Heatmap: Cluster_107 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- 2.66 - - 1.01 - - 2.74 0.25 0.09 2.79 - - - - - - - - - - - - - 0.85 -
-0.16 1.53 -0.07 -0.22 - 0.84 -0.09 - 1.39 -0.39 2.45 2.38 - - -0.55 0.64 - -0.45 - -0.62 - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.83 - - - 3.56 - - - - - - - - - - - - - - -
0.19 -1.22 -2.16 - -1.42 1.95 2.07 1.52 1.65 -1.47 0.13 1.3 -0.17 0.13 -0.6 - -2.16 0.27 -0.01 - - - - - - -0.38
- - - - - - 4.23 - 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.03 3.22 - 2.14 - - 2.13 - - - - - - - 1.93 - - - - - -
-0.57 -1.64 -1.51 -0.85 0.37 -0.12 0.38 0.14 0.09 0.78 1.85 1.58 0.33 -0.12 0.48 -0.2 -1.6 0.0 -0.2 -2.29 -5.8 -2.79 -1.28 0.84 -1.71 -0.81
- - - - - - 3.76 - - - - - - 1.84 - - 2.4 - - - - - - - - 1.85
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.11 -0.7 - - - -0.82 3.37 - -0.71 3.05 - - 1.39 - - -0.81 - -1.58 - - -2.28 - -0.91 - - -1.34
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.52 0.72 -0.2 - 0.87 -1.3 - 1.18 - 0.78 2.2 2.18 -1.42 - - - - - -0.35 -1.64 0.16 - - 1.56 - 0.18
-0.32 0.42 -2.0 -3.04 -0.66 0.04 0.77 0.94 2.25 1.18 1.61 1.47 0.67 - -3.22 -3.23 - -0.79 0.61 -1.46 - - -3.5 -1.18 -1.97 -1.7
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.91 - - - - - 2.98 1.82 - 1.78 2.88 - - - - - - - - - - - - - -
1.96 - 0.24 - - - 2.03 3.45 - 0.12 - - 2.26 - - - - - - - - - - - - -
3.59 - - - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.12 - - - 1.77 1.88 - - - 3.41 1.96 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.07 - - 1.32 - - 1.0 3.38 2.81 - 0.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.78 2.79 2.7 - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.93 - 0.6 - 3.91 - - - - - 1.1 2.44 - - - - - - - - - - - -
- 1.67 0.76 - - - - 2.33 0.66 0.45 2.08 0.63 - - 1.44 - 0.51 - - - 0.09 - - - - 1.11
- - - - - - - 3.23 - - 2.95 - - - - 3.16 - - - - - - - - - -
- 1.26 0.01 0.96 1.76 1.91 1.12 - - 0.93 2.26 - - - - - 1.24 -0.53 - 0.68 - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.16 - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.92 - - 1.98 - - - 1.77 1.67 1.72 1.9 2.22 - - - - - - - - - - - - -
2.16 - - - - - - - 2.15 1.91 2.96 - 2.46 - - - - - - - - - - - - -
- 2.77 - - - - 2.84 - - - 2.56 - - - - 2.61 - - - - - - - - - -
0.1 0.11 - - - 2.67 1.93 1.09 1.84 1.17 2.22 0.06 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.26 - 3.32 1.51 - - 2.0 1.59 0.38 - - - - - - - - - - - - -
- 2.66 0.68 - - - - 0.9 0.81 0.57 2.44 0.79 - - - 0.67 - 0.09 1.65 - - - - - - -
0.24 - - - -2.85 1.86 2.21 2.4 0.56 0.81 0.45 0.54 -2.12 -2.72 - - - 0.12 -0.24 - - - -3.22 - 1.41 -
- 1.16 - - - 0.92 2.64 2.03 1.04 - 0.84 2.59 - 0.75 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.48 - - 0.27 1.48 - - 0.22 2.22 0.15 2.93 1.89 - - -0.06 - - - - - - - - - - -
1.91 -0.24 -0.49 - 1.1 -0.24 -0.48 - 1.64 2.61 2.27 1.19 - - - - - - -0.56 - - - - - - -
0.06 - - - - 2.5 2.18 3.04 0.2 - 0.0 1.17 - -0.09 - - 0.27 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.42 -3.82 -4.07 -2.08 -1.59 -1.88 -1.53 -2.08 2.2 2.01 2.67 2.44 -0.45 -1.67 1.12 - - - - - -3.02 - - -1.88 - -4.65
- - - - - 2.64 - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.21 2.22 2.13 1.89 2.01 - - - - - - - - - - - - - - -
1.86 - - - - - - 4.26 - - - - - - - - - - 1.66 - - - - - - -
3.09 - - - - - - - 3.22 - 3.03 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 0.74 3.71 - 0.61 3.0 0.82 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.59 2.08 2.79 2.72 0.17 0.22 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.8 - - - - - - 1.96 0.92 - 2.56 0.26 - - - 2.2 0.63 - - -
- 3.2 3.07 - - - - - - - 3.07 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.12 - - - - 3.03 3.19 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.18 0.36 1.93 - - 0.13 0.57 - 2.81 - 1.63 - 0.01 - - - - - - - - - - 2.3 - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.7 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.04 - - - - 3.25 - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.13 2.38 - - - - - - - - - - - - - - - 1.72 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.21 - - 2.91 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.63 1.86 - 2.72 1.77 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.71 2.6 2.65 2.83 - - - - - - - - - - - - - -
- 3.19 - - - - - - 3.1 - 3.06 - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.