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Heatmap: Cluster_184 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.05 0.04 0.0 0.15 0.18 0.08 0.36 0.42 0.16 0.08 -0.11 -0.27 -0.01 -0.07 -0.34 0.47 -0.05 0.26 0.21 0.16 -4.27 0.25 -1.12 -0.69 0.28 0.01
-0.09 0.02 -0.23 -0.08 0.2 0.33 0.41 0.3 -0.01 0.06 -0.28 -0.56 -0.3 -0.13 0.09 -0.1 -0.05 0.35 0.44 -0.08 -3.98 1.07 -0.49 -0.46 -0.04 -0.15
-0.6 -0.1 0.05 0.63 0.51 0.11 0.39 0.75 0.4 -0.39 -0.16 -0.28 -0.94 -0.55 -0.38 -0.29 -0.72 0.51 -0.16 -0.73 -4.01 1.02 -0.53 -0.75 0.59 0.41
-0.43 -0.15 -0.02 0.07 -0.06 -0.71 0.09 0.26 0.15 0.55 0.38 0.1 -1.13 -0.12 -0.52 -0.1 -0.15 0.47 0.26 0.32 -6.36 0.39 0.1 0.01 0.39 0.12
-0.49 -0.07 0.23 0.34 0.2 -0.31 0.26 0.23 -0.13 0.46 0.45 0.51 -0.47 -0.22 -1.03 -0.68 0.34 0.18 0.18 0.36 -5.18 0.16 -1.25 -0.35 0.43 0.36
-0.58 -0.07 0.05 0.18 0.34 0.12 0.39 0.32 0.07 0.22 0.08 -0.11 -0.66 -0.02 -0.25 -0.17 0.03 0.37 0.46 0.29 -3.88 -0.01 -0.1 -0.39 0.12 -0.02
0.16 -0.28 -0.3 0.07 0.11 0.2 0.44 0.57 -0.18 -0.36 -0.63 -1.16 0.02 0.37 0.1 0.4 0.22 0.75 0.24 -0.16 -4.1 0.74 -1.77 -1.66 0.68 -0.3
0.03 -0.0 0.12 0.09 0.1 -0.22 0.07 0.03 -0.2 -0.13 -0.21 -0.05 0.13 0.31 0.18 0.55 0.05 0.37 0.26 -0.01 -2.77 0.76 -0.83 -0.8 -0.14 -0.19
-0.29 -0.29 -0.49 -0.13 -0.13 -0.24 0.36 0.44 0.22 0.2 -0.04 -0.46 -0.82 -0.28 0.1 -0.09 0.21 0.6 0.57 0.28 -3.36 0.38 0.16 -0.12 0.42 -0.33
-1.13 0.05 -0.07 0.21 0.49 0.57 0.26 0.16 0.16 -0.42 -0.41 -0.78 -0.99 -0.14 0.12 -0.1 -0.26 0.81 0.3 0.05 -3.71 1.12 -0.7 -0.33 0.09 0.01
-0.03 -0.08 -0.08 0.03 0.27 0.23 0.39 0.33 0.03 -0.06 -0.3 -0.5 0.02 0.11 0.26 0.25 0.12 0.6 0.21 -0.13 -3.53 0.6 -0.62 -0.67 -0.22 -0.38
-1.26 -0.07 0.16 0.4 0.41 0.19 0.38 0.47 0.52 0.1 -0.01 -0.19 -2.26 -1.32 -0.45 -0.9 0.0 0.54 0.06 0.61 -8.58 0.61 0.21 -0.5 0.41 0.04
-0.33 -0.35 -0.19 0.18 0.44 0.32 0.5 0.44 0.54 0.25 0.38 0.05 -0.71 -0.22 0.1 -0.26 -0.25 0.32 0.09 0.05 -4.12 0.09 0.08 -0.8 0.02 -0.45
0.0 -0.16 -0.26 0.11 0.35 0.1 0.24 0.22 -0.03 0.15 0.12 0.08 0.12 -0.42 -0.49 0.38 -0.87 0.18 -0.12 -0.86 -1.7 0.87 -0.72 -0.11 0.56 0.17
-0.07 -0.11 -0.11 0.18 0.19 -0.06 0.26 0.19 -0.05 0.02 -0.11 -0.22 -0.1 -0.31 0.02 0.1 0.24 0.47 0.44 0.14 -3.77 0.57 -0.65 -0.55 0.26 -0.12
