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Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.6 0.25 0.66 0.77 0.58 0.21 0.37 0.27 -0.69 -0.58 -0.98 -1.15 -1.64 -0.79 -0.76 -0.65 -0.03 0.41 0.36 0.48 -4.88 -1.12 -1.13 -0.52 1.01 1.43
-0.44 -0.88 0.32 0.42 0.05 -0.9 -0.97 -0.64 -0.65 -0.15 0.11 0.24 -0.47 -3.34 -3.35 -1.39 -2.85 -2.99 -3.2 -1.22 0.48 0.63 -0.48 0.88 1.8 2.18
-0.44 0.15 0.8 0.81 0.25 -0.21 0.1 0.34 -0.71 -0.81 -1.01 -1.09 -0.73 0.45 0.22 0.61 -0.19 0.18 -0.07 -0.01 -4.03 -0.91 -1.84 -1.64 1.16 1.06
-0.84 0.3 1.66 1.96 1.06 -0.14 -1.02 0.04 -5.6 -4.26 -3.7 -2.95 -1.39 -5.55 -5.76 -5.7 -6.35 -5.77 -5.5 -2.06 -4.95 0.21 -5.3 -2.28 2.53 2.16
-0.02 0.02 0.29 0.19 -0.04 -0.21 -0.62 -0.32 0.29 -0.03 0.04 -0.11 -1.44 -0.61 -0.14 -0.52 0.03 0.04 0.07 -0.25 -2.01 0.18 -0.08 0.25 0.77 1.28
0.77 0.61 1.06 1.08 -0.31 -1.7 -0.85 0.46 -1.16 -0.46 0.07 -0.07 1.18 0.17 -0.42 -1.9 -1.36 -1.75 -1.83 -2.65 -2.48 -2.78 -4.47 -1.88 1.42 1.81
-0.53 0.08 1.27 1.04 -0.23 -0.89 -0.4 0.4 -1.39 -1.23 -1.28 -1.25 -0.36 -1.7 -1.67 -1.9 -1.44 -1.43 -1.7 -0.78 -4.73 -1.81 -1.79 -1.84 2.28 2.49
-0.95 -1.4 -1.76 -0.35 -0.68 -0.41 -0.95 -1.25 -0.44 0.21 0.31 0.34 -1.9 0.52 -0.26 0.4 -1.29 0.07 0.06 -0.79 -0.19 0.79 -0.12 1.14 0.57 1.65
-1.11 0.36 0.74 0.65 0.2 -0.21 0.47 0.69 -0.5 -0.0 0.07 0.38 -0.05 -1.23 -1.08 -1.68 -1.11 -0.41 -0.43 0.57 -5.18 -2.52 -0.86 -0.44 1.12 1.42
-0.16 0.23 0.89 1.54 1.04 -0.11 0.06 0.77 -1.2 -0.44 0.17 -0.06 -0.34 -4.12 -3.18 -4.75 -2.64 -0.97 -0.7 -0.11 -4.93 -3.36 -4.27 -0.79 1.63 1.64
0.61 0.33 0.66 0.6 -0.05 -0.24 0.14 0.68 -0.27 -0.4 -0.4 -0.34 0.27 -0.62 -0.57 -0.56 -0.46 -0.27 -0.35 0.02 -3.54 -1.18 -1.02 -0.72 1.13 1.06
0.39 0.01 0.64 0.58 -0.27 -0.94 0.15 0.34 -0.58 -0.76 -0.73 -0.72 0.07 -0.43 -0.52 -0.3 -0.08 0.4 0.1 0.34 -3.85 -0.64 -1.22 -0.24 1.04 1.31
0.71 0.51 0.87 0.83 0.01 -0.83 -0.55 0.11 -1.21 -1.05 -0.97 -0.79 0.36 -0.31 -0.92 -0.39 -1.43 -0.54 -0.77 -0.04 -0.89 0.29 0.08 -1.06 1.15 1.31
0.4 0.42 0.68 0.93 0.42 -0.28 0.07 0.35 -0.6 -0.7 -0.4 -0.19 -0.16 -0.43 -0.36 -0.6 -0.3 -0.37 -0.54 0.02 -2.17 -2.48 -0.75 -0.37 1.11 1.11
0.79 0.41 0.92 1.01 0.57 -0.09 -0.09 0.42 -0.48 -0.87 -0.18 -0.07 0.43 -1.05 -0.75 -0.8 -0.71 -0.61 -0.98 -0.42 -1.97 -2.9 -0.71 -0.82 0.78 1.29
