Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.48 0.45 0.0 1.0 0.61 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.1 0.38 0.12 0.34 1.0 0.51 0.0 0.0 0.36 0.08 0.14 0.28
0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.14 0.33 0.57 0.39 0.35 1.0 0.35 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.04
0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.07 0.07 0.07 0.04 0.02 0.34 1.0 0.44 0.72 0.9 0.93 0.9 0.04 0.03 0.09 0.1 0.18 0.17
0.15 0.32 0.05 0.28 0.17 0.33 0.15 0.31 0.43 0.32 0.34 0.3 0.17 0.47 0.68 0.82 0.66 1.0 0.29 0.55 0.33 0.11 0.6 0.11 0.15 0.26
0.14 0.25 0.22 0.15 0.24 0.18 0.21 0.17 0.29 0.41 0.35 0.32 0.16 0.57 0.7 0.75 0.57 1.0 0.61 0.71 0.65 0.49 0.77 0.19 0.35 0.37
0.12 0.25 0.19 0.15 0.17 0.18 0.21 0.22 0.26 0.34 0.39 0.3 0.18 0.6 0.62 0.63 0.59 1.0 0.59 0.6 0.66 0.41 0.95 0.48 0.36 0.36
0.2 0.26 0.21 0.21 0.23 0.25 0.28 0.22 0.35 0.43 0.4 0.35 0.2 0.75 0.85 0.7 0.7 1.0 0.78 0.77 0.56 0.27 0.74 0.33 0.3 0.39
0.17 0.39 0.53 0.44 0.48 0.56 0.66 0.61 0.61 0.58 0.47 0.4 0.15 0.93 0.96 0.94 0.73 1.0 0.96 0.8 0.45 0.22 0.93 0.41 0.32 0.38
0.02 0.04 0.03 0.03 0.04 0.06 0.09 0.1 0.13 0.14 0.11 0.08 0.02 0.38 1.0 0.29 0.45 0.23 0.31 0.25 0.24 0.01 0.28 0.67 0.29 0.41
0.04 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.04 0.03 0.08 0.06 0.06 0.04 1.0 0.96 0.83 0.74 0.75 0.78 0.72 0.41 0.18 0.13 0.56 0.49 0.44
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.27 0.49 0.65 0.36 1.0 0.39 0.07 0.0 0.0 0.1 0.07 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.38 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.75 0.77 0.54 0.53 0.6 1.0 0.74 0.1 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.59 0.78 0.56 0.28 0.44 0.29 0.38 0.14 0.01 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68
0.07 0.06 0.06 0.06 0.06 0.09 0.1 0.09 0.17 0.27 0.26 0.23 0.1 0.52 0.95 0.54 1.0 1.0 0.85 0.59 0.11 0.14 0.15 0.47 0.21 0.22
0.06 0.06 0.06 0.06 0.07 0.08 0.09 0.1 0.15 0.27 0.29 0.24 0.1 0.49 0.84 0.54 0.98 1.0 0.63 0.56 0.1 0.14 0.14 0.47 0.17 0.19
0.01 0.05 0.08 0.07 0.07 0.07 0.03 0.02 0.07 0.16 0.17 0.14 0.01 0.95 0.75 0.93 1.0 0.61 0.58 0.66 0.17 0.15 0.13 0.55 0.28 0.38
0.1 0.07 0.06 0.04 0.14 0.17 0.09 0.1 0.06 0.11 0.04 0.08 0.09 0.81 0.87 1.0 0.77 0.59 0.86 0.86 0.11 0.04 0.01 0.02 0.16 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 1.0 0.56 0.47 0.38 0.33 0.34 0.5 0.53 0.35 0.81 0.57 0.49
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.61 1.0 0.52 0.54 0.37 0.56 0.58 0.2 0.18 0.24 0.48 0.3 0.37
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.66 1.0 0.58 0.6 0.49 0.56 0.61 0.22 0.2 0.28 0.44 0.35 0.37
0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.54 0.76 0.45 0.51 0.51 0.47 0.51 0.41 0.51 0.7 1.0 0.75 0.61
0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.75 1.0 0.69 0.72 0.75 0.6 0.73 0.33 0.32 0.46 0.6 0.53 0.54
0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.81 1.0 0.76 0.78 0.7 0.57 0.72 0.35 0.4 0.52 0.75 0.59 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.18 0.0 0.11 0.06 0.0 0.78 1.0 0.27 0.95 0.24 0.39 0.53 0.03 0.0 0.04 0.05 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.54 0.0 0.31 0.0 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.91 0.3 1.0 0.91 0.63 0.69 0.86 0.12 0.29 0.02 0.43 0.43 0.58
0.17 0.13 0.14 0.14 0.15 0.17 0.2 0.17 0.21 0.28 0.25 0.26 0.16 0.62 1.0 0.63 0.55 0.7 0.83 0.61 0.42 0.18 0.49 0.43 0.28 0.54
