Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.37 0.34 -1.37 -3.11 -3.77 -2.66 -0.37 0.37 0.18 0.89 0.85 0.66 1.19 1.42 -1.34 0.82 -0.92 -0.41 -0.32 -0.51 -5.43 -5.94 -1.68 -0.55 0.48 -0.65
0.39 0.37 0.37 0.37 0.48 0.7 0.59 0.63 0.99 1.06 0.86 0.77 -0.1 -1.46 -2.15 -2.16 -0.75 -0.27 -0.69 -0.14 -5.45 -1.64 -2.6 -0.68 -0.63 -0.57
0.25 0.02 0.04 0.53 0.92 0.53 0.68 0.79 0.82 0.69 0.55 0.44 0.02 -1.06 -0.41 -0.9 -0.68 -0.0 0.03 -0.35 -6.27 -2.33 -1.22 -1.2 -0.69 -0.83
0.17 -0.28 -0.02 1.07 0.96 0.59 0.98 0.62 0.87 1.31 1.7 1.8 0.64 -4.21 - -2.98 - -0.65 -1.04 - - - - - - -3.47
0.16 0.0 0.1 0.31 0.59 0.7 0.72 0.58 0.44 0.31 0.13 -0.02 0.27 0.07 -0.31 -0.05 -0.23 -0.29 -0.34 -0.14 -3.81 -0.24 -1.5 -0.76 -0.59 -0.54
0.26 0.17 0.45 0.58 0.37 0.03 0.18 0.56 0.73 0.67 0.6 0.58 0.42 -1.26 -1.37 -0.7 -0.76 -0.76 -0.92 -0.21 -0.7 -0.32 -0.78 -0.31 -0.52 -0.33
0.83 0.6 -0.0 0.17 0.37 0.38 0.87 0.97 0.81 0.59 0.46 0.19 0.32 -2.54 -1.26 -1.99 -0.55 0.18 0.02 -0.02 -7.62 -1.74 -1.83 -0.78 -0.13 -1.22
0.12 0.22 0.23 0.38 0.61 0.75 0.75 0.73 0.64 0.45 0.29 0.08 0.2 -0.65 -0.55 -0.57 -0.07 -0.39 -0.43 0.04 -2.14 -0.32 -1.5 -1.28 -0.74 -1.0
0.43 0.24 0.1 0.43 0.45 -0.06 0.25 0.3 0.42 0.61 0.88 0.87 0.59 -0.84 -1.31 -0.74 -0.52 -0.33 -0.73 -0.32 -2.33 -0.03 -1.03 -0.93 -0.21 -0.4
0.49 0.26 0.29 0.2 0.31 0.43 0.81 0.94 0.31 0.64 0.72 0.54 0.15 -1.09 -0.83 -1.19 -0.26 0.26 0.13 0.29 -7.59 -2.42 -1.88 -1.48 -0.66 -1.02
0.04 0.1 0.19 0.39 0.53 0.57 0.56 0.66 0.67 0.44 0.31 0.11 -0.05 -0.59 0.06 -0.21 -0.16 -0.22 0.04 0.0 -4.03 -0.55 -1.06 -1.07 -0.62 -0.92
-0.2 0.61 0.5 0.44 0.56 0.56 0.81 0.83 0.7 0.63 0.32 -0.06 -0.24 -1.2 -0.37 -0.53 -0.17 0.42 0.29 0.11 -6.85 -1.18 -2.45 -1.84 -1.2 -1.59
1.58 1.15 0.82 0.91 0.34 -0.57 1.13 1.02 0.41 0.64 0.26 -0.08 1.12 -3.75 -1.63 -4.81 -2.89 -1.77 -1.7 -3.07 - -3.1 -2.5 -2.81 0.76 -1.47
0.53 0.21 0.22 0.56 0.7 0.66 0.66 0.61 0.6 0.53 0.55 0.66 0.81 -0.61 -1.06 -0.61 -1.05 -0.71 -0.85 -1.05 -3.17 -0.67 -1.69 -0.92 -0.56 -0.99
0.75 1.06 1.11 1.2 0.85 0.25 0.48 0.75 0.53 0.88 1.1 1.14 1.26 -6.84 -7.03 -7.08 0.32 -6.16 -6.34 -5.18 -14.83 -3.44 -9.77 -8.31 -3.75 -2.42
1.13 0.93 0.93 0.8 0.71 0.55 0.4 0.52 -0.07 0.31 0.78 1.05 1.85 -3.62 -3.66 -4.01 -0.19 -3.04 -3.03 -3.86 -2.42 -1.94 -2.58 -3.05 -2.14 -1.16