0.08 0.59 0.8 0.72 0.15 -0.12 0.28 0.31 -0.52 -0.11 -0.32 -0.38 0.34 -1.33 -1.5 -1.46 -1.01 -0.48 -0.75 0.33 -1.13 -3.15 -0.27 -0.11 1.1 1.3
0.31 -0.2 -0.07 -0.21 -0.85 -1.3 -0.29 0.01 -0.0 0.11 0.28 0.32 0.25 -0.35 -0.43 -0.53 -0.36 0.09 0.13 -0.11 -2.02 0.23 -0.6 0.33 0.88 1.2
0.16 0.82 0.82 0.7 -0.11 -0.47 0.01 0.28 -0.93 -0.59 -0.42 -0.12 0.49 -1.53 -1.05 -1.4 -1.01 0.0 -0.14 -0.13 -3.63 -1.08 -0.88 0.06 1.37 1.24
-0.04 -0.12 0.14 0.06 -0.32 -0.16 -0.28 -0.34 -0.45 -0.24 -0.48 -0.56 -0.4 -0.37 -1.26 -0.93 -0.81 0.08 0.1 -0.15 -1.52 0.08 0.96 0.28 1.28 1.39
-0.03 -0.09 -0.03 -0.16 -0.58 -0.25 -0.58 -0.55 -0.2 -0.01 -0.02 -0.03 -0.39 -0.61 -1.08 -0.89 -0.94 -0.32 -0.03 0.01 -1.55 0.64 0.56 0.18 1.12 1.64
0.06 1.16 1.31 1.18 -0.22 -1.57 -0.15 0.87 -4.21 -2.08 -1.74 -1.65 -0.44 -4.98 -2.32 -4.03 -4.16 -2.75 -2.19 -0.44 -0.74 -0.18 -2.31 -1.07 2.13 2.15
0.08 0.17 0.5 0.94 0.64 0.36 -0.16 0.24 -1.08 -1.26 -1.03 -1.06 0.47 -0.26 -1.13 -0.28 -1.56 -1.1 -1.39 -0.93 0.6 -0.69 -0.62 -0.41 1.21 1.39
0.33 -0.18 -0.24 0.35 -0.07 -1.61 -1.07 -0.24 -1.96 -1.11 -0.77 -0.5 0.15 -0.92 -1.49 -2.08 -1.3 0.49 -0.23 0.77 - 0.3 -1.55 -1.31 1.78 2.35
-0.46 -1.28 -0.43 0.34 0.02 0.15 -0.17 0.13 -0.11 0.27 0.2 0.07 -0.68 -0.88 -1.77 0.21 -3.21 -1.4 -1.41 -0.12 -3.69 -0.92 -1.2 -2.87 1.89 2.36
0.14 0.55 1.01 1.18 0.83 0.23 -0.17 0.09 -0.45 -1.25 -1.16 -1.26 -0.33 -1.19 -1.23 -1.32 -0.88 -0.34 -0.52 0.02 -2.81 -0.7 -0.81 -0.95 1.44 1.36
0.04 -0.18 -0.73 -0.08 -0.59 0.21 0.24 0.2 -0.15 -0.2 -0.24 -0.27 -0.65 -0.16 -0.39 0.17 -0.44 0.49 0.3 0.12 -0.77 -0.66 0.1 0.46 0.88 0.65
-1.07 -0.74 0.46 0.96 0.67 0.16 0.08 0.59 -0.08 -0.23 -0.32 -0.32 -1.02 -1.06 -1.53 -1.32 -1.24 -0.61 -1.18 -0.26 0.31 0.66 -1.26 -0.45 1.02 1.52
-2.42 -1.03 0.88 0.75 0.06 -0.37 -1.39 -0.08 -2.45 -5.34 -6.12 -6.85 -3.88 -6.98 -4.71 -5.25 -1.07 -7.01 -6.69 -0.81 -1.68 -0.95 -3.13 -0.94 2.67 3.23
-1.22 -0.36 0.38 0.5 0.2 -0.37 -0.53 -0.02 -2.72 -2.3 -2.55 -2.77 -1.69 -0.34 -0.52 0.19 -0.03 -0.23 -0.15 0.9 0.37 -0.33 0.1 0.55 1.34 1.64
0.15 0.93 1.25 1.16 0.45 -0.06 -0.29 -0.01 -0.74 -1.02 -0.79 -1.02 -0.22 -0.37 -1.77 -0.05 -2.69 -0.31 -1.16 -0.4 -3.43 -0.1 -1.9 -0.88 1.23 1.49
