Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.06 0.02 0.0 0.11 0.02 0.04 0.0 0.03 0.09 0.1 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.48 0.11 0.17 0.25 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.28 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.62 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.07 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.1 0.62 0.24
0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.26 0.17 0.3 0.1
0.02 0.0 0.03 0.05 0.12 0.07 0.16 0.06 0.09 0.15 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.21 0.02 0.0 0.32 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.18 0.02 0.09 0.36 0.07 0.26 0.03 0.14 0.04 0.02 0.09 0.09 0.13 0.22 0.14 0.0 0.08 0.03 0.16 0.0 0.0 0.03 0.05 0.24 1.5 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.25 0.09 0.02 0.02 0.03 0.07 0.02 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.13 0.25 0.0 0.0 0.19 0.12
0.13 0.15 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.24 0.15 0.0 0.09 0.0 0.27 0.77 0.0 0.04 0.03 0.18
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.08 0.03 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.05 0.02 0.0 0.34 0.05 0.0 0.03 0.05 0.16 0.27 0.17 0.26 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.05 0.56 0.99 0.33 0.66 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0
0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.06
109.98 90.42 70.91 61.02 51.81 61.65 71.96 88.15 66.04 65.66 74.86 95.98 130.07 49.36 61.37 69.47 62.69 43.02 41.48 52.52 16.97 153.38 73.53 47.8 198.15 70.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.12 0.2 0.07 0.06 0.03 0.38 0.26 0.13 0.17 0.11 0.05 0.23 0.22 0.11 0.17 0.02 0.16 0.1 0.02 0.03 0.14 0.18 0.0 0.67 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.04 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.05 0.37 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.05 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.03 0.13 0.06 0.08 0.1 0.0 0.0 0.02 0.06 0.22 0.02 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.05 0.22 0.31 0.28 0.19 0.39 0.38 0.09 0.08 0.13 0.19 0.0 0.17 0.0 0.21 0.0 0.2 0.4 0.16 0.44 0.07 0.1 0.0 1.26 0.42
0.11 0.08 0.04 0.22 0.21 0.25 0.15 0.56 0.04 0.04 0.04 0.07 0.03 0.08 0.02 0.09 0.0 0.08 0.0 0.09 0.09 0.09 0.02 0.0 0.65 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.05 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.11 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.17 0.0 0.04 0.04 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.2 0.0 0.13 0.03 0.53 0.17 0.47 0.03
0.3 0.38 0.13 0.16 0.15 0.05 0.12 0.07 0.09 0.08 0.06 0.12 0.3 0.09 0.06 0.09 0.13 0.18 0.26 0.15 0.32 0.02 0.79 0.65 1.5 0.47
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.08 0.03 0.05 0.07 0.15 0.0 0.33 0.4
0.04 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.11 0.07 0.0 0.04 0.03 0.19 0.14 0.03 0.1 0.2 0.17
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.07 0.06
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0
0.0 0.05 0.08 0.07 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.11 0.17
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.31 0.08 0.0 0.25 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.14 0.08
6.16 1.33 1.14 1.73 2.01 4.56 2.02 5.18 1.87 2.0 0.43 0.73 2.51 6.0 1.28 1.89 0.68 2.17 3.6 0.81 4.26 19.92 1.72 5.21 33.2 5.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)