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Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.51 -0.37 -0.13 0.35 0.34 -0.08 0.23 0.18 -0.23 -0.03 -0.21 -0.65 -0.18 0.37 0.87 0.93 -0.29 -0.13 -0.08 -0.11 -2.55 -1.99 0.36 -0.85 0.18 0.66
-0.22 -0.23 -0.25 -0.36 -0.1 0.16 0.33 0.08 -0.24 -0.15 -0.59 -0.77 -0.22 0.58 0.61 0.54 0.57 0.61 0.32 0.42 -2.37 -0.25 -0.66 -0.75 0.15 0.01
-1.15 -0.52 -0.91 -0.89 -0.93 -0.77 -0.17 0.05 0.08 -0.12 -0.48 -0.7 -1.41 0.83 1.22 0.67 0.0 0.04 -0.06 -0.3 -1.81 0.26 0.53 -0.03 1.15 0.52
-0.36 -0.19 -0.07 0.09 0.1 -0.25 -0.02 -0.07 -0.33 -0.24 -0.41 -0.59 -0.39 0.55 0.42 1.05 0.14 0.65 0.4 -0.27 -0.99 0.44 -0.39 -0.49 -0.31 -0.25
1.44 -1.35 -1.52 -0.64 -1.1 -1.48 0.1 0.12 -0.74 -0.1 0.62 0.81 1.79 1.12 -2.13 0.98 -0.3 -0.57 -1.37 -1.71 -3.99 -4.61 -1.77 -4.02 1.45 -0.19
-3.71 -4.8 -3.08 -1.59 -0.88 0.18 0.53 -0.12 1.4 -0.03 -0.51 -0.96 -3.03 1.17 1.56 1.54 0.3 0.0 0.08 -0.28 -4.55 0.13 -0.13 -1.25 -0.06 -0.35
-1.32 -0.14 0.38 0.04 -0.43 -0.47 -0.18 -0.13 -0.26 -0.22 -0.07 0.11 -1.97 -0.09 0.3 1.36 -0.13 0.2 0.11 0.01 -0.07 -1.14 0.38 0.34 -0.11 0.43
-2.03 -1.38 -1.19 -1.14 -0.7 -0.45 0.23 -0.12 -0.15 -0.01 -0.36 -0.69 -1.98 1.31 1.07 0.89 0.36 0.61 0.12 0.13 -2.06 0.25 0.1 -0.04 0.34 0.39
0.63 -0.18 -0.16 -0.22 -0.35 -0.97 -0.14 -0.11 -0.33 -0.17 -0.1 0.16 0.62 0.05 -0.26 0.22 -0.23 0.08 -0.03 -0.45 -1.87 -0.02 0.16 0.01 1.0 0.45
0.06 -0.17 -0.16 0.03 0.07 0.21 0.24 -0.01 -0.01 -0.01 -0.28 -0.27 -0.14 0.36 0.34 0.3 0.24 0.4 0.11 0.07 -2.85 0.22 -0.65 -0.41 0.16 0.02
-3.1 -3.24 -2.8 -2.6 -2.13 -0.45 0.02 -0.8 1.21 0.25 -0.12 -0.69 -3.7 1.8 1.44 1.14 -0.04 -0.32 -0.44 -0.19 -3.43 -1.86 1.17 0.1 0.01 0.39
0.26 -0.31 -0.06 0.12 -0.29 -0.93 -0.19 -0.08 -0.76 -0.33 -0.22 -0.19 0.29 0.82 0.03 0.76 0.21 0.2 -0.19 -0.04 -2.02 0.07 -0.53 -0.08 0.54 0.49
-0.18 -0.09 -0.23 -0.05 0.04 -0.16 0.01 0.37 0.62 -0.85 -0.02 -0.35 -0.24 0.6 0.44 0.25 -0.91 0.28 0.04 -0.97 -0.93 -0.68 -0.06 -1.35 1.21 0.35
0.99 0.12 -0.32 -0.16 -0.99 -0.97 -0.26 0.17 -1.17 -0.83 -0.75 -0.53 1.04 0.39 -0.2 0.55 -0.4 0.24 -0.44 -0.79 -2.18 -1.76 -0.86 -1.18 1.79 1.03
-0.68 0.19 0.34 0.4 0.61 0.61 0.59 0.39 -0.29 -1.06 -1.25 -1.26 -0.69 0.56 0.39 0.91 0.47 0.17 0.01 -0.46 -4.41 -1.52 -1.66 -1.97 1.19 -0.2
