Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-4.03 -1.01 -0.45 -0.24 -0.13 -0.72 -0.35 -0.03 -0.33 -0.0 -0.27 -0.41 -4.11 1.42 1.2 1.4 0.85 1.17 0.97 0.52 -4.18 -1.96 -2.9 -1.6 -0.47 -0.76
-1.03 -0.54 -0.08 -0.07 0.17 0.18 -0.18 -0.54 -0.64 -0.42 -0.77 -0.95 -1.06 1.51 0.63 1.05 -0.03 0.34 0.0 0.95 -4.83 -0.37 -4.05 -1.72 0.42 0.97
0.02 0.25 0.2 0.25 0.23 0.27 -0.03 -0.06 -0.07 -0.04 0.18 0.29 -0.03 0.17 -0.38 0.16 -0.68 0.81 0.14 -0.66 -1.59 0.02 -0.66 -0.82 0.37 -0.14
-0.24 0.03 -0.25 -0.27 -0.22 -0.78 0.33 0.17 0.2 0.44 0.58 0.18 -0.08 0.24 0.85 -0.18 -0.32 0.57 -0.38 -0.06 -1.9 0.26 -0.66 -0.46 -0.09 -0.09
-1.31 -0.61 -0.38 0.12 0.4 0.25 -0.09 -0.46 -0.6 -0.1 -0.12 -0.3 -1.14 0.95 -0.19 0.42 -0.98 -0.22 -0.48 0.87 -3.99 0.42 -4.25 -1.85 1.26 1.56
-2.07 -0.63 0.02 0.22 0.48 0.48 0.15 0.0 0.06 -0.11 -0.14 -0.27 -1.59 0.62 0.87 0.73 0.96 0.11 0.16 -0.02 -5.17 -1.95 -1.14 -0.78 0.28 0.4
-2.72 -3.11 -3.01 -2.56 -2.16 -1.95 -1.46 -1.46 -1.62 -1.13 -0.96 -1.17 -1.79 1.85 1.62 2.06 1.05 2.12 1.21 0.98 -7.05 -3.19 -4.98 -3.18 -1.99 -2.92
-0.67 -0.32 -0.08 0.34 0.55 0.54 0.23 0.1 0.06 0.06 -0.21 -0.32 -0.48 0.37 -0.2 0.42 -0.56 0.64 0.39 -0.07 -1.97 0.19 -1.6 -1.12 0.25 0.44
-0.13 -0.21 -0.15 0.48 0.65 0.21 0.04 -0.12 -0.31 0.29 0.42 0.35 -0.08 0.6 -0.34 0.05 -0.67 -0.7 -0.61 0.0 -6.65 0.54 -2.25 -0.76 0.66 0.67
-0.89 0.0 -0.21 0.12 0.45 0.25 -0.2 -0.57 -0.25 0.33 0.27 0.09 -0.72 1.05 0.34 0.79 -0.32 0.13 0.24 0.04 - -0.04 -1.95 -1.05 -0.03 0.66
-0.99 -1.22 -1.98 -1.7 -1.5 -1.51 -1.14 -1.22 -1.16 -0.96 -0.41 -0.43 -0.37 1.64 1.2 1.88 0.97 2.16 1.01 0.51 -4.94 -3.96 -2.72 -3.4 -2.04 -3.15
-0.77 0.02 0.2 0.34 0.45 0.38 0.28 0.1 0.15 0.33 0.07 0.22 -0.56 0.79 -0.03 0.4 -0.65 0.1 -0.2 0.3 -6.72 0.1 -1.98 -1.31 0.05 0.23
-2.06 -0.57 0.13 0.23 0.2 -0.1 -0.08 -0.13 -0.61 -0.47 -0.5 -0.74 -1.59 1.05 0.39 0.5 -0.43 0.75 0.58 0.57 -4.55 -0.01 -1.76 -1.81 0.85 1.17
-0.48 -0.41 -0.3 -0.08 0.17 0.28 0.07 -0.28 0.0 0.34 0.52 0.65 -0.14 0.81 0.26 1.18 -0.51 0.24 -0.46 0.23 -5.26 -0.3 -2.18 -1.03 -0.23 -0.04
-0.3 -0.31 -0.23 0.41 0.28 0.11 0.05 -0.25 -0.3 -0.17 -0.02 0.07 -0.35 0.52 -0.44 0.28 -0.46 -0.37 -0.16 0.37 -5.0 0.05 -0.71 -0.41 0.89 1.11
-0.51 -0.25 0.12 0.32 0.59 0.46 0.35 -0.12 -0.23 -0.07 0.07 0.23 -0.44 0.77 -0.32 0.49 -0.65 -0.5 -0.3 0.33 -2.43 -0.2 -0.67 -0.3 -0.12 0.63