-0.55 -0.05 -0.19 -0.03 0.23 0.51 0.13 0.05 0.26 0.07 -0.11 -0.25 -0.56 0.13 0.33 0.18 -0.1 0.47 0.12 0.05 -2.64 0.45 -0.75 0.14 -0.04 -0.05
-0.39 -0.14 -0.06 0.04 0.09 -0.36 0.15 0.38 0.11 0.08 0.27 -0.05 -0.45 -0.17 -0.28 0.14 -0.14 0.53 0.11 -0.07 -2.79 0.69 -0.61 -0.26 0.49 0.26
-0.34 -0.22 -0.18 0.1 0.33 0.28 0.27 0.12 0.36 0.13 0.12 -0.06 -0.61 -0.57 -0.0 -0.39 -0.31 0.33 0.38 -0.09 -5.19 -0.12 -0.24 0.52 0.46 0.28
-0.42 -0.27 -0.41 0.28 0.42 0.01 0.22 0.05 0.44 0.31 0.59 0.02 -1.45 -0.44 -0.18 -0.43 -0.14 0.42 0.52 -0.06 -6.37 0.46 -0.65 0.12 0.29 0.12
-0.03 -0.36 -0.07 0.02 0.2 0.24 0.37 0.09 0.03 -0.2 -0.39 -0.29 0.0 0.29 0.08 0.43 -0.28 0.39 0.19 0.04 -2.65 0.99 -0.9 -0.68 0.02 -0.21
-0.51 -0.22 -0.2 0.04 0.27 0.35 0.42 0.21 0.09 -0.01 -0.26 -0.21 -0.49 0.17 0.18 0.31 -0.1 0.34 0.29 -0.12 -3.11 0.49 -0.33 -0.57 0.36 -0.03
-0.53 -0.08 -0.11 -0.03 -0.02 0.09 0.19 -0.04 0.01 0.18 -0.22 -0.31 -0.97 0.13 0.38 0.27 -0.08 0.46 0.63 0.28 -4.4 0.88 -0.73 -0.75 0.16 0.12
-0.64 -0.36 -0.25 0.31 0.49 0.1 0.19 0.24 0.49 0.38 0.31 0.12 -1.28 0.05 0.1 -0.29 -0.34 0.51 0.41 -0.14 -5.15 -0.35 -0.05 0.11 0.15 -0.13
-0.36 -0.4 -0.34 -0.02 0.2 0.17 0.59 0.48 0.35 0.16 -0.19 -0.41 -0.44 -0.57 -0.2 -0.34 0.01 0.5 0.27 0.31 -3.82 0.83 -0.48 -0.47 0.35 0.01
0.13 0.07 0.09 0.45 0.43 0.19 0.31 0.35 0.25 0.06 0.04 -0.21 0.0 -0.27 0.02 -0.19 -0.26 0.11 0.26 -0.29 -2.88 0.22 -0.29 -0.61 0.13 -0.35
0.16 -0.06 0.04 0.21 0.39 0.3 0.56 0.63 0.26 0.16 -0.09 -0.57 -0.13 -0.45 -0.37 -0.52 -0.14 0.25 0.33 0.14 -4.01 0.27 -0.28 -0.63 0.07 -0.18
-0.33 -0.17 -0.43 0.62 0.49 0.04 0.51 0.45 0.48 0.42 0.38 -0.12 -0.41 -1.29 -0.98 -0.84 -0.75 0.29 0.24 -0.29 -4.6 0.78 0.48 -0.16 0.03 -0.41
-0.15 -0.03 -0.05 0.32 0.49 0.47 0.57 0.55 0.35 0.28 0.24 -0.06 -0.61 -0.59 -0.19 -0.55 -0.17 0.32 0.21 0.01 -3.26 -0.08 -0.13 -0.84 0.09 -0.35
-0.79 -0.53 -0.44 0.63 0.72 0.2 0.32 0.5 0.05 -0.1 -0.04 0.09 -2.6 -0.18 -0.38 -0.99 -1.22 -0.38 -0.11 -0.85 -3.58 0.85 0.69 0.63 0.62 0.48
-1.07 -0.27 -0.21 -0.01 0.15 0.45 -0.04 0.12 0.13 0.08 -0.18 -0.37 -1.28 0.24 0.42 0.2 -0.02 0.37 0.51 0.02 -3.76 1.0 -0.43 -0.41 0.09 0.08
