Heatmap: Cluster_197 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
-0.28 0.33 0.11 0.52 0.88 -0.23 -1.13 -0.02 0.25 0.32 0.3 -3.16 -2.48 -0.02 0.6 -0.42 -0.12 0.45 0.16 0.01 0.33 1.05 0.12 0.2 -0.26 -0.93 0.5 0.32 0.01 -2.13 -0.14 -1.21 -0.1 0.17 0.23 0.8 -1.53 -1.66 -0.03 -0.07 -0.46 0.17 -0.13 0.23
AT1G03750 (CHR9)
-0.28 0.53 -0.17 0.27 -2.62 -0.4 -1.33 0.06 0.78 0.71 0.8 -0.72 -1.89 -0.15 0.62 -0.54 -0.16 0.21 -0.07 -0.57 0.34 0.65 0.14 0.12 -0.5 -0.01 0.59 0.56 -0.09 -1.16 -0.15 -0.72 -0.35 0.0 0.33 0.94 -0.6 -0.51 0.43 0.08 -1.34 -0.25 0.2 -0.32
0.32 0.63 0.2 0.18 -0.4 -0.07 -0.52 0.74 0.26 0.31 0.65 -2.94 -1.58 0.25 0.41 -1.25 -1.1 -0.81 -0.53 -0.35 -0.15 0.59 0.06 0.41 -0.13 0.17 -0.25 -0.82 0.26 -3.37 0.18 0.15 0.12 0.19 -0.54 0.89 0.54 -0.08 -1.08 0.3 -0.61 0.43 0.16 0.25
-0.8 -0.47 -0.85 -0.22 -0.61 -1.11 -0.68 -0.16 1.04 1.12 1.04 -0.11 -1.32 -0.28 0.12 -0.62 -0.2 0.37 0.41 0.3 0.56 0.71 -0.18 0.14 -0.83 -1.07 0.98 0.84 -0.11 -3.46 0.02 -2.01 0.07 -0.48 0.84 -0.26 -1.6 -2.29 0.51 -0.38 -0.48 0.47 0.65 -0.36
AT1G14660 (NHX8)
-1.06 -0.69 -0.62 0.1 - -1.16 -1.2 0.09 1.05 1.09 1.03 -0.92 -1.2 -0.1 1.1 -1.1 -0.24 0.31 0.5 0.21 0.81 -0.31 0.17 -0.45 -1.2 -1.52 1.11 0.78 0.41 - -0.44 0.71 -0.18 -0.56 -0.19 -0.57 0.57 0.26 0.56 -0.19 -1.34 -0.81 0.39 -0.67
AT1G16010 (MGT2)
-0.4 0.58 0.28 0.06 -0.11 -0.2 -0.53 -0.41 0.93 1.15 0.95 -2.48 -0.58 -0.64 1.21 -0.22 -0.29 -0.02 -0.02 -0.22 0.43 0.32 0.03 -0.19 -0.22 -0.39 0.0 -0.07 -0.01 -4.49 -0.25 -0.93 -0.27 0.86 0.09 0.67 -0.84 -1.61 -0.02 0.04 -0.6 -0.29 -0.38 -0.07
0.81 0.59 0.35 -0.76 1.31 -0.36 -1.35 -0.31 0.55 0.58 0.48 -3.77 -3.4 -0.04 0.61 -0.06 0.24 0.36 -0.23 -0.57 0.01 0.88 -0.61 -0.06 0.1 -1.52 0.38 0.77 0.06 - -0.31 -1.76 -0.37 -0.23 -0.29 1.3 -2.55 -2.32 0.29 0.05 -0.94 0.15 -0.44 0.58
AT1G22620 (ATSAC1)
0.08 0.44 0.25 -0.74 0.31 -0.63 -0.12 0.57 0.86 0.84 1.0 -1.97 -1.72 0.51 0.89 -1.4 -1.11 -0.67 -0.27 0.09 0.37 0.35 0.34 0.12 -0.08 -0.46 0.13 -0.03 0.06 -1.76 -0.07 -1.09 0.24 0.76 -0.43 -0.23 -1.39 -1.37 -0.36 -0.39 -0.18 0.11 0.29 0.39
AT1G34120 (IP5PI)
