Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.18 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.42 0.41 0.4 0.45 0.51 0.55 0.5 0.44 0.45 0.39 0.42 0.44 0.33 0.27 1.0 0.29 0.46 0.48 0.4 0.12 0.35 0.2 0.2 0.33 0.28
0.08 0.06 0.03 0.01 0.02 0.06 0.14 0.17 0.19 0.24 0.2 0.15 0.08 0.2 0.03 1.0 0.08 0.08 0.06 0.12 0.0 0.0 0.04 0.04 0.07 0.04
0.16 0.27 0.31 0.34 0.32 0.27 0.28 0.31 0.26 0.29 0.25 0.26 0.16 0.29 0.21 1.0 0.2 0.31 0.2 0.22 0.19 0.1 0.28 0.16 0.29 0.2
0.03 0.03 0.03 0.03 0.05 0.08 0.13 0.11 0.1 0.1 0.07 0.05 0.02 0.06 0.04 1.0 0.06 0.07 0.06 0.08 0.0 0.02 0.03 0.03 0.05 0.03
0.05 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.05 0.18 0.01 1.0 0.03 0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.12 0.1 0.13 0.07 0.02 0.05 0.08 0.07 0.17 0.22 0.2 0.23 0.02 0.03 1.0 0.21 0.05 0.04 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02
0.02 0.06 0.11 0.11 0.07 0.06 0.07 0.1 0.06 0.05 0.04 0.04 0.01 0.04 0.07 1.0 0.05 0.08 0.07 0.06 0.0 0.02 0.02 0.04 0.1 0.09
0.07 0.05 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.05 0.01 0.01 1.0 0.01 0.03 0.02 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02
0.08 0.11 0.09 0.13 0.14 0.1 0.16 0.19 0.22 0.22 0.22 0.19 0.08 0.5 0.26 1.0 0.24 0.15 0.1 0.12 0.01 0.38 0.1 0.08 0.1 0.11
0.19 0.22 0.24 0.25 0.26 0.21 0.33 0.32 0.35 0.32 0.25 0.24 0.2 0.37 0.33 1.0 0.3 0.54 0.36 0.27 0.09 0.22 0.3 0.27 0.25 0.25
0.04 0.05 0.05 0.06 0.07 0.1 0.1 0.1 0.13 0.12 0.11 0.11 0.04 0.32 0.13 1.0 0.11 0.1 0.11 0.1 0.01 0.06 0.05 0.05 0.06 0.07
0.05 0.06 0.07 0.08 0.08 0.09 0.15 0.14 0.18 0.16 0.15 0.12 0.05 0.3 0.11 1.0 0.11 0.11 0.09 0.09 0.01 0.09 0.07 0.08 0.12 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.03 0.0 0.05 0.03 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.02
0.07 0.07 0.18 0.27 0.27 0.28 0.26 0.27 0.33 0.3 0.29 0.26 0.1 0.27 0.27 1.0 0.19 0.25 0.24 0.18 0.03 0.29 0.22 0.23 0.33 0.3
0.2 0.13 0.09 0.04 0.02 0.05 0.22 0.18 0.16 0.4 0.35 0.24 0.17 0.15 0.08 1.0 0.26 0.22 0.27 0.29 0.01 0.25 0.16 0.21 0.28 0.4
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.42 0.28 0.18 0.1 0.09 0.2 0.27 0.27 0.24 0.23 0.23 0.35 0.14 0.23 1.0 0.22 0.35 0.24 0.3 0.06 0.09 0.24 0.21 0.22 0.19
0.29 0.3 0.23 0.25 0.24 0.21 0.34 0.27 0.3 0.18 0.2 0.2 0.17 0.12 0.15 1.0 0.12 0.2 0.26 0.13 0.04 0.35 0.14 0.23 0.51 0.21
0.04 0.06 0.1 0.11 0.05 0.03 0.05 0.05 0.02 0.03 0.03 0.05 0.06 0.04 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.18 0.01 0.02 0.09 0.11
0.28 0.29 0.21 0.24 0.24 0.23 0.27 0.29 0.24 0.22 0.2 0.25 0.2 0.09 0.14 1.0 0.14 0.21 0.31 0.15 0.02 0.24 0.1 0.11 0.28 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01
0.03 0.06 0.09 0.12 0.17 0.18 0.22 0.22 0.17 0.17 0.16 0.13 0.04 0.12 0.1 1.0 0.25 0.12 0.1 0.09 0.0 0.07 0.11 0.08 0.09 0.08
0.0 0.01 0.03 0.04 0.04 0.06 0.05 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.0 0.22 0.03 1.0 0.03 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 1.0 0.03 0.08 0.05 0.02 0.11 0.02 0.01 0.0 0.02 0.04
