Heatmap: Cluster_75 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.15 0.22 0.47 0.67 0.77 0.89 0.96 1.0 0.89 0.6 0.54 0.4 0.14 0.57 0.44 0.67 0.54 0.37 0.6 0.52 0.06 0.71 0.46 0.3 0.6 0.43
0.15 0.15 0.19 0.41 0.47 0.39 0.36 0.37 0.28 0.3 0.31 0.23 0.18 0.59 0.66 0.4 0.11 0.15 0.13 0.09 0.03 1.0 0.06 0.14 0.72 0.51
0.22 0.22 0.29 0.48 0.5 0.54 0.58 0.45 0.34 0.32 0.34 0.26 0.25 0.91 1.0 0.64 0.16 0.19 0.18 0.13 0.03 0.77 0.08 0.11 0.7 0.49
0.04 0.07 0.1 0.2 0.33 0.49 0.48 0.28 0.19 0.24 0.24 0.21 0.04 0.64 0.71 0.4 0.17 0.17 0.16 0.15 0.03 1.0 0.11 0.11 0.47 0.34
0.03 0.01 0.05 0.14 0.18 0.24 0.17 0.13 0.15 0.18 0.13 0.08 0.0 0.34 0.22 0.31 0.11 0.16 0.11 0.1 0.03 1.0 0.07 0.06 0.15 0.19
0.02 0.07 0.09 0.27 0.72 1.0 0.66 0.28 0.12 0.08 0.05 0.06 0.03 0.36 0.08 0.17 0.03 0.04 0.05 0.05 0.02 0.57 0.08 0.02 0.34 0.14
0.02 0.08 0.1 0.24 0.78 1.0 0.69 0.35 0.13 0.08 0.06 0.06 0.04 0.39 0.03 0.13 0.04 0.09 0.05 0.04 0.01 0.36 0.05 0.01 0.33 0.16
0.31 0.31 0.4 0.6 0.59 0.65 1.0 0.95 0.57 0.41 0.34 0.21 0.17 0.26 0.39 0.87 0.57 0.83 0.74 0.5 0.07 0.31 0.48 0.24 0.68 0.36
0.17 0.2 0.24 0.33 0.49 0.64 1.0 0.74 0.53 0.5 0.48 0.38 0.22 0.27 0.29 0.2 0.31 0.29 0.3 0.35 0.07 0.33 0.27 0.13 0.33 0.22
0.24 0.21 0.28 0.35 0.51 0.63 1.0 0.87 0.51 0.52 0.48 0.36 0.2 0.38 0.35 0.32 0.45 0.39 0.36 0.4 0.1 0.6 0.46 0.28 0.43 0.3
0.19 0.21 0.31 0.36 0.46 0.58 1.0 0.81 0.42 0.52 0.48 0.32 0.21 0.5 0.48 0.42 0.55 0.6 0.48 0.54 0.1 0.37 0.32 0.13 0.5 0.26
0.27 0.28 0.39 0.47 0.49 0.47 1.0 0.92 0.57 0.42 0.32 0.23 0.12 0.25 0.36 0.46 0.57 0.62 0.52 0.58 0.02 0.09 0.35 0.31 0.32 0.29
0.11 0.46 0.78 0.79 0.9 0.97 0.79 0.82 0.82 0.79 0.67 0.63 0.09 0.84 0.68 0.81 0.68 1.0 0.97 0.76 0.65 0.71 0.88 0.83 0.74 1.0
0.26 0.39 0.5 0.62 0.69 0.68 0.54 0.48 0.49 0.41 0.4 0.35 0.29 0.37 0.46 0.75 0.46 0.68 0.77 0.57 0.74 1.0 0.35 0.34 0.95 0.87
0.11 0.21 0.25 0.36 0.54 0.76 0.79 0.72 0.41 0.3 0.26 0.19 0.08 0.45 0.61 0.93 0.52 0.87 0.86 0.48 0.43 1.0 0.59 0.38 0.37 0.28
0.45 0.61 0.72 0.74 0.9 0.9 0.91 0.82 0.76 0.8 0.73 0.64 0.47 0.7 0.76 0.82 0.74 0.87 0.93 0.82 0.69 1.0 0.61 0.59 0.72 0.82
0.08 0.14 0.22 0.38 0.48 0.72 1.0 0.83 0.55 0.32 0.19 0.16 0.06 0.41 0.36 0.82 0.49 0.63 0.56 0.47 0.25 0.92 0.24 0.16 0.48 0.34
0.11 0.17 0.27 0.47 0.72 1.0 0.99 0.86 0.7 0.37 0.3 0.18 0.1 0.4 0.38 0.69 0.45 0.37 0.53 0.44 0.19 0.63 0.21 0.22 0.3 0.27