0.52 0.23 0.57 0.72 0.04 -0.9 -0.51 -0.13 -1.39 -0.68 -0.17 0.41 0.69 1.01 -0.01 0.61 -0.58 -1.11 -1.51 -0.91 -0.9 -0.59 -1.18 -0.64 0.87 0.67
0.46 0.47 1.49 1.81 1.11 0.21 0.51 1.09 -1.28 -3.79 -3.29 -2.93 -0.7 -7.67 -1.95 -7.37 -7.11 -7.15 -7.03 -0.78 -5.75 -0.93 -6.75 -2.72 1.77 1.9
-1.1 -0.58 0.17 0.27 -0.56 -1.37 -1.35 -0.91 -0.91 -0.05 0.15 -0.17 -0.89 0.3 0.0 -0.11 -2.18 -0.32 -0.83 -0.03 -1.33 0.68 -0.39 0.43 1.09 2.18
0.06 0.34 0.45 -0.3 -0.51 -0.64 -0.49 -0.64 -0.99 -0.68 -0.9 -1.21 -0.23 -0.06 -0.05 0.25 -0.09 0.48 0.19 0.29 -0.28 -0.12 0.17 0.34 0.68 1.21
-0.23 -0.07 -0.32 -0.56 -1.15 -1.35 -1.17 -1.28 -1.47 -1.48 -1.55 -1.38 -0.29 -0.41 -0.07 -0.06 -0.03 1.05 0.79 0.65 -0.17 -0.5 0.75 0.6 1.08 1.5
0.22 0.26 0.09 -0.16 -0.68 -1.24 -0.15 -0.12 -0.83 -0.03 -0.15 -0.16 0.13 -0.0 -1.3 -1.18 -0.33 0.16 -0.5 0.06 -1.31 0.23 0.56 0.32 1.16 1.22
-0.04 -0.32 0.5 0.72 -0.42 -1.38 -0.53 0.04 -0.68 -0.43 -0.28 -0.2 0.02 -0.79 -0.31 -0.55 -0.38 0.23 -0.09 0.46 -0.63 -0.9 0.05 0.2 1.03 1.33
0.54 0.03 0.68 0.92 0.06 -0.67 -0.39 0.55 -0.38 -1.05 -0.68 -0.32 0.49 0.32 -0.22 -0.03 -0.56 -1.07 -0.38 0.61 -3.97 -1.58 -2.5 -1.28 1.15 1.21
-0.17 0.34 0.82 1.07 0.96 0.59 0.46 0.46 -0.2 -0.57 -1.01 -1.07 -0.18 -1.02 -1.09 -1.06 -1.19 -0.71 -0.91 0.14 -2.68 -2.55 -1.08 -0.77 0.99 1.52
0.25 0.06 -0.08 0.04 -0.16 0.11 0.18 0.21 0.3 -0.69 -0.58 -0.85 0.06 -0.37 -0.37 -0.52 -0.4 0.25 -0.11 -0.15 -0.25 -1.11 0.12 -0.21 0.99 1.1
0.34 -0.21 1.05 1.24 0.37 -1.33 -0.43 0.3 -2.59 -3.25 -0.9 -1.09 -0.21 -0.91 -2.35 -2.22 -2.46 -1.86 -2.39 -2.24 - -0.12 -0.26 0.41 2.42 1.76
0.51 -2.33 -0.59 1.54 0.86 -3.2 -0.99 0.38 -2.23 -3.3 -1.24 -1.53 -2.82 -3.8 -3.47 - -2.98 -3.36 - -2.59 - 0.25 -0.03 2.03 2.35 1.98
0.34 0.2 -0.07 -0.21 -0.56 -0.03 -0.39 -0.42 -0.4 -0.73 -1.06 -0.95 0.51 0.29 -0.28 0.08 -1.03 -0.06 0.07 -0.91 -2.03 0.28 0.65 -0.21 1.53 0.92
-0.33 -0.36 -0.12 -0.0 -0.11 -0.44 -0.56 -0.49 -0.37 -0.19 -0.13 -0.01 -0.57 -0.48 -0.11 0.09 -0.18 0.25 0.5 0.61 -0.56 0.21 -0.26 0.7 0.34 0.97
-1.26 0.14 1.27 1.77 1.2 0.1 -0.06 0.3 -2.54 -2.45 -2.45 -2.44 -1.91 -2.4 -3.12 -2.93 -3.43 -3.26 -3.07 -1.65 -3.66 1.06 -3.86 -1.85 2.1 2.09
