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Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.87 -0.4 -0.39 -0.43 -0.34 -0.6 -0.29 -0.48 -0.47 -0.35 -0.49 -0.54 -0.79 0.62 0.54 0.7 0.23 0.63 0.46 0.15 -1.22 1.0 0.31 0.15 -0.17 0.31
-0.5 -0.6 -0.6 -0.41 -0.25 -0.53 -0.22 -0.36 -0.32 -0.26 -0.35 -0.29 -0.47 0.48 0.23 0.28 0.22 0.28 0.27 0.1 -0.95 1.23 0.19 -0.04 0.33 0.48
0.13 0.24 -0.04 -0.29 -0.81 -1.5 -0.74 -0.37 -0.51 0.03 -0.15 -0.29 -0.19 0.07 -0.04 0.13 -0.32 0.5 0.19 -0.15 -2.35 1.17 0.53 0.4 0.52 0.37
-1.27 -0.59 -0.31 -0.3 -0.12 -0.03 0.27 -0.04 -0.24 -0.15 -0.41 -0.42 -1.38 1.07 0.93 0.62 0.46 0.65 0.52 0.27 -3.23 0.26 -1.78 -0.36 0.02 0.12
-0.17 -0.03 0.04 0.01 -0.02 -0.16 -0.12 -0.13 -0.41 -0.35 -0.45 -0.19 -0.32 -0.17 -0.68 -0.07 -0.67 0.44 0.12 -0.62 -0.76 1.56 -0.03 0.51 0.09 0.3
-1.72 -0.51 -0.2 -0.27 -0.25 -0.57 -0.54 -0.38 -0.14 0.23 -0.0 0.06 -1.61 0.08 0.15 -0.11 -0.0 0.51 0.45 -0.33 -2.98 1.59 -0.1 0.47 0.46 0.47
-2.11 -1.34 -0.89 -0.4 -0.19 -0.01 -0.0 -0.23 -0.13 -0.13 -0.38 -0.51 -1.76 0.88 0.28 0.58 0.06 0.56 0.62 0.24 -2.05 1.15 -0.27 -0.14 0.61 0.35
-2.13 -1.6 -0.9 -0.51 -0.43 -0.76 -0.1 -0.29 -0.33 -0.25 -0.51 -0.68 -1.97 1.01 0.52 0.82 0.21 0.65 0.75 0.36 -1.87 1.01 -0.15 -0.22 0.62 0.5
0.14 -0.07 0.02 -0.16 -0.41 -0.56 -0.24 0.01 -0.3 -0.25 -0.18 0.08 0.29 0.37 -0.05 0.25 -0.43 0.36 -0.26 -0.37 -1.56 1.14 -0.27 -0.14 0.41 0.31
-0.65 -0.76 -0.57 -0.67 -0.26 -0.7 -0.54 -0.34 -0.15 0.11 0.08 0.21 -0.51 0.46 -0.04 0.32 -0.26 0.69 0.19 -0.5 -1.92 1.57 -0.4 0.15 0.41 0.42
-0.44 -0.13 -0.13 -0.28 -0.11 -0.44 -0.28 -0.43 0.09 -0.03 -0.13 -0.19 -0.76 0.06 0.19 -0.01 -0.51 0.17 0.2 -0.4 -1.97 1.3 0.53 0.31 0.43 0.4
-0.29 -0.67 -0.48 -0.11 0.17 0.29 0.36 0.15 0.06 -0.08 -0.12 -0.0 0.04 0.09 -0.02 0.29 -0.04 0.18 -0.18 -0.02 -2.16 1.09 -0.67 -0.21 -0.33 0.42
-0.96 -1.16 -0.88 -0.64 -0.41 -0.57 -0.07 -0.25 -0.49 -0.41 -0.77 -1.05 -0.98 0.53 0.21 0.58 0.59 0.63 0.51 0.59 -1.77 1.11 0.22 0.15 0.55 0.42
-0.75 -0.39 -0.29 -0.16 0.23 0.18 0.07 -0.0 0.27 0.16 -0.0 -0.06 -0.66 0.25 0.18 -0.07 0.17 0.92 0.57 0.33 -3.52 0.86 -0.79 -0.49 -0.69 -0.28
-2.6 -2.47 -2.39 -1.81 -2.38 -3.0 -3.36 -3.55 -3.4 -2.82 -2.51 -2.64 -2.8 0.88 0.88 0.52 0.33 1.47 1.28 1.14 -0.65 0.37 0.03 1.09 1.37 1.35
-1.34 -1.15 -1.41 -1.54 -0.87 -0.27 -0.05 -0.35 -0.03 -0.34 -0.29 -0.68 -1.27 0.31 0.45 -0.22 -0.14 0.72 0.55 -0.49 -1.63 1.05 -0.15 1.13 1.1 0.92