0.15 0.81 0.48 0.24 -1.05 -0.52 -0.98 0.18 0.7 0.79 1.0 -0.93 0.02 0.2 0.87 -1.12 -1.01 -0.32 -0.06 -0.45 0.21 0.28 0.04 0.19 -0.34 -1.47 0.35 0.09 0.33 -5.24 -0.08 -2.17 0.1 0.51 -0.27 1.57 -2.98 -2.61 -0.19 -0.37 -0.92 0.05 0.08 0.13
-0.72 -0.57 -0.51 -1.67 -2.43 -1.77 -2.01 0.0 0.68 0.97 1.13 -3.95 -3.99 1.01 1.36 -0.49 -0.09 -0.06 0.2 0.01 0.75 0.47 -0.24 0.62 0.51 -0.39 0.84 0.86 0.29 -3.71 0.22 -1.06 0.1 0.43 -2.4 0.38 -1.57 -1.16 0.78 -0.13 -0.84 -1.47 -0.05 0.47
AT1G53165 (ATMAP4K ALPHA1)
0.58 0.27 0.87 0.49 0.37 0.1 -0.96 0.53 0.47 0.49 0.71 -2.38 -2.58 0.3 0.64 -1.14 -0.56 -0.14 0.03 -0.11 0.11 0.74 -0.1 0.11 -0.52 -0.68 0.47 0.32 0.01 -1.93 -0.14 -1.25 -0.09 0.21 -0.53 0.8 -1.91 -2.12 0.02 0.16 -1.4 0.27 0.18 -0.0
AT1G53590 (NTMC2T6.1)
0.39 0.96 0.23 -0.24 -1.5 -0.48 -1.48 0.52 1.16 0.94 1.15 -2.08 -1.43 1.06 1.67 -0.29 -0.03 0.13 0.08 -0.21 0.15 0.37 -0.53 -0.65 -0.61 -1.54 0.16 0.06 -0.75 -6.94 -0.28 -1.4 -0.41 -0.09 -0.37 -0.01 -1.63 -1.71 -0.15 0.06 -1.24 -0.02 0.53 0.3
AT1G55250 (HUB2)
-0.53 -0.55 -0.51 0.29 0.3 -0.64 -0.93 0.41 0.63 0.5 0.65 -2.64 -0.3 -0.47 0.59 -0.77 -0.27 0.22 0.15 -0.18 0.36 1.28 -0.14 0.04 -0.8 -1.18 0.59 0.51 -0.37 -3.94 -0.34 -0.7 -0.45 0.15 0.17 1.19 -0.28 -0.53 0.33 -0.36 -1.36 0.71 0.44 -0.57
AT1G60170 (emb1220)
0.15 0.04 -0.25 0.45 -0.56 0.19 -0.8 1.02 0.82 0.89 1.04 -2.26 -1.93 -0.37 0.38 0.13 0.18 0.43 0.12 -0.27 0.06 0.47 -0.62 -0.42 -0.6 -0.86 0.44 0.38 -0.48 -4.37 -0.37 -0.5 -0.59 -0.27 0.71 0.33 -0.29 -0.66 0.11 -0.04 -0.45 0.16 -0.38 0.12
0.25 0.6 -0.17 0.09 -1.53 -0.61 -0.42 -0.05 0.36 0.39 0.25 -1.34 -0.98 -0.08 0.5 -0.18 0.02 0.35 0.14 -0.17 0.28 1.15 -0.0 0.05 -0.3 -1.11 0.76 0.61 -0.22 -8.91 -0.29 -0.57 -0.35 0.22 -0.2 0.02 -0.44 -0.68 0.4 -0.31 -0.96 0.97 0.49 -0.16
AT1G69220 (SIK1)
0.42 -0.02 0.55 0.72 -0.18 -0.02 -0.85 1.1 0.56 0.49 0.46 -2.37 -2.42 0.55 0.47 -0.82 -0.26 0.19 0.25 -0.14 0.14 -0.01 -0.27 -0.03 -0.48 -0.95 0.72 0.65 -0.38 -2.03 -0.15 -1.04 -0.09 0.19 -0.38 0.85 -1.98 -1.29 0.53 -0.06 -0.5 -0.7 -0.11 0.23
0.33 0.73 0.73 -0.3 0.58 -0.1 -0.55 0.18 0.49 0.69 0.85 -1.7 -0.23 -0.23 0.71 -0.78 -0.66 -0.27 -0.08 -0.34 0.29 0.22 -0.13 0.24 -0.24 -1.01 0.11 -0.02 -0.0 -1.84 -0.15 -0.88 -0.11 0.51 -0.27 0.32 -0.67 -0.96 -0.04 -0.02 -0.57 -0.0 0.17 0.27