-4.79 -4.99 -3.15 -1.48 -0.51 0.19 0.76 0.44 1.28 0.68 0.5 -0.13 -4.03 0.9 1.49 0.42 -0.06 0.07 -0.17 -0.89 -3.78 -0.51 0.48 -0.23 0.07 -0.69
-1.64 -1.0 -0.57 0.13 -0.16 -0.26 -0.24 -0.35 -0.06 -0.23 0.02 -0.36 -2.56 0.66 0.17 1.4 -0.25 0.6 0.49 -0.03 -3.25 0.4 0.04 -0.35 0.39 0.71
-0.15 -0.04 0.18 0.09 0.23 0.14 0.12 -0.11 -0.18 -0.26 -0.33 -0.43 -0.09 0.7 0.53 0.41 0.26 0.53 0.09 0.05 -2.15 -0.02 -1.31 -0.35 -0.15 0.02
-0.96 -0.73 -0.7 -0.57 -0.44 -0.34 -0.21 -0.36 0.17 0.09 -0.02 -0.28 -1.02 0.36 1.25 0.3 -0.23 0.39 -0.09 -0.35 -1.0 0.8 0.34 0.2 0.21 0.41
0.02 0.14 0.12 0.15 0.1 0.38 0.24 0.09 -0.01 -0.11 -0.17 -0.39 0.03 -0.11 -0.04 0.2 0.67 0.43 0.42 -0.03 -2.09 -0.52 -0.78 -0.61 0.07 -0.06
-2.69 -1.66 -1.3 -0.51 -0.12 0.14 0.52 -0.13 1.04 -0.39 -0.84 -1.05 -2.54 0.92 1.19 0.73 0.28 0.19 -0.05 -0.76 -2.56 0.56 0.83 -0.38 0.17 -0.03
-0.19 -0.8 -0.35 0.32 0.06 -0.7 -0.46 -0.47 -0.7 -0.65 -0.48 -0.44 -0.34 1.01 0.6 0.77 -0.26 0.11 -0.19 -1.1 -2.12 1.05 -0.38 -0.13 0.92 0.62
-4.12 - -2.15 -1.17 -0.61 -0.13 0.36 0.46 0.21 -0.2 -0.85 -0.72 - 0.81 1.64 0.75 0.02 -0.26 0.62 -0.36 -1.2 -2.14 1.26 -0.36 1.15 0.12
-3.96 -1.29 -0.84 -0.37 -0.31 -1.36 -0.4 -0.28 0.71 0.24 0.6 0.18 -2.79 1.12 0.57 1.51 -0.87 -0.26 -0.8 -0.75 -2.53 0.5 -0.03 0.33 0.47 0.63
-4.49 -4.4 -3.61 -2.84 -1.61 -0.53 0.09 -0.61 0.76 -0.44 -0.94 -1.58 -4.14 1.86 2.06 1.02 0.53 0.4 0.19 -0.66 -0.54 -0.24 0.19 -0.33 0.09 -0.5
-0.97 -0.85 -0.82 -0.48 -0.13 0.09 0.24 -0.29 0.37 -0.33 -0.27 -0.31 -1.07 1.37 1.3 0.58 0.2 0.13 -0.33 -0.48 -1.36 -1.21 0.24 -0.22 0.31 0.1
-1.79 -0.19 0.19 0.45 0.69 0.5 -0.23 -0.63 -0.91 -0.86 -0.88 -0.74 -1.87 0.79 0.89 0.59 -0.11 0.02 -0.18 -0.48 -1.64 0.88 -0.11 -0.27 0.51 0.41
-3.94 -3.08 -2.43 -1.77 -1.24 -0.48 0.15 -0.1 0.19 0.18 0.07 -0.54 -3.11 1.83 2.16 1.0 -0.46 -0.82 -0.93 -1.44 -2.7 0.56 0.67 -0.32 0.16 -0.58
0.58 -0.03 -0.18 -0.02 -0.29 -0.66 0.01 -0.13 -0.53 -0.45 -0.34 -0.27 0.7 0.74 0.11 0.55 -0.05 -0.06 -0.32 -0.68 -3.35 -0.73 -0.75 -0.28 1.23 0.68
-0.45 -0.97 -0.66 -0.47 -0.3 -0.36 -0.06 -0.19 -0.95 -0.8 -0.97 -1.17 -0.31 1.31 -0.2 2.18 -0.32 -0.53 -0.92 -0.66 -0.03 0.06 -0.41 -0.23 0.43 0.68
-0.67 -0.43 -0.25 -0.04 -0.2 -0.77 -0.2 -0.07 -0.58 -0.43 -0.55 -0.7 -0.65 0.1 0.49 1.01 0.38 0.88 0.5 -0.09 -0.36 0.68 0.31 -0.2 -0.21 -0.27