0.01 0.0 0.01 0.05 0.31 0.93 1.0 0.3 0.67 0.19 0.09 0.04 0.01 0.63 0.34 0.21 0.15 0.06 0.08 0.1 0.01 1.0 0.16 0.07 0.11 0.05
0.01 0.0 0.0 0.02 0.17 0.48 0.58 0.2 0.37 0.11 0.05 0.03 0.0 0.36 0.18 0.12 0.09 0.05 0.04 0.05 0.01 1.0 0.15 0.05 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.03 0.18 0.46 0.54 0.19 0.28 0.09 0.04 0.01 0.0 0.36 0.16 0.12 0.07 0.05 0.03 0.04 0.01 1.0 0.18 0.08 0.09 0.02
0.15 0.09 0.12 0.19 0.3 0.57 1.0 0.54 0.33 0.25 0.22 0.2 0.16 0.3 0.09 0.26 0.09 0.11 0.11 0.11 0.05 0.35 0.41 0.1 0.24 0.14
0.03 0.2 0.49 0.73 0.79 0.8 1.0 0.96 0.79 0.83 0.63 0.59 0.05 0.4 0.33 0.6 0.42 0.54 0.46 0.6 0.04 0.79 0.42 0.49 0.76 0.41
0.39 0.46 0.65 0.7 0.77 0.6 0.86 0.79 0.54 0.52 0.45 0.46 0.45 0.56 0.67 0.72 0.68 0.96 0.62 0.69 0.8 1.0 0.57 0.55 0.88 0.63
0.45 0.65 0.68 0.81 0.89 0.89 0.97 0.84 0.78 0.56 0.47 0.45 0.46 0.59 0.76 0.77 0.69 1.0 0.92 0.7 0.65 0.96 0.47 0.51 0.72 0.65
0.17 0.26 0.4 0.55 0.52 0.41 1.0 0.87 0.65 0.52 0.38 0.23 0.14 0.39 0.48 0.57 0.66 0.82 0.68 0.77 0.08 0.54 0.41 0.37 0.53 0.49
0.16 0.41 0.46 0.64 0.76 0.87 0.82 0.76 0.59 0.67 0.57 0.5 0.13 0.52 0.63 0.81 0.74 1.0 0.94 0.73 0.5 0.77 0.65 0.56 0.56 0.65
0.2 0.27 0.41 0.59 0.77 0.89 1.0 0.76 0.64 0.49 0.44 0.41 0.19 0.44 0.44 0.51 0.44 0.63 0.59 0.44 0.46 0.69 0.37 0.26 0.61 0.39
0.05 0.04 0.14 0.23 0.54 0.76 0.65 0.32 1.0 0.36 0.31 0.24 0.06 0.55 0.55 0.35 0.29 0.24 0.28 0.23 0.07 0.56 0.42 0.35 0.4 0.51
0.38 0.34 0.4 0.57 0.73 0.7 0.77 0.72 0.91 0.8 0.89 0.63 0.35 0.33 0.33 0.56 0.44 0.55 0.47 0.44 0.09 0.92 0.49 0.63 1.0 0.68
0.42 0.49 0.49 0.52 0.48 0.45 1.0 0.9 0.64 0.52 0.49 0.38 0.39 0.52 0.53 0.82 0.9 0.93 0.78 0.79 0.16 0.81 0.67 0.4 0.84 0.56
0.08 0.1 0.09 0.2 0.6 1.0 0.88 0.62 0.36 0.22 0.12 0.07 0.04 0.4 0.37 0.6 0.12 0.14 0.08 0.09 0.04 0.34 0.08 0.0 0.25 0.12
0.08 0.08 0.07 0.15 0.62 1.0 0.88 0.54 0.3 0.21 0.15 0.07 0.02 0.67 0.49 0.82 0.17 0.23 0.15 0.19 0.04 0.57 0.19 0.03 0.47 0.27
0.02 0.04 0.05 0.11 0.55 1.0 0.88 0.42 0.34 0.41 0.39 0.3 0.04 0.45 0.36 0.41 0.07 0.46 0.28 0.43 0.08 0.19 0.22 0.15 0.24 0.15
0.61 0.5 0.48 0.17 0.33 0.79 1.0 0.59 0.67 0.63 0.5 0.37 0.24 0.39 0.37 0.08 0.16 0.59 0.96 0.48 0.89 0.11 0.27 0.22 0.42 0.41
0.27 0.19 0.31 0.41 0.46 0.46 1.0 0.86 0.53 0.4 0.23 0.17 0.31 0.36 0.37 0.63 0.59 0.67 0.6 0.6 0.04 0.85 0.11 0.14 0.37 0.3
0.32 0.39 0.36 0.46 0.49 0.57 0.54 0.54 0.58 0.4 0.31 0.28 0.33 0.17 0.25 0.22 0.28 0.72 0.49 0.39 0.38 1.0 0.57 0.26 0.61 0.35