-0.48 -0.68 -0.73 0.66 0.82 0.27 0.48 0.71 0.74 0.59 0.7 -0.35 -1.13 -2.23 -0.84 -1.83 -0.84 0.32 -0.16 0.0 -4.82 0.56 0.38 -0.54 0.31 -0.1
-0.51 -0.17 -0.1 0.08 0.25 0.19 0.37 0.38 0.12 0.18 -0.12 -0.26 -0.77 -0.53 0.11 -0.41 0.14 0.64 0.58 0.23 -3.91 0.47 0.05 -0.63 0.09 -0.21
0.01 -0.05 -0.02 0.02 0.38 0.51 0.58 0.21 -0.27 -0.3 -0.81 -0.99 -0.07 0.19 0.22 -0.03 0.28 0.64 0.35 -0.0 -4.9 0.9 -1.53 -1.35 0.23 -0.24
-1.2 0.04 0.3 0.26 0.49 0.61 0.4 0.24 0.02 -0.18 -0.41 -0.38 -1.24 0.37 0.69 0.42 -0.14 0.34 0.35 -0.21 -1.38 0.34 -0.62 -0.76 -0.65 -0.41
-0.16 -0.08 -0.18 0.05 -0.03 -0.31 0.04 0.14 0.24 0.33 0.4 0.14 -0.5 0.01 -0.53 -0.23 -0.48 0.24 0.08 -0.25 -3.56 0.45 -0.08 0.32 0.63 0.27
-0.27 -0.61 -0.31 0.08 0.26 0.15 0.39 0.07 0.58 0.11 0.09 -0.06 -0.76 -0.43 -0.91 -0.08 -0.12 0.33 0.48 -0.15 -2.2 0.27 -0.04 0.38 0.35 0.19
-0.06 -0.28 -0.21 -0.08 0.05 -0.24 0.17 0.11 -0.03 0.08 -0.19 -0.34 -0.34 -0.08 -0.06 -0.25 0.12 0.71 0.45 0.16 -2.43 0.84 -0.01 -0.19 0.16 -0.13
-1.71 -0.22 0.04 0.28 0.15 -0.58 0.16 0.37 0.01 0.34 0.35 -0.21 -2.46 -0.88 -0.44 -0.91 -0.24 0.65 0.35 0.44 -4.84 0.47 -0.28 0.27 0.96 0.63
-0.43 -0.23 -0.18 -0.01 0.15 -0.1 0.29 0.26 0.15 0.23 0.19 0.1 -0.82 -0.29 -0.23 -0.47 -0.01 0.49 0.51 0.16 -1.71 0.23 0.1 -0.15 0.14 0.17
0.38 0.29 -0.09 -0.04 0.23 0.38 0.05 0.07 0.04 -0.2 -0.37 -0.18 0.31 -0.16 0.2 -0.37 -0.01 0.61 0.43 -0.09 -4.23 0.81 -0.94 -0.86 -0.11 -0.32
-1.09 -0.79 -0.04 0.15 0.52 0.67 0.4 0.15 0.28 -0.01 -0.02 -0.4 -1.14 -0.2 0.45 0.13 0.19 0.51 0.59 0.32 -5.25 0.05 -0.53 -0.45 -0.04 -0.15
-1.08 -0.6 -0.39 0.7 0.76 0.15 0.52 0.54 0.07 0.05 0.3 -0.19 -1.92 -1.03 -1.06 -1.22 -1.0 0.5 0.11 -0.66 -1.95 0.73 0.79 0.79 0.14 -0.3
-0.84 -0.09 0.09 0.31 0.06 -0.52 0.31 0.34 0.15 0.52 0.39 0.01 -0.73 -0.86 -0.25 -0.85 0.59 0.58 0.51 0.53 -5.8 0.33 -1.05 -0.72 0.53 -0.2
0.1 -0.01 0.15 0.23 0.1 -0.12 0.16 0.16 -0.13 0.33 0.24 0.21 0.48 -0.02 -0.63 -0.01 0.53 0.03 -0.39 -0.31 -2.55 -0.59 -0.54 -0.46 0.38 0.39
-0.89 -0.54 -0.37 -0.44 -0.13 0.54 -0.19 -0.12 0.28 0.12 -0.08 -0.36 -2.07 0.65 0.28 0.57 0.04 0.38 0.24 -0.03 -3.87 0.64 -0.2 0.37 0.1 0.27