0.67 -0.09 0.11 0.0 -0.02 0.15 0.55 0.75 0.42 0.4 0.37 0.57 0.96 0.06 -0.55 -0.05 -0.94 -0.3 -0.34 -0.22 -0.89 -2.3 -1.08 -1.18 -0.35 -0.61
0.81 0.19 -0.21 -0.36 -0.06 0.3 0.75 0.79 0.67 0.53 0.28 -0.11 0.68 0.07 -0.25 -0.47 0.03 -0.36 -0.08 -0.12 -3.12 -1.85 -1.17 -0.85 -0.43 -0.58
0.02 0.66 0.46 0.54 0.83 0.95 0.97 0.96 0.8 0.66 0.42 0.11 -0.08 -2.15 -0.97 -1.19 -0.64 -0.03 -0.18 -0.24 -6.96 -1.06 -2.37 -1.8 -1.02 -1.88
0.03 0.24 0.26 0.52 0.8 0.9 0.63 0.64 0.45 0.21 0.15 -0.13 -0.19 -0.37 -0.24 -0.5 -0.27 0.01 -0.11 -0.22 -4.46 -0.52 -1.18 -1.03 -0.43 -0.6
0.2 0.02 0.12 0.43 0.49 0.4 0.51 0.58 0.49 0.4 0.49 0.57 0.4 -0.85 -0.78 -0.8 -0.82 -0.49 -0.59 -0.83 -1.62 0.37 -0.6 -0.56 -0.25 -0.32
0.9 0.61 -0.23 -0.12 0.5 0.85 0.83 0.88 0.21 0.24 0.14 -0.11 1.02 -0.62 -0.34 -0.48 -0.98 -0.0 0.02 -0.49 -7.19 -2.02 -2.14 -0.88 -0.42 -1.13
0.23 0.31 0.54 0.52 0.49 0.2 0.78 0.73 0.66 0.95 0.84 0.54 0.16 -1.67 -1.81 -2.23 -0.68 -0.55 -0.83 0.13 -5.2 -1.58 -2.13 -0.67 -0.22 0.04
0.83 0.18 0.01 0.97 0.73 -0.17 -0.08 0.43 0.78 1.0 0.7 1.0 1.28 -1.23 -2.11 -2.35 -3.88 -1.16 -0.45 -1.53 -3.04 -1.63 -0.05 -1.45 -0.34 -1.03
0.52 -0.19 -0.05 0.0 -0.05 -0.08 0.25 0.29 0.53 0.67 0.89 1.15 0.7 -0.16 -0.72 -0.54 -0.83 -0.61 -0.61 -0.84 -2.7 -0.5 -0.67 -0.53 -0.26 0.04
0.08 0.35 0.55 0.5 0.43 0.46 0.77 0.94 0.85 0.65 0.43 0.15 0.34 -0.14 -0.76 0.06 -0.3 -0.52 -0.44 -0.09 -5.26 -1.16 -3.15 -2.81 -0.96 -1.39
-0.16 -0.11 0.32 0.6 0.85 1.1 1.1 1.02 0.82 0.53 0.22 -0.21 -0.18 -1.17 -0.78 -0.87 -0.03 -0.36 -0.32 0.28 -7.82 -0.84 -3.36 -2.29 -0.95 -1.13
0.42 0.35 0.27 0.49 0.66 0.79 0.95 1.02 0.83 0.44 0.1 -0.24 0.56 -0.97 -0.97 -0.56 -0.52 -0.25 -0.54 -0.17 -4.28 -0.71 -2.74 -2.38 -0.53 -1.17
0.61 0.25 0.16 0.36 0.31 0.47 0.59 0.62 0.52 0.27 0.34 0.42 0.71 -0.62 -0.44 -0.5 -0.74 -0.46 -0.57 -0.65 -2.7 -0.5 -0.48 -1.11 -0.37 -0.33
0.75 0.28 0.42 0.5 0.51 0.46 0.62 0.62 0.32 0.17 -0.0 0.03 0.76 -0.49 -0.76 -0.36 -0.24 -0.13 -0.29 0.0 -4.1 -0.77 -1.44 -1.21 -0.74 -0.59
0.97 0.17 -0.09 -0.25 0.01 0.34 0.58 0.52 0.4 0.32 0.06 -0.08 0.85 -0.88 -0.32 -0.84 -0.23 0.25 0.16 -0.07 -4.52 -0.94 -0.22 -0.33 -0.42 -0.72
