Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.37 0.07 -0.02 -0.33 -0.09 0.36 0.27 0.09 0.46 0.0 -0.13 -0.4 -0.82 -0.39 0.06 -0.82 -0.13 -0.03 0.42 0.17 -3.59 0.23 0.77 0.58 0.16 -0.01
0.1 0.36 0.05 0.18 -0.01 -0.68 -0.32 -0.29 -0.21 -0.35 -0.18 -0.16 -0.14 -0.51 -0.44 -0.24 -0.28 0.43 -0.21 -0.09 -1.17 0.47 1.11 0.35 0.58 -0.19
-0.47 -0.18 -0.47 -0.94 -1.06 -0.67 -0.22 -0.24 -0.23 -0.16 -0.18 -0.23 -0.69 -0.18 -0.16 -0.15 -0.45 0.35 0.31 -0.61 -1.63 0.52 1.3 0.89 1.17 0.39
-1.31 -0.5 -0.23 -0.1 0.21 0.2 -0.01 0.17 -0.26 -0.22 -0.1 -0.56 -1.49 -0.77 -0.55 -0.4 -0.46 0.89 -0.23 -0.09 -2.44 0.52 1.67 0.71 0.26 -0.04
0.68 -0.52 -2.03 -0.0 0.53 0.24 -0.02 0.13 -1.4 -1.53 -0.75 -1.36 -0.49 -0.37 -2.2 -1.07 -0.15 0.56 0.49 -0.18 -2.7 -0.2 2.01 0.18 0.56 0.63
0.72 -0.01 -0.3 -0.04 0.45 0.24 0.49 0.37 0.01 0.02 0.03 0.16 0.73 -1.54 -1.08 -1.58 -0.62 -0.05 -0.33 -0.04 -3.0 -0.32 1.3 -0.25 -0.0 -0.41
0.13 0.54 0.19 -0.04 -0.68 -0.92 -0.49 -0.09 -0.18 -0.61 -0.71 -0.48 -0.21 -0.6 -0.36 -0.35 -0.23 0.53 0.46 -0.11 -1.18 0.36 1.18 0.04 0.74 0.38
0.36 -0.25 -0.26 -0.31 -0.03 -0.09 -0.17 -0.11 -0.23 -0.33 -0.14 0.16 0.17 0.13 -0.01 -0.23 -0.15 0.3 0.26 -0.2 -0.8 -0.82 1.03 0.35 0.04 0.11
0.06 0.37 -0.25 0.09 -0.05 -0.35 -0.36 -0.12 0.1 -0.08 0.03 -0.27 0.37 -0.7 -0.11 -0.27 -0.58 0.48 -0.2 -0.92 -2.42 0.85 0.77 -0.7 0.83 0.29
0.55 -0.03 0.11 0.26 0.35 0.44 0.21 0.3 -0.1 -0.22 -0.46 -0.09 0.67 -0.9 -1.15 -0.77 -0.52 -0.22 -0.56 -0.57 -1.05 -0.39 1.34 -0.37 0.49 -0.33
0.53 0.21 -0.22 -0.18 -0.17 -0.04 0.19 0.24 -0.01 -0.24 -0.21 -0.08 0.22 -0.89 -0.72 -0.83 -0.07 0.22 0.28 -0.08 -2.69 -0.73 1.06 0.7 0.24 0.06
0.53 -0.36 -1.48 -1.92 -1.61 -1.14 -0.35 0.3 0.19 0.26 0.36 -0.29 0.31 -1.05 -0.67 -0.94 -0.86 0.76 -0.04 -0.7 -3.06 -0.45 1.38 1.33 0.88 0.5
0.75 -1.14 -1.82 -1.53 -1.09 -0.33 0.34 0.59 0.48 0.69 0.66 0.51 0.53 -0.74 -0.46 -0.7 -0.7 -0.01 -0.16 -0.38 -2.44 -1.22 1.46 0.5 0.02 -0.49
-1.05 0.5 0.09 0.12 0.43 0.72 0.29 -0.26 -0.57 -1.03 -1.04 -0.81 -1.36 0.22 0.16 -0.27 0.11 0.32 0.76 0.15 -2.55 -0.07 0.11 -0.01 -0.15 0.96
0.08 -0.32 -0.5 0.31 0.29 0.5 0.23 0.55 0.11 -0.57 -0.01 -0.23 -0.49 -0.93 -0.62 -1.4 -0.58 0.27 0.08 -0.38 -3.4 -0.25 0.77 0.62 0.87 0.44
0.22 -1.37 -2.42 -2.17 -0.91 -0.12 0.54 0.45 0.59 0.35 0.2 -0.08 0.18 -0.51 -0.14 -0.81 -0.29 0.14 0.23 -0.4 -2.2 -0.56 1.39 0.91 0.52 -0.17
0.04 0.21 -0.13 -0.03 -0.08 0.21 0.55 0.65 0.4 0.01 0.19 0.17 -0.25 -0.72 -1.09 -0.83 -0.65 -0.18 -0.1 -0.63 -3.05 0.15 0.84 0.3 0.49 -0.06
