0.73 0.7 -1.74 0.27 0.04 -0.38 0.37 0.28 -0.1 0.16 -1.23 0.22 -0.69 0.43 -0.09 0.21
-0.13 -0.31 -0.09 -0.05 0.26 0.22 0.5 0.4 0.34 0.5 0.45 0.37 -0.03 -0.35 -0.55 -0.45 -0.09 -0.05 -0.18 -0.07 -2.04 -0.33 -0.21 -0.21 0.1 0.23
0.08 -0.35 -0.23 0.33 0.28 -0.06 0.27 0.23 0.23 0.4 0.47 0.11 -0.09 -1.44 -1.11 -1.35 -0.17 0.11 0.0 -0.03 -1.81 0.35 -0.99 0.26 0.67 0.65
-0.4 -0.32 -0.23 -0.33 -0.49 -0.58 -0.14 -0.02 -0.09 0.23 0.48 0.36 -0.4 -1.53 -1.13 -1.94 -0.17 0.32 0.0 0.16 -1.55 0.96 0.24 0.42 0.66 1.19
-0.06 -0.01 0.08 0.04 0.12 0.03 0.27 0.39 0.45 0.67 0.67 0.46 0.03 -1.44 -0.8 -1.38 -0.5 -0.18 -0.34 -0.18 -5.15 0.76 -0.88 -0.25 0.49 0.36
0.11 -0.24 -0.18 -0.21 0.01 -0.07 -0.04 0.12 0.04 0.28 0.13 0.41 0.29 -0.09 -0.43 -0.41 -0.07 0.59 0.3 0.1 -2.84 0.31 -1.08 -0.94 0.55 0.48
-0.14 0.05 -0.33 -0.1 -0.06 -0.19 0.3 0.42 0.25 0.37 0.25 -0.15 -0.43 0.02 -0.13 -0.42 0.1 0.22 0.27 0.05 -2.08 0.03 -0.77 0.01 0.47 0.29
-0.39 -1.29 -0.3 0.71 -0.44 0.21 0.58 0.34 -0.04 0.66 0.23 0.64 -1.54 0.01 0.15 -0.77 -1.11 0.28 -0.09 -1.0 -1.9 -0.1 -0.52 -0.58 1.09 0.67
-0.0 -0.25 -0.02 -0.02 -0.08 -0.33 0.12 0.32 0.4 0.86 0.97 0.89 0.1 -2.12 -1.66 -3.41 -0.37 -0.55 -0.47 -0.13 -4.94 -0.16 -0.49 0.53 0.66 0.75
-0.1 0.09 -0.33 -0.3 -0.24 -0.33 0.01 0.22 0.44 0.31 0.22 -0.01 -0.23 0.37 -0.28 -0.44 -0.31 0.28 0.01 -0.33 -0.95 0.81 -1.01 -0.02 0.44 0.24
0.13 0.19 0.24 0.07 -0.34 -0.67 0.27 0.38 0.22 0.43 0.52 0.44 0.14 -0.36 -0.47 -0.36 -0.5 -0.14 0.01 -0.67 -3.32 0.93 -0.6 -0.37 0.41 -0.11
-0.85 -0.41 -0.09 0.56 -0.78 -0.36 -0.14 0.13 -0.23 0.24 0.81 0.7 -0.74 -1.05 -1.0 -1.96 -1.03 0.39 0.29 -1.32 -2.92 1.05 -0.16 0.19 1.24 0.71
-0.15 -0.14 -0.43 -0.41 -0.27 -0.62 0.18 0.24 0.34 0.46 0.3 0.12 -0.21 0.08 -0.25 -0.14 0.09 0.46 0.29 0.24 -2.69 0.49 -1.49 0.08 0.28 0.3
0.05 -0.4 -0.14 -0.21 -0.52 -0.06 0.47 0.45 0.49 0.46 0.5 0.3 -0.36 0.14 0.09 0.24 -0.0 0.04 0.24 0.17 -3.17 -1.92 0.25 -0.22 -0.27 -0.17
-0.06 -0.17 -0.17 -0.12 -0.09 -0.04 0.03 -0.01 -0.02 0.1 0.12 0.06 0.08 -0.33 0.16 0.07 0.28 0.27 0.39 0.26 -1.58 0.1 -0.49 -0.24 0.32 0.09
0.08 -0.11 -0.04 0.05 0.12 0.09 0.26 0.32 0.38 0.32 0.24 0.03 0.15 -0.72 -0.47 -0.93 -0.29 0.14 -0.08 -0.15 -4.15 0.69 -0.78 -0.4 0.7 0.39
0.15 0.12 0.14 0.36 0.33 0.22 0.35 0.19 0.35 0.59 0.58 0.44 0.13 -1.85 -1.31 -2.06 -0.51 0.02 -0.46 -0.1 -5.71 0.4 -1.06 0.05 0.6 0.26