1.64 0.63 -0.98 -2.16 -3.19 -1.99 -0.21 0.53 0.55 0.71 0.91 0.97 1.49 0.72 -1.0 0.35 -0.61 -0.34 -0.47 -0.41 -4.02 -2.98 -1.68 -0.8 -0.99 -1.79
0.35 0.2 0.2 0.66 0.83 0.85 0.89 0.76 0.45 0.14 0.03 -0.16 0.14 -1.25 -0.96 -0.69 -0.75 -0.37 -0.47 -0.26 -2.72 -0.98 0.07 -0.73 -0.26 -0.68
0.34 -0.11 -0.23 0.02 0.45 0.65 1.01 1.09 0.71 0.64 0.44 0.01 0.41 -0.87 -0.95 -0.01 -0.2 -0.49 -0.59 -0.24 -4.47 -0.34 -0.88 -1.07 -0.87 -1.21
0.45 0.21 0.31 0.46 0.83 0.67 0.64 0.56 0.1 0.33 0.28 0.42 0.54 -1.08 -0.52 -0.81 -0.69 -0.41 -0.25 -0.36 -2.58 -1.29 -0.52 -0.65 -0.51 -0.35
0.37 -0.03 0.42 0.81 0.67 0.57 0.9 1.07 0.57 0.59 0.81 0.69 0.23 -2.64 -1.4 -2.59 -0.98 -0.49 -0.99 -0.38 -5.2 -1.62 -0.46 -0.74 -1.03 -0.5
0.73 0.64 0.45 0.54 0.51 0.33 0.6 0.59 0.05 0.22 0.18 0.21 1.06 -0.95 -0.33 -0.49 -0.73 -0.07 -0.63 -0.71 -5.27 -1.88 -0.99 -2.48 0.54 -1.3
-0.1 0.31 0.3 0.53 0.96 1.17 0.89 1.02 0.73 0.5 0.25 -0.11 -0.31 -1.7 -1.1 -0.34 -0.46 -0.21 0.08 0.07 -9.68 -0.95 -2.47 -2.21 -1.05 -1.27
0.72 0.28 0.21 0.58 0.71 0.78 0.64 0.64 0.3 0.14 -0.04 -0.01 0.63 -1.46 -0.84 -0.67 -0.59 -0.29 -0.16 -0.3 -6.16 -0.94 -0.8 -1.19 0.32 -0.62
1.16 0.12 -0.04 1.25 1.22 0.68 0.61 0.66 0.03 0.21 1.16 1.55 1.82 - -2.17 -4.38 -4.08 -2.31 -1.77 -1.67 -5.26 -3.67 - - -3.35 -3.7
0.33 0.32 0.26 0.89 0.94 0.12 0.34 0.38 0.34 0.39 0.57 0.55 0.42 0.08 -0.35 -0.1 -0.77 -0.38 -0.36 -0.36 -5.72 -3.4 -2.11 -2.24 -0.21 -0.17
1.04 0.33 0.06 0.4 0.21 -0.18 0.53 0.8 0.68 0.69 0.67 0.33 1.06 -0.97 -1.09 -0.62 -0.61 -0.56 -0.4 -0.56 -5.73 -1.74 -2.74 -1.32 -0.27 -0.24
0.23 0.09 0.18 0.31 0.34 0.43 0.53 0.6 0.57 0.4 0.49 0.6 0.52 -0.39 -0.52 -0.17 -0.74 -0.87 -0.69 -0.71 -1.72 -0.06 -0.97 -0.63 -0.39 -0.42
0.92 0.4 0.28 0.61 0.57 0.38 0.17 0.34 0.24 0.13 0.42 0.54 0.83 -0.86 -0.65 -0.78 -0.79 -0.46 -0.63 -0.46 -3.88 -0.63 -0.85 -0.67 0.07 -0.68
0.3 -0.98 -0.59 1.02 0.7 -0.25 0.48 0.31 0.91 0.81 1.32 0.93 -0.14 -1.76 -2.72 -0.0 -2.72 -1.36 -1.3 -2.53 -1.14 0.42 -0.43 -1.31 0.41 -0.56
1.13 0.75 0.3 0.28 0.31 0.47 0.69 0.9 0.34 0.38 0.2 0.1 0.95 -2.4 -1.21 -1.58 -0.56 0.14 0.03 0.04 -6.71 -1.96 -1.28 -1.2 -0.63 -1.64
0.57 0.18 0.03 0.59 0.66 0.68 0.78 0.82 0.67 0.24 0.02 -0.24 0.3 -1.27 -1.04 -0.85 -0.75 -0.77 -0.64 -0.43 -2.59 -0.1 -0.32 -0.86 0.15 -0.44