-1.74 -0.7 -0.39 -0.38 0.0 0.21 0.31 0.04 0.26 0.28 0.08 0.13 -1.21 0.21 0.27 0.25 0.24 0.41 0.4 0.31 -3.39 1.14 -1.15 -0.23 -0.05 -0.07
-0.7 -0.49 -0.52 -0.19 -0.25 0.14 -0.15 -0.2 -0.24 -0.5 -0.21 -0.19 -0.8 0.22 0.54 0.71 0.13 0.63 0.34 -0.33 -1.85 1.14 0.15 -0.78 -0.02 0.47
-1.03 -1.37 -0.71 -0.49 -0.66 -0.96 -0.36 -0.43 -0.55 -0.72 -0.89 -0.8 -1.3 0.42 0.43 0.61 0.1 0.69 0.35 0.03 -0.55 1.04 0.11 0.24 1.14 0.94
-0.69 -1.24 -0.49 -0.01 -0.39 -0.22 -0.01 -0.3 0.06 -0.39 -0.5 -0.71 -1.45 0.05 0.68 0.27 -0.31 0.32 0.23 -0.98 -1.44 1.18 0.22 0.93 0.87 0.27
-0.2 -0.16 -0.3 -0.14 -0.12 -0.23 -0.14 -0.19 -0.29 -0.24 -0.23 -0.12 -0.17 -0.0 0.19 -0.25 -0.36 0.61 0.13 -0.46 -1.1 1.1 -0.05 0.32 0.51 0.38
-0.48 -0.41 -0.13 -0.14 0.04 -0.02 0.19 -0.12 -0.1 -0.0 -0.33 -0.24 -0.43 0.51 -0.07 0.66 0.21 0.47 0.5 0.35 -2.1 0.43 -0.3 -0.38 -0.19 0.12
-2.68 -0.79 -0.47 -0.41 -0.11 -0.08 -0.01 -0.08 0.25 -0.21 -0.41 -0.64 -2.54 0.49 0.35 0.33 0.2 0.37 0.49 -0.31 -1.64 1.24 0.31 0.12 0.59 0.34
-2.84 -0.84 -0.61 -0.63 -0.39 -0.71 0.13 -0.26 -0.06 -0.3 -0.56 -0.68 -3.07 0.69 0.57 0.6 0.29 0.48 0.52 -0.01 -1.47 0.99 0.23 0.49 0.62 0.46
0.16 -0.76 -0.59 -0.55 0.16 -0.42 -0.46 -0.05 -0.09 -0.49 -0.19 -0.05 0.23 -0.08 -0.09 0.14 -0.47 0.62 0.32 -0.4 -1.29 0.71 0.74 0.04 0.49 0.4
-0.79 -0.35 -0.19 -0.0 0.03 -0.19 -0.12 -0.18 -0.02 -0.09 -0.01 -0.11 -0.68 0.24 0.16 0.57 0.04 0.32 0.34 -0.1 -2.75 1.1 -0.26 -0.02 -0.01 0.28
-1.4 -0.44 -0.23 -0.36 0.14 0.3 -0.07 -0.19 -0.05 -0.26 -0.37 -0.61 -1.34 0.64 0.65 0.75 0.43 0.55 0.72 0.38 -4.01 0.81 -1.7 -0.97 0.29 0.04
-1.88 -1.96 -1.21 -0.3 -0.32 -0.01 0.81 0.6 0.83 0.34 0.03 -0.25 -2.06 -0.06 -0.39 0.14 -0.38 0.46 -0.31 -0.69 -1.7 1.55 0.22 -0.58 0.69 -0.07
-0.88 -0.64 -0.43 -0.35 -0.08 0.31 0.27 -0.06 0.2 -0.27 -0.41 -0.33 -0.66 0.39 0.16 1.04 0.37 0.64 0.56 0.15 -2.53 0.56 -0.91 -0.26 -0.01 -0.21
-3.81 -3.64 -3.59 -2.66 -2.47 -2.95 -2.89 -2.59 -2.37 -2.45 -2.14 -2.85 -4.76 0.97 0.37 0.39 0.37 0.88 0.86 0.02 -0.74 1.84 0.65 1.05 1.71 1.39
-0.57 -1.4 -0.99 -1.07 -0.77 -0.41 -0.26 -0.17 -0.54 -0.68 -0.54 -0.54 -0.36 0.39 0.32 0.5 0.17 0.11 0.15 0.07 -0.81 1.33 0.37 0.39 0.93 0.6
-2.36 -1.34 -0.37 -0.28 -0.27 0.06 -0.22 -0.13 0.22 0.18 0.22 0.13 -1.75 -0.2 0.04 0.79 -0.26 0.62 0.35 -0.11 -1.52 1.39 -0.43 -0.01 0.34 0.2
-2.08 -0.93 -1.86 -2.77 -2.69 -2.55 -2.03 -3.06 -1.83 -2.5 -2.57 -2.44 -1.65 0.23 0.4 0.49 0.39 1.59 1.1 0.65 -0.94 1.55 0.76 0.53 0.83 1.43