-0.43 -0.43 -0.7 -0.77 -0.68 -0.71 -0.05 0.19 0.15 0.4 0.54 0.87 -0.4 -0.74 -1.03 -0.46 -0.11 -0.11 0.19 -0.16 -3.7 0.11 -0.12 0.48 1.21 1.0
-0.82 -0.15 -0.32 -0.17 0.04 -0.16 0.27 0.17 0.41 0.35 0.25 0.04 -0.87 0.03 -0.39 -0.3 -0.01 0.35 0.2 0.12 -1.67 0.65 -0.65 0.18 0.2 0.41
0.34 -0.16 -0.18 -0.64 -0.77 -1.47 -0.93 -0.46 -0.03 0.89 1.26 1.27 0.62 -1.31 -0.85 -0.97 -0.44 -0.66 -0.68 -0.91 -4.19 -0.94 -0.87 1.48 0.44 0.76
0.1 0.07 0.05 0.03 0.14 0.18 0.32 0.4 0.46 0.76 0.77 0.63 0.19 -1.1 -0.63 -1.42 -0.35 0.2 -0.31 0.1 -4.38 -0.44 -1.05 -0.13 0.13 -0.05
-0.74 -0.63 -0.72 -0.28 -0.19 -0.46 -0.05 0.18 0.41 0.51 0.6 0.5 -0.51 0.18 -0.13 -0.17 -0.01 0.11 -0.05 0.11 -2.53 0.51 -0.48 0.26 0.33 0.51
-0.56 0.01 0.1 0.13 0.04 -0.25 0.29 0.2 0.37 0.49 0.22 -0.01 -0.58 0.08 -0.17 0.17 0.15 0.6 0.57 0.74 -4.27 -0.21 -0.96 -0.94 -0.34 -0.31
0.16 0.1 0.09 0.3 0.3 0.05 0.36 0.36 0.38 0.49 0.38 0.16 0.1 -1.71 -0.94 -1.78 -0.18 0.15 0.04 0.06 -4.31 0.01 -1.04 -0.23 0.46 0.61
-0.49 -0.44 -0.11 -0.12 -0.01 -0.16 0.12 -0.12 -0.02 0.43 0.24 0.17 -0.32 -0.35 -0.25 -0.39 0.05 0.18 0.06 0.13 -3.78 0.85 -0.7 0.29 0.52 0.61
-0.11 -0.08 -0.16 -0.01 0.11 0.05 0.05 0.1 0.21 0.39 0.27 0.17 -0.1 -0.95 -0.62 -1.6 0.12 0.24 -0.05 0.19 -4.64 0.41 -0.7 0.06 0.61 0.9
-0.56 -0.44 -0.24 -0.05 0.12 0.08 0.49 0.43 0.32 0.5 0.3 0.01 -0.29 -0.15 -0.16 -0.34 0.13 0.14 -0.0 0.26 -3.85 0.34 -0.81 -0.73 0.44 0.42
0.06 -0.19 -0.03 -0.01 0.03 0.03 0.28 0.18 0.28 0.45 0.39 0.35 0.14 -0.08 -0.02 -0.0 -0.48 -0.19 -0.3 -0.14 -3.42 0.44 -1.14 0.01 0.15 0.25
-0.03 -0.38 -0.33 -0.44 -0.07 0.07 0.05 -0.21 -0.08 0.22 0.33 0.52 0.06 0.33 -0.01 0.19 -0.26 0.37 0.2 -0.08 -1.78 -0.14 -0.14 0.17 -0.19 0.32
-0.35 -0.61 -0.34 0.05 -0.49 -0.34 0.15 0.21 -0.02 0.57 0.18 0.32 -0.32 -0.22 -0.47 -0.45 0.3 0.2 -0.11 0.35 -2.11 -0.33 -0.34 -0.16 0.88 0.9
0.06 -0.34 -0.19 0.02 -0.14 -0.44 0.36 0.46 0.22 0.51 0.71 0.56 0.27 -0.58 -0.53 -0.73 -0.26 0.05 -0.12 0.06 -3.14 -0.07 -0.87 0.1 0.44 0.29
-0.71 0.01 0.04 -0.1 -0.11 -0.4 -0.06 -0.01 0.27 0.69 0.58 0.41 -0.83 -0.05 0.27 0.47 0.11 0.51 0.42 0.52 -2.88 -1.11 -0.45 -0.17 -0.68 -0.15
-0.04 -0.11 0.14 0.11 0.23 0.23 0.28 0.36 0.39 0.56 0.44 0.31 0.2 -0.56 -0.2 -0.95 -0.12 -0.17 -0.13 0.04 -2.8 -0.27 -0.34 -0.28 -0.05 0.24
-0.62 -0.43 0.02 -0.01 0.14 -0.08 0.38 0.41 0.52 0.49 0.52 0.34 -1.47 -0.03 0.15 0.08 0.4 0.18 0.2 0.24 -2.65 -0.94 0.03 -0.12 -0.51 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.