-0.03 -0.16 0.11 0.39 0.65 0.7 0.82 0.74 0.55 0.53 0.21 0.12 0.02 -0.69 -0.76 -0.63 -0.29 -0.03 -0.08 0.05 -4.38 -0.21 -0.83 -1.13 -0.26 -0.88
0.46 0.13 0.45 0.36 0.11 0.76 0.62 0.71 0.75 0.2 0.44 0.42 0.37 -0.18 -0.2 0.08 -0.42 -1.79 -0.6 -0.53 -1.77 -0.87 -1.46 -1.02 -1.07 -0.46
0.82 0.29 0.24 0.48 0.66 0.51 0.72 0.64 -0.03 0.52 0.42 0.37 0.71 -1.3 -1.12 -0.98 -0.37 -0.07 -0.46 -0.19 -4.57 -1.76 -0.55 -0.69 -0.34 -1.24
-0.14 0.31 0.43 0.41 0.7 0.96 0.94 0.78 0.32 0.17 -0.08 -0.28 -0.54 -0.33 -0.23 -0.05 0.1 -0.03 0.18 0.26 -4.46 -1.28 -1.59 -1.8 -0.78 -1.02
1.44 -0.27 -1.69 -1.4 -1.11 0.28 1.26 1.36 0.58 0.38 0.21 -0.47 0.92 0.25 -2.6 -0.15 -1.27 -0.86 -0.82 -1.41 -0.76 -1.8 -0.88 -0.12 0.18 -0.1
-0.19 -0.25 -0.04 0.61 0.6 0.85 0.97 0.86 0.95 0.77 0.56 0.74 0.35 -3.16 -2.01 -2.73 -1.43 -0.3 -1.0 -0.59 -3.41 -0.07 -0.56 0.05 -0.85 -1.14
0.75 0.46 0.16 0.05 0.41 0.84 0.76 0.69 0.86 0.52 0.51 0.4 0.61 -0.79 -1.01 -0.95 -0.69 -0.76 -0.83 -0.59 -2.82 -0.85 -1.04 -1.31 -0.55 -0.86
0.87 0.71 0.49 0.47 0.41 0.47 0.69 0.75 0.38 0.21 0.11 -0.04 0.76 -1.52 -0.84 -0.89 -0.66 0.36 -0.3 -0.35 -3.88 -0.82 -1.5 -1.32 -0.62 -0.9
0.57 0.61 0.73 0.81 0.58 0.06 0.11 0.21 0.2 0.51 0.61 0.56 0.57 -0.69 -1.67 -1.06 -0.31 -0.85 -0.97 -0.35 -3.52 -0.79 -1.29 -0.04 -0.41 -0.16
0.26 0.39 -0.07 1.21 1.24 0.89 0.83 0.98 0.76 0.94 0.66 0.37 0.49 -2.35 -2.11 -1.7 -1.71 -1.7 -1.57 -2.2 -5.62 -0.22 -1.97 -1.62 -0.99 -1.04
0.51 -0.02 0.08 1.32 0.96 0.33 0.8 1.31 0.74 0.73 1.08 0.56 0.29 -2.91 -2.81 -2.97 -3.13 -2.09 -2.96 -4.01 -6.24 0.64 -1.76 -1.44 -0.22 -1.15
0.26 0.53 -0.01 1.04 0.99 0.44 0.72 1.18 0.61 1.64 1.33 0.72 -0.37 -1.13 - -2.51 -3.93 -1.36 -2.49 -2.51 - -0.4 -1.92 - -1.78 -0.41
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0.48 0.14 0.26 0.57 0.82 0.91 1.14 1.08 0.55 0.23 -0.02 -0.48 0.18 -0.79 -0.77 -0.32 -0.43 -0.29 -0.26 -0.21 -4.74 -1.64 -1.41 -1.69 -0.55 -1.17
0.28 -0.1 -0.24 0.64 0.79 0.06 0.39 0.58 0.41 0.55 1.18 1.07 0.41 -0.98 -1.42 -1.42 -1.16 -0.95 -0.95 -1.07 -1.64 -0.03 -0.67 -0.63 -0.17 -0.49
1.69 0.41 -0.77 -0.95 0.04 0.76 1.3 1.19 0.55 0.28 -0.3 -1.2 1.3 -1.77 -1.26 -3.19 -0.35 0.34 0.07 0.09 -6.45 -2.65 -2.44 -2.17 -0.48 -2.17