-0.32 -0.23 -0.22 0.2 0.11 -0.41 -0.0 0.1 -0.2 -0.28 -0.26 -0.55 -0.33 -0.17 0.36 0.62 -0.09 0.37 0.35 -0.45 -0.39 0.75 0.39 -0.19 0.04 -0.26
0.02 0.67 0.78 0.59 -0.3 -0.99 -0.44 -0.11 -0.47 -0.57 -0.46 -0.48 -0.07 0.95 0.12 0.67 -0.17 0.28 -0.15 -0.13 -4.45 -0.84 -1.07 -1.15 0.81 0.66
-0.41 -0.67 -0.69 -1.04 -1.17 -0.65 -0.11 -0.2 -0.03 0.12 -0.25 -0.09 -0.46 1.5 1.17 1.0 0.22 0.05 0.32 0.17 -1.32 -2.11 -0.51 -0.81 -0.0 0.57
-2.46 -1.53 -1.29 -1.33 -1.24 -1.07 -0.52 -0.55 0.46 -0.17 -0.2 -0.56 -2.71 1.07 1.76 1.06 0.86 0.79 0.19 -0.02 -2.71 -3.25 0.84 0.43 -0.31 -0.05
-2.45 -4.72 -5.23 -4.22 -4.8 -2.46 -0.5 -0.66 -0.59 -0.88 -0.82 -1.47 -1.56 2.44 2.57 1.29 0.86 0.32 -0.35 -1.52 -4.95 -1.06 0.6 -1.76 -0.22 -1.0
-3.09 -7.14 -5.23 -2.09 -1.03 -0.38 0.33 0.19 0.74 0.7 0.27 -0.29 -2.37 1.2 1.72 0.02 0.3 -0.24 -0.51 -0.0 -3.95 -0.79 0.31 0.26 0.58 0.59
0.49 -0.02 -0.24 -0.08 0.58 0.29 0.42 0.15 0.15 -0.24 -0.43 -0.39 0.02 0.45 0.09 0.53 -0.36 0.47 0.27 -0.16 -4.03 -1.52 0.08 -0.21 -0.08 -0.39
-2.11 -2.15 -2.1 -1.94 -1.4 -0.49 0.11 -0.7 0.7 -1.28 -1.74 -2.14 -2.24 1.87 2.52 1.66 0.46 -0.26 -0.25 -0.9 -1.22 -0.53 -1.29 -1.22 -0.23 -0.91
-0.38 -0.89 -0.83 -0.41 -0.35 -0.29 -0.0 0.14 0.44 0.14 0.18 0.23 -0.3 -0.47 1.09 1.32 -0.89 -0.41 -0.55 -0.82 -2.22 -0.17 0.64 -0.27 0.74 0.04
-2.6 -1.72 -1.24 -1.31 -0.84 0.1 0.94 0.55 1.14 0.52 0.33 -0.01 -1.99 1.09 0.9 0.96 0.16 -0.18 -0.74 -0.83 -2.29 0.11 -0.98 -0.34 -0.05 -0.14
-0.1 0.33 0.36 0.34 0.5 0.36 0.11 -0.0 -0.57 -0.51 -0.53 -0.45 0.34 0.31 0.59 0.75 0.23 -0.08 0.03 -0.25 -3.57 -0.5 -1.73 -1.34 0.77 -0.28
-0.54 -0.23 -0.64 -1.07 -2.1 -2.07 -0.81 -0.59 0.98 0.33 0.1 -0.16 -0.59 -0.06 0.8 0.77 0.41 0.94 0.89 0.1 -2.44 -1.13 0.32 0.15 0.44 -0.25
-0.96 -1.12 -0.81 -0.28 -0.34 -0.71 -0.09 -0.36 -0.21 -0.29 -0.08 -0.5 -1.36 1.27 0.53 1.28 -0.32 0.35 -0.07 -0.34 -3.39 0.28 -0.64 -0.1 0.86 0.98
-0.11 -0.05 0.25 0.36 0.2 0.01 0.33 0.26 -0.16 -0.44 -0.42 -0.34 0.02 0.55 0.6 0.65 0.11 0.01 -0.16 -0.08 -4.01 0.0 -1.13 -1.04 0.43 0.03
-0.02 -0.86 -0.66 -0.05 -0.52 -0.75 -0.29 -0.22 -0.51 -0.38 0.07 -0.45 -0.29 1.44 -0.14 0.84 -0.95 -0.11 -1.2 -1.08 -3.83 -2.91 -0.04 -1.36 2.2 0.91
-0.84 -1.02 -0.6 -0.2 -0.61 -0.96 -0.01 0.15 0.2 -0.22 -0.44 -0.86 -0.83 1.06 0.06 0.91 -0.13 0.19 -0.22 -0.3 -1.35 -0.1 0.7 0.25 0.86 0.68