-0.15 0.07 -0.56 -0.33 -0.0 0.07 -0.03 -0.13 -0.25 -0.22 -0.33 -0.18 -0.7 0.19 0.09 -0.12 -0.23 0.19 0.36 -0.29 -2.21 0.38 0.99 0.41 0.19 0.53
0.09 0.19 0.08 0.15 0.07 0.43 0.05 -0.0 -0.16 -0.57 -0.49 -0.49 -0.33 -0.39 -0.07 -0.31 -0.28 0.09 0.4 -0.09 -1.69 -0.18 0.58 0.61 0.44 0.22
0.06 0.21 -0.56 -0.24 -0.58 -0.45 0.31 0.51 0.49 0.32 0.31 0.03 0.0 -0.53 -0.53 -0.52 -0.72 0.08 -0.04 -0.4 -0.86 0.29 0.77 -0.04 0.52 -0.07
0.01 0.21 0.01 -0.0 -0.18 -0.3 0.03 0.05 0.08 -0.03 0.07 0.11 -0.19 -0.24 -0.51 -0.34 -0.36 0.25 0.33 -0.04 -1.0 -0.03 1.16 -0.05 -0.06 -0.22
0.72 -0.05 -0.17 -0.32 -0.49 -0.09 -0.12 0.04 0.3 0.07 0.29 0.3 0.15 -0.7 -0.04 -0.87 -0.55 0.17 0.17 -0.23 -0.22 -1.85 1.01 0.73 -0.25 -0.52
-0.69 -1.33 -1.51 -0.96 -0.23 -0.56 -0.13 -0.21 0.45 0.71 0.57 -0.25 -0.27 -0.59 0.03 -1.03 -0.33 -0.12 -1.03 -0.89 -2.09 -1.43 1.35 1.11 1.48 0.7
0.79 -0.19 -0.87 0.25 0.08 0.38 0.43 0.2 0.15 -0.06 -0.14 -0.03 0.57 -0.64 -1.09 -0.69 -1.04 -0.27 -0.49 -1.25 -2.78 -0.76 1.53 0.3 0.55 -0.19
0.11 0.24 -0.64 -0.16 0.13 0.37 0.3 0.4 -0.11 0.28 -0.04 -0.19 -0.26 -1.29 -0.16 -0.26 -0.54 0.37 0.14 0.09 -1.29 0.14 1.0 -0.28 0.18 -0.55
-0.79 -0.34 -0.33 -0.01 0.36 0.22 0.32 0.72 0.06 0.18 0.45 -0.34 -0.94 -0.35 -0.46 -0.05 -0.77 0.2 -0.29 -0.78 -0.42 -0.34 0.83 -0.39 0.82 0.24
0.1 0.01 -0.21 -0.4 -0.16 0.09 -0.18 -0.36 -0.28 -0.53 -0.43 -0.24 -0.36 -0.31 -0.14 -0.53 -0.28 0.01 0.23 -0.05 -2.23 -0.1 1.21 0.83 0.79 0.55
0.97 0.2 -0.19 -0.64 -0.92 -0.55 -0.11 -0.08 0.02 -0.1 -0.01 -0.13 0.8 -0.74 -0.58 -0.89 -0.78 0.15 -0.07 -0.66 -1.7 -0.21 1.71 -0.45 0.5 0.01
0.02 0.12 -0.08 -0.06 0.1 0.27 0.29 0.06 -0.35 -0.42 -0.16 -0.16 -0.35 -0.05 -0.14 0.27 0.01 0.3 0.25 0.19 -1.59 0.33 0.73 -0.34 -0.16 -0.37
0.48 -0.19 -0.5 -0.32 0.21 0.18 0.42 -0.07 0.14 -0.11 0.15 0.31 0.74 -0.91 -0.52 -0.94 -0.57 0.22 0.27 -0.58 -1.45 -0.06 1.04 0.06 -0.03 -0.45
-0.04 -1.52 -2.46 -1.94 -0.54 0.28 0.61 0.47 0.45 0.16 -0.1 -0.26 -0.19 -0.73 -0.73 -1.16 -0.18 0.42 0.27 -0.26 -1.84 -0.46 1.64 0.86 0.56 -0.03
-0.56 0.23 0.07 -0.01 -0.1 0.15 -0.35 -0.19 -0.11 -0.27 -0.09 -0.04 -0.82 0.14 0.01 -0.2 -0.34 0.16 0.08 -0.65 -3.59 1.0 0.82 0.24 0.29 0.42
0.21 -0.25 -0.31 -0.29 -0.27 -0.69 -0.06 -0.01 -0.37 -0.44 -0.34 -0.53 0.14 0.21 -0.01 0.14 -0.39 0.6 0.25 -0.29 -1.35 0.93 0.78 -0.07 0.33 0.16
0.38 0.09 0.04 -0.02 -0.0 0.09 0.21 -0.12 -0.08 -0.33 -0.25 -0.36 0.04 -0.65 -0.03 -0.67 -0.59 0.32 0.29 -0.42 -1.12 -2.37 1.58 0.37 -0.18 0.2