0.15 -0.15 0.2 0.66 -4.49 0.25 -0.79 1.56 1.41 1.31 1.43 -4.28 -0.96 -0.46 1.06 -0.46 -0.5 -0.16 -0.37 -0.52 -0.25 0.54 -0.2 0.14 -0.37 -1.06 0.21 -0.43 -0.07 -5.54 -0.63 -1.27 -0.73 -0.32 -0.84 1.12 -1.05 -1.1 -0.4 -0.32 -0.7 -0.19 -0.03 -0.11
0.26 -0.56 -0.49 0.88 -8.16 0.24 -0.93 -0.69 -0.32 -0.37 -0.36 -2.88 -0.15 -0.24 0.4 -0.22 -0.01 0.41 0.27 -0.22 -0.21 -0.01 -0.33 -0.24 -0.61 -0.4 0.67 0.78 0.21 -3.04 -0.04 1.05 -0.24 -0.87 -0.01 0.23 1.34 1.12 0.71 0.19 -0.99 -0.55 -0.16 -0.38
0.6 0.37 0.71 -1.01 1.1 0.2 0.27 0.98 0.86 0.83 0.87 -1.6 -0.76 0.57 0.61 -1.29 -1.32 -1.01 -0.43 -0.21 -0.33 0.17 -0.03 0.07 0.35 -1.33 -0.47 -0.77 0.24 -4.02 -0.01 -1.89 0.15 0.61 -1.61 0.33 -2.72 -2.47 -0.65 -0.26 -0.56 0.37 0.38 0.65
0.44 -0.8 -1.4 0.65 -1.68 -0.58 -0.98 -0.08 0.46 0.45 0.36 -3.67 -2.53 -0.02 0.36 -0.36 0.34 0.76 0.69 0.2 -0.01 0.81 -0.04 -0.43 -0.72 -0.38 0.73 0.53 0.18 -1.66 -0.25 -0.03 -0.21 -0.02 -1.26 0.8 -0.56 0.09 0.62 0.58 -1.72 0.39 0.48 -0.61
AT1G79830 (GC5)
0.6 -0.05 0.61 0.16 1.17 -0.08 -1.08 0.69 0.64 0.5 0.64 -2.4 -1.16 0.22 0.14 -1.32 -0.96 -0.37 0.03 -0.22 -0.03 0.86 -0.32 0.15 -0.44 -0.06 0.11 -0.02 -0.02 0.34 -0.19 -0.98 -0.17 -0.4 -0.67 0.26 -1.31 -0.82 -0.17 -0.12 -0.64 0.22 0.26 0.29
AT2G03620 (MGT3)
-0.29 -0.09 -0.3 -0.6 0.08 -1.11 -1.53 0.25 0.7 0.82 0.77 -1.04 -1.15 -0.68 0.3 -0.12 -0.0 0.27 -0.24 -0.29 0.55 0.74 0.05 0.02 -0.74 -0.71 0.82 0.91 0.29 -5.84 -0.16 -0.12 -0.08 0.87 -0.06 -0.73 0.27 -0.08 0.82 -0.42 -1.24 -0.18 -0.12 -0.49
AT2G05170 (VPS11)
0.56 -0.06 0.04 -0.42 0.91 -0.33 0.06 -0.34 -0.2 -0.36 -0.17 -4.42 -2.24 0.55 0.05 -0.33 -0.27 0.06 0.16 0.21 0.14 0.97 -0.02 0.16 0.31 -0.63 0.27 0.52 0.09 -1.93 0.04 -0.94 0.21 0.07 0.2 0.36 -1.79 -1.03 0.23 -0.44 -0.66 0.88 0.53 0.28
AT2G14680 (MEE13)
-0.03 0.58 0.59 0.03 -4.23 -0.43 -0.88 0.07 0.62 0.63 0.72 -3.65 -2.3 0.54 0.92 -1.05 -0.55 0.03 0.31 0.05 0.8 0.77 0.12 0.04 -0.68 -0.97 0.52 0.36 0.17 -1.53 0.04 -1.3 0.12 1.04 -0.29 0.14 -1.61 -1.9 0.22 -0.28 -0.97 0.17 0.5 -0.4
-0.27 -0.92 -0.33 0.73 -0.56 0.2 -1.32 -0.39 -0.03 -0.26 -0.12 -3.01 - -0.32 0.67 0.11 0.65 1.02 0.57 0.01 0.32 0.02 -0.2 -0.64 -0.89 -1.04 0.94 1.01 -0.15 -6.8 -0.09 -0.37 -0.21 -0.58 1.06 0.18 0.13 -0.29 0.99 0.34 -1.28 -0.12 0.68 -0.74
