1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_137 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.22 1.93 1.01 3.92 2.94 1.47 0.57 1.45 0.82 0.9 0.59 0.72 1.83 0.72 1.22 1.29 0.47 1.2 1.17 0.62 0.48 0.46 1.3 0.65 1.43 0.59
19.43 18.79 20.64 24.03 29.18 24.79 18.56 14.9 14.92 18.0 15.52 15.61 19.2 16.41 23.77 22.36 15.47 19.96 23.07 20.2 4.05 10.3 8.96 12.21 10.67 12.5
0.54 0.32 0.05 1.12 0.59 0.15 0.21 0.17 0.09 0.1 0.19 0.09 0.16 0.48 0.18 0.6 0.14 0.11 0.21 0.11 0.05 0.02 0.08 0.12 0.06 0.27
0.0 0.35 0.75 1.35 0.83 0.95 0.38 0.02 0.04 0.02 0.02 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.07 0.23 0.96 0.19 0.14 0.0 0.03 0.0 0.0
3.26 16.94 37.84 54.88 79.58 78.55 73.14 64.31 36.75 19.93 8.21 3.99 2.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.13 0.86 0.43 5.35 7.19 0.03
0.09 0.28 0.12 0.3 0.21 0.16 0.07 0.09 0.09 0.06 0.06 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.2 0.12 0.04 0.29 0.2 0.13 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.0 0.04 0.05 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.04 1.43 1.97 6.61 7.92 4.72 3.7 1.42 0.52 0.24 0.06 0.05 0.26 0.06 0.18 0.07 0.15 0.28 0.22 0.47 1.0 0.25 0.35 0.08 1.28 0.17
0.86 1.46 1.47 3.5 5.4 5.31 4.84 3.88 2.65 3.11 2.01 1.94 1.01 3.4 3.09 3.3 1.46 3.4 2.79 2.32 1.65 0.56 4.22 1.71 1.65 2.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.9 0.85 2.26 2.99 1.37 0.92 0.29 0.24 0.0 0.17 0.05 0.1 0.25 0.32 0.37 0.04 0.37 0.56 0.94 1.24 0.23 0.88 0.04 0.13 0.6
0.0 0.13 1.54 2.68 4.5 3.94 2.71 0.85 0.18 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.57 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.8 2.77 3.51 3.86 2.68 2.41 1.51 1.02 0.96 1.18 0.7 0.22 2.01 1.57 1.36 1.26 1.04 1.3 1.61 0.05 0.32 0.21 0.89 0.45 1.14
2.79 25.4 28.1 23.96 50.13 67.4 79.94 56.68 51.07 25.55 17.11 8.8 4.03 0.03 0.04 0.0 0.0 0.04 0.14 0.04 0.22 0.04 0.0 0.46 0.85 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.26 0.25 0.46 0.62 0.54 0.35 0.32 0.32 0.24 0.23 0.3 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.03 0.08
0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 1.1 0.92 1.85 2.68 2.56 3.35 1.88 1.91 1.5 0.62 0.44 0.24 0.13 1.14 0.54 0.32 0.38 0.54 0.54 0.03 0.12 0.78 0.11 0.54 0.38
0.05 0.12 0.14 0.13 0.18 0.19 0.16 0.16 0.09 0.14 0.13 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.64 0.09 0.63 0.54 0.4 0.32 0.31 0.85 0.37 0.43 0.49 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.04 0.14 0.0 0.21 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 2.78 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.0 0.0 0.09 0.67 0.0 0.1 0.0
0.04 0.0 0.0 0.02 0.07 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.35 0.85 3.59 2.57 2.53 1.79 0.71 0.02 0.06 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.09 0.05 0.0 0.0 0.02 0.06 0.4 0.04 0.03
0.13 0.64 1.19 0.88 4.67 4.34 4.48 1.83 1.21 0.12 0.2 0.14 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.21 0.27 0.0 0.49 0.1 0.0 1.59 5.56 0.14
0.84 0.66 0.47 1.35 0.65 0.66 0.67 0.77 0.68 0.37 0.62 0.72 0.86 0.46 0.43 0.99 0.08 0.29 0.25 0.09 0.02 0.11 0.62 0.37 0.32 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.2 0.55 0.74 1.12 0.72 0.43 0.15 0.11 0.02 0.19 0.19 0.1 0.01 0.19 0.29 0.03 0.23 0.18 0.35 0.21 0.07 0.25 0.11 0.01 0.0
