Heatmap: Cluster_121 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - 0.59 - - - 0.54 1.46 3.95 - 0.17 - - 0.27 - 1.33 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
-0.37 0.15 -0.21 -0.16 -0.45 -1.06 0.17 - 0.2 -0.74 - 0.88 - 0.59 0.42 1.22 -0.93 0.62 0.75 0.69 0.99 -0.21 0.5 -0.09 -0.51 -
- - - - - - - - - - - - - 2.09 - 3.15 - 2.97 - 1.59 - - - - 1.0 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 1.78 - - 2.93 - 2.98 - - - - 2.15 1.37 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.31 4.13 - 1.82 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - - - 0.83 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.23 - 1.11 1.27 - - 2.09 2.66 1.15 - - - - - - - 0.57 2.26
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
1.44 - - - 1.64 - - - 1.43 - - - - - 2.19 0.92 0.18 -0.76 2.25 - - -0.41 - 1.21 - 0.56
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.49 - - 2.36 - 2.42 - - 2.45 - - - 2.15 - - -
-0.42 0.15 -2.91 0.22 -1.75 0.31 0.0 -1.07 -0.31 -0.08 -0.03 -0.91 -0.36 0.28 0.75 0.54 0.21 1.58 0.76 0.6 -2.72 -0.49 -0.72 -1.06 0.67 -0.89
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - 0.78 - - - - - - 2.66 0.48 3.27 - - 2.79 - - - - - - -
- - - 0.76 - - - - - - - 0.92 - - 1.55 2.79 - 1.75 0.45 0.48 0.84 - - - 0.19 1.81
- - 1.79 - - - - - - - 2.72 - - - - 3.27 - 2.65 - - - - - - - -
- - - 3.15 - 2.31 - 1.95 2.19 - - - - 1.9 - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.75 - - - - - - - - - 3.22 2.84 - - 0.63 - - - - - 0.36 -
2.07 - - - - 1.02 1.21 - 2.05 0.89 1.02 - 1.44 1.84 - - - 0.26 - 0.92 - - - - - -
-1.38 -0.58 -0.68 0.84 0.12 -1.14 0.82 0.5 -0.75 -1.38 -1.4 -0.74 -1.69 0.64 0.41 0.3 0.74 1.16 -0.62 -0.49 0.23 -0.42 -3.51 -1.17 0.6 1.13
- - 2.63 - - - - -0.05 - - - 2.04 - - - 3.14 - - 2.56 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
-1.17 1.08 1.64 - -2.53 -1.09 -2.32 -1.71 -1.38 -2.55 -1.38 -3.34 -1.59 -0.61 2.84 2.67 -1.14 -0.41 -0.33 -2.52 -2.4 -1.63 -1.35 -3.53 -1.98 -2.3
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 1.85 2.16 - - 3.97 - - - - - - - - 1.14 -
0.34 -0.34 -1.59 -0.57 -0.4 - -0.14 -0.64 -0.53 - 1.18 - -0.4 -0.44 0.16 1.3 - 1.85 1.45 0.89 -0.58 -1.85 - -0.69 -0.24 1.02
3.6 - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - - - - - - - -
- - - -0.98 -0.16 -0.8 -1.73 - -1.94 -0.44 0.87 2.17 1.22 - - 2.35 -0.15 0.02 - 0.05 - -0.25 -0.56 - -0.58 1.93
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - 3.1
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.93 - - 3.43 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.6 - - 1.62 - 1.49 1.73 - 1.53 - - 2.76 1.35 - - - - - 0.62 - - - - -
-2.16 -1.57 - -0.2 -0.56 - 0.69 - -0.56 -1.25 -0.6 2.03 - - - 2.45 - 1.47 -0.43 -2.24 2.07 - 0.8 0.04 -1.8 -
- - - - - - - - 2.89 - - - - 3.6 - - - - 2.69 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.94 - - 2.7 - - - - 0.87 - - - - 3.83 - - - - - - 0.57 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - 1.95 - - 1.98 - - - - 1.77 - 3.15 - 1.19 - 1.85 - - - - - -
- - - - 2.18 - - - - 1.16 - - - 2.92 1.19 2.26 - - 2.2 - - - - - - -
- - - - 1.59 0.53 - 0.51 - - 1.55 - - 0.46 2.83 2.6 - - - 0.54 - - 0.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.66 - 2.71 - - 2.75 - - - 2.68 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - 1.96 - - - 0.97 0.85 - - - - 1.85 1.79 - 2.52 - - 2.47 - - - - - - -
- - - - - - - 0.07 - 2.06 - - - 1.69 1.93 3.36 - - - -0.52 - 0.46 - 0.46 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.