0.57 0.37 0.18 -0.05 -1.53 -1.57 -1.1 -0.17 -0.39 -0.14 -0.32 -0.13 0.11 -0.86 -0.96 -0.4 -0.62 0.39 -0.05 -0.09 -2.05 -0.57 0.27 0.46 1.46 1.43
0.29 0.47 0.59 0.54 0.18 -0.49 -0.68 -0.34 -0.43 -0.63 -0.42 -0.2 -0.08 -1.13 -1.23 -1.4 -0.75 -0.44 -0.96 -0.03 -1.71 0.16 0.67 0.39 1.36 1.16
0.65 0.08 -0.36 -0.6 -0.66 -0.53 -0.05 0.13 -0.56 0.01 -0.05 -0.14 0.32 -0.07 -1.93 -1.41 -0.0 -0.07 -0.17 -0.32 -2.92 -0.73 -0.03 0.5 1.11 1.69
-0.02 -0.34 1.66 2.33 1.39 -1.21 -0.91 0.83 -1.68 -4.81 -4.02 -3.25 -1.09 -4.74 -5.14 -4.97 -5.23 -4.8 -4.77 -0.86 -6.82 -1.91 -5.79 -3.49 1.82 2.34
0.52 -0.22 1.71 2.41 1.03 -1.04 -0.55 0.63 -5.08 -4.99 -4.29 -3.42 -0.4 -6.61 -6.19 -6.14 -6.26 -6.83 -6.42 -0.45 -7.62 -0.95 -7.04 -3.02 1.68 2.24
0.27 0.21 0.99 1.12 0.66 0.09 0.34 0.42 -0.38 -1.12 -0.92 -0.88 0.11 -0.36 -0.13 -0.09 0.06 -0.65 -0.91 -0.21 -4.01 -1.41 -1.73 -1.37 1.02 0.98
0.2 0.36 0.95 1.15 0.13 -0.82 -0.77 0.07 -1.15 -0.26 0.46 0.6 -0.32 -0.39 -2.5 0.3 -3.61 -2.76 -6.77 -1.09 -1.5 -2.07 -2.51 -0.86 1.31 2.16
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0.14 0.25 1.05 1.12 0.7 -0.05 0.49 0.72 0.02 -0.24 -0.47 -0.46 -0.01 -0.57 -1.01 -0.88 -1.28 -0.49 -0.65 -0.53 -2.23 -0.59 -1.75 -1.1 0.61 1.13
-5.01 -2.94 -1.74 0.7 1.4 0.45 -0.11 -0.63 -0.16 0.48 0.87 0.48 -3.63 0.54 -2.08 -1.0 -1.89 -2.58 -2.7 -1.48 -3.42 -1.38 -3.63 0.45 1.54 2.26
-0.3 -1.41 -0.98 0.1 -1.59 -0.16 -0.71 -0.87 -1.12 -0.63 -0.23 0.01 -0.39 -0.14 -1.74 -1.09 -2.82 -1.92 -5.34 -1.29 1.24 -0.23 -2.48 -1.6 2.18 2.67
0.59 0.28 0.85 1.24 0.24 -1.2 0.08 0.9 -1.82 -2.27 -1.42 -0.94 0.47 -0.02 -1.11 -0.74 -1.34 -1.05 -1.97 -0.66 -0.19 -1.41 -1.33 -1.84 1.55 1.65
0.6 0.29 0.51 0.34 0.07 -0.08 -0.25 -0.01 -0.69 -0.49 -0.72 -0.48 0.13 -0.72 -0.74 -0.57 -0.53 -0.22 -0.07 -0.15 -1.55 -0.55 0.67 -0.19 1.0 1.15
0.17 -0.13 0.18 0.71 0.4 -0.3 -0.57 -0.19 -0.56 -0.83 -0.44 -0.48 -0.18 -0.74 -1.43 -1.5 -2.96 -2.01 -2.3 0.04 -1.79 0.88 -4.89 -2.16 1.98 2.22
1.23 0.34 1.08 0.56 -0.53 -2.58 -0.73 0.31 -2.68 -1.74 -0.83 -1.2 0.24 -0.39 -0.88 -1.69 -0.77 0.55 0.08 0.19 -3.39 -1.7 -2.04 -2.05 1.45 1.99
-0.07 -0.29 0.08 0.46 -0.18 -1.24 -0.5 -0.04 -0.46 -0.39 -0.33 -0.47 -0.59 -0.44 -0.03 -0.64 -0.28 0.11 -0.28 0.8 -2.2 0.81 -0.66 -0.19 1.15 1.39