-0.72 -0.3 -0.21 0.25 0.5 0.06 -0.04 -0.19 -0.33 0.02 0.06 0.05 -0.43 0.75 -0.63 0.54 -0.74 0.01 -0.46 0.21 -4.03 0.81 -2.01 -1.31 0.84 1.04
0.02 -0.19 -0.12 -0.05 -0.13 -0.27 -0.2 -0.38 -0.51 -0.24 -0.16 -0.11 -0.11 0.59 0.21 0.46 -0.0 -0.02 0.1 0.68 -5.19 0.28 -1.58 -0.73 0.73 1.0
-0.58 -0.51 -0.12 0.39 0.46 0.41 0.08 -0.3 -0.26 -0.07 -0.09 -0.19 -0.85 0.83 -0.04 0.48 -0.5 -0.04 -0.25 0.68 -3.75 0.03 -2.92 -1.05 0.74 1.01
-2.73 -4.96 -0.77 1.45 0.67 -0.32 -0.48 -0.64 -1.5 -0.95 -2.01 -1.27 -3.13 0.35 - -0.34 - -1.97 -1.05 -1.59 -5.53 2.03 -2.92 -1.66 2.15 2.31
-1.45 -0.37 -0.26 -0.1 0.3 0.59 0.56 0.06 0.22 -0.59 -1.05 -1.4 -1.58 1.11 1.38 0.83 0.31 0.48 0.18 -0.36 -1.68 0.11 -0.64 -1.33 -0.46 -0.8
-0.98 -0.15 0.14 0.46 0.54 0.24 0.16 -0.09 -0.35 0.09 0.17 -0.1 -0.76 0.77 -0.32 0.57 0.06 -0.07 -0.25 0.3 -5.94 0.1 -1.02 -1.05 0.44 0.54
-0.38 0.08 0.06 0.54 0.71 -0.04 0.38 0.1 -0.5 0.24 0.59 0.42 -0.27 0.77 -0.63 0.27 -0.63 -0.8 -0.92 0.16 -5.95 -0.04 -2.52 -1.19 0.66 0.61
-0.4 -0.05 0.16 0.34 0.62 0.6 0.16 -0.22 -0.48 0.18 0.12 0.04 -0.43 1.2 0.11 0.59 -0.11 -0.84 -0.2 0.9 -6.6 -0.57 -3.75 -2.29 -0.32 0.36
-2.59 -0.92 -0.12 0.25 0.54 1.08 1.33 0.91 1.2 -0.31 -1.1 -1.87 -2.35 0.49 1.07 0.31 0.1 0.73 0.07 -0.18 -4.09 -0.73 -1.83 -2.35 -1.39 -1.92
-1.42 -0.33 0.16 0.48 0.19 -0.22 0.3 0.3 0.13 0.24 -0.11 -0.03 -1.33 0.44 0.19 0.55 0.33 0.13 0.39 0.41 -4.87 -2.6 -0.33 -0.59 0.31 0.51
-0.4 -0.2 0.1 0.0 0.03 -0.24 -0.6 -0.51 -0.15 -0.01 -0.08 0.03 -0.32 1.26 0.46 1.04 0.14 0.16 -0.21 -0.06 -3.59 0.28 -1.02 -0.4 -0.17 0.12
-0.7 -0.15 -0.17 -0.38 -0.25 0.19 0.79 0.71 0.78 0.31 -0.37 -0.74 -0.7 0.97 1.37 0.49 0.29 0.51 0.11 0.07 -5.46 -1.3 -1.65 -2.24 -0.99 -1.49
-0.65 -0.14 -0.33 -0.43 -0.04 0.51 0.75 0.74 0.79 0.33 -0.26 -0.67 -0.53 0.8 1.29 0.28 0.12 0.17 0.22 -0.11 -5.1 -1.2 -1.41 -1.87 -0.41 -1.12
-0.63 -0.26 0.11 0.38 0.56 0.4 0.15 -0.16 -0.21 -0.13 -0.08 -0.24 -0.46 0.94 0.23 0.73 -0.3 -0.06 -0.35 0.58 -5.42 -0.06 -3.39 -1.87 0.25 0.78
-1.38 -1.43 -0.51 -0.48 -0.22 -0.32 -0.14 -0.19 -0.16 -0.45 -0.95 -1.32 -0.85 0.84 0.99 1.55 0.57 1.14 1.06 0.52 -2.64 -2.01 -1.32 -0.7 -0.25 0.13