0.69 0.06 -0.61 -0.48 -0.33 -0.14 0.19 0.15 0.32 0.31 0.21 0.16 0.28 -0.71 -0.56 -0.63 -0.13 0.08 0.07 0.07 -0.96 -1.69 0.98 0.58 0.19 -0.73
1.42 -0.68 -2.14 -3.43 -1.79 0.03 0.19 0.38 0.35 0.46 -0.08 -0.83 0.22 - -3.12 - -1.55 0.07 -0.36 -0.77 -1.43 -1.87 2.21 0.67 0.68 0.98
0.65 -0.16 -0.25 0.08 0.16 0.0 0.47 0.25 -0.05 -0.17 0.16 0.03 0.29 -1.4 -0.92 -1.14 -0.58 -0.08 -0.18 -0.32 -1.29 -0.16 1.47 -0.38 0.53 -0.38
0.55 -1.11 -3.02 -2.96 -2.37 -0.87 0.47 0.45 0.23 0.01 -0.06 -0.15 0.5 -0.5 -0.64 -0.94 -0.24 0.69 0.36 -0.13 -1.45 -1.07 1.54 0.88 0.83 -0.02
-1.84 -1.8 -2.53 -0.96 0.09 0.19 0.55 0.35 -0.33 -0.46 -0.55 -0.9 -2.04 -2.07 -1.84 -1.78 -0.75 -0.01 0.08 -0.78 -2.98 0.36 1.79 1.39 1.79 0.89
0.11 -1.2 -1.56 -0.98 -0.19 0.34 0.15 0.1 0.01 -0.18 -0.67 -1.19 -0.23 -0.22 -0.83 -0.49 -0.62 -0.16 0.17 -0.48 -1.91 0.3 1.19 1.36 1.14 0.54
0.88 -0.55 -1.61 -1.13 -0.31 0.32 0.68 0.49 0.35 0.12 0.03 -0.52 0.57 -0.63 -0.75 -1.03 -0.6 0.01 -0.12 -0.79 -2.55 -1.12 1.52 0.74 0.15 -0.16
0.12 -0.24 -0.74 -0.71 -0.92 -1.37 -0.87 -0.51 -0.56 -0.67 -0.28 -0.47 -0.57 0.24 -0.4 0.2 -0.82 0.74 0.46 -0.82 -1.54 1.18 1.1 0.61 1.01 0.68
0.66 -0.69 -4.23 -2.5 0.12 0.15 -0.27 -1.39 0.41 0.78 0.28 0.71 0.83 -1.19 -4.32 -1.82 -1.65 -0.08 -0.55 -1.33 -0.04 -0.86 2.31 0.18 0.13 -0.63
0.67 0.2 -0.53 -0.73 -0.49 -0.28 0.08 0.17 0.07 0.04 -0.16 -0.43 0.17 -0.67 -0.5 -0.67 -0.21 0.42 0.32 -0.14 -1.13 -0.42 1.39 0.19 0.3 -0.21
0.94 -0.59 -1.21 -1.56 -0.92 -0.29 0.31 -0.2 -0.15 0.0 0.09 0.25 0.57 -0.78 -0.33 -0.82 -0.34 0.12 0.19 -0.25 -2.09 0.07 1.28 0.86 0.21 0.11
0.75 -0.86 -1.87 -2.12 -1.94 -0.8 0.03 0.06 -0.41 -0.22 -0.29 0.1 0.18 -0.51 -0.11 -0.91 -0.2 0.62 0.33 0.19 -1.81 -0.37 1.3 1.0 0.92 0.44
-0.74 -1.12 -1.24 -0.72 -0.28 -1.02 -0.5 -0.24 -0.76 -0.33 -0.02 -1.78 -0.73 -0.98 -0.52 -1.04 -0.96 0.59 0.19 -0.66 -1.91 0.5 2.1 1.42 1.26 0.32
-1.72 -2.24 -2.1 -0.34 0.59 0.5 0.87 0.92 0.09 -0.61 0.14 -1.16 - -2.55 -0.99 -1.01 -0.05 0.21 0.47 -1.3 -1.14 0.03 1.39 0.91 1.29 0.09
0.63 -0.1 -0.24 -0.12 0.04 0.23 0.38 0.32 -0.11 -0.07 0.03 0.25 0.52 -0.92 -0.62 -0.78 -0.41 0.22 0.07 -0.37 -2.37 -0.03 1.4 -0.83 -0.15 -0.49
0.14 0.42 -0.12 0.0 0.12 0.19 0.15 -0.06 -0.23 -0.27 -0.49 -0.32 -0.31 -1.17 -0.32 -0.47 -0.31 0.36 0.31 -0.23 -1.45 -1.02 1.69 0.18 0.25 -0.36
-0.11 -0.19 -1.35 -0.06 0.1 -0.13 0.29 0.39 0.1 0.11 0.37 -0.01 -0.12 -1.12 -0.81 -0.68 -0.69 0.04 -0.49 -0.57 -0.37 1.04 0.95 0.29 0.52 -0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.