0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.67 0.79 1.0 0.34 0.6 0.78 0.78 0.06 0.0 0.12 0.33 0.12 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.78 0.74 0.54 0.62 1.0 0.32 0.07 0.35 0.01 0.08 0.1 0.36
0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.75 0.97 0.65 0.4 0.38 1.0 0.59 0.09 0.2 0.04 0.17 0.22 0.11
0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.02 0.02 0.0 0.93 0.96 0.66 0.68 0.61 1.0 0.52 0.1 0.11 0.08 0.17 0.11 0.13
0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.03 0.05 0.11 0.11 0.08 0.01 1.0 0.92 0.99 0.83 0.95 0.56 0.61 0.24 0.01 0.59 0.98 0.61 0.49
0.42 0.31 0.37 0.3 0.27 0.27 0.48 0.46 0.47 0.57 0.45 0.44 0.44 1.0 0.57 0.84 0.67 0.94 0.72 0.57 0.43 0.32 0.38 0.22 0.35 0.48
0.33 0.0 0.12 0.0 0.14 0.0 0.14 0.28 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.21 0.89 0.57 0.16 0.81 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.25 0.07 0.05 0.0 0.05 0.1 0.0 0.07 0.39 0.47 0.9 0.43 0.21 0.83 1.0 0.09 0.08 0.17 0.05 0.07 0.04
0.31 0.14 0.17 0.17 0.08 0.18 0.2 0.24 0.25 0.25 0.22 0.16 0.17 0.88 0.61 1.0 0.46 0.71 0.81 0.41 0.31 0.16 0.11 0.16 0.28 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.0 0.09 0.2 0.0 0.21 0.0 0.0 0.23 0.09 0.0 0.0 0.72 0.74 0.44 0.11 0.35 1.0 0.78 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.33
0.06 0.09 0.14 0.2 0.36 0.47 0.42 0.32 0.43 0.33 0.23 0.17 0.11 1.0 0.62 0.72 0.6 0.88 0.69 0.61 0.44 0.22 0.22 0.15 0.19 0.19
0.03 0.05 0.0 0.0 0.12 0.14 0.03 0.0 0.03 0.06 0.09 0.0 0.12 0.82 0.56 0.75 0.21 0.38 1.0 0.68 0.13 0.02 0.04 0.12 0.06 0.69
0.19 0.27 0.26 0.28 0.21 0.12 0.24 0.24 0.32 0.45 0.47 0.5 0.23 0.71 0.54 0.57 0.8 0.82 0.72 0.52 0.34 0.14 1.0 0.58 0.3 0.33
0.03 0.02 0.0 0.02 0.03 0.04 0.02 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.15 1.0 0.34 0.2 0.3 0.33 0.22 0.05 0.08 0.35 0.13 0.13 0.17
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.59 0.83 0.0 0.66 0.69 0.0 0.1 0.0 0.18 0.0 0.24
0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.7 1.0 0.65 0.67 0.49 0.43 0.62 0.0 0.01 0.0 0.09 0.03 0.07
0.22 0.16 0.13 0.24 0.26 0.15 0.22 0.14 0.14 0.12 0.08 0.1 0.09 0.16 1.0 0.36 0.12 0.52 0.39 0.25 0.08 0.03 0.11 0.01 0.29 0.19
0.06 0.02 0.04 0.05 0.08 0.07 0.05 0.05 0.03 0.08 0.08 0.13 0.05 0.22 1.0 0.75 0.35 0.5 0.74 0.67 0.14 0.08 0.37 0.3 0.35 0.44
0.15 0.2 0.56 0.67 0.72 0.73 0.72 0.69 0.84 0.75 0.57 0.56 0.19 0.91 0.61 1.0 0.77 0.96 0.88 0.7 0.41 0.14 0.89 0.3 0.27 0.33
0.0 0.17 0.25 0.19 0.23 0.07 0.27 0.0 0.18 0.11 0.12 0.06 0.13 0.46 0.62 0.26 0.45 0.44 1.0 0.52 0.0 0.25 0.08 0.34 0.15 0.44
0.04 0.07 0.09 0.1 0.13 0.15 0.11 0.08 0.12 0.17 0.18 0.18 0.06 0.66 0.81 1.0 0.92 0.41 0.47 0.43 0.16 0.16 0.06 0.4 0.26 0.37
0.07 0.08 0.08 0.08 0.09 0.1 0.12 0.1 0.11 0.13 0.14 0.14 0.09 0.28 0.51 0.63 1.0 0.34 0.45 0.34 0.03 0.16 0.04 0.26 0.2 0.26
0.11 0.13 0.13 0.15 0.16 0.14 0.13 0.15 0.12 0.14 0.13 0.11 0.12 0.93 0.69 0.88 0.76 1.0 0.88 0.68 0.45 0.26 0.31 0.41 0.62 0.38
0.09 0.08 0.1 0.09 0.12 0.11 0.13 0.14 0.08 0.11 0.12 0.11 0.16 0.85 0.67 0.74 0.94 0.77 1.0 0.99 0.13 0.07 0.05 0.18 0.27 0.19
0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.05 0.04 0.05 0.05 0.07 0.05 0.02 0.95 0.91 1.0 0.82 0.73 0.7 0.61 0.82 0.28 0.61 0.61 0.57 0.48
0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.43 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.87 0.0 0.4 0.0 0.0 0.65 0.0 0.68 1.0 0.0 0.9

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)