-2.2 -0.88 0.11 0.39 0.29 -0.14 -0.36 -0.41 -0.19 0.12 0.19 0.02 -1.78 0.96 -0.11 0.19 -1.06 -0.79 -0.1 0.27 -2.48 0.28 -4.7 -0.79 1.19 1.71
-0.53 -0.51 -0.4 -0.1 0.21 -0.04 -0.06 -0.56 -0.72 -0.32 -0.43 -0.37 -0.53 1.29 0.17 0.8 -0.15 -0.18 -0.22 0.76 -6.65 1.06 -2.92 -1.74 0.56 0.91
-1.3 -0.48 -0.03 0.09 0.24 0.4 -0.18 -0.83 -0.01 0.4 0.26 0.03 -1.65 1.08 0.36 0.94 -0.09 -0.37 -0.45 0.45 -5.83 -0.41 -2.74 -1.05 0.69 0.93
-3.68 -1.93 -1.64 -1.01 -0.07 0.53 0.19 -0.95 -0.35 -2.31 -2.92 -3.6 -4.1 1.09 1.93 1.73 1.47 1.0 0.68 -0.0 -7.69 0.45 -2.33 -2.26 -0.6 -1.06
0.66 -0.89 -0.64 -0.57 -0.46 -0.37 0.36 0.16 -0.17 0.21 -0.23 -0.3 0.25 1.39 0.71 1.48 0.31 0.18 -0.04 0.31 -6.98 -3.88 -2.59 -2.77 -0.43 -0.02
-0.34 0.12 -0.04 0.05 0.07 0.1 -0.24 -0.16 -0.21 -0.25 -0.17 -0.01 0.18 0.52 0.47 0.9 0.15 0.29 0.33 -0.8 -1.41 0.56 -0.5 -0.59 -0.55 -0.36
-1.28 -0.47 -1.1 -1.09 -0.13 0.75 0.75 -0.42 -0.83 -2.07 -1.92 -2.51 -1.87 1.29 2.15 2.37 0.18 0.08 0.33 -1.09 -3.12 -1.49 -1.64 -3.03 -2.08 -1.98
-1.11 -0.32 -0.02 0.16 0.32 0.11 -0.06 -0.17 -0.1 -0.05 -0.08 -0.04 -0.79 0.54 0.64 0.64 0.15 0.49 0.32 -0.34 -0.85 0.17 -0.36 -0.34 -0.2 -0.27
-1.0 -0.58 -0.03 0.62 0.21 0.67 -0.04 -0.62 0.18 -0.29 0.38 0.49 -0.58 0.59 -1.03 -0.32 -2.99 -1.09 -0.78 -0.58 -3.22 0.64 -1.03 0.53 0.84 1.37
-6.96 -5.73 -5.76 -4.15 -1.2 0.31 0.3 0.12 -0.38 0.03 0.06 -0.78 -4.68 1.33 2.33 2.72 -0.64 -2.3 -2.89 -2.1 -6.65 -1.16 -4.44 -2.89 0.85 -0.53
0.06 -0.13 0.1 0.37 0.43 0.24 -0.04 -0.01 -0.19 0.08 0.05 0.12 -0.11 0.53 -0.09 0.23 -0.41 -0.19 -0.63 -0.06 -4.65 -0.08 -1.4 -0.35 0.6 0.8
-0.26 -0.1 0.16 0.42 0.66 0.31 0.28 -0.09 -0.06 0.2 0.48 0.37 -0.25 0.67 -0.63 -0.02 -0.77 -0.52 -0.72 0.29 -2.28 0.41 -6.8 -1.7 0.34 0.79
-0.13 0.21 0.12 0.59 0.85 0.55 0.2 -0.17 -0.43 -0.04 0.14 0.09 -0.35 0.25 -1.03 -0.16 -1.07 -0.0 -0.24 0.13 -4.97 0.02 -6.7 -2.02 0.82 1.21
-0.81 -0.42 0.14 0.25 0.2 0.22 0.26 0.1 0.2 -0.01 -0.22 -0.11 -0.57 0.61 0.33 0.4 -0.02 0.73 0.82 0.45 -3.8 -0.69 -1.66 -1.01 -0.52 0.17
0.53 0.19 -0.45 -0.56 -0.4 0.07 0.75 0.85 0.6 0.26 -0.23 -0.76 0.31 0.84 0.64 0.29 -0.03 0.43 0.09 0.02 -7.18 -0.27 -2.66 -2.23 -0.3 -1.6
-0.06 -0.06 0.1 0.24 0.31 0.16 0.26 0.26 -0.14 -0.11 -0.19 -0.34 0.03 1.11 -0.12 1.26 -0.04 0.05 -0.07 -0.09 -4.13 0.14 -2.26 -1.69 -0.5 -0.32