-0.14 0.02 0.1 0.23 0.14 -0.23 0.23 0.24 0.12 0.14 0.15 -0.08 -0.44 -0.21 -0.16 -0.27 0.03 0.41 0.36 0.12 -3.19 0.23 -0.19 -0.05 0.05 0.11
-0.72 -0.21 -0.15 0.06 0.17 0.28 0.01 0.2 0.26 -0.19 -0.2 -0.39 -1.11 0.24 0.61 0.6 0.16 0.33 0.35 -0.1 -3.02 1.01 -0.9 -0.67 -0.09 -0.16
-0.84 -0.21 0.17 0.21 0.27 0.53 0.31 0.23 0.15 -0.17 -0.41 -0.65 -0.76 0.34 0.46 0.76 0.17 0.39 0.53 0.19 -2.95 0.75 -1.34 -1.3 -0.83 -0.46
-0.62 0.16 0.11 0.26 0.29 0.25 0.22 0.17 0.12 -0.11 -0.15 -0.25 -0.81 -0.28 0.03 -0.11 -0.13 0.91 0.58 -0.16 -3.49 0.64 -1.44 -1.78 0.85 -0.21
-0.15 0.06 0.0 0.33 0.65 0.76 0.62 0.58 0.31 0.08 -0.11 -0.15 -0.57 -0.44 -0.18 -0.26 -0.26 0.21 0.16 0.03 -4.57 0.18 -0.63 -1.36 -0.04 -0.08
-0.35 -0.2 -0.14 0.04 0.34 0.16 0.29 0.33 0.31 0.03 -0.06 -0.32 -0.62 -0.26 -0.21 0.1 -0.17 0.36 0.18 0.11 -3.95 0.86 -0.95 -0.09 0.44 -0.0
0.33 -0.04 -0.0 0.19 -0.0 -0.15 0.25 0.31 -0.03 -0.01 0.03 0.05 0.33 -0.03 -0.3 -0.03 -0.28 0.4 -0.01 -0.25 -2.75 0.69 -1.28 -0.5 0.41 0.07
-0.42 0.04 0.09 0.3 0.26 -0.03 0.36 0.35 0.26 0.4 0.29 -0.02 -0.63 -0.37 -0.38 -0.3 -0.18 0.56 0.29 -0.05 -4.27 0.29 -0.22 -0.29 0.08 -0.11
-0.33 0.2 -0.3 0.08 0.32 0.18 0.16 0.23 0.5 0.21 0.3 0.05 -0.3 -0.34 0.16 -0.58 -0.46 0.28 -0.11 -0.1 -3.91 0.85 -0.57 -0.36 0.24 -0.02
-0.6 -0.07 -0.07 0.0 0.11 0.32 0.64 0.48 -0.08 -0.23 -0.56 -1.01 -0.73 0.32 0.03 0.12 0.43 0.66 0.43 -0.06 -5.7 0.5 -1.37 -0.78 0.67 0.01
0.34 -0.16 -0.25 0.3 0.53 0.4 0.64 0.46 0.52 0.07 0.29 -0.09 -0.09 -0.6 -0.47 -0.38 -0.48 0.29 0.11 -0.54 -5.24 0.23 -0.04 -0.54 0.07 -0.46
-0.77 -0.06 -0.2 0.12 0.47 0.23 0.4 0.34 0.53 0.17 0.31 -0.08 -1.56 -0.32 -0.01 -0.32 -0.07 0.61 0.56 0.16 -3.89 -0.27 -0.01 -0.08 -0.12 -0.27
0.26 0.01 -0.01 0.21 0.07 -0.18 0.31 0.48 -0.03 0.07 0.03 -0.28 -0.03 -0.66 -0.18 -0.61 -0.2 0.39 0.43 0.02 -4.16 -0.17 0.0 0.01 0.51 0.19
-0.19 0.1 -0.19 0.26 0.5 0.15 0.33 0.38 0.28 0.2 0.09 -0.19 -0.75 -0.62 -0.13 -0.38 -0.15 0.43 0.13 0.09 -4.02 0.24 0.01 -0.13 0.28 -0.2
-0.38 -0.11 -0.02 0.34 0.41 0.25 0.1 0.06 0.05 0.2 0.11 0.06 -0.78 -0.11 -0.41 0.32 -0.45 0.56 0.36 -0.21 -3.83 0.71 -0.76 -0.25 0.29 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.