1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.27 - - 0.75 - - - 2.34 -
- 2.26 - - 1.58 - 2.13 - - 1.63 1.65 - - - - 1.82 - - - - - - 2.02 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.47 - - 2.0 - - 3.45 - -
0.67 2.46 0.68 - 1.97 - 0.69 - - - - - 1.08 0.52 0.43 - - 0.09 - - 2.15 0.43 - - - -
- 3.38 - - - - - - - 2.12 - - - 2.05 - - - - - - - - 2.83 - - -
- 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.1 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.21 - - - - - - - - 4.06 - - - - - - - -
-0.21 3.13 1.22 - 0.8 1.0 1.11 -0.02 1.11 - 0.06 - 1.53 - - 0.08 - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - - - -
- 0.2 0.19 - - - - 0.17 - -0.09 - - - - - 1.43 1.05 3.85 - - - - - - 1.28 -
- 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - 3.61 - - - - - - - -
- -1.3 - - -2.53 -1.08 - -1.51 -2.74 -1.77 -0.95 -1.63 -2.33 -2.89 -1.01 -1.79 -1.09 2.67 1.01 1.85 0.79 -1.98 2.07 1.54 - -0.59
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 3.24 - - - - - - - - - - 4.05 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.5 - - - - - - - 3.87 - - - - - - - -
- 0.72 - - - 0.49 0.68 3.22 - - 0.41 0.57 0.87 - - - - 1.31 1.99 - - - - - -0.14 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.18 2.33 -0.15 - -3.83 -1.48 0.43 - - -4.8 - - 1.4 - -4.84 -0.75 -0.73 -4.9 - 1.1 1.65 2.37 - - - 0.72
- - - - 1.02 0.33 - - - - - 1.99 - 0.73 0.23 - 1.53 2.27 2.14 - - - - 0.21 -0.36 0.89
3.06 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.62 - - 2.43 - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.09 - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - 2.57 - - - - -
- 2.86 - 1.23 - - 1.73 - - - 1.24 - - - 1.02 2.42 - 0.53 - 0.95 - - - - - -
-1.2 -2.63 -5.69 -3.02 -1.49 -2.65 -2.32 -1.51 -0.97 -0.83 -0.03 -0.12 -0.24 0.55 0.15 -0.21 -1.63 0.89 1.7 1.67 0.8 0.6 -0.42 1.59 -0.41 -0.87
- 1.33 - - - - - 0.08 - - - - - - -0.22 - 3.23 3.4 -0.14 -0.45 - - - - - -
2.3 2.53 - - 1.56 2.27 - 2.33 - 1.32 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.85 -2.36 -2.74 - -2.23 - -2.31 - - -0.76 - -1.48 0.63 - 0.53 3.42 -2.79 -0.44 1.76 -2.69 1.87 -0.33 -1.53 -0.36
- - 0.31 0.77 0.78 -0.8 - - -0.76 - - - - 0.54 - - -0.61 3.85 0.12 -0.13 -0.5 - - -0.91 - -1.31
- - - - - - 0.43 0.11 - -0.89 - 0.32 - 0.57 0.62 -0.79 2.83 2.05 1.78 - -0.71 - 0.43 - -0.42 -0.35
- 3.96 - - - - - 2.27 - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.66 - - 3.74 - 1.67 - - - 1.65 - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.63 - -1.32 1.87 1.31 0.69 0.69 0.24 -0.26 1.74 1.47 1.09 -1.43 - - - -1.12 0.74 - -1.7 - -0.04 0.02 -0.72 - -1.9
- 2.69 - 0.6 1.81 - - - - - - - - -0.06 2.66 - - 1.65 2.04 - - - - - - -
- - 2.1 - - - - - - - - - - 1.71 - - 2.07 2.71 - - - - 1.49 - - 2.29
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
2.58 3.17 - - - - - - - - - - 2.99 - - - - - - - 1.61 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 4.05 2.27 - - - - - - 2.22 - - - - - - - - - - - - - - - -
1.89 1.77 - - - - - - - - - - - - 2.1 2.08 - 1.65 2.12 - - - 1.53 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.88 2.91 - - - - - - - - - - - - 1.65 - - - 3.26 - - - - - 1.07 -
- 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - 2.86 - - - - -
- 3.51 - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.85 - - - 1.52 - - - - - - - - 2.77 1.16 - 3.62 - - - - - - - -
0.94 3.49 - 2.32 - - - - - - 1.21 1.34 - 1.59 - - - - - - - - - - - -
- 3.46 - - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.66 - - - - 3.74 - - -
- - - - - - - - - - - 3.01 - 2.75 - - - 3.49 - - - - - - - -
3.26 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.2 - - - - - - -
- 1.16 -0.01 - -0.3 2.29 - 0.88 - 0.95 - - - - - -0.11 0.22 -0.16 2.29 1.4 - - - 0.6 0.32 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 3.31 - - - - - - - - 2.66 - - - 2.64 - - - - - 1.8 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.88 - - - 3.11 2.88 - - 1.65 1.67 - - -
- 0.86 0.01 0.09 0.85 -0.82 0.59 -2.29 -2.26 0.23 - -1.22 - 0.42 0.6 1.27 2.14 0.13 1.76 0.4 - -1.02 -1.97 - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 0.15 0.36 2.0 0.09 - 2.19 -0.23 -0.5 3.35 -0.51 0.59
- 3.5 - - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.18 - - - - - - 0.47 1.36 - - - - - - - - - - 1.6 - - - - -0.08
2.8 - - - - - - 2.02 - - - - - - - - - 3.06 2.73 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
2.28 1.73 - - - - - 2.17 - - - - - - 1.9 - - 1.4 - - 2.8 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - 0.25 - - - - - - 0.44 - - 0.1 1.41 - 4.13 1.18 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.96 - - - 3.38 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.91 - - - - - -1.98 3.39 - - - - - - - - - -1.94 - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.