-0.83 -0.24 0.1 0.19 0.19 0.16 -0.01 0.08 0.05 -0.09 -0.2 -0.18 -0.72 0.57 0.8 0.75 -0.19 0.63 0.44 -0.43 -1.77 0.31 -0.89 -0.89 -0.36 -0.14
-0.96 -2.01 -1.94 -1.82 -1.82 -2.55 -1.95 -1.48 -0.9 -0.35 -0.21 -0.13 -0.99 1.66 1.1 1.92 0.3 2.14 1.38 0.59 -3.06 -2.05 -4.31 -2.61 -1.97 -1.53
0.45 -0.07 -0.61 -0.3 0.69 0.69 0.33 0.18 0.11 -0.33 -0.86 -1.27 0.5 -0.74 0.82 1.85 -1.16 0.01 -0.35 -1.09 -1.2 -2.63 0.36 -0.85 -0.67 -0.75
-0.17 -0.22 -0.11 -0.39 -0.15 -0.1 0.25 0.05 0.16 0.15 0.06 -0.09 -0.28 1.05 0.31 0.71 0.24 0.22 0.37 0.37 -4.4 -0.59 -0.96 -0.54 -0.31 -0.19
-0.88 -0.07 -0.1 0.03 0.24 0.09 -0.26 -0.32 -0.19 -0.05 -0.28 -0.89 -1.09 0.39 0.84 1.36 0.49 1.51 1.42 0.46 -4.82 -4.05 -2.89 -1.4 -3.87 -1.58
-1.71 -1.13 -1.45 -1.55 -1.01 -0.23 0.45 0.04 0.51 -0.43 -1.14 -1.81 -2.04 1.37 1.91 0.96 0.71 1.29 0.77 0.26 -4.51 -1.4 -1.23 -1.53 -0.51 -1.15
-2.77 -1.25 -0.72 -0.67 -0.36 0.16 0.7 0.61 0.61 -0.0 -1.07 -2.07 -2.96 1.11 2.1 0.72 0.51 0.75 0.55 0.51 -4.84 -1.56 -1.51 -2.39 -0.99 -1.75
-0.31 -0.35 -0.06 0.55 0.72 0.34 0.2 0.02 -0.01 0.34 0.5 0.35 -0.03 0.68 -0.8 0.28 -0.99 -0.71 -1.17 -0.19 -4.85 0.3 -3.38 -1.6 0.79 0.79
-1.45 -1.69 -1.52 -1.23 -1.45 -1.84 -1.34 -1.23 -0.94 -0.44 0.03 -0.17 -0.64 1.88 1.17 2.22 0.4 1.79 1.08 0.23 -6.53 -2.5 -4.13 -3.77 -2.2 -3.29
0.07 -0.01 -0.45 -0.28 -0.63 -0.69 0.05 -0.09 -0.38 -0.37 -0.53 -0.53 0.21 1.0 -0.45 0.6 -0.08 0.86 -0.06 -0.04 -1.95 0.83 -0.21 -0.02 0.21 0.14
0.15 0.06 -0.23 -0.3 -0.33 -0.3 -0.09 -0.17 -0.45 -0.26 -0.46 -0.56 0.17 1.06 -0.09 0.78 0.08 0.66 0.34 0.21 -2.3 0.32 -0.49 -0.47 0.09 -0.17
-3.44 -1.3 -0.51 -0.37 -0.1 0.36 0.77 0.27 0.51 -0.86 -2.11 -3.01 -3.52 1.19 2.0 0.84 0.69 0.82 0.63 0.55 -2.01 -0.84 -1.82 -3.29 -1.02 -1.52
-0.5 -0.49 -0.07 0.28 0.6 0.45 -0.12 -0.51 -0.67 -0.17 -0.07 -0.03 -0.5 1.29 -0.24 0.74 -0.61 -0.54 -0.41 0.33 -6.9 0.73 -3.36 -2.44 0.66 0.95
-1.53 -0.46 -0.28 -0.29 0.12 0.38 0.67 0.47 0.41 0.2 -0.3 -0.86 -1.41 1.52 0.76 1.31 0.57 0.44 0.44 0.31 -6.63 -2.61 -3.34 -3.03 -0.9 -1.63
-1.6 -0.45 -0.26 -0.13 0.11 0.07 0.66 0.65 0.37 0.34 -0.09 -0.73 -1.37 1.51 0.48 1.37 0.53 0.57 0.08 0.15 -6.89 -2.07 -3.05 -3.22 -0.49 -1.65
-0.2 -0.12 0.03 0.55 0.64 0.39 0.13 -0.08 -0.13 0.06 0.13 -0.05 -0.14 0.42 -0.28 0.01 -0.36 -1.16 -0.64 0.3 -6.53 0.29 -2.82 -1.55 0.8 1.11