0.08 0.08 0.26 0.14 0.07 0.1 0.24 0.47 0.58 0.71 0.84 0.57 0.19 0.22 0.12 1.0 0.18 0.24 0.25 0.21 0.01 0.04 0.29 0.14 0.41 0.17
0.24 0.31 0.33 0.33 0.33 0.34 0.37 0.36 0.41 0.41 0.36 0.35 0.26 0.26 0.23 1.0 0.23 0.33 0.22 0.31 0.15 0.25 0.3 0.23 0.26 0.23
0.01 0.03 0.07 0.1 0.15 0.2 0.19 0.19 0.27 0.2 0.19 0.15 0.01 0.1 0.16 1.0 0.1 0.11 0.1 0.09 0.01 0.2 0.21 0.12 0.17 0.13
0.39 0.42 0.3 0.24 0.15 0.2 0.29 0.39 0.49 0.94 0.87 0.9 0.66 0.23 0.15 1.0 0.14 0.37 0.19 0.37 0.07 0.09 0.23 0.64 0.51 0.49
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.25 0.18 0.12 0.12 0.15 0.18 0.31 0.3 0.34 0.32 0.26 0.21 0.22 0.18 0.19 1.0 0.2 0.33 0.24 0.19 0.07 0.1 0.24 0.24 0.2 0.16
0.27 0.17 0.08 0.06 0.1 0.2 0.27 0.29 0.35 0.29 0.24 0.18 0.23 0.15 0.17 1.0 0.17 0.23 0.2 0.18 0.06 0.06 0.18 0.18 0.16 0.11
0.11 0.12 0.13 0.12 0.13 0.17 0.24 0.22 0.32 0.32 0.28 0.23 0.11 0.39 0.29 1.0 0.29 0.34 0.22 0.25 0.07 0.16 0.18 0.14 0.17 0.16
0.07 0.08 0.11 0.1 0.06 0.04 0.06 0.08 0.09 0.09 0.1 0.11 0.05 0.08 0.05 1.0 0.05 0.05 0.04 0.05 0.01 0.2 0.04 0.09 0.1 0.12
0.47 0.13 0.02 0.01 0.0 0.01 0.09 0.16 0.07 0.08 0.06 0.05 0.34 0.01 0.01 1.0 0.02 0.07 0.05 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01
0.15 0.15 0.2 0.18 0.16 0.21 0.26 0.26 0.3 0.29 0.26 0.23 0.14 0.28 0.44 1.0 0.24 0.36 0.22 0.27 0.05 0.14 0.22 0.19 0.21 0.28
0.03 0.01 0.02 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.59 0.08 1.0 0.05 0.13 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.1 0.07
0.14 0.19 0.14 0.1 0.05 0.05 0.1 0.15 0.17 0.19 0.18 0.16 0.13 0.15 0.12 1.0 0.09 0.11 0.11 0.12 0.03 0.06 0.15 0.1 0.1 0.1
0.06 0.04 0.06 0.06 0.08 0.08 0.09 0.1 0.08 0.1 0.11 0.13 0.05 0.24 0.13 1.0 0.1 0.13 0.15 0.11 0.07 0.03 0.14 0.13 0.12 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.12 0.19 0.34 0.33 0.29 0.17 0.02 0.26 0.04 1.0 0.07 0.07 0.06 0.05 0.0 0.06 0.0 0.01 0.14 0.1
0.22 0.32 0.37 0.46 0.44 0.42 0.41 0.4 0.44 0.46 0.44 0.37 0.22 0.11 0.22 1.0 0.27 0.27 0.29 0.29 0.06 0.18 0.2 0.27 0.29 0.26
0.16 0.14 0.18 0.21 0.26 0.29 0.25 0.23 0.21 0.21 0.2 0.16 0.15 0.12 0.09 1.0 0.13 0.17 0.17 0.2 0.04 0.11 0.11 0.12 0.21 0.18
0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.04 0.01 0.33 0.12 1.0 0.07 0.1 0.04 0.05 0.01 0.03 0.01 0.02 0.06 0.04
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.02 0.02
0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.0 0.01 0.02 1.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.05 0.04 0.03 0.06 0.03
0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02
0.25 0.39 0.46 0.43 0.52 0.47 0.43 0.38 0.35 0.27 0.18 0.15 0.17 0.1 0.24 1.0 0.47 0.82 0.65 0.72 0.02 0.32 0.06 0.13 0.81 0.36
0.01 0.05 0.11 0.19 0.16 0.16 0.32 0.3 0.49 0.38 0.33 0.19 0.04 0.22 0.25 1.0 0.15 0.16 0.12 0.15 0.0 0.07 0.17 0.09 0.22 0.17
0.14 0.19 0.16 0.15 0.14 0.12 0.14 0.16 0.18 0.16 0.16 0.16 0.14 0.17 0.14 1.0 0.14 0.19 0.13 0.11 0.09 0.1 0.19 0.11 0.2 0.11