-0.06 -0.34 -0.35 -0.68 -0.54 -0.86 -0.66 -0.63 -1.42 -0.27 -0.83 -1.05 -0.43 -0.03 0.25 0.35 -0.33 0.34 0.2 -0.5 -0.78 1.38 0.63 0.36 1.11 0.84
0.03 0.08 -0.04 -0.41 -0.42 -0.87 -0.37 -0.58 -0.6 -0.54 -0.43 -0.42 -0.14 0.09 0.4 0.67 0.08 0.37 0.38 0.05 -1.36 0.65 0.52 0.35 0.23 0.27
-0.6 -0.32 -0.22 -0.22 0.02 -0.08 0.1 -0.03 0.15 0.02 0.11 0.14 -0.07 0.48 0.31 0.38 0.15 0.44 0.13 0.06 -2.64 0.88 -0.69 -0.42 -0.35 -0.23
-0.65 -0.81 -0.6 -0.46 -0.18 -0.0 -0.09 -0.22 -0.15 -0.04 -0.12 -0.11 -0.56 0.91 0.26 0.44 -0.32 0.27 0.19 -0.37 -0.72 0.74 0.16 0.22 0.32 0.21
-1.08 -0.59 -0.54 -0.17 0.17 0.06 0.06 -0.07 -0.1 -0.27 -0.45 -0.63 -0.92 0.49 0.19 0.39 -0.23 0.45 0.38 -0.63 -0.85 1.02 -0.15 0.23 0.29 0.63
-0.32 -0.57 -0.7 -0.5 -0.61 -0.51 -0.35 -0.5 -0.59 -0.56 -0.48 -0.77 -0.44 0.47 0.08 0.5 -0.31 0.8 0.31 -0.39 -0.47 1.19 0.42 0.32 0.76 0.37
-3.9 -2.16 -2.13 -1.31 -0.65 0.02 0.82 0.21 0.76 0.54 0.05 -0.51 -4.32 0.16 0.24 0.33 -0.31 0.57 -0.2 -0.7 -1.41 1.53 0.57 0.23 0.32 0.09
-0.63 -0.46 -0.69 -0.25 -0.1 -0.61 0.03 -0.05 0.19 0.21 0.2 0.03 -0.36 0.36 0.28 0.42 -0.41 0.03 -0.09 -0.88 -2.05 0.99 0.03 0.41 0.6 0.21
-2.53 -1.12 -0.74 -0.01 -0.24 -0.81 0.12 0.27 0.74 0.38 0.32 -0.09 -2.35 0.24 -0.69 0.24 0.05 -0.11 -0.47 -0.52 -1.29 1.52 0.19 -0.09 0.95 0.08
-3.49 -4.11 -4.17 -4.23 -3.19 -3.24 -2.81 -2.38 -2.66 -2.85 -3.18 -5.19 -4.72 1.0 0.85 1.47 0.68 1.28 1.37 0.72 -1.17 1.45 0.58 0.52 0.8 1.01
-1.17 -0.43 -0.86 -0.24 0.07 -0.13 -0.06 -0.15 0.07 0.05 0.11 -0.32 -1.73 0.45 0.17 0.44 -0.17 0.16 0.29 -0.45 -3.35 1.01 0.35 0.69 0.35 0.31
-1.31 -0.41 -0.3 -0.28 0.15 -0.23 -0.13 -0.42 -0.37 -0.09 -0.44 -0.3 -1.38 0.72 0.75 0.5 0.33 0.63 0.62 0.13 -3.07 0.3 -0.44 -0.13 0.39 0.54
-0.65 -0.82 -0.53 -0.36 0.07 0.07 0.29 0.03 0.06 0.5 0.35 0.41 -0.47 0.04 -0.68 0.01 0.16 0.12 0.06 0.51 -2.7 0.92 -0.63 0.46 -0.44 0.09
-2.03 -1.43 -1.1 -0.12 -0.24 -0.28 0.27 0.17 0.56 0.21 0.08 -0.47 -2.24 0.4 -0.26 0.37 -0.07 0.47 -0.19 -0.67 -1.27 1.41 -0.15 0.43 0.68 0.21
-1.77 -0.47 -0.18 -0.26 -0.0 0.16 -0.11 -0.48 -0.16 -0.18 -0.53 -0.62 -2.18 0.28 0.39 0.16 0.07 0.67 0.71 0.29 -3.24 1.44 -0.39 0.51 -0.16 0.18
-0.28 -0.58 -0.66 -0.51 -0.77 -0.5 -0.66 -0.63 -0.43 -0.44 -0.62 -0.09 0.1 0.17 0.52 0.05 -0.42 0.54 0.31 -0.32 -2.57 1.91 0.43 -0.1 0.23 0.31
-1.63 -1.86 -1.64 -1.11 -1.05 -1.54 -1.4 -1.38 -1.05 -0.94 -0.83 -1.07 -1.86 0.27 1.01 0.37 -0.12 1.4 0.65 0.08 -0.66 1.4 0.69 0.65 0.8 0.87

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.