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0.5 0.06 -0.6 -0.82 -0.26 0.18 0.72 0.58 0.59 0.01 -0.49 -1.07 0.05 0.68 0.48 0.28 0.29 0.74 0.43 -0.17 -5.36 -0.87 -1.18 -0.83 -0.09 -0.7
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-0.83 -0.53 -0.4 -0.18 -0.02 -0.23 -0.38 -0.98 -0.73 -0.51 -0.48 -0.47 -0.88 1.31 0.6 1.06 0.28 0.22 0.1 0.73 -3.89 0.3 -1.54 -1.05 0.76 0.76
-2.2 -2.38 -2.5 -2.35 -2.88 -2.69 -2.7 -2.43 -1.34 -1.94 -1.77 -1.86 -2.56 1.77 1.84 1.8 0.91 2.38 1.3 0.06 -3.21 -1.8 -0.98 -1.76 -0.92 -1.32
-0.07 -0.22 0.11 0.37 0.26 -0.26 0.0 0.06 -0.03 -0.05 -0.07 -0.13 -0.11 0.53 -0.58 0.09 -0.28 0.44 0.08 0.1 -1.55 -0.08 -1.21 -0.65 0.4 0.87
-1.78 -1.11 -0.35 0.09 0.34 0.23 0.45 0.14 0.16 0.12 -0.42 -0.82 -1.57 0.52 1.25 0.82 0.26 0.69 0.36 0.32 -3.11 0.05 -0.88 -1.01 -0.16 -0.66
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0.05 -0.25 0.33 0.42 0.35 0.18 -0.13 -0.21 -0.54 -0.47 -0.41 -0.34 -0.27 0.71 -0.25 0.31 -0.7 -0.3 -0.63 0.05 -4.01 0.68 -1.77 -0.9 0.89 1.27
-0.75 -0.62 -0.16 0.15 0.24 0.17 0.14 -0.06 -0.41 0.1 0.02 -0.07 -0.76 1.06 -0.12 0.84 -0.31 -0.36 -0.63 0.22 -5.35 0.27 -5.03 -1.68 0.76 1.35
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-0.63 -0.39 -0.05 0.06 0.37 0.18 0.13 -0.29 -0.17 0.04 -0.05 -0.07 -0.49 0.72 0.11 0.74 -0.22 0.57 0.45 0.31 -1.88 -0.14 -1.36 -0.91 -0.31 0.53
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-1.43 -0.46 -0.24 0.14 0.3 0.12 -0.2 -0.39 -0.36 -0.03 -0.07 -0.04 -1.55 0.55 -0.42 0.85 -0.49 0.31 0.07 0.31 -2.83 1.14 -1.04 -0.94 0.43 1.02
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-0.08 -0.09 0.03 0.38 0.63 0.33 -0.03 -0.14 -0.48 0.03 0.14 -0.05 0.07 0.57 -0.08 0.58 -0.43 -0.76 -0.77 0.24 -2.06 0.64 -3.0 -1.36 0.62 0.45
-2.06 -0.5 0.01 0.07 0.2 0.35 0.36 0.2 0.32 -0.11 -0.1 -0.2 -2.93 0.64 0.75 0.6 0.38 0.44 0.21 0.3 -6.21 -1.59 -0.24 -1.09 0.57 0.13
-2.04 -0.5 -0.11 0.07 0.44 0.56 0.55 0.27 0.16 -0.26 -0.53 -0.79 -1.61 0.75 0.88 1.44 0.27 0.25 0.19 -0.11 -5.53 -1.46 -1.27 -1.71 0.61 -0.51
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-0.32 -0.12 0.21 0.03 -0.17 -0.89 -0.49 -0.56 -0.82 -0.14 -0.41 -0.44 -0.51 1.16 0.49 0.58 -0.17 0.21 -0.07 1.06 -5.37 -0.31 -3.14 -1.9 0.56 1.44
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.