0.32 -0.57 -0.56 -0.5 -0.03 0.34 0.65 0.61 0.33 0.01 -0.34 -0.88 0.4 -0.1 1.22 0.23 -0.15 0.41 -0.08 0.02 -3.2 -1.36 -1.1 -0.4 0.22 -0.1
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-1.48 -0.38 0.02 0.27 0.26 -0.07 0.23 0.22 -0.22 -0.22 -0.36 -0.49 -1.8 0.75 0.92 0.68 -0.49 0.01 -0.33 -0.38 -4.13 0.47 -0.14 -0.98 0.84 0.65
-2.01 -2.92 -2.83 -2.39 -2.28 -1.08 -0.3 -0.28 -0.12 0.22 -0.29 -1.16 -1.77 1.44 1.59 0.27 0.77 0.22 -0.33 -0.52 -2.82 -0.37 1.72 -0.01 0.6 0.42
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0.69 -0.67 -0.79 -0.92 -1.32 -1.03 -0.13 0.16 -0.73 -0.26 -0.57 -1.27 0.97 0.31 1.16 0.71 -0.79 0.23 -0.1 -0.14 -1.65 -1.67 0.43 -1.0 1.02 1.03
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-1.41 -0.52 -0.38 -0.27 -0.28 -0.26 -0.11 -0.14 -0.27 0.07 -0.4 -0.22 -1.81 -0.11 -0.22 1.62 -0.65 0.42 0.57 -0.53 -0.65 -0.61 -0.07 0.18 0.77 0.97
-1.37 -0.44 -0.09 0.04 0.15 -0.14 -0.19 -0.35 -0.46 -0.47 -0.71 -0.75 -1.49 0.67 0.66 1.64 0.11 0.31 0.25 -0.2 -1.63 0.5 -0.07 -0.26 -0.06 0.1
-1.49 0.19 0.58 0.92 0.87 0.35 0.02 -0.07 -0.56 -0.35 -0.32 -0.18 -1.04 0.8 0.25 0.5 -0.03 -0.04 -0.65 -0.4 -3.33 -0.2 -1.24 -0.99 0.68 0.28
-1.68 -2.12 -3.27 -3.15 -2.02 -1.77 -1.79 -1.98 -2.64 -2.7 -2.91 -3.42 -1.76 1.94 3.15 2.35 -1.19 0.24 -0.07 -1.5 -2.73 0.41 -2.31 -2.91 -1.18 -1.71
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0.26 -0.79 -0.61 -0.21 -0.74 -0.51 0.04 -0.0 -0.14 -0.3 -0.07 -0.74 -0.53 0.6 0.5 0.26 -0.54 -0.11 -0.02 -0.85 -1.73 0.63 0.17 0.58 1.06 0.65
-1.54 -1.25 -1.16 -1.01 -0.66 -0.41 -0.73 -1.41 -1.1 -0.84 -0.6 -0.55 -0.98 1.12 1.97 1.75 1.42 -0.09 0.11 0.2 -2.42 -1.42 -1.53 0.14 -0.26 -0.15
-3.78 -2.34 -1.27 -0.62 -1.06 -1.17 0.13 0.23 0.69 0.71 0.41 0.58 -6.27 1.35 1.47 1.04 -0.04 -0.02 -0.37 -1.09 -2.3 -0.12 -1.1 0.13 0.31 -0.14
-0.57 -0.36 -0.09 0.1 -0.26 -1.03 -0.07 0.02 -0.64 -0.35 -0.46 -0.66 -0.71 -0.02 0.54 1.2 -0.02 0.77 -0.01 -0.24 -0.29 0.51 -0.11 -0.48 0.44 0.41
-0.43 -0.28 0.04 0.1 -0.05 -0.34 -0.03 0.02 -0.44 -0.28 -0.48 -0.52 -0.43 -0.04 0.67 1.07 -0.05 0.69 0.28 -0.21 -0.67 0.14 -0.64 -0.66 0.29 0.39
-3.72 -4.74 -3.92 -3.3 -3.07 -1.72 -0.19 -1.01 1.44 0.52 0.3 -0.17 -3.1 1.48 1.48 0.61 0.31 0.3 0.09 -0.21 -2.49 -0.82 1.14 0.1 0.11 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.