Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.12 0.03 0.0 0.22 0.04 0.09 0.0 0.05 0.19 0.22 0.14 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.03 1.0 0.24 0.37 0.52 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.41 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.46 0.15 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 1.0 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.75 0.0
0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56
0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.73 0.0 0.0 0.27 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.41 0.12 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.32 0.16 1.0 0.38
0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.16 0.86 0.55 1.0 0.34
0.07 0.0 0.08 0.15 0.37 0.22 0.49 0.19 0.28 0.46 0.34 0.29 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.66 0.05 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.37 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.12 0.02 0.06 0.24 0.05 0.18 0.02 0.09 0.03 0.01 0.06 0.06 0.09 0.15 0.1 0.0 0.05 0.02 0.11 0.0 0.0 0.02 0.03 0.16 1.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.98 0.35 0.09 0.1 0.1 0.26 0.09 0.0 0.16 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.53 1.0 0.0 0.0 0.76 0.48
0.16 0.19 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.31 0.2 0.0 0.11 0.0 0.35 1.0 0.0 0.05 0.04 0.23
0.0 0.0 0.27 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.28 0.75 0.26 0.29 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.41 1.0 0.41 0.51 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.05 0.02 0.0 0.34 0.05 0.0 0.03 0.05 0.16 0.27 0.17 0.26 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.05 0.57 1.0 0.33 0.67 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.35 0.38 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.81 0.0
0.0 0.78 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.89 1.0
0.56 0.46 0.36 0.31 0.26 0.31 0.36 0.44 0.33 0.33 0.38 0.48 0.66 0.25 0.31 0.35 0.32 0.22 0.21 0.27 0.09 0.77 0.37 0.24 1.0 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.29 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.18 0.3 0.1 0.09 0.04 0.57 0.38 0.2 0.25 0.16 0.07 0.35 0.33 0.17 0.25 0.03 0.24 0.15 0.03 0.05 0.21 0.27 0.0 1.0 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.38 0.32 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.27 0.06 0.05 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.16 0.0 0.0 0.13 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.21 0.08 0.1 0.1 0.0 0.0 0.1 0.2 0.0 0.13 0.58 0.25 0.39 0.47 0.0 0.0 0.08 0.26 1.0 0.08 0.0 0.77 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 1.0 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.04 0.17 0.25 0.22 0.15 0.31 0.3 0.07 0.07 0.1 0.15 0.0 0.14 0.0 0.17 0.0 0.16 0.32 0.12 0.35 0.06 0.08 0.0 1.0 0.34
0.17 0.13 0.07 0.34 0.32 0.39 0.23 0.86 0.07 0.06 0.06 0.11 0.05 0.13 0.03 0.14 0.0 0.13 0.0 0.13 0.14 0.13 0.03 0.0 1.0 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.48 0.0 0.2 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.27 0.76 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.15 0.61 0.0 0.0 1.0 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.33 0.35 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.32 0.0 0.08 0.08 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.08 0.0 0.11 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.39 0.0 0.25 0.06 1.0 0.33 0.89 0.06
0.2 0.25 0.09 0.1 0.1 0.03 0.08 0.04 0.06 0.06 0.04 0.08 0.2 0.06 0.04 0.06 0.09 0.12 0.17 0.1 0.21 0.01 0.52 0.43 1.0 0.31
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.21 0.21 0.09 0.11 0.16 0.37 0.0 0.81 1.0
0.22 0.0 0.11 0.23 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.44 0.3 0.58 0.37 0.0 0.21 0.18 0.95 0.7 0.17 0.51 1.0 0.86
0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.7 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.17 0.0 0.14 0.0 0.26 1.0 0.0 0.0 0.55 0.51
0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.29 0.45 0.38 0.0 0.15 0.13 0.13 0.0 0.12 0.0 0.0 0.46 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.26 0.0 0.26 0.0 0.64 1.0
0.0 0.3 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.0 0.8 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.17 0.0 0.0 0.0 0.17 0.21 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 1.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.1 0.0 0.0 0.23 0.12 0.0 0.24 1.0 0.55
0.19 0.04 0.03 0.05 0.06 0.14 0.06 0.16 0.06 0.06 0.01 0.02 0.08 0.18 0.04 0.06 0.02 0.07 0.11 0.02 0.13 0.6 0.05 0.16 1.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.34 0.81 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)