0.04 0.05 0.07 0.08 0.48 0.49 0.96 1.0 0.68 0.63 0.32 0.09 0.06 0.15 0.11 0.07 0.26 0.26 0.2 0.19 0.0 0.1 0.37 0.11 0.33 0.19
0.1 0.05 0.06 0.17 0.52 0.88 1.0 0.92 0.97 0.67 0.33 0.12 0.11 0.18 0.11 0.11 0.25 0.48 0.34 0.21 0.02 0.29 0.21 0.24 0.5 0.24
0.12 0.02 0.06 0.12 0.38 0.68 1.0 0.44 0.2 0.36 0.37 0.28 0.16 0.95 0.17 0.37 0.09 0.1 0.11 0.11 0.04 0.15 0.04 0.04 0.36 0.31
0.12 0.03 0.06 0.13 0.4 0.76 1.0 0.41 0.27 0.35 0.35 0.31 0.16 0.53 0.11 0.21 0.05 0.05 0.06 0.07 0.02 0.12 0.04 0.06 0.2 0.24
0.27 0.59 0.5 0.7 0.94 1.0 0.8 0.75 0.59 0.56 0.53 0.4 0.3 0.6 0.49 0.68 0.37 0.52 0.46 0.41 0.42 1.0 0.69 0.5 0.67 0.45
0.37 0.31 0.21 0.34 0.53 0.59 0.91 0.86 0.6 0.49 0.44 0.41 0.41 1.0 0.46 0.65 0.35 0.34 0.42 0.33 0.35 0.24 0.5 0.4 0.4 0.31
0.29 0.3 0.18 0.3 0.44 0.45 0.76 0.69 0.38 0.44 0.4 0.29 0.34 1.0 0.37 0.74 0.36 0.44 0.4 0.33 0.34 0.13 0.53 0.28 0.36 0.26
0.55 0.41 0.6 0.61 0.64 0.59 1.0 1.0 0.61 0.5 0.39 0.34 0.48 0.45 0.39 0.62 0.62 0.82 0.54 0.57 0.09 0.61 0.4 0.24 0.77 0.53
0.22 0.52 0.52 0.77 0.84 0.82 1.0 0.84 0.65 0.58 0.6 0.52 0.24 0.65 0.6 0.94 0.67 0.66 0.65 0.44 0.36 0.82 0.46 0.56 0.55 0.47
0.03 0.0 0.0 0.04 0.22 0.41 0.6 0.47 0.24 0.17 0.17 0.14 0.14 0.62 0.68 0.26 0.46 0.2 0.16 0.11 0.01 1.0 0.12 0.04 0.96 0.49
0.2 0.21 0.43 0.52 0.47 0.58 0.93 0.86 0.42 0.49 0.33 0.28 0.14 0.5 0.69 0.75 0.89 1.0 0.99 0.78 0.05 0.92 0.68 0.44 0.84 0.59
0.47 0.62 0.56 0.65 0.72 0.86 0.88 0.92 0.8 0.54 0.44 0.38 0.54 0.32 0.56 0.54 0.4 0.99 0.95 0.56 0.79 1.0 0.6 0.35 0.46 0.33
0.86 0.8 0.74 0.78 0.87 0.84 0.99 1.0 0.83 0.72 0.6 0.6 0.83 0.56 0.75 0.69 0.63 0.92 0.88 0.73 0.64 0.57 0.63 0.43 0.73 0.58
0.05 0.07 0.2 0.27 0.24 0.29 1.0 0.82 0.52 0.42 0.2 0.11 0.05 0.17 0.31 0.49 0.95 0.93 0.77 0.77 0.06 0.53 0.32 0.16 0.61 0.42
0.12 0.13 0.26 0.52 0.58 0.71 1.0 0.82 0.66 0.41 0.4 0.31 0.12 0.42 0.26 0.6 0.34 0.36 0.43 0.29 0.31 0.68 0.34 0.31 0.47 0.39
0.19 0.05 0.17 0.3 0.45 0.7 1.0 0.45 0.77 0.63 0.6 0.5 0.16 0.86 0.38 0.36 0.16 0.08 0.22 0.14 0.0 0.05 0.21 0.09 0.19 0.12
0.0 0.0 0.04 0.54 1.0 0.98 0.85 0.41 0.23 0.63 0.58 0.48 0.13 0.57 0.07 0.52 0.08 0.32 0.3 0.13 0.05 0.13 0.22 0.79 0.14 0.16
0.02 0.08 0.07 0.35 0.68 1.0 0.73 0.36 0.4 0.43 0.57 0.28 0.08 0.46 0.42 0.28 0.14 0.06 0.19 0.12 0.01 0.61 0.04 0.14 0.17 0.17
0.22 0.45 0.53 0.64 0.74 0.67 0.84 0.69 0.66 0.61 0.48 0.41 0.16 0.73 0.6 0.86 0.64 1.0 0.85 0.7 0.49 0.76 0.49 0.38 0.79 0.74

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)