-0.11 -0.54 -0.32 0.34 0.94 1.24 1.18 1.02 0.75 0.46 0.31 -0.04 -0.12 -0.69 -0.83 -0.43 -0.28 -0.28 -0.07 -0.1 -2.89 -2.56 -1.33 -1.72 -0.87 -0.9
0.31 0.39 0.4 0.53 0.79 0.73 0.71 0.6 0.31 0.12 0.17 -0.14 0.26 -0.76 -0.12 -0.42 -0.22 -0.02 0.08 -0.04 -4.88 -0.73 -1.73 -1.14 -0.72 -1.09
0.75 0.23 0.19 0.66 0.87 0.52 0.42 0.57 -0.29 -0.14 0.04 0.19 0.91 -0.98 -0.99 -1.03 -0.94 -0.46 -0.61 -0.47 -2.88 -0.62 -0.42 -0.62 0.29 0.02
0.94 0.42 0.24 0.28 0.36 0.49 0.6 0.63 0.2 0.05 -0.14 -0.13 0.86 -0.9 -0.69 -0.19 -0.26 0.09 0.07 0.14 -5.03 -0.97 -1.89 -1.5 -0.24 -0.55
-0.51 -0.16 0.17 0.39 0.7 0.83 0.91 0.81 0.43 0.12 0.01 -0.04 -0.32 -0.33 -0.12 -0.17 -0.3 0.3 0.17 -0.26 -5.73 -0.55 -1.05 -1.2 -0.38 -0.49
0.29 0.12 0.07 0.2 0.28 0.14 0.34 0.43 0.34 0.39 0.51 0.6 0.42 -1.07 -0.48 -0.37 0.0 -0.1 -0.33 -0.24 -1.61 -0.23 -0.89 -0.1 -0.05 -0.89
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0.71 0.34 0.38 0.74 0.77 0.57 0.36 0.49 0.18 0.37 0.5 0.44 0.34 -0.87 -0.9 -0.82 -0.97 -0.68 -0.55 -0.59 -4.95 -0.34 -1.49 -1.0 0.18 -0.25
0.78 0.36 0.27 0.17 0.2 0.32 0.42 0.41 0.42 0.55 0.74 0.71 1.04 -0.89 -1.04 -1.05 -0.31 -0.39 -0.99 -0.05 -2.28 -1.54 -1.08 -0.53 -0.83 -0.71
0.25 0.38 0.46 0.63 0.79 0.63 0.83 0.66 0.44 0.54 0.4 0.1 0.2 -0.65 -1.01 -0.74 -0.11 -0.29 -0.47 0.05 -7.31 -0.43 -2.92 -1.33 -0.73 -1.02
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-0.47 0.38 0.43 0.42 0.39 0.54 0.9 1.02 0.91 0.85 0.6 0.11 -0.54 -0.33 -0.63 -0.24 -0.26 -0.08 -0.35 0.03 -9.37 -0.7 -3.22 -2.44 -0.81 -1.76
0.38 -0.04 0.1 0.76 0.91 0.78 0.59 0.72 0.43 0.36 0.41 0.27 -0.22 -1.05 -0.31 -0.88 -0.45 0.15 0.01 -0.17 -5.08 -1.88 -1.13 -1.04 -0.21 -0.97
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0.28 0.21 -0.02 0.7 0.46 0.29 0.6 0.66 0.87 0.57 0.77 0.64 0.35 -0.89 -1.0 -0.89 -0.56 -0.63 -0.63 -0.59 -3.45 -0.51 -0.81 -0.67 -0.94 -0.45
1.08 0.34 -0.07 -0.31 0.18 0.67 0.99 0.95 0.49 0.39 0.03 -0.49 0.8 -1.31 -0.55 -1.51 0.11 0.43 0.18 0.37 -7.07 -1.27 -2.49 -1.9 -1.02 -1.42
1.02 0.5 0.03 -0.15 0.03 0.35 0.74 0.8 0.49 0.27 0.17 0.02 0.76 -0.39 -0.63 -0.3 -0.25 0.0 -0.15 -0.38 -3.5 -1.27 -0.93 -0.83 -0.6 -1.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.