0.04 0.04 0.08 0.07 0.07 0.05 0.05 0.07 0.08 0.17 0.2 0.22 0.06 0.04 0.09 1.0 0.17 0.12 0.02 0.06 0.01 0.06 0.01 0.06 0.07 0.18
0.07 0.11 0.12 0.14 0.15 0.11 0.1 0.1 0.15 0.32 0.38 0.42 0.16 0.05 0.15 1.0 0.14 0.17 0.03 0.08 0.03 0.24 0.03 0.07 0.17 0.24
0.02 0.0 0.0 0.02 0.06 0.12 0.17 0.15 0.21 0.32 0.25 0.17 0.03 0.03 0.05 1.0 0.09 0.15 0.13 0.15 0.02 0.02 0.22 0.21 0.1 0.08
0.12 0.33 0.38 0.38 0.34 0.3 0.3 0.38 0.32 0.32 0.26 0.2 0.11 0.1 0.2 1.0 0.24 0.38 0.36 0.35 0.0 0.11 0.03 0.06 0.23 0.15
0.17 0.27 0.4 0.42 0.48 0.42 0.35 0.37 0.37 0.35 0.27 0.23 0.16 0.13 0.28 1.0 0.3 0.49 0.49 0.4 0.02 0.27 0.17 0.17 0.35 0.2
0.0 0.02 0.06 0.09 0.1 0.12 0.11 0.1 0.11 0.09 0.07 0.05 0.01 0.05 0.11 1.0 0.08 0.13 0.11 0.12 0.01 0.06 0.08 0.06 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0
0.03 0.08 0.12 0.19 0.23 0.21 0.29 0.26 0.33 0.28 0.25 0.19 0.05 0.32 0.21 1.0 0.28 0.23 0.21 0.21 0.11 0.27 0.29 0.31 0.31 0.34
0.14 0.1 0.13 0.15 0.14 0.13 0.15 0.17 0.15 0.17 0.2 0.21 0.18 0.17 0.28 1.0 0.13 0.15 0.12 0.11 0.08 0.17 0.19 0.16 0.23 0.19
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.18 0.0 1.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.12 0.13 0.12 0.18 0.22 0.24 0.22 0.21 0.16 0.21 0.18 0.19 0.04 0.14 0.09 1.0 0.09 0.23 0.15 0.12 0.02 0.23 0.09 0.09 0.33 0.18
0.46 0.25 0.19 0.18 0.16 0.21 0.35 0.43 0.35 0.41 0.38 0.37 0.43 0.18 0.18 1.0 0.19 0.38 0.31 0.27 0.05 0.18 0.36 0.31 0.35 0.27
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
0.67 0.43 0.32 0.28 0.35 0.4 0.38 0.36 0.26 0.24 0.23 0.24 0.62 0.14 0.24 1.0 0.29 0.3 0.33 0.31 0.0 0.14 0.1 0.1 0.13 0.1
0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 0.0 0.02 0.04 0.08 0.06 0.11 0.04 0.05 0.21 0.11 1.0 0.03 0.05 0.03 0.03 0.02 0.01 0.04 0.0 0.08 0.06
0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03
0.02 0.06 0.12 0.16 0.21 0.21 0.25 0.24 0.22 0.24 0.2 0.18 0.04 0.08 0.26 1.0 0.07 0.1 0.11 0.08 0.01 0.08 0.05 0.12 0.13 0.08
0.14 0.14 0.16 0.17 0.14 0.11 0.15 0.15 0.19 0.2 0.22 0.24 0.16 0.41 0.29 1.0 0.18 0.19 0.2 0.15 0.09 0.2 0.2 0.21 0.17 0.2
0.08 0.07 0.07 0.08 0.06 0.06 0.1 0.11 0.09 0.08 0.09 0.08 0.11 0.22 0.09 1.0 0.08 0.08 0.08 0.09 0.05 0.06 0.07 0.06 0.14 0.16
0.21 0.2 0.2 0.19 0.19 0.18 0.3 0.37 0.39 0.46 0.55 0.56 0.33 0.19 0.17 1.0 0.15 0.26 0.22 0.24 0.05 0.23 0.2 0.26 0.29 0.35
0.19 0.09 0.07 0.05 0.04 0.05 0.08 0.11 0.08 0.08 0.1 0.09 0.2 0.05 0.03 1.0 0.05 0.06 0.06 0.06 0.0 0.05 0.05 0.04 0.13 0.12
0.37 0.67 0.47 0.44 0.5 0.52 0.62 0.64 0.62 0.59 0.51 0.37 0.39 0.16 0.3 1.0 0.27 0.3 0.31 0.35 0.04 0.15 0.09 0.08 0.22 0.13
0.53 0.74 0.61 0.58 0.44 0.41 0.61 0.58 0.55 0.52 0.41 0.35 0.71 0.17 0.25 1.0 0.31 0.42 0.3 0.39 0.04 0.22 0.16 0.16 0.35 0.23
0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.06 0.1 0.06 0.08 0.02 0.01 0.01 0.02 0.21 0.17 1.0 0.05 0.03 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01
0.06 0.04 0.04 0.04 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)