AT2G19950 (GC1)
0.9 0.38 1.08 0.13 0.87 0.2 -0.9 -0.48 -0.08 0.23 0.4 -3.35 -3.28 0.41 0.32 -0.96 -0.62 -0.22 0.07 -0.14 0.39 0.43 -0.18 0.64 0.03 -1.06 0.35 0.54 0.66 -5.2 0.17 -2.01 0.06 0.05 -0.1 0.77 -2.81 -2.61 0.36 0.01 -0.48 -0.44 0.05 0.1
AT2G23460 (XLG1)
-0.07 -0.21 -0.33 -0.45 -0.09 -0.98 -0.54 0.65 0.22 0.1 0.2 -1.71 -0.89 -0.26 0.28 -0.22 0.13 0.4 -0.12 -0.0 0.56 0.33 0.53 0.18 -0.07 0.19 0.78 0.66 -0.25 - 0.03 -2.16 0.26 0.67 -0.11 1.28 -3.38 -3.08 0.46 -0.02 -0.58 -0.1 0.41 0.07
AT2G31510 (ARI7)
-0.46 -0.08 -0.44 -0.34 0.05 -0.9 -1.03 0.73 0.7 0.62 0.9 -1.67 -1.94 0.36 0.95 -0.86 -0.53 -0.05 0.21 0.33 0.52 0.79 0.11 0.22 -0.71 -1.02 0.63 0.29 -0.05 -6.5 -0.1 -0.37 0.14 1.11 -0.12 0.14 -0.37 -0.72 -0.01 -0.34 -1.14 0.02 -0.16 -0.21
AT2G32260 (CCT1)
0.46 0.6 0.32 -0.19 0.74 -0.08 -1.24 0.61 1.17 1.12 1.13 -2.73 -1.69 0.28 0.79 -0.15 -0.19 -0.03 -0.16 -0.61 -0.32 0.77 -0.31 -0.0 -0.13 -1.09 0.16 0.06 -0.41 -3.37 -0.34 -0.97 -0.35 0.02 -0.91 -0.1 -1.01 -1.21 -0.22 -0.0 -0.62 0.16 0.2 0.18
AT2G32900 (ATZW10)
0.29 -0.37 0.62 0.29 -0.01 -0.01 -0.95 -1.2 -0.92 -0.8 -0.78 -1.87 -2.72 -0.04 0.12 -0.56 0.04 0.45 0.09 -0.22 0.33 0.37 -0.23 0.2 -0.52 0.05 0.71 0.83 0.28 0.31 -0.04 0.61 -0.26 -0.29 0.02 0.61 0.72 0.55 0.53 -0.02 -1.27 -0.66 -0.31 -0.14
-1.14 0.32 -0.41 -0.75 - -1.17 -1.95 -0.13 0.84 0.78 0.7 -0.14 -3.24 -0.38 0.91 -1.07 -0.47 0.13 -0.36 -0.44 0.63 0.9 0.76 1.05 -0.26 -0.97 1.04 0.83 0.39 -3.48 -0.04 0.08 -0.33 0.84 -0.21 -0.77 -0.13 -0.06 0.6 -0.51 -1.53 -0.69 -0.16 -0.03
AT2G46180 (GC4)
0.38 -0.32 0.67 0.21 1.43 -0.02 -0.86 -0.17 0.0 -0.17 -0.01 -2.35 -2.72 0.27 0.33 -0.99 -0.53 0.06 0.28 0.05 0.28 0.73 -0.0 0.43 -0.3 -1.11 0.43 0.32 0.12 -3.9 0.09 -1.24 0.06 0.32 -0.44 1.28 -1.3 -1.45 0.19 -0.05 -1.21 0.44 0.32 -0.44
-0.34 -0.44 -0.6 -1.47 -1.84 -1.43 -1.49 0.99 1.69 1.77 1.69 -4.49 -2.81 -0.29 1.35 -0.96 -0.65 -0.45 -0.49 -0.78 -0.38 0.25 -0.02 0.33 0.01 -0.7 0.24 0.28 0.06 -4.15 -0.05 -1.09 -0.07 0.7 -0.3 0.8 -1.01 -1.53 0.24 -0.49 -0.88 -0.88 0.3 -0.11
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AT5G22950 (VPS24.1)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.