-0.0 0.42 0.73 0.51 0.04 -0.3 -0.36 -0.12 -0.65 -0.63 -0.47 -0.49 -0.46 -0.22 -0.1 0.09 -0.24 -0.19 -0.1 -0.03 -1.06 -0.06 -0.5 0.14 0.86 1.04
0.7 0.24 -0.03 -0.01 -0.03 0.15 0.35 0.21 -0.15 -0.32 -0.26 0.12 0.34 -0.53 -0.58 -0.98 -0.59 -0.33 -0.21 -0.47 -0.1 -0.09 -0.37 0.56 0.37 0.58
0.27 0.26 0.62 0.06 -0.01 0.11 -0.25 -0.18 -0.1 -0.75 -0.71 -0.46 -0.3 -0.49 0.06 -0.45 -0.64 -0.2 0.04 -0.28 0.32 -0.49 0.34 -0.29 0.66 1.05
0.38 0.32 1.11 1.58 0.8 -0.54 0.06 0.62 -2.16 -1.42 -1.15 -1.4 0.26 -2.64 -3.41 -2.48 -3.05 -2.1 -2.41 -0.78 -2.14 0.72 -2.52 -1.38 1.7 1.78
0.91 0.03 -0.13 0.48 -0.5 -1.79 -0.85 -0.13 -1.18 -1.17 -0.69 -0.95 0.84 1.02 -0.96 1.78 -1.18 -1.39 -2.08 -1.63 -3.13 0.13 -1.51 -1.56 1.61 1.14
0.32 0.26 0.58 0.64 0.53 0.51 0.34 0.23 -0.4 -0.7 -0.89 -0.91 -0.08 -0.43 -0.79 -0.56 -0.73 -0.44 -0.46 -0.11 -2.65 -0.15 -1.0 -0.73 1.25 1.18
0.45 0.15 0.53 0.2 -0.46 -0.6 -0.6 -0.1 -0.92 -0.86 -0.69 -0.33 0.36 -0.0 -0.09 0.17 -0.24 -0.0 0.03 -0.09 -3.24 -1.98 -0.08 -0.22 1.22 1.49
0.87 -0.24 0.24 0.9 -0.12 -1.36 -0.56 0.28 -0.7 -0.62 -0.46 -0.51 0.54 -0.96 -1.29 1.02 -1.74 -1.18 -1.24 -0.92 -1.12 0.24 -0.43 -1.68 1.42 1.54
-1.5 -0.93 -0.67 0.02 0.14 -0.01 -0.42 -0.25 -1.67 -1.41 -1.66 -2.29 -1.82 -1.24 -0.16 -0.35 0.54 0.91 0.65 1.07 0.33 -0.37 0.4 -0.12 1.2 1.39
0.36 0.35 0.53 0.49 -0.86 -2.03 -0.81 -0.08 -1.74 -0.89 -0.82 -0.99 0.31 0.08 -0.46 0.66 -0.45 -0.16 -0.26 0.12 -1.6 -1.62 0.14 -0.21 1.5 1.47
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-0.63 0.39 0.77 0.65 -0.21 -0.26 -0.02 0.15 -1.05 -0.53 -0.56 -0.28 -0.25 -0.49 -0.37 -0.35 -0.3 -0.02 -0.45 0.05 -2.27 -1.45 0.01 -0.15 1.45 1.27
0.31 0.82 0.38 0.23 -0.34 -0.51 -0.42 -0.29 -0.81 -0.14 0.1 0.33 0.38 -1.14 -3.25 -2.42 -1.73 0.08 -0.06 0.11 -2.71 -0.94 -0.56 0.14 1.46 1.59
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0.53 0.1 0.27 0.76 0.1 -0.56 -0.08 0.32 -0.86 -0.97 -0.55 -0.56 0.57 -0.73 -0.66 1.17 -0.81 -0.23 -0.72 -0.93 -1.69 -0.77 -1.11 -0.34 1.3 1.06
0.19 0.14 0.55 0.31 0.17 0.22 0.05 -0.11 -0.48 -0.34 -0.14 0.23 0.02 -1.05 0.04 -0.95 -0.52 -0.55 -0.26 0.26 -1.23 -0.84 -0.34 0.31 0.73 1.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.