0.0 0.02 0.05 0.02 0.16 0.15 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.02 0.04 0.11 0.02 0.04 0.0 0.01 0.06
0.09 0.92 1.01 4.63 10.12 4.98 3.19 2.23 0.74 0.61 0.0 0.33 0.06 0.0 0.2 0.15 0.28 0.87 0.41 0.53 0.73 0.09 1.01 0.21 0.03 0.09
0.0 0.05 0.0 0.06 0.14 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.01 13.07 27.73 33.97 43.01 35.5 17.78 7.51 6.69 4.47 3.95 3.39 2.84 7.89 7.33 6.17 2.68 7.28 7.3 9.49 21.53 7.16 26.56 11.59 5.63 6.85
1.89 10.15 18.69 25.31 29.55 22.82 12.89 4.27 4.52 2.06 2.05 2.08 1.21 3.86 2.53 2.36 1.28 3.36 4.5 6.95 11.13 2.29 12.8 3.33 1.63 3.38
0.68 6.98 23.55 28.99 35.68 24.04 15.22 7.2 7.5 7.87 6.82 3.62 0.71 5.03 2.81 5.38 3.67 9.36 5.67 10.75 2.25 2.86 2.04 0.96 4.13 2.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.0 0.05 0.05 0.06 0.0 0.16
0.35 2.04 4.11 5.11 5.11 5.19 3.29 1.38 2.09 2.69 1.15 2.24 0.37 3.6 2.83 3.14 2.09 2.28 2.74 3.54 0.16 0.87 0.21 0.76 0.53 0.78
0.18 1.33 3.97 6.1 6.33 5.07 2.93 0.38 0.3 0.08 0.09 0.3 0.02 0.04 0.19 0.25 0.08 0.45 0.45 1.19 0.38 0.18 0.21 0.0 0.04 0.05
0.08 1.8 4.52 4.79 8.48 5.15 2.37 0.37 0.68 0.39 0.28 0.14 0.18 0.22 0.3 0.31 0.15 0.47 0.96 0.89 3.64 0.98 0.88 0.51 0.11 0.57
0.25 0.53 1.93 2.15 2.14 2.07 1.54 1.1 1.26 1.2 1.0 0.86 0.38 1.21 0.75 1.01 0.75 1.09 1.07 1.26 1.69 1.08 2.46 0.62 0.83 0.84
1.15 1.87 2.24 2.32 4.09 4.06 4.21 3.08 2.03 1.99 1.86 2.15 1.14 3.33 3.17 3.09 2.16 3.51 3.29 1.72 1.65 1.46 3.24 1.72 3.72 2.46
0.2 0.12 0.04 0.19 0.07 0.1 0.09 0.17 0.04 0.14 0.2 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.37 0.96 2.57 2.33 2.53 1.68 0.75 0.41 0.31 0.26 0.33 0.03 1.9 1.94 1.46 0.87 2.38 1.14 1.51 1.52 0.34 2.74 0.47 0.25 0.73
0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.09 0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0
6.2 4.39 3.85 8.32 15.37 9.29 6.92 4.84 3.54 3.36 3.42 4.06 7.6 4.46 2.15 5.55 1.42 0.87 1.93 1.26 11.75 8.15 8.56 1.3 1.89 1.58
0.12 0.05 0.0 0.05 0.04 0.09 0.0 0.04 0.04 0.04 0.04 0.09 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.23 0.78 0.47 2.25 2.96 1.82 0.86 0.64 0.28 0.42 0.45 0.77 0.32 0.22 0.11 0.51 0.33 0.16 0.41 0.37 0.1 0.05 0.13 0.26 0.12 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
195.52 165.19 180.12 207.14 230.55 156.55 107.5 108.74 76.92 92.74 106.36 118.97 276.34 69.23 58.63 75.58 229.56 82.14 54.71 53.79 336.5 248.07 167.09 127.67 78.0 78.27
0.21 0.1 0.31 0.93 1.46 0.81 0.49 0.32 0.0 0.06 0.02 0.05 0.33 0.0 0.02 0.02 0.0 0.07 0.1 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 1.79 4.25 10.52 10.42 7.29 3.93 1.55 0.82 0.33 0.13 0.07 0.0 0.0 0.18 0.06 0.0 0.0 0.17 0.95 3.29 0.52 0.24 0.0 0.04 0.0
0.0 0.02 0.15 0.2 0.17 0.31 0.14 0.06 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.05
0.27 0.5 0.62 1.18 0.63 0.3 0.28 0.17 0.07 0.04 0.15 0.16 0.16 0.01 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.15 0.21 0.11 0.28 0.55 0.49 0.11
0.12 0.03 0.09 0.09 0.22 0.11 0.03 0.02 0.0 0.06 0.04 0.05 0.16 0.01 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.02 0.21 0.22 0.07 0.0 0.01 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)